Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Men den 20. januar 1839 opnåede de restaurerende styrker fra den chilenske Manuel Bulnes og den peruvianske Agustín Gamarra sejren i Yungay mod Santa Cruz under Konfederationskrigen
, som satte en stopper for den peruansk-bolivianske konføderation. Den 14. februar 1839 informerede general Velasco, Bolivias nye præsident, guvernøren i Jujuy om afslutningen på krigstilstanden og viste sig villig til at forhandle om problemet med Tarija. Den 26. april 1839 satte general Rosas officielt en stopper for krigen uden at udnytte nederlaget i Santa Cruz til at rykke frem mod Tarija, hvilket gav dem mulighed for at afgøre spørgsmålet. De forblev på den bolivianske side. Territoriet for Puna de Jujuy, Iruya og andre besatte befolkninger blev returneret af Bolivia i marts 1839.