På grund af sin fars karriere, Agron sagde hun og hendes familie boede i forskellige hoteller vokser op. Hun har en yngre bror, Jason. Hendes far blev født til en jødisk familie, mens hendes mor konverteret til islam. Agron gik på hebraisk skole og havde en Bat Mitzvah. Hendes faderlige forfædre var jødiske indvandrere fra Østeuropa, hvis oprindelige efternavn "Agronsky" var, ifølge hende, ændret af indvandring embedsmænd på Ellis Island, men det ser ud til at have ændret familienavnet efter ankomsten i USA.
Hebraisk skole