Skriv en fortsættelse til dette afsnit - NRA blev dannet fra Nuclear Safety Commission, som kom under kabinettets myndighed, og Nuclear and Industrial Safety Agency, som var under Ministeriet for Økonomi, Handel og Industri (METI). Efter Fukushima atomkatastrofen efter jordskælvet den 11. marts 2011
, blev regeringens sikkerhedsforanstaltninger anset for utilstrækkelige. Desuden blev NISA, der var under METI's paraply, som også var ansvarlig for at fremme brugen af atomkraft, set som at have en interessekonflikt. Som følge heraf blev det nye agentur oprettet under Miljøministeriet.