Efter sin eksamen i september 1864 begyndte Nietzsche studier i teologi og klassisk filologi ved universitetet i Bonn med håb om at blive præst. I en kort tid blev han og Deussen medlemmer af Burschenschaft Frankonia. Efter et semester (og til sin mors vrede) stoppede han sine teologiske studier og mistede sin tro. Allerede i sit essay "Skæbne og historie" fra 1862 havde Nietzsche hævdet, at historisk forskning havde diskrediteret kristendommens centrale lære, men David Strauss's Jesusliv synes også at have haft en dyb effekt på den unge mand.
September 1864