Efter at World Trade Center i 1993 blev bombet, ændrede hans forskningsområde sig til terrorangreb. I de følgende år var han involveret i efterforskningen af 1998 USA ambassade bombninger
i Tanzania og Kenya, 2000 USS "Cole" bombning i Aden, Yemen, og de ødelæggende angreb af 11. september 2001, på World Trade Center og Pentagon. I løbet af årene blev han derfor ekspert på al-Qaeda.