Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Den 30. januar 2013 lavede Varane sin "El Clásico" debut mod Barcelona i 2012-13 Copa del Rey
- Hvad? Han stoppede en række farlige forsøg fra Barcelona, herunder et skud fra Xavi, som han rensede fra mållinjen. Han capped sin præstation med et hovedmål i spillet, som sluttede 1<unk>1. Han blev også den næstyngste udenlandske spiller til at score for Real Madrid i en Clásico-kamp. I returkampen på Camp Nou den 26. februar 2013 scorede Varane Madrids tredje mål i en 3-1 sejr med en hovedkamp fra et hjørnespark fra Mesut Özil. Varane fik ros fra den tidligere VM-vinder Bixente Lizarazu efter hans præstationer mod Barcelona og Manchester United. Han sagde: "Vi taler om en knægt i Real Madrid, der har fjernet Pepe, og Pepe, med alle sine ting, er stadig en stor centerhalvdel. Hans præstation mod Manchester United og Barcelona var ekstraordinær". Varane fortsatte med at imponere i kvartfinalen i Champions League mod Galatasaray, hvor han hjalp Madrid med at holde clean sheet i en 3-0 triumf. Alle hans 27 pas fandt hans holdkammerater uden nogen afbrydelse, og alle hans tacklinger lykkedes, med de fleste på Didier Drogba.