Pada tahun 1672 ia mulai mencatat penelitian teologinya dalam buku catatan yang ia tidak menunjukkan kepada siapa pun dan yang baru-baru ini telah diperiksa. Mereka menunjukkan pengetahuan yang luas tentang tulisan-tulisan gereja awal dan menunjukkan bahwa dalam konflik antara Athanasius dan Arius yang mendefinisikan Creed, ia mengambil sisi Arius, yang kalah, yang menolak pandangan konvensional tentang Tritunggal. Newton "mengakui Kristus sebagai mediator ilahi antara Allah dan manusia, yang tunduk kepada Bapa yang menciptakan dia". Dia terutama tertarik dalam nubuat, tetapi bagi dia, Kristus adalah pengkhianat trinitarian.
adalah sesat