Palmyra digunakan sebagai tempat berlindung oleh cucu Shirkuh II, al-Ashraf Musa, yang bersekutu dengan raja Mongol Hulagu Khan dan melarikan diri setelah kekalahan Mongol pada 1260 Pertempuran Ain Jalut
melawan Mamluk. Al-Ashraf Musa meminta pengampunan kepada sultan Mamluk Qutuz dan diterima sebagai vasal. Al-Ashraf Musa meninggal pada tahun 1263 tanpa seorang pewaris, membawa distrik Homs di bawah pemerintahan Mamluk langsung.