I 1817 blev Baptist Education Society of the State of New York grundlagt af tretten mænd (seks gejstlige og syv lægfolk). To år senere, i 1819, gav staten skolens charter, og skolen åbnede et år senere, i 1820. De første klasser blev afholdt i en bygning i byen Hamilton. Tre år senere, i 1823, blev Baptist Theological Seminary i New York City indarbejdet med Baptist Education Society og efterfølgende ændret sit navn til Hamilton Literary & Theological Institution. Blandt formynderne var William Colgate, grundlægger af Colgate Company. I 1826 købte skolens formynders gård, der senere blev fokuspunktet for skolen, kendt som 'The Colgate'. Et år senere, den nuværende fakultet og fakultet af West Hall, bygget af en stenkvarter på den side af universitetet, blev kaldt Colgate Collegiate Academy, og skolen åbnede et år senere, i 1820 blev den første klasser afholdt i en bygning i byen Hamilton. Efter at George Washington University i begyndelsen af 1846 havde besluttet at flytte sine studerende fra sin tidligere fakultet til en skole på Westgate College, blev den oprindelige navn
Colgate Rochester Divinity School