Ved at binde ("ligere") DNA-fragmenter fra forskellige kilder sammen kan forskere skabe rekombinant DNA, DNA'et, der ofte er forbundet med genetisk modificerede organismer. Rekombinant DNA bruges almindeligvis i forbindelse med plasmider: korte cirkulære DNA-molekyler med et par gener på dem. I den proces, der er kendt som molekylær kloning, kan forskere forstærke DNA-fragmenterne ved at indsætte plasmider i bakterier og derefter dyrke dem på plader af agar (for at isolere kloner af bakterieceller<unk>"kloning" kan også henvise til de forskellige midler til at skabe klonede ("klonale") organismer).
Rekombinant DNA