Under borgerkrigen, tidevandet af nye minearbejdere ind i territoriet aftog til en dråbe, og mange forlod øst for at kæmpe. De missourianere, der blev, dannede to frivillige regimenter, samt hjemmeværn. Selv om tilsyneladende stationeret på periferien af krigens teatre, Colorado regimenter fandt sig i en afgørende position i 1862 efter den konfødererede invasion af New Mexico Territory af general Henry Sibley og en kraft af texanere. Sibleys New Mexico kampagne var beregnet som et optog til en invasion af Colorado Territory nordpå til Fort Laramie, skære forsyningslinjer mellem Californien og resten af Unionen.
to