Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I starten af 2013-14 sæsonen, Starke gjorde sin første optræden af sæsonen mod Borussia Dortmund i DFL-Supercup, hvor han modtog fire mål, i en 4-2 nederlag. Starke fortsatte med at være en anden valg målmand for siden bag Neuer for det meste af 2013-14 sæsonen. Den 23. februar 2014 gjorde han sin første optræden i sæsonen, i en 4-0 sejr mod Hannover 96. En måned senere, den 29. marts 2014, gjorde Starke sin tredje optræden i sæsonen og indgik tre mål, da Bayern München trak 3-3 mod sin tidligere klub, TSG 1899 Hoffenheim. Han fik dog en albueskade under træningen, der holdt ham ude resten af 2013/14 sæsonen. På trods af dette var Starke medlem af Bayern Münchens hold, der vandt Bundesligaen, FIFA Club World Cup, UEFA Super Cup
og DFB-Pokal. I sin anden sæson i Bayern München spillede han tre gange i alle turneringer.