Kot palatin je nadvojvoda Aleksander Leopold sprva vodil zmerno vlado. Vendar pa je svojo politiko spremenil po jakobinski zaroti leta 1794, ki ga je močno razočarala. Cilj zarote je bil, da bi Madžarska postala neodvisna od habsburške monarhije, z Aleksandrom Leopoldom kot kraljem. Upornike je hudo kaznoval in zmerne dostojanstvenike zamenjal z politiko zatiranja. Istega leta je Tadeusz Kościuszko, ki je želel zagotoviti nevtralnost Avstrije med vstajo proti cesarski Rusiji in Kraljevini Prusiji
, je ponudil krono Poljske nadvojvodu Aleksandru Leopoldu. Ponudbo so zavrnili.