Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Historien om regionen er blevet stærkt politiseret, med både kinesiske og nationalistiske uiguriske historikere, der ofte overdriver omfanget af deres respektive gruppers bånd til regionen. I virkeligheden har det været hjemsted for mange grupper gennem historien, med uighurerne ankom fra Centralasien i det 10. århundrede. Selv om forskellige kinesiske dynastier til tider har udøvet kontrol over dele af det, der nu er Xinjiang, kom regionen som den eksisterer i dag under kinesisk styre som følge af den vestlige ekspansion
Manchu-ledede Qing-dynastiet, der også så annektering af Mongoliet og Tibet.