Klien memulai tahun 2006 dengan kuat, lolos di 10 besar untuk 2 balapan pertama musim ini. Di Bahrain
Dia finis di urutan kedelapan, mencetak satu poin. Namun, di Malaysia ia bertabrakan dengan Kimi Räikkönen pada putaran pertama dan harus pit dengan kerusakan suspensi, sebelum akhirnya keluar dengan kegagalan hidraulik.