Også i 1896 brød Armand Peugeot af med Les Fils de Peugeot Frères for at danne sit eget firma, Société Anonyme des Automobiles Peugeot, og byggede en ny fabrik i Audincourt for at fokusere helt på biler. I 1899 nåede salget 300; det samlede bilsalg for hele Frankrig det år var 1.200. Samme år vandt Lemaître Nice-Castellane-Nice-rallyet i en speciel 5.850 cc (357 cu in) 20 hk (14.9 kW) racer. På Paris Salon 1901 debuterede Peugeot med en lille akseldrevne 652 cc (40 cu in) 5 hp (3.7 kW) encylinder, kaldet "Bébé" ("baby"), og skød sin konservative stil, og blev en billedleder.
1896