Den 31. august 2015 underskrev Ljajić for Internazionale på et sæsonlangt lån, hvor Inter betalte Roma 1,75 millioner euro og inkluderede en option for at gøre overførslen permanent ved slutningen af sæsonen.
for 11 mio. EUR. Den 1. december 2015 scorede Ljajić sit første Inter-mål i et 2-1 tab mod Napoli.