Francken je postal državni sekretar za azil in migracije v prvi vladi Charlesa Michela leta 2014, kjer je postal znan po svojem kontroverznem pristopu ničelne tolerance do nezakonitega priseljevanja sredi evropske migrantske krize.
-Kaj? Francken in N-VA sta nasprotovala podpori Belgije Globalnemu sporazumu za migracije, zaradi česar sta decembra 2018 zapustila koalicijsko vlado in s tem sprožila njen propad.