Prvič po svojem prvem mednarodnem tekmovanju na svetovnem prvenstvu leta 2013 se Shirai ni kvalificiral za japonsko moško reprezentanco AG; s tem pa ni mogel tekmovati na svetovnem prvenstvu v umetniški gimnastiki leta 2019
v Stuttgartu, Nemčija, 4.-13. oktobra 2019. Shiraijeve nastopove je za večino sezone 2019 upočasnila precej trmasta in gnusna poškodba levega gležnja, zaradi česar ni mogel tekmovati najboljšega med svetovnim prvenstvom v Japonskem 2019. Shiraijeva najboljša možnost je bila, da dobi eno od dveh mest, ki sta bila na voljo na posebnih aparatih posameznikov, natančneje na podpisanih dogodkih na FX in VT. Vendar pa je Shirai na FX dosegel 3. mesto in na VT 5. mesto, zaradi česar se ni kvalificiral za WC in ni mogel braniti svojih svetovnih medalj iz leta 2018. Poleg tega, ker Shirai ni bil edini odsoten visoki profil (Kōhei Uchimura ni bil tam niti zaradi poškodb), so japonski moški poslali precej neizkušeno ekipo na svetovno prvenstvo 2019, kjer je v moškem tekmovanju prevladovala druga država. Shirai se je dolgo trudil, da bi se vrnil v tekmovalno obliko, da bi se opomogel od različnih poškodb, nato pa je na vsakem tekmovanju precej zarjavel.