Setelah finis di tempat ketiga di Grand Prix Australia 2016, partisipasi Vettel di Bahrain
berakhir tanpa memulai karena mobilnya rusak pada putaran formasi. Pada balapan di Sirkuit Losail, Vettel bertabrakan dengan rekan setimnya Räikkönen pada putaran pertama, tetapi keduanya mampu melanjutkan balapan. Dia menyalahkan pembalap Red Bull Daniil Kvyat atas tabrakan itu, menyebutnya "orang gila" dan menggambarkan manuver menyalipnya sebagai "bunuh diri". Pada balapan, Vettel pensiun pada putaran pertama setelah dua tabrakan berturut-turut dengan Kvyat. Pada balapan, Vettel mencoba untuk menyalip pembalap Red Bull Max Verstappen, tetapi setelah Verstappen berlari keluar dari trek dan bergabung kembali di depannya, Vettel secara verbal menyerang dia dan direktur balapan Charlie Whiting, yang kemudian ia minta maaf. Vettel kemudian menghalangi Ricciardo Red Bull dengan bergerak di zona pengereman, dan diberi hukuman sepuluh detik dan dua poin pada lisensi-nya. Meskipun ia mencapai tujuh podium selama musim, Vettel tidak memenangkan balapan apa pun pada tahun 2016.