Dina tanggal 12 Maret 2011, sanggeus gempa jeung tsunami di Jepang kalér-wétan
, Kan ngapung dina helikopter pikeun niténan Fukushima I Nuclear Power Plant sarta pohara kalibet dina usaha pikeun éféktif ngabales musibah nuklir Fukushima Daiichi. Naoto Kan nyandak sikep anti-nuklir anu beuki ningkat dina sababaraha bulan saatos bencana Fukushima. Dina bulan Méi, anjeunna maréntahkeun yén Hamaoka Nuclear Power Plant anu parantos sepuh ditutup kusabab sieun gempa bumi sareng tsunami, sareng anjeunna nyarios yén anjeunna bakal beku rencana ngawangun réaktor anyar.