I krigstid er handelsskibe ofte bevæbnet og bruges som hjælpe krigsskibe, såsom Q-skibe i Første Verdenskrig og de bevæbnede handelskrydser i Anden Verdenskrig. Indtil det 17. århundrede var det almindeligt, at handelsskibe blev presset ind i flåden, og det var ikke usædvanligt, at mere end halvdelen af flåden bestod af handelsskibe. Indtil pirattrusselen aftog i det 19. århundrede var det normal praksis at bevæbne større handelsskibe som galler. Krigsfartøjer er også ofte blevet brugt som tropper eller forsyningsfartøjer, såsom den franske flåde i det 18. århundrede eller den japanske flåde under Anden Verdenskrig.
krigsskibe og handelsskibe