Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Jokubaitis spillede for Litauen ved FIBA U16 EM i Polen i 2016. Han fik i gennemsnit 10 point og hjalp sit hold med at vinde en sølvmedalje. Jokubaitis var den yngste spiller ved 2017 FIBA Under-19 World Cup i Egypten, gennemsnit 10 point og 5,3 assists per spil for sjettepladsen holdet. På FIBA U18 Europamesterskabet i Letland i 2018 scorede han i gennemsnit 12,9 point og 5,6 rebounds pr. Kamp, da hans hold sluttede som femte. Jokubaitis førte Litauen til fjerdepladsen ved FIBA Under-19 World Cup 2019
i Grækenland, hvor han i gennemsnit scorede 11,3 point og 5,6 assists pr. kamp.