Finalen blev spillet i to-legged hjemme-og-ud-format mellem Mamelodi Sundowns fra Sydafrika og Zamalek fra Egypten. Første omgang blev afholdt af Mamelodi Sundowns på Lucas Masterpieces Moripe Stadium i Pretoria den 15. oktober 2016, mens anden omgang blev afholdt af Zamalek på Borg El Arab Stadium i Alexandria den 23. oktober 2016. Vinderen tjente retten til at repræsentere CAF ved FIFA Club World Cup 2016
, der går ind i kvartfinalen, samt spiller i 2017 CAF Super Cup mod vinderen af 2016 CAF Confederation Cup.