Halsey je poslal TG 38.1 na jug, da napade japonska letališča v tem območju.
Invazija na Morotai, ki se je začela 15. septembra, jih je pozvala nazaj, da se pridružijo glavnemu delu TF 38 pred načrtovanim napadom na Manilo 21. septembra. Letala "Hornet" so sodelovala v drugem valu napadov na Manileski zaliv in potopila starejšo rušnico. Ameriški piloti so trdili, da so sestrelili 110 letal in uničili 95 na tleh, čeprav je prva letalska flota dejansko izgubila manj kot dva ducata letal. TF38 je trdil, da je potopil ali poškodoval sedem naftnih tankerjev, japonski zapisi pa kažejo, da je bilo devet potopljenih ali uničenih. Slab vremenski pogoj je prisilil v preklic večine napadov, načrtovanih za drugi dan, vendar se je Halsey odločil, da namesto tega napade zaliv Coron na otokih Calamian, sidrišče, ki ga pogosto uporabljajo japonski naftniki, na drugi strani Filipinov s TG 38.1 in 38.3. "Hornetova skupina je vodila skupni zračni napad, ki je potopil dva naftna plovila, šest tovornih ladij, več spremljevalcev in hidroavion. TG 38.1 je nato odplul v pristanišče Seeadler, da bi dopolnil in zamenjal zračno skupino 2 za zračno skupino 11. Clark je 1. oktobra končno zapustil Hornet.