Desjardins blev udvalgt som nummer 38 i draften.
1987 NHL Entry Draft af Montreal Canadiens fra Granby Bisons i Quebec Major Junior Hockey League (QMJHL). Efter at have spillet en sæson mere for Granby, sluttede han sig til Sherbrooke Canadiens i American Hockey League (AHL) i tide til at gøre sin professionelle debut i foråret 1988, spillede tre regulære sæson kampe og fire playoff kampe. Han begyndte sin NHL-karriere i 1988/89 med to mål og tolv assists i 36 kampe. Han spillede også i 14 playoff-kampe på Montreal's vej til 1989 Stanley Cup Finals, et tab mod Calgary Flames.