Antibiotikavalg afhænger i første omgang af de karakteristiske egenskaber hos den berørte person, såsom alder, underliggende helbred, og hvor infektionen blev erhvervet. Antibiotikaforbrug er også forbundet med bivirkninger som kvalme, diarré, svimmelhed, forvrængning eller hovedpine. I Storbritannien anbefales behandling med amoxicillin før kulturresultater som første linje for samfundsgenereret lungebetændelse, med doxycyclin eller clarithromycin som alternativer. I Nordamerika, hvor den "atypiske" anvendelse af samfundsgenereret lungebetændelse er mere almindelig, kan øget brug af antibiotika dog føre til udvikling af antimikrobielle resistente bakteriestammer.
Cefalosporiner, carbapenemer, fluoroquinoloner, aminoglykosider og vancomycin af tredje og fjerde generation