Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Keramične najdbe kažejo, da je bil Kolonai naseljen v prazgodovinskih časih, vendar ni znano, ali je bilo med tem obdobjem naselitve in grškim obdobjem kakršno koli kontinuiteto. Grški keramični material se pojavi na mestu iz 7. stoletja pred našim štetjem, kar označuje njegovo ustanovitev kot grško naselje. V obdobju, ko je Daës iz Kolonaja pisal (verjetno 4. stoletje pr. n. št.), so prebivalci Kolonaja mislili, da so jih ustanovili Eolski Grki. Glede na to, da je bil Lesbos tudi etnično eolski in Kolonai je bil eno od tako imenovanih aktejskih mest, ki jih je Atena vzela Mitilenu po koncu mitilenskega upora.
Leta 427 pr. n. št. je verjetno, da je Mitilena ustanovila Kolonai in ga nato nadzorovala. Pokvarjen odlomek geografja Strabona namesto tega kaže, da je Kolonai pripadal peraji Tenedosa, vendar je zdaj med konsenzom soglasje, da bi se morali rokopisi nanašati na to, da pripada peraji Lesbos.