Tulis kelanjutan untuk paragraf ini - Sudah melemah selama abad ke-18, pada pertengahan 1790-an, Persemakmuran Polandia-Lithuania telah dua kali dibagi oleh tetangganya: Rusia, kekaisaran Habsburg dan Prusia. Pada tahun 1791, Kaisar Austria dan Kekaisaran Romawi Suci Joseph II mengubah status Kazimierz sebagai kota yang terpisah dan menjadikannya sebuah distrik Kraków. Keluarga-keluarga Yahudi yang lebih kaya mulai pindah. Akan tetapi, karena perintah untuk tidak melakukan perjalanan pada hari Sabat, kebanyakan keluarga Yahudi tinggal relatif dekat dengan sinagoge-sinagoge sejarah. Pada tahun 1794, Tadeusz Kościuszko memulai pemberontakan yang tidak berhasil
di Lapangan Utama kota yang, meskipun kemenangan Pertempuran Racławice melawan tentara Rusia yang superior secara numerik, mengakibatkan partisi ketiga dan terakhir Polandia. Pada tahun 1809, Napoleon Bonaparte merebut bekas wilayah Polandia dari Austria dan menjadikan kota itu bagian dari Kadipaten Warsawa. Setelah kekalahan Napoleon, Kongres Wina 1815 memulihkan batas-batas pra-perang tetapi juga menciptakan Kota Bebas Kraków yang sebagian independen. Pemberontakan pada tahun 1846 gagal, mengakibatkan kota ini dianeksasi oleh Austria dengan nama Kadipaten Agung Kraków (, ).