Nystrom membangun gaya kerja keras yang mirip dengan ayahnya, yang membantunya mendapatkan undangan untuk bermain dengan Program Pembangunan Nasional AS (USDP). Dia bermain 55 pertandingan untuk USDP di Liga Hoki Amerika Utara pada tahun 1999 <unk> 2000, mencetak tujuh gol dan 23 poin. Dia membagi musim 2000-01 dengan program nasional U-18 dan tim junior di Liga Hoki Amerika Serikat, juga mewakili Amerika Serikat di Kejuaraan Dunia U-18 IIHF 2001. Dia kemudian mewakili Amerika Serikat di 2002
dan 2003 Junior Ice Hockey Championship Dunia.