Under borgerkrigen havde han flere kommandoer og deltog i aktioner langs Golfkysten. Han kommanderede "Owasco" og "Sangamon", passerede fortene for indtagelsen af New Orleans og engagerede konfødererede batterier i belejringen af Vicksburg. Han deltog også i erobringen af fortene ved Galveston, Texas, og erobringen af Fort Fisher
- I North Carolina.