Roy je bil izvoljen v centralni odbor Krišak Samitija in Komunistične partije leta 1968. V tem obdobju se je skrival pred policijo in pomagal organizirati proteste proti predsedniku Ajubu Khanu. Na splošnih volitvah v Pakistanu leta 1970 je sodeloval v kampanji za kandidata Komunistične stranke. Po začetku vojne za osvoboditev Bangladeša leta 1971 se je preselil v Indijo in se usposabljal kot član Mukti Bahini. Pomagal je organizirati usposabljanje v kampu Mukti Bahini Balat v indijski Meghaliji. Pomagal je organizirati gerilske sile, sestavljene iz levičarskih političnih podpornikov, da bi se borili proti pakistanski vojski v
Osvobodilna vojna v Bangladešu.