Elliott se je ponovno vpisal za drugo službo 1. januarja 1864 v Warrentonu v Virginiji. Elliot in njegov polk so se nato vključili v unijsko ekspedicijo v Turčijo do 4. januarja; kampanjo od Rapidana do Jamesa (4 maja do 12. junija), ki je vključevala bitko pri Toddovi krčmi (7 maja); kopensko kampanjo poročnika generala Ulysseja S. Granta, ki je vključevala bitko pri rumeni krčmi (11 maja), Sheridanov napad na Richmond do 24. maja in bitke pri Haw's Shop (28. maja), Totopotomoy Creek
(28. - 31. maja), Cold Harbor (1 - 12. junija), Trevilian Station (11. - 12. junija). Elliott je nato 21. junija med operacijami Unije utrpel strelno rano v prepone in stegno. Po okrevanju od ran je bil 9. septembra premeščen v topniško baterijo. Z novim polkom je sodeloval v Richmondsko-petersburški kampanji, nato pa se je boril v bitkah pri Poplar Springs Church (29. septembra - 2. oktobra 1864), Hatcher's Run (5-7. februarja 1865) in Dinwiddie Court House (30-31. marca), preden je vstopil v bitko Appomattox in bitko pri petih vilicah (1. aprila).