Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Ved begyndelsen af den amerikanske borgerkrig, Sedgwick tjente som en oberst og assisterende generalinspektør af Military Department of Washington. Han gik glip af krigens tidlige aktion ved det første slag ved Bull Run, da han var ved at komme sig efter kolera. Forfremmet til brigadegeneral den 31. august 1861 kommanderede han den 2. brigade af generalmajor Samuel P. Heintzelmans division i Army of the Potomac, derefter sin egen division, som blev udpeget som 2. division i II Corps for Peninsula Campaign. I Virginia kæmpede han ved Yorktown og Seven Pines.
- Hvad? Under Syv Dagers Slaget kæmpede Sedgwicks division ved Savage's Station og Glendale, hvor han blev såret i det sidstnævnte engagement. Efter Syv Dagers Slaget blev han forfremmet til generalmajor. II Corps og Sedgwicks division var ikke involveret i Northern Virginia-kampagnen.