Za konec leta 1945 so ameriške podmornice na otok namestile avstralske komandose z zaveznikovsko posebno enoto Z, ki je izvajala obveščevalne operacije in usposabljala na tisoče avtohtonih prebivalcev za boj proti Japoncem v gerilskem boju v bornejski kampanji v pripravah na prihod glavnih zaveznikovskih osvobodilnih misij. Po iztovarjanju na Severnem Borneu in
Labuan od 10. junija 1945 z kombinacijo avstralskih in ameriških sil, je bil otok Borneo osvobojen. Britanska vojaška uprava je uradno prevzela japonsko oblast 12. septembra 1945.