Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Martínez startede kampagnen 2013/14 på udskiftningsbænken under den nye manager Pep Guardiola. Den 30. august 2013 i samme år
I UEFA Supercupen i 2009 tog han banen tidligt i anden halvdel af kampen mod Chelsea, og scorede 2-2 i sidste minut af forlængelsen, da Bayern vandt trofæet i Prag efter en straffespark. Martínez sluttede sæsonen med et mål i 34 optrædener.