V Monaku, Nemčiji in na Portugalskem je bil tretji, v Braziliji, Franciji, na Madžarskem in v Španiji pa je bil med šestimi najboljšimi (čeprav je dobil kazen za start v španski nagradi). Ferrari iz leta 1991 se je izkazal za nezanesljiv in v sezoni je imel devet odstopanj, vključno z mehansko okvaro, ko je vodil Grand Prix Belgije. Po slabi sezoni 1991 je bil Alesijev soigrač Prost odpuščen po japonski nagradi.
Ko je javno opisal avto kot "tovornjak" in si vzel enoletni dopust od dirkanja, je tako Alesi postal vodilni voznik ekipe za leto 1992. Alesi je osvojil 21 točk in končal na sedmem mestu prvenstva.