Biopreparat blev etableret i 1973 som en "civil" fortsættelse af tidligere sovjetiske biologiske våbenprogrammer. Projektet blev angiveligt indledt af akademikeren Yuri Ovchinnikov, der overbeviste generalsekretær Leonid Brezhnev om, at udvikling af biologiske våben var nødvendigt. Forskningen på Biopreparat udgjorde en overtrædelse af vilkårene i Biologisk Våben Konvention af 1972, som forbød biologiske våben.
Yuri Ovchinnikov