Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1975 tilbagekaldte Tjekkoslovakiets kommunistiske regering Dukas tilladelse til at arbejde som præst. Fra da til regimet kollapsede
I 1989 arbejdede Duka som designer på Škoda-fabrikken i Plzeň. I mellemtiden arbejdede han i hemmelighed i ordenen og blev valgt til provinsens vikarprovinsiale og tjente fra 1975 til 1987. Fra 1976 til 1981 underviste han i teologi for seminarister ved det teologiske fakultet i Litoměřice. I 1979 opnåede han en licentiate i teologi ved det teologiske fakultet i St. John the Baptist i Warszawa, Polen.