Izpolnite naslednji stavek: Pablo Morillo
6. maja 1816 so končno zavzeli Santafé. Kot drugi voditelji gibanja za neodvisnost je Caldas pobegnil iz mesta, prvotno z namenom, da bi prišel v Buenaventuro, da bi pobegnil v tujino. Na poti pa bodoči podpredsednik Sámano zmaga nad republikanskimi vojaki v bitki pri la Cuchilla de El Tambo in ponovno osvoji Popayán, Caldas pa se je moral skriti na kmetiji Paisbamba v Sotaráju, kjer so ga leta 1816 kmalu aretirali španski rojalisti. Nato so ga poslali nazaj v Santafé in ga 29. oktobra 1816 na ukaz Morilla, grofa Cartagene, usmrtili na trgu San Francisco. Ko je bil Caldas tik pred usmrtitvijo in so se ljudje, ki so bili prisotni tam, pritoževali za življenje znanstvenika, je Morillo odgovoril: "Španija ne potrebuje učenjakov" (špansko: "España no necesita sabios"). Preden je umrl, je na steno napisal veliko grško črko θ, kar je bilo razloženo kot vzklik: "Oh, dolg in temen odhod!" (Špansko: "¡Oh larga y negra partida!". V klasičnih Atenah se je Theta uporabljala kot kratica za grško θάνατος (thanatos, <unk>smrt<unk>).