Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter invasionen af Kuwait
I 1990 måtte Kazem Behbehani flygte fra Kuwait og tilslutte sig WHO. I WHO (1990-2005) arbejdede han i vaccinationsforskningen i det globale AIDS-program, var programleder for forskning i tropiske sygdomme (TDR), direktør for både afdelingen for bekæmpelse af tropiske sygdomme (1994-1998) og forbindelseskontoret for det østlige Middelhav (1998-2003) i Genève. Han var medlem af WHO's appeludvalg, sekretær for en række mellemstatslige møder (f.eks. tobakskonventionen), samt flere af udvalgene/underudvalgene i direktionen og Verdenssundhedsforsamlingen. Hans sidste stilling var assisterende generaldirektør for eksterne forbindelser og styrende organer (2003-2005). I 2005 blev han WHO-ambassadør. I 2006 blev han officiel kandidat i WHO's valg af generaldirektør, hvor han nåede frem til top 5-listen.