Leta 1938 ga je francoska vlada imenovala za guvernerja Francoske Indije, kolonije, ki jo je pretreslo nemir v tekstilnih tovarnah. V času francoskega vojaškega propada med drugo svetovno vojno je Bonvin 20. junija 1940 telegrafiral francoski vladi (takrat v Bordeauxu), v katerem je razglasil voljo ljudi francoske Indije, da nadaljujejo vojno na strani zaveznikov. Po podpisu premirja z dne 22. junija 1940 pa je
Takoj je priznal vlado maršala Petaina. Kmalu zatem je pod pritiskom polkovnika Schomberga, britanskega konzula v Pondicherryju, ki ga je opozoril, da bo britanska indijska vojska zasedla kolonijo, če ne bo izrekel za generala de Gaulla, spremenil svojo odločitev. V pozivu ljudstvu 27. junija 1940 je Bonvin napovedal, da bo francoski kolonialni imperij (in s tem tudi francoske ustanove v Indiji) "ostal na britanski strani do končne zmage". 12. julija je guverner Bonvin prek Britancev zagotovil de Gaulleu sodelovanje francoske Indije.