Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1644 modsatte Mercy sig de franske hære, nu under den store Condé og vikomten af Turenne. Han erobrede Freiburg og holdt den i en ubeslutsom, men blodig kamp i august. Den 2. maj 1645 besejrede han Turenne ved Mergentheim. Senere i 1645, da han igen kæmpede mod Condé og Turenne, blev Mercy dræbt af en musketkugle i slaget ved Nördlingen
(eller Allerheim) den 3. august, mens han førte forstærkninger til aktionens fokus. På det sted, hvor han faldt, blev der rejst en mindesten med inskriptionen "Sta viator, heroem calcas", angiveligt efter Condés instruktioner. Hans lig blev først bragt til Donauwörth på en artillerivogn og derefter til Ingolstadt den næste dag, hvor han blev begravet i Saint Maurice-kirken. Den franske marskal Gramont, der var blevet taget til fange i slaget, fortæller om den overdådige modtagelse, som Mercy fik fra byens folk, der havde skyndt sig til portene. Han var meget populær og højt respekteret i Ingolstadt, hvor han havde været befalingsmand og guvernør.