Fuentes se je vrnil v Giants leta 1969 in preživel naslednje dve sezoni kot utility infielder, preden je ponovno dobil svojo začetno mesto na drugi bazi leta 1971. V sezoni 1971 se je pojavil v po sezoni, ko so njegovi Giants osvojili naslov NL West; njegov dva domača tekma v prvi tekmi sezone 1971 je bila njegova prva domača tekma.
Leta 1971 je San Franciscu pomagal prevzeti vodstvo pred Pittsburgh Piratesom, vendar se je to izkazalo za edino zmago Giantsov v seriji najboljših petih. Fuentes je bil še tri sezone drugi bejzmen Giantsa. Leta 1973 je postavil rekord v Nacionalni ligi, ko je zabeležil odstotek.993, najvišji za vsakega rednega drugega bejzmana v zgodovini lige. Ironično, Fuentes je vodil vse National League druge baze v napakah v prejšnjih dveh sezonah, preden je postavil nov rekord za odličnost. Njegov rekord je trajal 13 sezon, preden je Ryne Sandberg leta 1986 zabeležil 0,994 odstotka na drugem mestu.