Zgodba sledi pustolovščinam pilota Garde Nagate Tanikazeja, ki je od rojstva živel v podzemnem sloju Sidonije in ga je vzgojil njegov dedek. Nikoli ni srečal nikogar drugega, vsak dan se usposablja v starem simulatorju pilota Guardianja in ga sčasoma obvlada. Po dedkovem smrti se pojavi na površje in je izbran za pilota Guardianja, prav tako kot Sidoniji znova grozi Gauna. Vprašanje: Kaj je izbran po dedkovem premoru?
Pilot varuhov