Implementasi konstitusi Federasi Malaya berdasarkan Revised Constitutional Proposals pada 1 Februari 1948 dan keputusan MCP untuk melancarkan pemberontakan bersenjata menandai awal akhir bagi koalisi PUTERA-AMCJA dan AMCJA secara keseluruhan. Dengan deklarasi darurat nasional
, organisasi konstituen menarik diri dari koalisi, pergi ke bawah tanah, atau dalam kasus MDU, secara sukarela membubarkan dirinya sendiri dan AMCJA tidak ada lagi sebagai badan.