Napišite nadaljevanje tega odstavka - Med potopom
Med letoma 1655 in 1661 je mesto zasedlo Moskvo in cerkev je bila hudo poškodovana. Iz notranjosti je zgorela, delno je bila uničena. Lokalni škof v Grodnu Aleksander Chodkiewicz je financiral obnovo in do leta 1674 je cerkev ponovno dobila svoj nekdanji videz. V 18. stoletju pa je bila cerkev ponovno uničena med Veliko severno vojno. Poljski kralj je financiral obnovo, vendar ni jasno, ali so bila dela končana, ko je leta 1753 v mestu izbruhnil požar in cerkev ponovno močno poškodovala. 5 let je trajalo, da sem jo obnovil. Lokalni duhovnik Józef Chrebtowicz je najel znanega nemškega arhitekta Johanna Mezera, da bi nadziral gradnjo. Cerkev so ponovno posvetili 18. aprila 1758.