Strejc lahir pada musim gugur 1592, mungkin di Hranice na Moravě sebagai putra keempat dari Jiří Strejc, seorang penulis, penerjemah teks-teks keagamaan dan penyelenggara Persatuan Persaudaraan di Židlochovice di Moravia selatan. Strejc muda pertama kali belajar di Herborn, kemudian di gimnasium di Bremen dan kemudian teologi di Universitas Heidelberg. Di Heidelberg, pada tahun 1620, ia menjadi tutor Ceko untuk putra tertua dari Elector Palatine Frederick V (yang sebentar memerintah sebagai raja Ceko). Kemudian, Strejc belajar di akademi di Leiden. Pada tahun 1632 ia bergabung dengan komunitas pengasingan Unity of the Brethren di Leszno, Polandia dan pada tahun yang sama menjadi pendeta dan administrator toko cetak Unity. Di Leszno ia menikahi Kristina Poniatowska, anak angkat Commenius yang terkenal karena nubuatnya yang penuh kegembiraan. Pasangan itu memiliki dua putra dan tiga putri. Pada tahun 1655, selama Perang Utara
, Leszno dibakar dan masyarakat hancur. Strejc dan sisa-sisa Persatuan pindah ke Brzeg (Břeh) di Silesia, pusat baru untuk pengasingan.