D'Escoto se je počutil poklicanega, da služi kot duhovnik in je vstopil v seminar Maryknoll Missionary Society leta 1953. Leta 1961 je bil posvečen za duhovnika Društva, preden se je vključil v politiko. Naslednje leto je diplomiral na Columbia University Graduate School of Journalism in je bil ključna oseba pri ustanovitvi založniške hiše Maryknoll, Orbis Books, leta 1970. Bil je uradnik Svetovnega sveta cerkva. Kot privrženec teologije osvoboditve se je prikrito pridružil sandinistom. D'Escoto je januarja 1973 ustanovil Nikaragovsko fundacijo za celovit razvoj skupnosti (FUNDECI), da bi spodbujal nevladni odziv na izseljevanje tisočih ljudi v potresu v Managui decembra 1972.
-Kaj? Do svoje smrti leta 2017 je bil predsednik FUNDECI, ki deluje v več oddelkih v Nikaragvi.