Uji coba bom atom pertama oleh Uni Soviet pada Agustus 1949 datang lebih awal dari yang diharapkan oleh orang Amerika, dan McMahon segera mendesak agar produksi senjata atom AS meningkat secara substansial. Selain itu, selama beberapa bulan berikutnya terjadi perdebatan sengit di dalam pemerintahan AS, militer, dan komunitas ilmiah mengenai apakah akan melanjutkan pengembangan bom hidrogen yang jauh lebih kuat, yang kemudian dikenal sebagai "Super". McMahon sangat mendukung untuk melanjutkan Super, dan berpendapat begitu banyak dalam serangkaian surat yang dia tulis kepada Presiden Truman. Senator menolak argumen berbasis moralitas terhadap bom hidrogen berdasarkan pada itu secara inheren lebih merusak dari senjata sebelumnya, bertanya "Di mana perbedaan etis yang valid antara" Perang Dunia II multi-hari-dan-malam pemboman Hamburg
, pemboman api Toyko, dan pemboman atom Hiroshima, dan setiap serangan masa depan dengan teknologi apa pun yang menyebabkan korban massal.