S svojo enoto se je boril v Fort Henryju, Fort Donelsonu, Korintu, Shilohu in Hatcher's Run. Nato je zbolel za tifoidno vročino in je bil 1. avgusta 1862 odpuščen. Po okrevanju se je vrnil v Chicago Mercantile Independent Battery Light Artillery, kjer se je boril pri Arkansas Post,
Port Gibson, Champion Hill, Big Black River Bridge, Vicksburg in Mansfield. Pri Mansfieldu so aretirali brigado in Arnolda zaprli. Četrnajst mesecev je bil zaprt v taborišču Ford v Teksasu.