Radford blev beordret til at melde sig hos kontreadmiral John Dahlgren i Philadelphia for kommandoen over pansret skib. Ved ankomsten blev det fastslået, at skibet havde brug for reparationer, så Radford blev lettet og beordret til et flådebestyrelse i Washington, DC i juli 1864. Han blev genindsat til "New Ironsides" på, og sluttede sig til North Atlantic Blockading Squadron på Hampton Roads. Konteradmiral David Porter samlede en flåde for at angribe Fort Fisher for at få kontrol over Cape Fear River. Han satte Radford i kommando over Ironclad Division, bestående af flagskib "New Ironsides",,,, og under
Angrebene på Fort Fisher i december 1864 og i januar 1865. David Porter roste Radfords støtte til Unionens styrker på land, og otte medlemmer af hans besætning blev tildelt Medal of Honor.