Bioremediacija okolja, onesnaženega z naftom, je proces, v katerem se biološke poti v mikroorganizmih ali rastlinah uporabljajo za razgradnjo ali zapiranje strupenih ogljikovodikov, težkih kovin in drugih hlapnih organskih spojin, ki jih najdemo v fosilnih gorivih. Izlivi nafte se pogosto pojavljajo v različnih stopnjah skupaj z vsemi vidiki dobavne verige nafte, kar predstavlja kompleksno vrsto vprašanj tako za okolje kot za javno zdravje. Medtem ko tradicionalne metode čiščenja, kot so kemična ali ročna omejitev in odstranitev, pogosto dajejo hitre rezultate, je bioremediiranje manj delovno intenzivno, drago in preprečuje kemično ali mehansko škodo. Učinkovitost in učinkovitost prizadevanj za bioremediiranje temeljijo na ohranjanju idealnih pogojev, kot so pH, potencial RED-OX, temperatura, vlaga, količina kisika, razpoložljivost hranil, sestava tal in struktura onesnaževal, za želeni organizem ali biološko pot za olajšanje reakcij. Tri glavne vrste bioremediation, ki se uporabljajo za razlitje nafte, vključujejo mikrobiološko remediiranje, fitoremediiranje in mikoremediiranje. Bioremediiranje je bilo izvedeno pri različnih pomembnih razlitjih nafte, vključno z razlitjem Exxon Valdez leta 1989.
incident, pri katerem je uporaba gnojil na prizadeti obali povečala stopnjo biorazgradnje.