Po vpisovanju v Maine za vojaško službo v državljanski vojni je bil Edward P. Tobie Jr. uradno vpoklican v službo kot narednik v četu G 1. Maine Volunteer Cavalry. Nato je sodeloval s svojim polkom v številnih najpomembnejših bitkah vojske Unije v vojni, vključno s prvo bitko pri Winchesterju (25. maja) in bitkami pri Cedar Mountain (9. avgust), Second Bull Run (28. avgust), South Mountain (14. september), Antietam (17. september) in Fredericksburg (11. december) leta 1862; Stonemanov napad leta 1863, bitka pri Brandy Station (9. junij), med katero je bil ranjen in je bil ujetnik, in bitke pri Gettysburgu (1. julij) in Mine Run (7. november do 2. december); in bitke pri Todd's Tavern (7. maj), Haw's Shop
28. maja), Old Church (30 maja), Cold Harbor (31. maja do 12. junija), Trevilian Station (11. junija 12), St. Mary's Church (24. junija), Deep Bottom I/Gravel Hill (27. julija 29), Ream's Station II (25. avgusta) in Boydton Plank Road (27. oktobra 28).