Diokno lahir di Manila, anak kahiji ti genep anak ti Jose Manuel "Chel" Diokno, pangacara jeung dekan pangadeg De La Salle University (DLSU) College of Law, jeung Divina Aromin, panulis. Manéhna dingaranan ngaran nini-nini, almarhum sénator Filipina jeung pejuang kabébasan, Jose W. Diokno, bapa hak asasi manusa jeung pangadeg Free Legal Assistance Group (FLAG), anu maot genep bulan saméméh manéhna lahir. Aki buyut Pepe nyaéta Jenderal Ananías Diokno, pamingpin pasukan Visayan nalika Revolusi 1896 sareng perang ngalawan Amérika Serikat
. tapi