Campomanes huskes bedst som præsident for FIDE, som han blev valgt til i 1982, og som han varetog indtil 1995, gennem flere kontroverser, især opgivelsen af 1984/85
kampen mellem Karpov og Garry Kasparov uden resultat, efter 48 kampe, og bruddet fra FIDE af den professionelle skakforening i 1993. Aflysningen kastede den internationale skakkalender i kaos i de næste flere år, da en række kampe måtte afholdes for at løse sagen, og disse påvirkede andre kvalificerende begivenheder.