Marcello Lippi overtog stillingen som Juventus-manager i starten af sæsonen 1994/95. Hans første sæson som leder af klubben var en succesfuld, da Juventus indspillede deres første Serie A-mesterskab siden midten af 1980'erne, samt Coppa Italia. I denne periode spillede Ciro Ferrara, Roberto Baggio, Gianluca Vialli og en ung Alessandro Del Piero. Lippi førte Juventus til deres første Supercoppa Italiana og Champions League den følgende sæson, hvor de slog Ajax på straffespark efter en 1-1-træk, hvor Fabrizio Ravanelli scorede for Juventus. Klubben hvilede ikke længe efter at have vundet Europacuppen: flere højt ansete spillere blev bragt ind i foldet i form af Zinedine Zidane, Filippo Inzaghi og Edgar Davids. På hjemmebane vandt Juventus Serie A-titlerne i 1996<unk>97 og 1997<unk>98, samt UEFA Super Cup i 1996 og Intercontinental Cup i 1996.
- Hvad? Juventus nåede 1997 og 1998 Champions League-finalen i denne periode, men tabte til henholdsvis Borussia Dortmund og Real Madrid. Efter to og en halv sæson fravær vendte Lippi tilbage til klubben i 2001, efter hans erstatning Carlo Ancelottis afskedigelse, og underskrev store navnespillere som Gianluigi Buffon, David Trezeguet, Pavel Nedvěd og Lilian Thuram, og hjalp holdet til to mere "scudetto" titler i 2001-02 og 2002-03 sæsoner. Juventus var også en del af en italiensk Champions League-finale i 2003, men tabte til Milan på straffespark efter kampen sluttede med 0-0. Ved afslutningen af den følgende sæson blev Lippi udnævnt til Italiens landsholdstræner, hvilket satte en stopper for en af de mest frugtbare manager-perioder i Juventus' historie.