Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1798, var Wallis kommanderende General af Venetia. Det følgende år, under Anden Koalitionskrig, kommanderede han en del af Habsburgernes hær i Schwaben under ærkehertug Karl. Han ledte den tredje kolonne i dens angreb på de franske positioner i Habsburr sejr over General of Division Jordan's Army of the Danube i Slaget ved Ostrach
Den 21. marts En uge senere, og i det franske nederlag ved Stockach den 25. marts, kommanderede han den højre fløj. Fra den 14. til den 25. april, mens ærkehertug Karl var indisponeret, overtog Wallis kommandoen over den vigtigste habsburgske hær, der var placeret på bredden af Rhinen. Et par uger senere kommanderede han reserven i det første slag ved Zürich den 4. juni, hvor divisionsgeneral André Masséna, der nu kommanderede over Donau-hæren og den schweiziske hær, blev besejret og tvunget til at trække sig tilbage over Limmat-floden. I løbet af slaget førte Wallis fem bataljoner af grenaderer i stormen på de franske stillinger på Mount Zürich. Han blev alvorligt såret og døde fem uger senere, den 19. juli 1799.