Udfyld følgende sætning: Før sæsonen 2016 skiftede Shibasaki nummertrøje fra tyve til ti. I starten af sæsonen 2016 fortsatte Shibasaki med at genvinde sin første holdplads for siden, hvor han spillede i den centrale midtbanesplads. Det var ikke før den 10. april 2016, da han scorede sit første mål i sæsonen og derefter satte et mål for Caio, der scorede to gange i en kamp, i en 4-1 sejr mod Sanfrecce Hiroshima. En måned senere den 29. maj 2016 scorede Shibasaki klubbens første mål i kampen og derefter klubbens tredje mål i kampen i en 4-0 sejr mod Ventforet Kofu. Han scorede senere to mål i løbet af september, hvor han scorede mod Kataller Toyama og Albirex Niigata. Men Shibsaka fik en fodskade der holdt ham ude i en måned. Efter at klubben kvalificerede sig til tredjepladsen i slutningen af J.League anden etape, gjorde han ikke sit comeback før finalen mod Urawa Red Diamonds og spillede i begge ben, da Kashima Antlers drog 2<unk>2 på aggregat gennem et udendørs mål, hvilket resulterede i, at klubben blev Champions. I den
2016 Club World Cup, Shibasaki startede alle tre kampe og hjalp Kashima Antlers fremskridt i knockoutfasen til finalen. Han blev berømt efter at have scoret to gange for Kashima Antlers i finalen i 2016 Club World Cup mod Real Madrid. Real Madrid vandt kampen 4-2 efter et hat-trick fra Cristiano Ronaldo. På trods af at have tabt i finalen, blev Shibasakis præstation rost af medierne, både i og uden for Japan. Derudover blev han tildelt Adidas Bronze Ball ved turneringen. Efter dette hjalp Shibasaki klubben med at komme tilbage fra nederlaget, og satte to mål for at slå Yokohama F. Marinos for at hjælpe Kashima Antlers med at nå kejserens Cup-finalen. Han hjalp klubben med at slå Kawasaki Frontale 2<unk>1 for at vinde kejserens Cup Final. I slutningen af 2016 sæsonen, han gik på at gøre 46 optrædener og scorede seks gange i alle konkurrencer.