Tuliskeun saterusna pikeun paragraf ieu - Salah sahiji kelompok tilu, dipikawanoh salaku "Thugut's Benjamins" (bantuan dipercaya ka Menteri Luar Negeri Johann Amadeus Francis de Paula, Baron of Thugut, salila kampanye 1799, Weyrother dilayanan salaku kapala staf ka Feldzeugmeister Pál Kray, dimana anjeunna dibédakeun dirina di Legnago (26 Maret), Magnano (5 April) jeung, ayeuna porsi salaku perwira hubungan jeung Rusia Field Marshal Alexander Suvorov, di Novi
dina 15 Agustus. Manéhna tuluy ngarencanakeun lalampahan pasukan Rusia di handapeun Alexander Suvorov meuntas Saint Gotthard Pass. Dipromosikeun jadi "Oberst" (kolonel) dina 5 Pébruari 1800, Weyrother dibéré komando Infanterie-regiment Nr. 7 "Schröder", nu mangrupa bagian ti tentara di Jérman dina Pál Kray, tapi tatu salajengna jeung galur kampanye nyababkeun manéhna ninggalkeun tentara pikeun cageur. Dipanggil deui dina usum gugur 1800, Kaisar Francis II ditugaskeun anjeunna janten kapala staf ka Archduke John Austria, komandan anyar tentara di Bavaria, sareng "Adlatus" na (panaséhat utama) Franz von Lauer. Ku percaya yén tentara Perancis Jean Moreau keur mundur, Weyrother ngayakeun ngudag agresif ngaliwatan rupa bumi anu leuweung-leuweung ku opat kolom anu henteu saling ngadukung. Gantina, Moreau teu eureun-eureun, ngambekan pasukan Austria, sarta ngalingkupkeun sisi kénca. Patempuran Hohenlinden nu hasilna jadi musibah keur Austria, sacara efektif ngeureunkeun Perang Koalisi Kadua. Sanajan kitu, Weyrother diangkat jadi panaséhat militér ka Menteri Luar Negeri anyar, Graf Ludwig Cobenzl dina rundingan sanggeus gencatan senjata Steyr, nu ngakibatkeun Peace of Luneville dina 1801.