Skriv en fortsættelse af dette afsnit - I c. 800, Abd al-Malik blev også placeret som lærer over Haruns søn al-Qasim. Hans fremtrædende rolle og indflydelse i hæren gjorde, at Harun mistroede ham, og i 803 blev han arresteret og kastet i fængsel. Den egentlige årsag er uklar, selvom de fleste kilder er enige om, at hans egen søn, Abd ar-Rahman, informerede kaliffen om, at han angiveligt planlagde at vælte ham. Abd al-Malik forblev fængslet indtil Haruns død seks år senere, da kaliffen al-Amin (r. 809<unk>813) løsladt ham. Al-Amins efterfølgelse blev bestridt
af sin ældre halvbror al-Ma'mun, og der var uroligheder i Syrien. Abd al-Malik havde stadig betydelig indflydelse på grænsetropperne, og derfor blev han udnævnt til guvernør i Syrien og Øvre Mesopotamien og havde til opgave at sikre disse regioner for al-Amin og rejse tropper til at konfrontere al-Ma'mun. Kort efter at have nået sit sæde i Raqqa blev Abd al-Malik imidlertid syg og døde. Hans grav blev revet ned et par år senere af den sejrende al-Ma'mun, angiveligt fordi Abd al-Malik havde svoret aldrig at acceptere al-Ma'muns styre.