Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Pinturault ni mogel začeti sezone v Söldenu oktobra 2012, saj se je med igranjem tenisa poškodoval na gležnju in moral biti tri mesece odsoten. Decembra je osvojil svojo drugo tekmo na svetovnem pokalu v slalomu v Val-d'Isère, kjer je navdušil domače navijače z briljantnim drugim tekom pod reflektorji in se povzpel s šestega mesta. Prepričljivo je premagal nemškega Felixa Neureuthera za pol sekunde in prihodnjega prvaka svetovnega pokala Marcela Hirschera, ki je vodil za 0,57 sekunde po prvem tekmu. Pinturaultova tretja zmaga je bila na superkombiniranem v Wengenu, Švica, kjer so bile njegove nadvse dobre veščine slaloma ključne. Po uvrstitvi na 22. mesto v spustnem delu je končal 1,15 sekunde pred Hrvatom Ivicom Kostelićem. Na treningu za spust je bil prvič na spustnih smučeh že več mesecev, saj je po operaciji na levem gležnju avgusta, da bi popravil vezi, poškodovane med igranjem tenisa, zamudil predsezonsko hitrostno vadbo. Pinturault ni osvojil medalje na svetovnem prvenstvu leta 2013
, vendar je imel štiri top-šest konča. Teden kasneje je osvojil četrto zmago na svetovnem prvenstvu, svojo prvo v velikanskem slalomu v Garmischu v Nemčiji. Drugi po prvem tekmu je Pinturaultov skupni čas bil 0,60 sekunde pred drugim tekmovalcem Hirscherjem. 15. marca je bil nagrajen kot 2013 Longines Rising Star, kot najboljši mladi dirkač (mlajši od 23 let) sezone.