Preston je eden izmed mnogih ljudi, ki so jih imenovali "Peti Beatle". V nekem trenutku med snemanjem "Get Back" je John Lennon predlagal, da se pridruži skupini (na kar je Paul McCartney odvrnil, da je dovolj težko doseči dogovore s štirimi). Preston je igral orgla in električni klavir za Beatlese med več posnetki Get Back; nekateri od teh posnetkov so se pojavili v filmu Let It Be in na njegovem spremljevalnem albumu. Preston je tudi spremljal bend na električnem klavirju za
Koncert na strehi je bil zadnji javni nastop skupine. Aprila 1969 je bil njihov singl "Get Back" pripisan "The Beatles z Billyjem Prestonom", edini čas, ko je bila takšna skupna kreditna vrednost podana na uradni izdaji Beatlesov (v nasprotju z nesankcionirano ponovni izdajo nekaterih posnetkov iz Hamburgske dobe, na katerih so bili podporna skupina za Tonyja Sheridana). To zasluge so pripisali Beatlesi, da bi odražali obseg Prestonove prisotnosti na skladbi; njegov električni klavir je izreden skozi celotno skladbo in igra podaljšan solo. Preston je delal tudi v bolj omejeni vlogi na albumu "Abbey Road", prispeval je orgel na skladbe "I Want You (She's So Heavy) " in "Something".