Pada tahun 1938, Pemerintah Prancis menunjuknya sebagai gubernur India Prancis, sebuah koloni yang terguncang oleh kerusuhan di pabrik tekstil. Dalam perjalanan kehancuran militer Prancis selama Perang Dunia II, Bonvin mengirim telegram kepada pemerintah Prancis (kemudian di Bordeaux) pada tanggal 20 Juni 1940, menyatakan keinginan rakyat India Prancis untuk melanjutkan perang di pihak Sekutu. Namun, setelah penandatanganan gencatan senjata tanggal 22 Juni 1940
, dia segera mengakui pemerintahan Marshal Pétain. Tak lama setelah itu, di bawah tekanan dari Kolonel Schomberg, konsul Inggris di Pondicherry, yang memperingatkannya bahwa Angkatan Darat India Inggris akan menduduki koloni jika ia tidak menyatakan untuk Jenderal de Gaulle, ia membalikkan keputusannya. Dalam sebuah banding kepada rakyat pada tanggal 27 Juni 1940, Bonvin mengumumkan bahwa kekaisaran kolonial Prancis (dan oleh karena itu Pendirian Prancis di India) "akan tetap berada di sisi Inggris sampai kemenangan akhir". Pada tanggal 12 Juli, Gubernur Bonvin, melalui Inggris, meyakinkan de Gaulle tentang kerja sama India Prancis.