Tulis kelanjutan untuk paragraf ini - Neuner mengalami kemunduran lebih lanjut di Kejuaraan Dunia 2009
di Pyeongchang, di mana dia berjuang dengan pilek dan sejumlah besar kesalahan menembak. Dia menempati posisi kedelapan dalam sprint, di mana dia menabrak lereng yang menuruni bukit, dan berada di urutan kesebelas dalam balapan mengejar. Dia tidak ditunjuk untuk balapan individu dan tidak bisa memulai di relay campuran karena pileknya. Pada 21 Februari 2009, Neuner meraih medali perak sebagai bagian dari tim relai wanita Jerman, bersama Martina Beck, Andrea Henkel dan Kati Wilhelm. Pada hari terakhir kejuaraan, ia berada di urutan ketujuh dalam balapan mass start.