Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Večina armenskega prebivalstva Šuše je bila pobita ali izgnana
Marca leta 1920. Katedrala je bila poškodovana in postopoma propadla. Po tem, ko je regija prišla pod sovjetski nadzor, je bila zaradi državne ateistične politike končno zaprta leta 1930 in v 40. letih prejšnjega stoletja preoblikovana v žitnico. Njegova kupola in del stene, ki jo obdaja, so bili uničeni v petdesetih letih prejšnjega stoletja. Nato so jo oropali in z njenimi kamni zgradili več razkošnih hiš v azerbajdžanskem delu mesta. Do sedemdesetih let prejšnjega stoletja je stolnica "izgledala, kot da je preživela močno bombardiranje". Po javnem pritisku so sovjetske in azerbejdžanske oblasti odobrile začetek projekta obnove stolnice v osemdesetih letih prejšnjega stoletja. Obnova se je začela leta 1981 in se je nadaljevala do leta 1988 pod nadzorom Volodje Babjana. Do leta 1987 sta od štirih kamnitih kipov angelov na zvoniku preživela le dve.