Gennem handlen med R.A. Dickey fik Mets mange nye spillere, herunder Travis D'Arnaud og Noah Syndergaard. Efter at have mistet rettighederne til Buffalo Bisons, krævede Mets Las Vegas 51s som deres Triple A affiliate for 2013<unk>15. Citi Field var vært for 2013 Major League Baseball All-Star Game
som fandt sted den 16. juli 2013. Matt Harvey var den primære krukke for holdet og var starter for National League All-Stars. I løbet af sæsonen fik Harvey kælenavnet "The Dark Knight of Gotham" fra Sports Illustrated. Mets sluttede sæsonen med 74-88, den samme rekord som den foregående sæson. Men for første gang i franchises historie, slog Mets deres rivaler på tværs af byen, Yankees i Subway Series.