Med 176.214 km2 (68.037 sq mi) af fastland og 142.199 km2 (54.903 sq mi) af jurisdiktionel vand og små flodøer, er Uruguay den næstmindste suveræne nation i Sydamerika (efter Surinam) og det tredje mindste territorium (fransk Guyana er den mindste). Landskabet er hovedsagelig bølgende sletter og lave bjergkæder (cuchillas) med et frugtbart kystnære lavland. Uruguay har 660 km (410 mi) af kystlinje. Et tæt flodnet dækker landet, der består af fire flodbassiner eller deltaer: Río de la Plata Basin, Uruguay River, Laguna Merín og Río Negro. Den største indre flod er Río Negro ("Black River"). Flere laguner findes langs Atlanterhavskysten.
410 andre