Z Torontom je bil Cone 4 na 3 z 2.55 ERA in 47 strikeoutov. Skupaj z 214 strikeoutov, ki jih je imel z Metsom, je 261 strikeoutov vodil glavne lige in so bili karierne najvišje. Cone je po drugič v karieri dosegel post sezono, ko so Blue Jays osvojili vzhodno ligo. Jays so porazili Oakland Athletics v ameriški ligi leta 1992
, in Atlanta Braves v svetovnem prvenstvu, da Cone svoj prvi svetovni prstan serije, in postane prva kanadska ekipa, ki je osvojil svetovno serijo. Cone je v končnici sezone dosegel 3,22 ERA.