Pengalaman yang diperoleh pada tahun 1964 dan 1965 memungkinkan 7 liter Mk II untuk mendominasi tahun berikutnya. Pada bulan Februari, GT40 kembali menang di Daytona. Ini adalah tahun pertama Daytona dijalankan dalam format 24 Jam dan Mk II selesai pertama, kedua, dan ketiga. Pada bulan Maret, pada tahun 1966 12 Jam Sebring, GT40s kembali mengambil semua tiga finish teratas, dengan X-1 Roadster pertama, Mk II mengambil kedua, dan Mk I di ketiga. Kemudian pada bulan Juni, di 24 Jam Le Mans
, GT40 mencapai hasil 1<unk>2<unk>3 lainnya.