Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Massa je dobro začel pri Ferrariju, na uvodni dirki v Bahrajnu se je uvrstil na drugo mesto
, in prihaja iz 21. položaja na 5. v Maleziji, premagovanje kolega Michael Schumacher, ki je začel iz 14. Toda v Bahrajnu je Massa v sobotni vaji in na dirki ponovno začel vrteti, tako da je komaj zamudil Fernanda Alonsa, končnega zmagovalca dirke. Na avstralskem GP-ju je v kvalifikacijah strmoglavil s svojim Ferrarijem, nato pa se je v prvem zavoju dirke trčil s Christianom Klienom in Nico Rosbergom. Kljub temu je Massa na Nürburgringu dosegel svoj prvi podij v karieri, ko je bil tretji za Michaelom Schumacherjem in Fernandom Alonsom. Najhitrejši krog je dosegel tudi v Barceloni leta 2006. Massa je leta 2006 dosegel še štiri stopnice na stopničkah in osvojil svoj prvi F1 pole position in svojo prvo F1 zmago na dirkališču Istanbul Park. Njegov prihodnji položaj pri Ferrariju je bil zagotovljen, ko je Michael Schumacher 10. septembra 2006 napovedal, da se bo po koncu sezone 2006 upokojil iz Formule 1. 22. oktobra je Massa zmagal domačo dirko na Interlagosu, kar je bilo prvič, da je brazilski voznik zmagal na Interlagosu od Ayrtona Senne leta 1993. Massa je sezono končal na tretjem mestu s 80 točkami, za svetovnim prvakom Fernando Alonso in Ferrarijevim soigralcem Michaelom Schumacherjem.