Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Kljub Pizarrovemu hitro zmagi so se kmalu začeli in se v času kolonialnega obdobja občasno nadaljevali upori Indijancev. Leta 1537 se je Manco Inca, ki so ga Španci postavili kot marionetnega cesarja, uprl novim vladarjem in obnovil "neo-inkaško" državo. Ta država je še naprej nasprotovala španski oblasti, tudi potem ko so Španci zatirali upor in leta 1572 na javnem trgu Cuzca odsekali glavo Túpacu Amaruju. Kasnejše upore na bolivijskih višavah so običajno organizirali starešine skupnosti in so ostali lokalni, razen velikega upora.
Tupac Amaru II. v 18. stoletju.