Setelah memenangkan medali emas dan perak di Kejuaraan Renang Junior Eropa 1998 di Antwerp, ia membuat debut internasionalnya di Kejuaraan Dunia FINA Short Course 1999 di Hong Kong. Groot segera memenangkan medali internasional pertamanya, perak, di 4 × 100 m gaya bebas relay bersama dengan Thamar Henneken, Wilma van Hofwegen dan Inge de Bruijn. Secara individual, ia menempati posisi ke-14 dalam 100 m kupu-kupu. Beberapa bulan kemudian ia berkompetisi di Kejuaraan Olahraga Air Eropa 1999
di Istanbul. Dalam 50 m kupu-kupu ia memenangkan medali individu pertamanya, pada usia 17, mencapai tempat ketiga di belakang Anna-Karin Kammerling dan Johanna Sjöberg. Chantal juga mencapai final 50 m gaya bebas yang berakhir di urutan ke-7. Dalam gaya bebas 4×100 m ia menempati posisi keempat dengan tim.