Indtagelsen af "Philadelphia" og dens besætning motiverede også præsident Jeffersons beslutning om at sende William Eaton, en tidligere hærofficer, kendt for sin frækhed og trodsig diplomati, til Tripoli i 1805 for at befri de 300 amerikanske gidsler i det, der var den første amerikanske hemmelige mission for at vælte en udenlandsk regering. William Eaton etablerede en gruppe på omkring 20 kristne (hvoraf otte var amerikanske marinesoldater) og måske 100 muslimske lejesoldater for at begynde overtagelsen af Tripoli med start i Derna. Han formåede at trekke med den lille afskedning af marines ledt af Presley O'Bannon og hans lejesoldater styrke over 500 miles. Støttet til søs af Isaac Hull, kaptajn på, i en effektiv "kombineret operation", ledte Eaton angrebet i slaget ved Derna
Den 27. april 1805. Byens erobring, mindet i "Marines' Hymn" berømte linje "til kysten af Tripoli" og truslen om yderligere fremrykning på Tripoli, var stærke påvirkninger mod fred, forhandlet i juni 1805 af Tobias Lear og Commodore John Rodgers med Pasha af Tripoli.