Kompleks ini menjadi sasaran sekali lagi ketika Perang Saudara Libya pecah pada tahun 2011. Pada bulan Maret tahun itu, sebuah koalisi internasional yang dipimpin oleh NATO meluncurkan intervensi militer terbatas
dalam konflik, mengebom unit militer loyalist dan pusat komando dan kontrol. Bab al-Azizia diidentifikasi sebagai salah satu pusat tersebut, dan dibom berulang kali sepanjang perang.