Burrows blev forfremmet til oberstløjtnant den 1. maj 1800. Kvasikrigen med Frankrig fortsatte indtil september samme år, hvor sagen endelig blev afgjort. Kongressens insisteren på, at omkostningerne til flåden straks skulle reduceres, forårsagede betydelig forlegenhed for Burrows i hans bestræbelser på at etablere Marine Corps på fredstid. Den
Barbariske krige brød ud kort tid efter, og korpsets hovedopgave var at levere afdelinger til flådeskibe til tjeneste i Middelhavet.