Den 6. april 1941 invaderede Tyskland, Italien, Ungarn og Bulgarien Jugoslavien, og Luftwaffe bombarderede Beograd.
I tre dage dræbte han 17.000 mennesker. Belgrad blev erobret af tyske styrker den 13. april 1941, og fire dage senere den 17. april 1941 overgav den kongelige jugoslaviske hær sig betingelsesløst. Kong Peter II fulgte råd og forlod landet med et tungt hjerte for at søge støtte fra de allierede. Han blev hilst velkommen som den helt, der turde modsætte sig Hitler. Den kongelige jugoslaviske regering, Jugoslaviens eneste juridiske organ, fortsatte med at arbejde i London. Derefter delte de besættelsesmagter Jugoslavien op. De vestlige dele af landet sammen med Bosnien-Hercegovina blev omdannet til en nazi-marionettestat kaldet Den Uafhængige Stat Kroatien (NDH) og regeret af Ustashe. Det meste af det moderne Serbiens territorium var besat af den tyske hær og blev styret af den tyske militære administration i Serbien. Det styrede område blev kaldt Serbien eller Militærkommandørens område i Serbien, og udover tyske militære administratorer blev det også styret af de serbiske marionetter først under Milan Aćimović og derefter under den serbiske hærgeneral Milan Nedić. De nordlige områder blev annekteret af Ungarn, og de østlige og sydlige områder af Bulgarien. Kosovo og Metohija blev for det meste annekteret af Albanien, som var under den fascistiske Italiens sponsorering. Montenegro mistede også områder til Albanien og blev derefter besat af italienske tropper. Slovenien blev delt mellem Tyskland og Italien, som også besatte øerne i Adriaterhavet.