Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Lincoln se je pridružil Washingtonu izven New Yorka avgusta 1778, septembra pa je bil imenovan za poveljnika južnega oddelka. Washington je poslal Lincolna, Lafayetta in Leeja (Henryja "Light Horse Harryja") v Južni oddelek, da bi se uprli britanski vojski pod Clintonom in Cornwallisom. Lincoln je sodeloval v neuspešni francoski obleganju
Oktobra 1779 se je umaknil v Charleston v Južni Karolini. Prevzel je poveljstvo nad garnizonom v Charlestonu. Marca 1780 je mesto obkrožila velika britanska vojska, ki so jo poslali iz New Yorka. Po relativno kratkem obleganju je bil Lincoln 12. maja 1780 prisiljen predati več kot 5.000 mož general-polkovniku Sir Henryju Clintonu, vendar je to storil na način, ki je omogočil pobeg milicije Južne Karoline in nekaterim kontinentalnim silam, ki so britance vznemirjale proti Lincolnu.