Nalika New York State Agricultural College (nu saterusna dihijikeun kana Cornell University) diadegkeun di Ovid, New York, Kimball jadi Profesor Kimia jeung Ékonomi Géologi. Kalayan wabah Perang Sipil Amérika dina taun 1861, présidén kuliah, Maj. M. R. Patrick diangkat jadi Brigadier-Jenderal Sukarelawan; Kimball jadi Kapala Staf Brigjen Patrick, kalayan pangkat Kaptén. Anjeunna ngalaman jasa lapangan di handapeun Mayor Jenderal Irvin McDowell, sarta hadir dina Patempuran Bull Run Kadua (28-30 Agustus 1862); Patempuran Chantilly
(1 Séptémber 1862); Patempuran Gunung Kidul (14 Séptémber 1862); Patempuran Antietam (17 Séptémber 1862); Patempuran Fredericksburg (11-15 Désémber 1862); Patempuran Chancellorsville (30 April-6 Méi 1863); jeung Patempuran Gettysburg (1 Juli-13, 1863). Brigjen Patrick tuluy diangkat jadi Provost Marshal of the Army of the Potomac, jeung Kaptén Kimball ngabarengan manéhna ka ditu, ngawula di Staf Jénderal di handapeun Jénderal George B. McClellan, Ambrose Burnside, Joseph Hooker, jeung George Meade.