Ifølge en erklæring fra Ministeriet for Nødsituationer blev bomben detoneret i togets tredje vogn. Øjenvidner sagde, at eksplosionen fandt sted nær døren. Umiddelbart efter eksplosionen fyldte røgen perronen. Video fra sociale medier viste flere ofre på perronen og en metaldør, der blev vendt af eksplosionskraften. Efter rapporter om eksplosionen blev alle metrostationer i Sankt Petersborg hurtigt lukket. Sent om aftenen blev metroen genoptaget på linjer 3, 4 og 5.
på et tog