Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Bulvičius' gruppe blev sporet ned ved at opdage deres radiosamtaler. Radioen blev konfiskeret den 6. juni. Bulvičius blev arresteret af NKVD den 9. juni. I alt anholdt NKVD i alt 16 personer i forbindelse med "Bulvičius-gruppen". Efter at næsten hele ledelse af Vilnius LAF blev arresteret, tog Kaunas LAF den ledende rolle i det planlagte oprør. Under juni-deportationen
En uge efter Bulvičius' anholdelse blev 236 litauiske officerer anholdt. Den 22. juni invaderede Tyskland Sovjetunionen. Anholdelserne gjorde juniopstanden mod den tilbagetræktende Røde Hær svagere i Vilnius. Ikke desto mindre var litauiske oprørere involveret i skyderier med den tilbagetræktende Røde Hær, og tyskerne var i stand til at komme ind i byen uden modstand den 24. juni.