Japonska vojska (kombinirana flota) je bila sestavljena iz dveh različnih flot, ki so bile razdeljene v dve ločeni operaciji, operaciji AL.
(za Aleutians) in operacija MI (za Midway). Spisek spodaj prikazuje vse ladje, dodeljene operaciji MI, vendar sta bili v bitki za Midway dejansko vključeni le Nagumova prva letalska mornarica in Kuritajeva srednja podporna sila.