Batalyon ke-6, yang dibentuk pada tanggal 31 Juli 1939 sebagai duplikat dari Batalyon ke-5, bertugas sebagai bagian dari Brigade Infanteri ke-199, awalnya bagian dari Divisi Infanteri ke-66, bersama dengan 7th Manchester dan Batalyon 2/8 dari Lancashire Fusiliers. Pada 23 Juni 1940, Divisi ke-66 dibubarkan dan Brigade ke-199 dipindahkan ke Divisi Infanteri ke-55 (Lancashire Barat). Pada tanggal 5 Mei 1942, batalion ini ditunjuk kembali sebagai Batalyon 1, untuk menggantikan batalion asli, yang telah hilang di Singapura pada bulan Februari. Pada bulan Oktober 1943, Batalyon 1 yang baru dipindahkan ke Divisi Infanteri (Welsh) ke-53, di mana ia akan tetap selama sisa perang. Pada 27 Juni 1944, Batalyon 1, Resimen Manchester mendarat di Prancis, 21 hari setelah invasi awal dimulai pada 6 Juni, D-Day. Dengan sisa Divisi ke-53, batalion ini melihat pertempuran sengit dalam Pertempuran Normandia dan mengambil bagian dalam sejumlah pertunangan di daerah sekitar Caen, tempat pertempuran yang sangat sengit, yang ditangkap oleh pasukan Inggris dan Kanada pada 9 Juli, dan kemudian bertempur dalam Pertempuran Falaise. Batalyon maju di seluruh Prancis Utara
, mencapai Antwerp di Belgia pada awal September. 1st Manchesters, bersama dengan seluruh Divisi 53rd (Welsh), pindah ke Turnhout, sebelum maju ke Belanda, di mana 1st dan 7th Manchesters melihat aksi berat, dengan 7th, sekarang sebagai bagian dari Divisi Infanteri 52nd (Lowland), bertempur dalam Pertempuran Scheldt di bawah komando Angkatan Darat Kanada Pertama. 1st Manchester, setelah memasuki wilayah Jerman dalam menghadapi pertahanan Wehrmacht, menyeberangi Rhine dengan Divisi ke-53 pada akhir Maret. 7th Manchester dengan Divisi 52 melihat pertempuran terakhirnya di Bremen, ketika kota itu ditangkap pada 26 April. Batalyon 1 mengakhiri perang di Hamburg ketika kota itu menyerah pada 3 Mei.