Namun, korupsi yang merajalela dalam jajaran pemerintah dan birokrasi, ketidaksetaraan ekonomi antara dua sayap negara yang disebabkan terutama oleh kurangnya pemerintahan perwakilan dan ketidakpedulian pemerintah terhadap upaya politisi etno-nasionalis yang ganas seperti Mujeeb-ur-Rehman dari Pakistan Timur, mengakibatkan perang saudara di Pakistan
dan pemisahan Pakistan Timur sebagai negara baru Republik Rakyat Bangladesh.