Efter to sæsoner med Coyotes blev Boynton byttet ved 2008 NHL Entry Draft
Sammen med Keith Ballard og et andet runde valg til Florida Panthers for Olli Jokinen den 20. juni 2008. I sæsonen 2008-09 genvandt Boynton sin scorende touch og postede 21 point i 68 kampe for Panthers. I løbet af sæsonen den 27. februar 2009 blev Boynton sendt hjem fra en Panthers road trip og savnede tre kampe af disciplinære årsager, senere afsløret at være efter et skænderi med træner Peter DeBoer.