Pišite nadaljevanje za ta odstavek - Z sovjetske perspektive se je Velika domoljubna vojna začela junija 1941. V nasprotju z obstoječim paktom o nenapadanju je nemška vojska napadla Sovjetsko zvezo. Julija 1941 sta se Karl Linke in njegov sin Heinz prostovoljno pridružila Rdeči armadi, kjer je bila ena od Linkejevih vlog komisar v partizanski diviziji, vloga, ki jo je dve leti kombiniral z (komunističnim) "sekretarjem stranke" v partizanski skupini. V tej vlogi je sodeloval pri padalskih operacijah za nemškimi linijami v regiji Gomel. Leta 1944 je kot vodja izvidniške skupine sodeloval v oboroženih slovenskih partizanskih operacijah, nato pa v slovenskem narodnem vstaji proti vladi osi, ki je izbruhnil med avgustom in oktobrom 1944. Vojna.
Karel Linke se je vrnil v Moskvo zaradi poškodb, ki jih je utrpel v vojni, in zaradi smrti svojega sina Heinza, ki je bil ubit v boju s slovenskimi partizani.