Obando je bil 25. maja 1985 imenovan za kardinala in duhovnika San Giovanni Evangelista a Spinaceto, s čimer je postal prvi nikaragovski kardinal. Sodeloval je na papeškem konklavu leta 2005
ki je izbral papeža Benedikta XVI. Obando je bil predsednik Nikaragvske škofovske konference od decembra 1999 do novembra 2005.