Teori ini telah menghadapi skeptisisme karena Muslim tidak sepenuhnya terpisah dari Hindu dan sekitar sepertiga dari semua Muslim terus hidup di India pasca-partisi sebagai warga negara India bersama dengan mayoritas Hindu yang jauh lebih besar. Pembagian Pakistan yang berikutnya
menjadi negara-negara Pakistan dan Bangladesh saat ini dikutip sebagai bukti bahwa Muslim tidak membentuk satu bangsa dan bahwa agama saja bukanlah faktor penentu untuk kebangsaan.