Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1580'erne førte konflikten i Holland England ind i krig med Spanien, hvilket skabte en yderligere trussel mod spansk skibsfart. Bestræbelserne på at neutralisere denne trussel førte til et katastrofalt forsøg på at invadere England i 1588.
Det følgende år lykkedes det at bringe balancen mellem de krigsførende parter tilbage. Nederlaget i 1588 førte til en reform af flåden. Flåden på dette tidspunkt var ikke en enkelt operation, men bestod af forskellige flåder, der hovedsagelig bestod af bevæbnede handelsskibe med eskorte af kongelige skibe. Armadas fiasko markerede et vendepunkt i søkrig, hvor artilleri nu var vigtigere end ramning og ombordstigning, og så blev spanske skibe udstyret med specialbyggede søkanoner. I løbet af 1590'erne tillod udvidelsen af disse flåder en stor stigning i den oversøiske handel og en massiv stigning i importen af luksusvarer og sølv. Ikke desto mindre tillod utilstrækkelige havneforsvar en anglo-hollandsk styrke at angribe Cadiz i 1596, og selv om den ikke lykkedes med sit mål om at fange sølvet fra den lige vendte konvoj, var den i stand til at påføre byen stor skade. Havneforsvaret i Cadiz blev opgraderet, og alle forsøg på at gentage angrebet i de følgende århundreder ville mislykkes.