I december 1843 sluttede Voorhees sig til kommandør Daniel Turners brasilianske eskadrille, der blokerede Montevideo for at beskytte USA's handel under krigen.
Uruguays borgerkrig. Den 29. september 1844 fangede Voorhees en bevæbnet argentinsk schooner, der leverede en post til den argentinske kommanderende officer. Denne overreaktion skadede forholdet mellem USA og Argentina og resulterede i en krigsret for Voorhees. Hans impulsivitet resulterede i et par måneders suspension, for Voorhees, men gjorde lidt skade på hans karriere.