Ko je bil III. korpus ukinjen, je bila Clarkova baterija prenesena v rezervno artilerijo v brigadi majorja Johna A. Tompkinsa. V tej formaciji je Clarkova baterija služila v zgodnjih bitkah nad kopenskim pohodom. V času bitke pri Cold Harboru je bila Clarkova baterija prenesena v artilerijsko brigado 2. korpusa pod poveljstvom polkovnika Johna C. Tidballa. V obleganju Petersburga je Clarkova baterija ostala v II korpusu pod vodstvom Tidballa in nato pod vodstvom polkovnika Johna G. Hazarda. Clark je bil rahlo ranjen.
Druga bitka pri Ream's Station leta 1864. Kasneje je spremljal svoje vojake, ki so bili že na končnem položaju, nazaj v Trenton, New Jersey, preden se je vrnil na petersburško fronto. V Petersburgu je bil Clark decembra 1864 poveljnik artilerije na sprednjih linijah 2. korpusa.