Lengkepan kalimah di handap ieu: Dina Juni 1861, O'Neal diangkat jadi kaptén jeung maréntah tilu kompi prajurit. Sanggeus nepi ka Richmond manéhna diangkat jadi mayor ti 9th Regiment Alabama Infantry sarta dipromosikeun jadi letnan kolonel dina usum gugur. Dina Maret 1862, anjeunna diangkat jadi kolonel ti infantri Alabama ka-26, sarta maréntahkeun resimen ieu salila Kampanye Semenanjung. Dina Patempuran Tujuh Pines, kuda na ditelasan di handapeun anjeunna, sarta anjeunna parah tatu ku fragmen cangkang. Manéhna meunang pujian pikeun pagelaranana dina Patempuran Chancellorsville. Dina taun 1863, anjeunna maréntahkeun brigade di divisi Mayor Jenderal Robert E. Rodes, sarta mingpin éta dina Patempuran Gettysburg, Patempuran Manassas Gap jeung di Perang Perang Amérika Sarikat.
Patempuran Run Tambang. Dina awal taun 1864, resiménna dikirim deui ka Alabama pikeun ngarékrut réngkingna nu geus réngsé, tapi gancang dititah ka Dalton, Géorgia, di mana O'Neal ngabawah brigade Brigjen James Cantey di Angkatan Darat Tennesse. O'Neal maréntahkeun brigade ieu salila sésana Kampanye Atlanta. Sanggeus Lt. Gen. John Bell Hood dibéré paréntah Angkatan Darat Tennesse, O'Neal dibebaskeun sarta dilayanan dina tugas misah pikeun sesa perang. Manéhna diangkat jadi brigadier jenderal dina tanggal 6 Juni 1863, tapi ieu diangkat ku Jenderal Robert E. Lee jeung promosi ieu dibatalkeun ku Présidén Konfederasi Jefferson Davis.