Morehead je delil vse nevarnosti svojih mož v 106. pešadiji Pensilvanije, ki je služila v vojni. Najprej pri Ball's Bluff, potem v polotoku, kjer so se borili pri Fair Oaksu,
Savage Station, bitka za Glendale ali Charles City, križanje cest in Malvern Hill. Potem se je boril pri Antietamu in Fredericksburgu. Čeprav nikoli ni bil ranjen, je bil Morehead ranjen, ko je bil njegov konj pod njim ustreljen v Antietamu: