Efter at en aftale med Sven-Göran Eriksson ikke kunne indgås, udnævnte Fédération Camerounaise de Football Seedorf som manager for Camerouns landshold i august 2018. Han blev tilsluttet af sin tidligere holdkammerat Patrick Kluivert som hans assisterende manager. Men efter en skuffende 2019 Africa Cup of Nations
Han blev afskediget i juli 2019 efter at have spillet en uindtrykkelig gruppefase, hvor Cameroun blev elimineret af Nigeria i sekstenfinalen.