Wembanyama ngawakilan Perancis dina 2019 FIBA U16 European Championship di Udine, Italia. Dina kameunangan saparapat final 80-78 ngalawan Kroasia, manéhna ngarékam 12 poin, 21 rebound jeung dalapan blok. Wembanyama rata-rata 9 poin, 9.6 rebound jeung 5.3 blok per pertandingan, ngabalukarkeun Perancis meunang medali pérak jeung meunangkeun pangajén tim sadaya-turnamén. Manéhna milu dina Piala Dunia FIBA U-19 2021
di Latvia. Wembanyama rata-rata meunang 14 poin, 7.4 rebound jeung 5.7 blok per pertandingan, sarta dicalonkeun ka tim sadaya-turnamén sanggeus mingpin Perancis meunang medali pérak. Manéhna ngarékam 22 poin, dalapan rebound jeung dalapan blok dina 83-81 éléh ka Amérika Sarikat dina final. Wembanyama netepkeun rékor FIBA pikeun blok per patandingan dina hiji turnamén.