"Fanshaw Bay" se je tiho umaknil nazaj v Manus, kjer so se začele priprave za Filipinske kampanje. Natančneje, "Fanshaw Bay", kot vodilna ladja za "Taffy 3", bi zagotovila zračno kritje za načrtovane pristanke
na otoku Leyte. Po kratkem obdobju dopolnjevanja v Manusu od 7. do 12. oktobra je "Fanshaw Bay" odpotovala na Filipine. Na poti je 16. oktobra "Fanshaw Bay" izgubil še eno letalo zaradi nesreče, pri čemer se je eden od njenih lovcev zrušil na krovu, preden ga je ujel kabel za zaustavitev, zaradi česar je letalo nevarno viselo nad njeno levo stranjo. Posadko in kmalu tudi letalo so našli.