Efter Italiens kapitulation i september 1943 overtog de tyske styrker den direkte kontrol over regionen. I september 1944 erklærede Sovjetunionen krig mod Bulgarien og besatte en del af landet. Et statskup den 9. september førte til, at Bulgarien sluttede sig til Sovjetunionen. Som følge heraf gik tre bulgarske hære, bestående af omkring 340.000 mand, sammen med den Røde Hær ind i det besatte Jugoslavien og flyttede fra Sofia til Niš, Skopje og Pristina for at blokere de tyske styrker, der trak sig tilbage fra Grækenland. Bulgarerne opererede sammen med de jugoslaviske og albanske kommunistiske partisaner. Kosovo blev befriet
I slutningen af november. Det blev en provins i Serbien inden for det demokratiske føderale Jugoslavien. Kosovo-albanerne, der havde fået løfte om selvbestemmelse, hvis de sluttede sig til partisanerne, gjorde oprør og der blev indført undtagelsestilstand. Det tog omkring seks måneder for området at blive pacificeret, efter at omkring 20.000 albanere under Shaban Polluza modsatte sig integrationen af Kosovo i Jugoslavien.