Hanyu se je po okužbi z gripo umaknil iz japonskega državnega prvenstva.
-Kaj? Kljub temu je bil izbran za tekmovanje na prvenstvu štirih celin in svetovnem prvenstvu leta 2017. Na prvenstvu štirih kontinentov leta 2017 je Hanyu zaradi napake v svoji kombinaciji osvojil tretje mesto v kratkem programu z rezultatom 97,04 točk. Med svobodnim drsanjem, kljub močnemu začetku, je spet naredil napako v kombinaciji, ki naj bi bila štirikratna-trikratna kombinacija. Hanyu je nato improviziral svojo postavitev za drugo polovico programa in uspešno spremenil tri skoke v težje elemente, da bi po napaki povečal svoj rezultat. Prvi je bil na prostem drsališču z rezultatom 206,67, vendar je na splošno končal na drugem mestu za Nathanom Chenom za približno štirimi točkami.