De Blackfoot Ninjas ledet af Harada og ledsaget af Dr. Green ankommer og angriber komplekset. Dr. Green stikker Shingen i halsen med en forgiftet kuglepen og Ninjas kvisker Mariko væk. Logan og Yukio ankommer senere og ved hjælp af Ichiros røntgenmaskine opdager en robotparasit fastgjort til Logans hjerte, hvilket undertrykker hans helbredende evne. Logan skærer sig selv op og udtrækker enheden. Under operationen forsøger Shingen, der overlevede Dr. Greens angreb, at dræbe Logan, men Yukio holder Shingen væk længe nok til at Logan kan komme sig og dræbe Shingen. Logan følger Marikos spor til Ichirō's fødselslandsby, hvor han bliver fanget af Haradas ninjas.
Han har fortrængt sin helbredende evne.