Maguire har været ædru siden han var 19 år gammel, efter at han havde oplevet "en vis vanskelighed" med alkohol i sin sene teenage. Maguire mødte juveleredesigner Jennifer Meyer i 2003, mens han var i gang med at skyde filmen Seabiscuit på Universal Studios, og de blev forlovet i april 2006. Deres datter blev født i november 2006.
Kona, Hawaii