Popolni naslednjo frazo: Cena se je presenetljivo vrnil kot zadnji udeleženec tekme Royal Rumble, ko je zmagal in tradicionalni WrestleMania XXIV naslovni udarec, tako da je nazadnje izločil Triple H. Namesto da bi čakal do WrestleManije, je naslovni udarec bil izplačan proti takratnemu prvakom WWE Randyju Ortonu na No Way Out leta 2008 v tekmi, ki jo je Cena zmagal z diskvalifikacijo in zato ni dobil prvenstva. Naslednjo noč na Raw, je Cena ponovno nastopil v WrestleManijini tekmi za prvenstvo WWE, kjer je premagal Ortona v ne-naslovni tekmi z Triple H kot posebnim gostujočim sodnikom, zaradi česar je bil to trojni boj med tremi moškimi, med katerim ga je Orton zadel. Cena ni uspel ponovno osvojiti naslova na Backlashu v smrtonosni štirikolesni eliminacijski tekmi, v kateri ga je izločil Orton. Cena je med tem dvobojom izločil JBL, kar je obnovilo njihov spor iz leta 2005. Cena je premagal JBL na
Sodni dan in potem na One Night Stand v tekmi Prve krvi. Cena tudi ni uspel ponovno osvojiti prvenstva WWE od Triple H v Noči prvakov. Pozneje je JBL premagal Ceno v New York City Parking Lot Brawl na The Great American Bash v juliju, da bi končal spor. V epizodi "Raw" 4. avgusta je Cena drugič postal svetovni prvak v skupinah, ko je z Batisto premagal Codyja Rhodesa in Teda DiBiasa, vendar ni uspel obdržati prvenstva naslednji teden proti nekdanjim prvakom. Cena je izgubil pred Batisto na SummerSlamu. Kmalu zatem je bil Cena imenovan za enega od štirih tekmovalcev za CM Punkovo svetovno prvenstvo v težki kategoriji v tekmi za prvenstvo na Unforgiven, vendar ga je zamenjal Rey Mysterio, potem ko je v tekmi na SummerSlamu utrpel hernijo diska v vratu, ki je zahtevala operacijo. Cena je bil uspešno operiran, da bi popravil poškodbo.