Efterfølgende hævdede han, at der var tale om stemmekøb og andre uregelmæssigheder, og krævede en fuldstændig omtælling fra det føderale valginstitut (IFE). IFE fandt nogle uregelmæssigheder, men bekræftede resultaterne den 6. juli. López Obrador afviste denne meddelelse, og den 12. juli indgav en klage om ugyldighed af valget. Han påstod, at der var tale om stemmekøb, ulovlig udnyttelse af valgregler, fundraising og stemmesvindel. Men den 30. august afviste valgdomstolen i den føderale retspleje hans klage.
31,6%