Menulis kelanjutan untuk paragraf ini - Pada awal Perang Dunia Kedua "Protée" ditugaskan ke Divisi Kapal Selam ke-3, berbasis di Toulon, bersama saudara perempuannya, dan. Pada awal Februari 1940, Divisi Kapal Selam ke-3 ditransfer sebentar ke Casablanca untuk melakukan pengawasan Kepulauan Canary, di mana beberapa kapal kargo Jerman hadir. Divisi kapal selam kemudian ditugaskan ke teater Mediterania pada tanggal 12 April, pertama di Bizerte kemudian, tanpa "Fresnel", di Beirut, di bawah otoritas komandan tertinggi Inggris di Alexandria. "Protée" mengambil bagian dalam beberapa patroli di Dodecanese sampai penandatanganan gencatan senjata antara Perancis dan Jerman
22 Juni 1940. Pada tanggal 25 Juni, tanggal gencatan senjata mulai berlaku, kapten "Protée" mengabaikan perintah untuk kembali ke Beirut, dan sebaliknya berlayar ke Alexandria, menjadi bagian dari Force X. Kapten itu dihukum karena insiden ini.