Junija 1997 je Lissouba, ki se je bal državnega udara, poslal Cocoye, da aretirajo vodjo Cobra Denis Sassou Nguesso in razorožijo milico, ki je začela drugo državljansko vojno.
-Kaj? Njihovi nekdanji sovražniki, Ninje, so se z njimi združili proti kobram. Med drugo državljansko vojno so Cocoye igrali pomembno vlogo, saj so zavzeli jez Moukoukoulou in odklopili elektriko na velikem delu juga.