Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter at han forlod forsamlingen, arbejdede Thomas som entreprenør i flere år, men forblev aktiv i lokalpolitik. Han blev udnævnt til vice kommissær for vandforsyning, gas og elektricitet i januar 1904, og kort efter at være blevet fjernet fra stillingen i maj blev han udnævnt til Collector of City Revenue og Superintendent of Markets. I 1906 blev han udnævnt til ejendomsvurderer for finansministeriet. I 1911 udnævnte New Yorks guvernør John Alden Dix ham til skattekommissær i New York. I december 1915 blev Thomas udnævnt til undersherif, en stilling han holdt resten af sit liv. Thomas var også delegeret til den demokratiske nationalkonvention i 1912 og 1916
s.