I 1941 fulgte Zuse sin tidligere maskine op med Z3, verdens første fungerende elektromekaniske programmerbare, fuldt automatiske digitale computer. Z3 blev bygget med 2000 relæer, der implementerede en 22-bit ordlængde, der fungerede med en klokkefrekvens på ca. 5 × 10 Hz. Programkode og data blev gemt på gennemboret film. Det var ganske ens med moderne maskiner i nogle henseender, og var banebrydende talrige fremskridt som flyvende punktnumre. Erstatning af det vanskelige at implementere decimalsystem (brugt i Charles Babbage tidligere design) med det enklere binære system betød, at Zuse's maskiner var lettere at bygge og potentielt mere pålidelige, i betragtning af de teknologier, der var tilgængelige på det tidspunkt.
IBM