Tuliskeun saterusna pikeun paragraf ieu - Saatos invasi Jerman ka Polandia, anu ngamimitian Perang Dunya II dina Séptémber 1939, "SS-Totenkopf-Standarte Brandenburg" asup ka kota pikeun ngalakukeun sagala rupa kajahatan ngalawan populasi. Baheula dina ahir Séptémber 1939, Jérman maéhan sandera Polandia ti Kłodawa di leuweung Rzuchów anu caket, sareng salah sahiji walikota sateuacan perang, Władysław Zalewski, dibunuh dina bulan Nopémber 1939 di Środa Wielkopolska. Salila penjajahan ku Nazi Jérman
, kota ieu diganti ngaranna jadi "Tonningen" (1940<unk>1945). Baheula taun 1940, gerakan résistansi bawah tanah Polandia dibentuk di kota, sarta ogé sakola Polandia rusiah diayakeun. Dina taun 1941, leuwih ti 1.500 urang Yahudi Kłodawa dibunuh ku Nazi Jerman di kamp pemusnahan Chełmno. Dina 1943, Jérman néwak sababaraha anggota perlawanan Polandia lokal, anu saterusna dihukum pati atawa dipenjara. Pendeta paroki Kłodawa, Bapa Teofil Choynowski, tiwas di kamp konsentrasi Dachau dina taun 1943. Kłodawa ahirna dibébaskeun dina tanggal 19 Januari 1945 ku Tentara Beureum, sarta dipulangkeun ka Polandia.