Atatürks sidste aktive tjeneste i den osmanniske hær var at organisere tilbagevenden af de osmanniske tropper, der blev efterladt syd for forsvaret. I begyndelsen af november 1918 blev Yıldırım Army Group officielt opløst, og Atatürk vendte tilbage til et besat Konstantinopel.
, den osmanniske hovedstad, den 13. november 1918. I en periode arbejdede han på hovedkvarteret for krigsministeriet ("Harbiye Nezareti") i Konstantinopel og fortsatte sine aktiviteter i denne by indtil 16. maj 1919. Langs de etablerede linjer i delingen af det osmanniske rige besatte de allierede (britiske, italienske, franske og græske styrker) Anatolien. Besættelsen af Konstantinopel, efterfulgt af besættelsen af İzmir (de to største osmanniske byer på det tidspunkt) udløste etableringen af den tyrkiske nationale bevægelse og den tyrkiske uafhængighedskrig.