Lengkapi kalimat berikut: Setelah armada Virginia diintegrasikan dengan Angkatan Laut Konfederasi, Barron diberi komisi sebagai komandan dan ditunjuk sebagai kepala Kantor Perintah dan Rincian pada tanggal 10 Juni. Barron akan tetap di jabatan itu sampai 20 Juli, ketika Sekretaris Angkatan Laut Konfederasi Stephen R. Mallory menyetujui permintaan Barron untuk ditugaskan sebagai komandan pertahanan pesisir Virginia dan North Carolina, sebuah pelabuhan penting bagi kapal perompak Konfederasi yang berbasis di Pamlico Sound. Tiba di markasnya di Fort Hatteras pada tanggal 28 Agustus, Barron memerintahkan pertahanan kedua benteng
Hatteras dan Clark melawan Union Flag Officer Silas H. Stringham selama Pertempuran Hatteras Inlet pada tanggal 28-29 Agustus. Barron ditangkap setelah penyerahan dua benteng. Dilakukan di Fort Columbus di Governors Island di pelabuhan New York, kemudian di Ft. Warren, pelabuhan Boston, Barron akhirnya dibebaskan dalam pertukaran tahanan tahun berikutnya.