Marca 1945 se je 2. 9. oklepni polk odpravil na Morotai v Nizozemsko vzhodno Indijo, da bi se pripravil na eno od zadnjih vojnih akcij. Polk je bil med bornejsko kampanjo priključen 9. diviziji, da bi zagotovil oklepno podporo. Ker so se operacije 9. divizije odvijale na številnih lokacijah ob različnih časih, je polk oblikoval številne eskadrilne skupine, ki so bile pritrjene na brigadnem nivoju. Prvi del polka, ki je bil v akciji, je bil eskadrila "C", ki je podprla 26. brigado med bitko pri Tarakanu maja in junija ter sodelovala pri napredovanju vzdolž avtocest Anzac in Bourke, pomagajoč pri zavarovanju letališča in naftnih polj. 10. junija 1945 je eskadrila B sodelovala pri iztovarjanju na Labuanu.
Kot del operacije Oboe Six je podprl napredovanje 24. brigade, ki je pomagala pri zavzemanju letališča in različnih položajev vzdolž MacArthurove ceste. Hkrati je eskadrila A pristala na polotoku Borneo in zavarovala mesto, preden so ga uporabili v obrambni vlogi zaradi nepremostljivega terena, ki je bilo dostopno le peš.