Piquet havde en skuffende 1989 sæson, kører en Judd V8-drevet Lotus, som havde 125 mindre hk end Honda V10s brugt af McLaren. Han fik dog en fremragende 4. plads i det britiske Grand Prix (med hensyn til Lotus bilens begrænsninger).
I Silverstone, hvor han overhalede teoretisk hurtigere biler og var tredje før Nannini overhalede ham i de sidste runder. Han (og holdkammerat Satoru Nakajima) havde endnu en gang ingen sejre, og de begge formåede endda ikke at kvalificere sig til Belgisk Grand Prix 1989, Piquets første ikke-kvalifikation siden Detroit Grand Prix 1982. På det, der var hans sidste forsøg på at kvalificere sig i Spa, mistede Piquet sin chance, da han blev bremset af rookie-franskmanden Olivier Grouillard, der havde fået ry i løbet af sæsonen som en bloker.