Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Hans pastorale og pædagogiske arbejde blev afbrudt af oprøret i 1863<unk>1864
Og blev gjort ekstremt vanskeligt, da den russiske regering strammede sine tøjler efter sammenbruddet af oprøret. Alligevel forhindrede disse omstændigheder ham ikke i at følge en kurs, der ikke kunne undgå at bringe ham i direkte konflikt med myndighederne. Han gjorde alt for at underminere regeringens russificerings-plan. I 1874 blev Valančius syg og døde i Kaunas den 29. maj 1875. Han blev begravet i krypten i Kaunas Cathedral Basilica.