En vigtig gren af virologi er virusklassificering. Virusser kan klassificeres efter værtscellen, de inficerer: dyrevirus, plantevirus, svampevirus og bakteriofager (virus, der inficerer bakterier, som omfatter de mest komplekse virus). En anden klassifikation bruger den geometriske form af deres kapside (ofte en helix eller en ikosahedron) eller virusets struktur (f.eks. tilstedeværelse eller fravær af en lipidkonvolut).
afhængigt af værtscellen, de inficerer