Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Han gjorde en god start på sæsonen 2012/13, hvor han slog Tony Drago og Robert Milkins for at kvalificere sig til slutfasen af Australian Goldfields Open
i Bendigo; der slog han det lokale wildcard James Mifsud 5<unk>0, før han forlod turneringen med samme scoreline mod Ding Junhui. På 2013 Welsh Open nåede McManus sin første kvartfinal siden 2006 Grand Prix, med en 4-2 sejr over nummer 16 sædet Barry Hawkins, efterfulgt af et dramatisk comeback for at slå Joe Perry 4-3, efter at have været bagud 0-3. Han blev slået i kvartfinalen 3 til 5 af landsmanden Stephen Maguire. Den følgende turnering, Haikou World Open, så McManus vinde tre kampe i kvalifikationen for at nå de sidste faser af turneringen; han slog derefter det lokale wildcard Lin Shuai 5<unk>3, før han mødte landsmanden John Higgins. McManus leverede en god præstation; han tabte til sidst 3 over 5, men samlede værdifulde rangeringspunkter i processen.