Untuk mencegah Muslim biasa, apakah mereka Turki, Kurdi atau Arab, dari menyelamatkan nyawa orang Armenia, sebuah dekrit yang menyatakan hukuman untuk melindungi orang Armenia adalah kematian dengan gantung dan penghancuran rumah seseorang disahkan; meskipun dekrit ini, sejumlah orang Turki biasa, Kurdi dan Arab memang melindungi orang Armenia dari kemarahan Organisasi Khusus. Orang-orang biasa Turki, Kurdi dan Arab lainnya memang membantu tentara, jender dan Organisasi Khusus dalam deportasi dan pembunuhan, yang dimotivasi oleh keinginan untuk menjarah properti Armenia, untuk memiliki wanita dan gadis Armenia sebagai budak seks atau karena hasutan oleh pendeta Muslim yang mengatakan bahwa genosida adalah tindakan "jihad". Ketika polisi mengepung orang-orang Armenia untuk dideportasi, adalah umum bagi pasar budak untuk didirikan di mana untuk harga yang tepat seorang pria Muslim bisa membeli wanita Armenia dan / atau gadis untuk digunakan sebagai budak seksnya. Selain genosida terhadap orang-orang Armenia, rezim CUP melancarkan genosida Asyur terhadap minoritas Asyur dan genosida Yunani Pontus
melawan Yunani Pontic di Pontus. Di Thrace dan Anatolia barat, Organisasi Khusus yang dibantu oleh pejabat pemerintah dan tentara, mendeportasi semua pria Yunani yang berusia militer ke brigade kerja mulai musim panas 1914 dan berlangsung hingga 1916.