IAF oplevede en betydelig konflikt i 1960, da Belgiens 75 år lange herredømme over Congo endte pludseligt, og landet blev opslugt af udbredt vold og oprør
- Jeg ved det ikke. IAF aktiverede No. 5 Squadron, udstyret med engelsk Electric Canberra, til støtte for FN-operationen i Congo. Eskadronen begyndte at udføre operationelle missioner i november. Enheden forblev der indtil 1966, da FN's mission sluttede. Canberras opererede fra Leopoldville og Kamina og ødelagde snart oprørernes luftvåben og forsynede FN's landstyrker med deres eneste langtrækkende luftstyrke.