Napisati nadaljevanje za ta odstavek - Podaljšani konflikt je izčrpal gospodarstvo republike, ki je bilo odvisno od donosne trgovine z Otomanskim cesarstvom. Do 1660-ih, kljub povečani pomoči drugih krščanskih narodov, se je začela vojna. Osmani so na drugi strani, ko so uspeli ohraniti svoje sile na Kreti in okrepili pod sposobnim vodstvom družine Köprülü, leta 1666 poslali zadnjo veliko odpravo pod neposrednim nadzorom velikega vezira. Tako se je začela zadnja in najbolj krvava faza obleganja Candie, ki je trajala več kot dve leti. Končala se je s pogajanji o predaji trdnjave, s čimer je bila zapečatena usoda otoka in se je vojna končala z osmansko zmago. V končni mirovni pogodbi je Benetka obdržala nekaj izoliranih otoških utrdb ob Kreti in dosegla nekaj ozemeljskih dobičkov v Dalmaciji. Beneška želja po maščevanju je le 15 let pozneje pripeljala do nove vojne.
, iz katerega bi Venecija izšla zmagovalna. Kreta pa je ostala pod osmanskim nadzorom do leta 1897, ko je postala avtonomna država; končno je bila združena z Grčijo leta 1913.