Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Koledž je utrpel hude človeške in kapitalske izgube med švedsko invazijo leta 1656
in kugo leta 1710, vendar so se opomogli. Po zatiranju jezuitov leta 1773 je upravljanje koledža prevzela Komisija za nacionalno izobraževanje. Po tretji delitvi Poljsko-Litovske skupnosti so karmelitke iz Kolajnih šolo vodile od leta 1797 do 1817. Leta 1817 so carske oblasti sekularizirale šolo, spremenile njeno ime v gimnazijo, uvedle osnovnošolske razrede in prenesle njeno upravo na Vilnijsko univerzo. Tako se je število študentov povečalo in preseglo 400.