Det meste af Stanford University ligger på en 8.180-acre (12.8 sq mi; 33.1 km2) campus, en af de største i USA. Det er beliggende på San Francisco halvøen, i den nordvestlige del af Santa Clara Valley (Silicon Valley) ca. 37 miles (60 km) sydøst for San Francisco og ca. 20 miles (30 km) nordvest for San Jose. I 2008, 60% af denne jord forblev uudviklet.
20 miles