Dokončajte naslednjo frazo: Kennedy se je vpisal v vojsko Konfederacije aprila 1861. Postal je kapitan kompanije E, 2. južno karolinskega pešskega polka, pod vodstvom kolega iz Camdena, polkovnika Josepha Brevarda Kershawa. V prvi bitki pri Manassasu ga je zadela krogla Minie in je bil hudo ranjen. Po okrevanju je postal polkovnik, ko je Kershaw postal brigadni general. Kennedyjev prvi boj v poveljstvu polka se je zgodil v spopadu na cesti Nine-Mile Road blizu Richmond, Virginia, junija 1862 med kampanjo na polotoku. Po spopadih na
V bitki za Savage's Station je bil več tednov invalid zaradi vročine. Vrnil se je k svojemu polku pravočasno za kampanjo v Marylandu. Med Stonewall Jacksonovo invazijo na Harpers Ferry je bil Kennedy s Kershawovo brigado pri zavzemanju pomembnih Maryland Heights. Vodil je svoj polk v Kershawovem nasprotnem napadu med bitko pri Antietamu, ko je del II. korpusa Unije pred njim. Vendar pa je bil v prvem napadu boleče ranjen, ko je prehajal leseno ograjo vzdolž Hagerstown Pike. Kennedy je spet pravočasno okreval za večjo bitko in vodil 2. in 8. južno-karolinsko divizijo v podporo generala Howella Cobbja na Marye's Heightsu, središču najbolj vročih bojev pri Fredericksburgu.