John W. Dawson kembali ke Joggins pada musim panas 1853 tanpa Charles Lyell, yang telah disewa untuk bekerja untuk Pameran Dunia 1853
di New York City. Dawson terus menyelidiki Formasi Joggins sendirian, dan pada 2 November 1853 mengirim survei yang telah selesai ke Lyell. Dawson mengklaim bahwa temuan-temuan dia dan Lyell cocok dengan yang dibuat oleh William Logan, dan pada tahun 1855 Dawson tidak lagi menggunakan survei sendiri dan mulai hanya mengandalkan Logan sebagai referensi. Dalam tinjauan tahun 2005 dari survei masing-masing, ditentukan bahwa pekerjaan Dawson dan Lyell lebih akurat daripada Logan. "Hylonomus lyelli" ditemukan di Joggins Cliffs oleh Dawson dan secara resmi dijelaskan pada tahun 1859. Dinamai untuk menghormati rekannya, Charles Lyell, spesies ini kemudian diakui sebagai reptil tertua yang diketahui dan menjadi fosil provinsi Nova Scotia. Sebuah jejak fosil yang ditemukan Dawson pada tahun 1866 pada satu titik diyakini telah dibuat oleh invertebrata terbesar yang diketahui "Arthropleura", tetapi Dawson akhirnya menemukan jejak yang cukup berbeda untuk diberikan kepada spesiesnya sendiri: "Diplichnites aenigma". Dawson akan mencurahkan sebagian besar karirnya untuk mempelajari Formasi Joggins dan kembali lagi pada tahun 1877, melakukan ekspedisi yang didanai oleh Royal Society untuk mencari lebih banyak spesimen yang tertanam di pohon fosil. Bahan peledak diledakkan di Coal Mine Point, mengekspos dua puluh lima pohon lycopsid; dari ini, lima belas mengandung fosil vertebrata yang mewakili lebih dari seratus spesimen, koleksi tunggal terbesar tetrapod Paleozoikum yang pernah ditemukan. Dawson dan Lyell akan datang dengan banyak teori selama bertahun-tahun untuk menjelaskan mengapa begitu banyak hewan akan berkumpul di sana. Saran pertama adalah bahwa makhluk-makhluk itu telah berbaring, tetapi juga disarankan bahwa mereka telah meninggal di tempat lain dan dicuci ke dalam batang oleh air. Akhirnya, Dawson akan percaya bahwa hewan telah jatuh ke dalam batang dan mati di sana, tidak dapat melarikan diri.