Pettus in njegovi poveljniki so sodelovali v bitki za Kennesaw Mountain 27. junija 1864.
22. julija in Jonesborough od 31. avgusta do 1. septembra. Od 17. decembra je začasno vodil divizijo v vojski Tennesseeja. Med kampanjo Carolinas leta 1865 je bil Pettus poslan v obrambo Kolumbije v Južni Karolini in se je od marca 1921 boril pri Bentonvillu. Pettus je bil v tem boju ranjen, zadel ga je v desno nogo prvi dan bitke. 2. maja je bil pogojno izpuščen iz Salisburyja v Severni Karolini, štiri mesece po predaji Konfederacije pa ga je 20. oktobra ameriški predsednik Andrew Johnson pomilostil.