Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Dokumenter opnået af "Washington Post" via Freedom of Information Act Requests (FOIAs) afslørede, at efter al-Qaeda begik selvmordsangrebet i oktober 2000 på USS "Cole"
Efter terrorangrebet på World Trade Center og Pentagon blev Navy's afdeling for økonomiske forbrydelser reduceret fra 140 ansatte til kun ni personer, hvoraf de fleste var blevet omdirigeret til at fokusere på terrorisme. Mindst 27 separate undersøgelser var blevet åbnet, men senere lukket uden handling, takket være indgriben af højtstående Navy personale, der var i forbund med Francis.