Pada tahun 1805 ia menjadi Profesor Kedokteran di Kiel (kemudian di Denmark dan bagian dari Kadipaten Holstein) dengan gelar Konselor Kehakiman dan, kemudian Konselor Negara. Ini adalah tahun-tahun yang sulit bagi Denmark yang telah berpihak pada Perancis dalam Perang Napoleon
melawan Inggris (dan sekutunya) untuk mempertahankan kekaisaran maritimnya. Uang adalah masalah dan Wiedemann menggunakan sumber daya sendiri untuk mendirikan klinik kebidanan yang diusulkan sebagai salah satu tugasnya sebagai profesor.