Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Fra 1972 til 1976 studerede Remek på Gagarin Air Force Academy. Da han vendte tilbage til Tjekkoslovakiet i 1976, blev han forfremmet til kaptajn og udnævnt til næstkommanderende for sit jagerregiment, hvorefter Remek tog tilbage til Rusland for at træne for det sovjetisk-ledede rumprogram. Efter sin tilbagevenden fra rummet i marts 1978 tilbragte Remek tid i den Tjekkoslovakiske Folkehær (ČSLA) som vicedirektør for Flight Research Institute i Prag. I 1986 blev Remek næstkommanderende for en flyvning division baseret i Čáslav. I 1988 dimitterede han fra Voroshilov-Staff Academy of Soviet Air Force og blev udnævnt til sin højeste kommando, som stedfortræder for 2. luftforsvarsdivision stationeret i Moravia. Efter fløjlrevolutionen
I 1989 blev Remek forvist til en rolle som direktør for Museet for Luftfart og Astronautik i Prag. Efter sin pensionering fra luftvåbnet i 1995 repræsenterede Remek det tjekkiske firma CZ Strakonice og joint venture CZ<unk>Turbo-GAZ i Moskva.