Pada musim berikutnya, klub tidak mampu lolos ke Liga Champions setelah kalah dari Arsenal, tetapi maju sejauh babak 16 besar di Liga Europa 2011-12 UEFA, yang dieliminasi oleh tim Belanda AZ. Mereka menyelesaikan 2011<unk>12 Serie A
di tempat ketiga, hasil terbaik dalam sejarah klub, menyamai musim 1996-97 Alberto Zaccheroni, sekali lagi meraih tempat di babak kualifikasi untuk Liga Champions UEFA 2012-13. Pada musim ketiganya di Udinese, Guidolin sekali lagi gagal mencapai Liga Champions yang tepat, kalah pada adu penalti ke Braga, tetapi kali ini juga finis terbawah di grup mereka di UEFA Europa League 2012-13. Di klasemen Serie A, klub menempati posisi kelima, mencapai babak kualifikasi Liga Europa untuk ketiga kalinya.