Jupiter er konstant dækket af skyer, der består af ammoniakkrystaller og muligvis ammoniumhydrosulfid. Skyerne er placeret i tropopausen og er arrangeret i bånd med forskellige breddegrader, kendt som tropiske regioner. Disse er opdelt i lysere farvede zoner og mørkere bælter. Samspillet mellem disse modstridende cirkulationsmønstre forårsager storme og turbulens. Vindhastigheder på 100 m / s (360 km / t) er almindelige i zonale jetfly. Zonerne er blevet observeret at variere i bredde, farve og intensitet fra år til år, men de er forblevet tilstrækkeligt stabile til, at forskere kan give dem identificerende betegnelser.
tropisk