Fuldfør følgende sætning: Toni's tredje sæson med klubben var mindre vellykket, da skader og sammenstød med klubbens manager Luigi Delneri så ham kæmpe for at få form og spilletid. Efter at Verona var blevet fordrevet fra
2015-16 Serie A sæson, Toni bekræftede sin pensionering fra fodbold den 4. maj 2016. Han scorede sit sidste karriere mål i sin sidste kamp fra straffespark i en 2 til 1 hjemme sejr over Serie A-mester Juventus, med en Panenka stil straf, og senere også startede spillet, der førte til Verona andet mål; dette var hans 23. optræden og sjette mål i ligaen sæson. I det 85. minut blev en synligt følelsesladet Toni udskiftet og modtog en stående ovation fra fansene. I alt havde han klaret 48 ligamål for Verona i løbet af sine tre sæsoner i den italienske topdivision med klubben, 157 karriere Serie A-mål i 344 ligaoptrædener og en karriere på 324 mål i alle konkurrencer (med 659 optrædener og 306 mål på klubbeniveau og 47 optrædener og 16 mål med det italienske landshold). Toni forklarede sin beslutning om at trække sig tilbage efter kampen, idet han sagde, at han ikke ville spille i Veronas sidste kamp i sæsonen, i en udekamp mod sin tidligere klub Palermo, da han ønskede at spille sin sidste karriere kamp på sit holds hjemmebane.