Dina tanggal 23 Agustus 2015, Bonaventura nyieun debut usumna nalika Milan éléh 2<unk>0 ka Fiorentina. Kaulinan saterusna ngalawan Empoli, Bonaventura asup ka lapangan salaku gaganti Suso dina menit ka-55 sarta junun mantuan gol unggul Luiz Adriano ti tendangan pojok 15 menit saterusna. Tanggal 19 Séptémber, Bonaventura ngabantuan Carlos Bacca ngéléhkeun gawang kahiji sarta nyetak langsung tina tendangan bébas dina kameunangan 3-2 ngalawan Palermo. Manéhna ogé meunangkeun hiji deui assist jeung gol dina pertandingan Milan saterusna, meunangna 2 ka 3 ngalawan Udinese. Sakali deui, manéhna mantuan duanana Carlos Bacca jeung Philippe Mexès 'gol ngalawan Lazio dina 3-1 kaluar meunang dina 1 Nopémber. Manéhna terus ngajalankeun ogé handapeun palatih tim Siniša Mihajlović sarta jadi pamaén fundamental pikeun timnya sapanjang usum. Sanggeus leungit hiji 0<unk>0 draw ngalawan urut tim Atalanta na ngaliwatan gantung, anjeunna ngoleksi pembuka dina 4<unk>1 eleh Sampdoria dina 28 Nopémber. Anjeunna nyetak deui dina pertandingan salajengna dina tanggal 1 Désémber, 3-1 Coppa Italia ngéléhkeun Crotone, ngalangkungan tendangan bébas 20-yard anu cemerlang. Tanggal 20 Désémber anjeunna ngabantosan gawang Carlos Bacca sareng nyetak gawang telat nalika Milan ngéléhkeun Frosinone 4-2. Tanggal 17 Januari 2016, anjeunna nyadiakeun hiji deui bantuan pikeun Carlos Bacca nalika Rossoneri ngéléhkeun Fiorentina 2 <unk> 0. Manéhna réngsé usum kalawan 7 gol jeung 8 assists dina sagala kompetisi salaku Milan réngsé 7th di Serie A
, sarta éléh di final Coppa Italia ngalawan Juventus, sanggeus éléh 1-0 dina waktu tambahan.