Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Under sin tjeneste i krigen
, den 5. infanteriregiment aktivt forfulgte styrker fra den filippinske republikanske hær. Regimentets kompagnier og forskellige afdelinger marcherede i alt over 15.426 miles og deltog i 38 sammenstød og mindre aktioner, før fjendtlighederne sluttede i juli 1902. I områder under amerikansk kontrol blev det nødvendigt for militæret at håndhæve loven. Sigerfoos tjente som dommer-advokat på en række militære kommissioner i hele 1901. En sådan komité mødtes i juni i Vigan i provinsen Ilocos Sur på Luzon. Kommissionen dømte Noverto Pré, en oprørsk hærofficer, for "mord i strid med krigens love og skikke". Pré blev dømt til "at blive hængt ved halsen indtil han døde", men dommen blev omsat til femten års tvangsarbejde i et fængsel i Manila. Sagens forløb, sammen med ni andre drabsprocesser, hvor Sigerfoos fungerede som dommer-advokat, blev offentliggjort i en omfattende modbevisning af krigsministeriet som svar på påstande om, at det amerikanske militær begik grusomheder mod filippinere under krigen. Krigsministeriet kaldte beskyldningerne "enten ubegrundede eller grovt overdrevne".