Dalam F1, setelah awal yang menjanjikan tahun sebelumnya, 1966 adalah tahun yang buruk bagi Stewart; BRM H16 3-liter tidak dapat diandalkan, meskipun Stewart memenangkan Grand Prix Monaco dengan mobil bermesin 2-liter. Peristiwa yang paling signifikan di tahun itu adalah kecelakaan di Grand Prix Belgia
di Spa-Francorchamps, yang memicu kampanye untuk meningkatkan keamanan di F1 dan menyebabkan dia melewatkan Grand Prix Prancis di Reims.