Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Issoufou je osvojil četrto mesto (s samo 7,60% glasov) na napačnih in spornih predsedniških volitvah 7. in 8. julija 1996
ki je Maïnassari prinesla popolno zmago. Skupaj s tremi drugimi opozicijskimi kandidati je bil Issoufou na drugi dan volitev v hišnem priporu, kjer je bil dva tedna. Kasneje je zavrnil sestanek z Maïnassaro, neuspešno se je pritožil na vrhovno sodišče, da bi razveljavili volitve, PNDS pa je pozval k demonstracijam. 26. julija je bil ponovno v hišnem priporu, skupaj z drugim vodilnim članom PNDS, Mohamedom Bazoomom; 12. avgusta so bili po sodniškem sklepu izpuščeni. Po prodemokratični demonstraciji 11. januarja 1997 je bil Issoufou aretiran skupaj z Ousmaneom in Tandjo in pridržan do 23. januarja.