Pozdravil se je bolezni, septembra 1943 pa je bil imenovan za uradnika za zvezo v glavnem štabu 6. divizije. Tistega meseca je bil povišan v začasnega majorja, kar se je spremenilo v maj 1945. Kasneje se je udeležil šole za osebje v Cabarlah, Queensland, in po končanem tečaju je bil oktobra 1944 postavljen v 1. avstralsko sekcijo za kombinirane operacije. Bil je pripisan sedežu 7. divizije in pomagal načrtovati amfibijske pristanke na
Morotai in Balikpapan. Ferguson je bil omenjen v Despatches za njegovo načrtovanje.