Tulis kelanjutan untuk paragraf ini - Kapal itu kembali ke Jepang untuk perbaikan pada pertengahan November. Kekurangan bahan bakar dan material berarti bahwa ia tidak dapat dibawa kembali ke layanan dan ia diubah menjadi baterai anti-pesawat terapung. Corong dan tiang utamanya dihapus untuk meningkatkan busur api dari senapan AA-nya, yang ditingkatkan dengan dua pemasang Tipe 89 dan sembilan pemasang senjata 25 mm tiga kali lipat. Senjata sekunder ke depannya telah dihapus sebagai kompensasi. Sebuah boiler pembakar batu bara dipasang di dermaga untuk pemanasan dan tujuan memasak dan sebuah kapal selam yang dikonversi berlabuh di sampingnya untuk menyediakan uap dan listrik; senapan anti-pesawatnya tidak memiliki kekuatan penuh dan hanya sebagian beroperasi. Pada tanggal 20 April "Nagato" direduksi menjadi cadangan. Pada bulan Juni 1945, semua senapan sekunder dan sekitar setengah dari persenjataan anti-pesawatnya dipindahkan ke darat, bersama dengan pengukur jarak dan lampu pencari. Oleh karena itu, awaknya berkurang menjadi kurang dari 1.000 perwira dan prajurit. Pada tanggal 18 Juli 1945, kapal yang sangat kamuflase diserang oleh pesawat tempur pembom dan torpedo berbasis kapal induk. "Nagato" terkena dua bom dan roket yang menewaskan 35 orang dan merusak empat meriam 25 mm. Pada tanggal 30 Agustus, beberapa hari sebelum penyerahan resmi
, Pelaut Amerika mengambil kendali atas kapal.