Isaac Newton se je rodil (po julijanskem koledarju, ki se je takrat uporabljal v Angliji) na božični dan, 25. decembra 1642 (NS 4. januar 1643), "ura ali dve po polnoči", v dvorcu Woolsthorpe Manor v Woolsthorpe-by-Colsterworth, naselju v okrožju Lincolnshire. Njegov oče, imenovan tudi Isaac Newton, je umrl tri mesece prej. Predčasno rojen, je bil Newton majhen otrok; njegova mati Hannah Ayscough je poročala, da bi se lahko prilegal v šolski kozarec.
njegova babica po materi, Margery Ayscough