I juni 1998 blev CCDG-3 udsendt til Den Persiske Golf. Udrulningen var den første ombord på USS "Abraham Lincoln". Den 20. august 1998 deltog gruppen i Operation Infinite Reach, hvor de lancerede Tomahawk-krydsermissiler mod den sudanske Al-Shifa-farmaceutiske fabrik. Fabrikken var mistænkt for at hjælpe Osama Bin Laden med at fremstille kemiske våben. Battle Group lancerede også en anden bølge af Tomahawk krydsermissiler mod Bin Ladens terrortræningslejre i Afghanistan. Disse krydsermissil angreb blev beordret af præsident Bill Clinton 13 dage efter terrorister bombede de amerikanske ambassader i Kenya og Tanzania
- Hvad? Konteradmiral Kevin Green overførte kommandoen over gruppen til den kommende konteradmiral Phillip Balisle den 3. december 1999 om bord på flagskibet "Abraham Lincoln".