Hancocks sår krævede flere måneders fravær. William Hays blev placeret i kommandoen over korpset umiddelbart efter slaget ved Gettysburg, og beholdt kommandoen indtil 12. august, da han blev afløst af generalmajor Gouverneur K. Warren. Warren havde udmærket sig ved Gettysburg ved sin hurtige forståelse af den kritiske situation ved Little Round Top, og ved den energiske hurtighed, hvormed han afhjælpede vanskelighederne. Han havde også fået et strålende ry i V-korpset, og som den øverste topografiske officer i Army of the Potomac. Han var efterfølgende i kommando ved Slaget ved Bristoe Station, en II Corps affære, og en, der var bemærkelsesværdig for dash, som officerer og mænd kæmpede, sammen med den overlegne evne, der blev vist af Warren selv. Han kommanderede også ved
Battle of Mine Run og Morton's Ford, divisionerne på det tidspunkt var under generaler Caldwell, Alexander S. Webb og Alexander Hays.