Menulis kelanjutan untuk paragraf ini - Pada bulan September 1944, Cole menyerahkan NWA ke Air Commodore Alan Charlesworth. Pada tahap perang ini, Sekutu maju ke utara dan laju operasi di daerah Darwin telah menurun. Kapten Grup Peter Jeffrey memimpin No. 1 Wing ke Kepulauan Tanimbar dan menembaki target di Selaru, tetapi mengatakan kepada Caldwell bahwa ia menganggap serangan itu sebagai usaha yang sia-sia dan hanya melakukannya untuk meningkatkan semangat pilotnya. Charlesworth menyuarakan keprihatinan mengenai No. 80 Wing, memperingatkan komando yang lebih tinggi bahwa moralnya akan turun jika tidak diberi peran yang lebih aktif dalam perang atau dipindahkan ke Australia selatan untuk beristirahat. Pada bulan Oktober, sayap tersebut telah menerima perintah untuk meninggalkan NWA untuk Morotai untuk bergabung dengan First Tactical Air Force; ini meninggalkan NWA dengan dua belas skuadron yang tersedia, termasuk satu unit Liberator dan tiga skuadron Spitfire lainnya. Sementara itu, NWA mendukung serangan di Leyte
dengan serangan di pelabuhan, fasilitas minyak, dan pengiriman di Hindia Belanda Timur menggunakan Beaufighters, Mitchells, dan Liberators. Operasi ini berlanjut hingga November dan Desember. Skuadron No. 31 dipindahkan dari Coomalie ke First Tactical Air Force di Morotai pada bulan Desember. Pada saat itu, staf kantor pusat NWA berjumlah 651, termasuk 156 petugas.