"Gelombang modern" perbudakan di Sudan dilaporkan dimulai pada tahun 1983 dengan Perang Saudara Sudan Kedua antara Utara dan Selatan. Ini melibatkan sejumlah besar orang Sudan dari wilayah selatan dan tengah, "terutama Dinka, Nuer dan Nuba dari Sudan tengah", ditangkap dan dijual "atau dieksploitasi dengan cara lain" oleh orang Sudan Utara yang menganggap diri mereka sebagai orang Arab. Masalah perbudakan dilaporkan menjadi lebih buruk setelah pemerintah militer yang didukung Front Islam Nasional berkuasa pada tahun 1989
, pemerintah Khartoum menyatakan "jihad" terhadap oposisi non-Muslim di selatan. Suku Baggara juga diberi kebebasan "untuk membunuh kelompok-kelompok ini, menjarah kekayaan mereka, menangkap budak, mengusir sisanya dari wilayah-wilayah, dan secara paksa menetap di tanah mereka".