Pye kom til Marquette i efteråret 1987 og var backup til Mike Jeffrey i hans første sæson. Han overtog startrollen i starten af sin andenårs sæson og gav et øjeblikkeligt skub i mål. NMU gik fra sjette til anden i WCHA og Pye førte Wilcats til deres første WCHA mesterskab, og erobrede MVP ærer. Northern Michigan kom ikke ud af første runde af NCAA-turneringen men Buffalo Sabres havde set nok til at vælge Pye i sjette runde af
NHL udkast.