På OL i 2006 var hendes første afstand 3000 meter, hvor Wüst slog Groenewold og Cindy Klassen fra Canada og blev den yngste olympiske mester fra Holland i historien om Vinter-OL. Hun nåede ikke podiet i 1000 meter, da hun blev fjerde. I sin sidste begivenhed på 1500 meter vandt hun en bronzemedalje bag Cindy Klassen og Kristina Groves fra Canada. På hendes sidste begivenhed i sæsonen, 2006 World Allround Championships
Wüst sluttede som fjerde efter at hun var blevet syg et par dage før turneringen.