I 2011 blev museet lukket på grund af sikkerhedsproblemer efter den libyske borgerkrig.
og efterfølgende uroligheder. Museet forblev lukket i 2020. Under krigen i 2011 gik oprørere ind i museet, og nogle få genstande, der tilhørte Muammar Gaddafi, blev beskadiget. De mest værdifulde genstande blev opbevaret på et andet sted af museets personale. De resterende genstande vedrørende Gaddafi blev opbevaret af personalet.