Setelah pembongkarannya, situs katedral tetap kosong sampai Carl Ludwig Wimmel mendirikan bangunan baru antara 1838 dan 1840 untuk Gymnasium paling terkenal di Hamburg, Gelehrtenschule des Johanneums. Bangunan ini kemudian diberikan kepada Hamburg, tapi hancur dalam Operasi Bom Sekutu Gomorrah
di musim panas 1943. Sejak puing-puingnya dibersihkan pada tahun 1955, situs itu tetap kosong lagi, disilangkan oleh jalan baru bernama Domstraße (Katedral Street).