Den 7. november 1997 blev Bodine udnævnt til ambassadør i Republikken Yemen. Bodines udnævnelse i Sana'a faldt sammen med begivenheder af stor betydning i Yemen: I 1999 forhandlede Bodine løsladelsen af tre amerikanere, der var blevet kidnappet i Yemen. Den 12. oktober 2000 blev USS Cole bombet i et terrorangreb.
i Adenbugten. I januar 2001, på vej til den yemenitiske by Taiz for at mødes med landets præsident, blev et fly med Bodine og 90 andre passagerer fra Yemen kapret af et irakisk fly midt i flyvningen. Flyet blev omdirigeret til den lille afrikanske nation Djibouti, hvor det landede med flykapreren overmandet af besætningen. Bodine forlod Yemen som ambassadør den 30. august 2001.