Nagy fik sin professionelle debut i AHL-playofferne senere samme år med Worcester Ice Cats. Nagy spillede med Blues fra 1999 til 2001, og blev byttet til Coyotes med Michal Handzus, Jeff Taffe og et første runde valg i 2002 udkast
I bytte for Keith Tkachuk. I løbet af sin tid med Coyotes, Nagy postet 3 lige 20+ mål sæsoner fra 2001 til 2004, og noteret 50 point fra 2002-03 til 2005-06. Men hans mål og point produktion ville hurtigt falde i den sidste sæson.