I sæsonen 2011-12 førte Diego Simeone Atlétio til deres anden Europa League-titel i de tre år siden grundlæggelsen, efter at de slog Athletic Bilbao 3-0 i finalen den 9. maj 2012 i Bukarest, hvor Radamel Falcao scorede to gange og Diego én gang. Igen, ved at vinde Europa League, kvalificerede de sig til UEFA Super Cup 2012
mod Chelsea, vinderen af den foregående sæson i Champions League, som blev spillet i Monaco den 31. august 2012. Atlético vandt 4-1, herunder et hat-trick scoret af Falcao i første halvleg. Den 16. maj 2013 slog Atlético Real Madrid 2<unk>1 i Copa del Rey-finalen, i en anspændt kamp, hvor begge hold sluttede med ti mænd. Dette endte en 14-årig og 25-kamp uden sejr i Madrid derby.