Pada EuroBasket 2007, Giannakis memimpin Yunani untuk finis di posisi keempat. Pada Olimpiade Musim Panas Beijing 2008
, ia memimpin Yunani untuk finis di posisi kelima. Pada Desember 2008, Giannakis mengakhiri masa jabatannya sebagai pelatih kepala tim nasional senior Yunani. Ia digantikan oleh Jonas Kazlauskas.