Taffarel je za Brazilijo debitiral 7. julija 1988 na australijskem Bicentenary Gold Cupu, kjer je igral vse štiri tekme in zadal dva gola, ko je njegova ekipa zmagala na turnirju. Bil je tudi v igri za Copa América naslednje leto.
, ki jo je zmagala tudi Brazilija (v svoji desetletni mednarodni karieri je nastopil na petih izdaj slednjega turnirja, leta 1997 pa je osvojil naslov za drugič in leta 1991 in 1995 pobral medalje za drugo mesto). Na poletnih olimpijskih igrah leta 1988 v Seulu je osvojil srebrno medaljo, saj je v polfinalu turnirja proti Zahodni Nemčiji prihranil tri penalizacije: eno v pravilnem času in dve v uspešnem streljanju Brazilije. Bil je tudi član brazilske ekipe, ki je sodelovala na svetovnem prvenstvu FIFA 1990 v Italiji, kjer je bila Brazilija izločena v osminčnem krogu po porazu 1:0 pred tekmeci in branilcem Argentino, pri čemer je Taffarel v celotnem turnirju zadal le dva gola.