Meskipun netralitas Portugal, pada bulan Desember 1941, Timor Portugis diduduki oleh pasukan Australia dan Belanda, yang mengharapkan invasi Jepang. Reaksi Salazar sangat keras. Dia memprotes, mengatakan bahwa Sekutu telah melanggar kedaulatan Portugis dan membahayakan netralitas Portugis. Sebuah pasukan garnisun Portugis yang kuat (sekitar 800 orang) kemudian dikirim dari Afrika Timur untuk mengambil alih pertahanan Timor Timur tetapi tidak tiba tepat waktu; pada tanggal 20 Februari 1942 Jepang mulai mendaratkan pasukan
di Timor.