Pedernera vandt Copa América i 1941 og 1946 i det argentinske landshold
, blev udnævnt til "Bedste spiller" af sidstnævnte. Han blev også valgt som den 12. bedste sydamerikanske fodboldspiller i det 20. århundrede i en meningsmåling foretaget af IFFHS i 2000, og hans navn vises på listen over de 100 største fodboldspillere nogensinde udvalgt af tidsskriftet "FourFourTwo" i 2017, hvor han holder den 58. plads.