Kmalu po Izsojevi odhodu iz opere je izbruhnila prva svetovna vojna. Avstrijski nadvojvoda Frančišek Ferdinand je bil umorjen, Avstro-Ogrska pa je mesec dni kasneje razglasila vojno in napadla Srbijo. Izso je bil ujet v hitro mobilizacijo in služil kot duhovnik v avstro-ogrski vojski. Osem mesecev je bil aktiven, vendar je bil med prvo bitko pri Isonzu resno ranjen v nogo zaradi italijanskega delca granate.
Leta 1915. Sčasoma je ozdravel, vendar se ni mogel vrniti v službo.