Genova faldt, før den første konsul nåede frem. Han koncentrerede sin hær og angreb østrigerne i et forsøg på at slå dem, før de også koncentrerede deres styrker igen. Reservearméen kæmpede et slag ved Montebello den 9. juni før hovedkonfrontationen ved
Marengo. Konsulen blev næsten besejret her, indtil general Desaix ankom rettidigt med forstærkninger og drev Melas tilbage, og dermed vendte en fransk rote til en fransk sejr. I dette modangreb blev Desaix dræbt, men Bonaparte hedrede ham senere med monumenter til minde om hans tapperhed, og hans navn har en æresplads på Arc de Triomphe, der blev rejst for at fejre Napoleons sejre.