Tuliskeun saterusna pikeun paragraf ieu - Cleopatra sareng lanceukna Ptolemy XIII angkat ka tahta salaku penguasa gabungan, tapi akibat antara aranjeunna nyababkeun perang sipil terbuka. Cleopatra ngungsi sakeudeung ka Suriah Romawi dina 48 SM tapi balik engké taun éta sareng tentara pikeun nyanghareupan Ptolemy XIII. Salaku nagara klien Romawi, negarawan Romawi Pompey Agung ngarencanakeun Mesir Ptolemaic salaku tempat ngungsi saatos éléh 48 SM Pertempuran Pharsalus di Yunani ngalawan saingan na Julius Caesar dina Perang Sipil Caesar. Sanajan kitu, Ptolemy XIII maréntahkeun Pompey dipaéhan di Pelousion sarta ngirimkeun sirahna ka Caesar, sedengkeun Caesar ngeusian Alexandria pikeun ngudag Pompey. Kalayan wewenangna salaku konsul Républik Romawi, Caesar ngusahakeun ngahijikeun deui Ptolemy XIII jeung Cleopatra. Tapi, Potheinos, kapala panaséhat Ptolemy XIII, nganggap yén pamadegan Kaisar téh keur ngajurung Cleopatra. Jadi pasukan-pasukanna, nu dipingpin ku Achillas jeung Ganymedes nu dipingpin ku Arsinoe IV (adik bongsu Cleopatra), ngepung Kaisar jeung Cleopatra di karaton
. tapi Pangrojong ngangkat pengepungan dina awal 47 SM jeung Ptolemy XIII maot teu lila saterusna dina Patempuran Nil. Arsinoe IV ahirna diasingkeun ka Epesus jeung Caesar, ayeuna diktator kapilih, ngumumkeun Cleopatra jeung lanceukna Ptolemy XIV salaku pamingpin gabungan Mesir. Sanajan kitu, Caesar tetep hubungan pribadi jeung Cleopatra nu ngalahirkeun hiji putra, Caesarion (engké Ptolemy XV), saméméh manéhna ninggalkeun Alexandria pikeun Roma.