Henry melanjutkan perang dengan Prancis, tapi dia terganggu oleh masalah keuangan, kesehatan yang menurun dan pemberontakan yang sering terjadi. Sebuah invasi Skotlandia dikalahkan di Pertempuran Homildon Hill
, tetapi itu mengakibatkan perang panjang dengan Henry Percy, Earl 1 dari Northumberland, untuk Inggris utara, yang diselesaikan hanya dengan hampir kehancuran lengkap dari keluarga Percy di Pertempuran Bramham Moor. Di Wales pemberontakan Owain Glyndŵr yang meluas hanya ditekan pada tahun 1408. Banyak yang menganggapnya sebagai hukuman dari Allah sewaktu Henry kemudian terkena penyakit kusta dan epilepsi.