Ini dibuka kembali pada tanggal 22 Maret 2000 sebagai Phoenicia Inter-Continental Beirut, setelah proyek restorasi senilai $ 100 juta untuk desain arsitek Hellmuth, Obata + Kassabaum. Inter-Continental Hotels direorganisasi sebagai InterContinental Hotels Group pada tahun 2003, dan nama hotel diubah sedikit, kehilangan tanda hubung dan menjadi Phoenicia InterContinental Beirut. Pada Juli 2003, menara ketiga, Phoenicia Residence, yang terdiri dari 35 apartemen mewah, dibuka. Phoenicia rusak dalam pemboman pembunuhan Rafik Hariri pada tahun 2005 di jalan di depan dan ditutup selama tiga bulan untuk perbaikan. Pada tahun 2011, ia menjalani renovasi senilai US$50 juta yang bertepatan dengan ulang tahunnya yang ke-50. Pada tahun 2012 hotel ini berganti nama menjadi Phoenicia Hotel Beirut, meskipun masih menjadi bagian dari jaringan InterContinental. Hotel ditutup pada 5 Agustus 2020, karena kerusakan akibat ledakan Beirut 2020
hari sebelumnya.