Sekali lagi dengan bantuan Zhu Rongji, Wang menjabat sebagai sekretaris jenderal Dewan Negara dari Maret 1998 hingga Maret 2003, di mana ia diangkat sebagai presiden Sekolah Administrasi Nasional (sekarang "Akademi Pemerintahan"), membantu merevisi administrasi Kebijakan Satu Anak, menjabat sebagai kepala kelompok terkemuka yang mengawasi sensus nasional ke-5 China, dan duduk sebagai anggota komite pengarah yang mengawasi pertemuan puncak APEC 2001 di seluruh China. Pada tahun 1999, ia juga berpartisipasi dalam transfer
Makau dari Portugis ke kontrol Cina. Dari 5 Maret 2003 sampai 5 Maret 2008, ia adalah wakil ketua Konferensi Konsultatif Politik Rakyat. Pada tahun 2005, ia memimpin misi diplomatik China ke Ghana dari 31 Mei sampai 2 Juni. Ia menjabat sebagai presiden Asosiasi Internasional Dewan Ekonomi dan Sosial dan Institusi serupa dari tahun 2005 sampai 2007.