Peale kadang-kadang bekerja pada medali untuk pemerintah, berhati-hati untuk mengecualikan Longacre dari proses. Selama Perang Meksiko-Amerika, Kongres memilih medali emas untuk Mayor Jenderal Zachary Taylor untuk kemenangannya di Palo Alto
dan Resaca de la Palma. Peale mengukir desain dari potret oleh William Carl Brown dan model oleh John T. Battin. Setelah Taylor menjadi presiden, Peale mendesain Medali Perdamaian India; Peale juga mengukir Medali Perdamaian India untuk presiden John Tyler dan James Polk, bekerja dari desain atau model oleh orang lain. Pada tahun 1846, Peale merancang dan mengukir Coast Survey Medal (juga disebut medali George M. Bache). Peale percaya bahwa semua medali peringatan nasional, yang diberi wewenang oleh Kongres, harus ditempatkan di Philadelphia Mint, dan dicetak di sana, dan dengan dukungan Patterson mendesak penerbitan medali untuk presiden yang tidak ada Medali Perdamaian India yang dirancang, seperti John Adams dan William Henry Harrison. Ini dilakukan, tetapi tidak pada zaman Peale - misalnya, medali William Henry Harrison dirancang oleh Asisten dan Kepala Pengukir George T. Morgan. Karya-karya ini, seperti Medali Perdamaian India Peale, merupakan bagian dari seri Presiden Mint, yang berlanjut hingga saat ini.