Brockenbrough overtog kommandoen over brigaden, efter at Field blev såret i det andet slag ved Bull Run og førte den to dage senere ved Chantilly.
- Hvad? Under Maryland-felttoget deltog Brockenbrough i erobringen af Harpers Ferry, og marcherede derefter med resten af den lette division til undsætning af general Robert E. Lees hær ved Sharpsburg; hans brigade blev indsat i højre side af A.P. Hill's linje og så ikke nogen direkte handling der. Ved Fredericksburg fik hans brigade ordre til at lukke et hul i den konfødererede linje, der blev udnyttet af unionstropper under generalmajor George G. Meade. Brockenbrough mistede kontrollen over sin brigade under denne aktion, og to af hans regimenter splittede sig med ham og nåede aldrig frem til kampene. Lee var åbenbart ikke imponeret over Brockenbroughs lederegenskaber. Selv om der var gået måneder, blev enheden stadig kaldt Field's Brigade og Brockenbrough blev stadig betragtet som den midlertidige kommandant. Lee anbefalede ikke John til forfremmelse.