Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 2000 blev han hyret til at træne det tyrkiske fodboldlandshold. Tyrkiet kvalificerede sig til FIFA World Cup 2002 og sluttede som tredje. Güneş vandt UEFA Coach of the Year-prisen for 2002. Efter VM fik han mange tilbud fra Grækenland, Brasilien og Spanien, men han ville blive i Tyrkiet. Efter at landsholdet ikke kvalificerede sig til UEFA Euro 2004
Güneş blev fyret som manager.