Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter udbruddet af borgerkrigen
, sluttede han sig til guerrillagruppen Guatemalas Arbejderparti (Partido Guatemalteco de los Trabajadores eller PGT). I denne periode blev han arresteret, retsforfulgt og fængslet, hvorefter han tilbragte syv år i eksil i Mexico. Han vendte tilbage til Guatemala i 1971 og hjalp med at danne det væbnede folks revolutionære organisation (Organización Revolucionaria del Pueblo en Armas, ORPA). Han kæmpede under "nom de guerre" Gaspar Ilom, som han tog fra en karakter i "Hombres de maíz", en af sin fars romaner. Da fire gerillagrupper, herunder disse to, kombinerede sig for at skabe den guatemalanske nationale revolutionære enhed (Unidad Revolucionaria Nacional Guatemalteca, URNG) i 1982, opstod Asturias som en af de fire ledere af sin generelle kommando. Han var den eneste af lederne, der ikke deltog i undertegnelsen af fredsaftalen med regeringen i begyndelsen af 1990'erne.