Lengkapi kalimat berikut: Pada tanggal 13 Juli 2011, diumumkan bahwa Jonathan akan meninggalkan Santos untuk berlatih dengan raksasa Serie A Inter Milan, menunggu finalisasi transfer. Dua hari kemudian, pada tanggal 15 Juli, ia secara resmi menjadi pemain Inter, menandatangani kontrak empat tahun. Jonathan membuat debutnya di Inter pada tanggal 11 September 2011 di minggu kedua dari
2011-12 Serie A, bermain 90 menit penuh dalam kekalahan 4-3 dari Palermo. Tiga hari kemudian, Jonathan membuat debut di Liga Champions, bermain seluruh pertandingan pada Matchday 1 melawan tim Turki Trabzonspor dalam kekalahan 0-1 di San Siro.