Ko se je komunistična upornost približala koncu, je razglasitev Malezije združila federacijo Malaje s Sarawakom in Sabahom, da bi oblikovala neodvisno državo Malezijo. Pogoji, ki so jih prinesli novi komunistični upori
V nasprotju z novo neodvisno malezijsko državo je MCP zatiral nasprotnike v svojih lastnih vrstah, kar je povzročilo razcepljenje številnih frakcij, ki so se začele boriti med seboj. To je kulminiralo s končnim razpustitvijo Malajske komunistične stranke leta 1989, ko je radikalna levica v državi začela iskati alternative marksizmu-leninizmu.