Vzporedno vzponu Atene kot pomembne sile v Grčiji je privedel do trenja med njo in Šparto ter dveh velikih spopadov (prva in druga peloponeska vojna), ki sta opustošila Grčijo. Šparta je v teh vojnah utrpela več porazov, med njimi je bila prvič predaja celotne špartske enote pri Sphacteria leta 425 pr. n. št. Kljub temu je na koncu zmagal, predvsem zaradi pomoči, ki so mu jo dali Perzijci. Pod vodstvom admirala Lizandra je peloponeska flota, ki jo je financirala Perzija, zavzela mesta atenske zveze in odločilno pomorsko zmago pri Aegospotami
prisilil Atene, da so kapitulirale. Atenska poraza je v Grčiji postavila Šparto in njene vojaške sile na prevladujoč položaj.