Anson overvågede flåden i store dele af Syvårskrigen og etablerede en permanent eskadrille i Devonport, som kunne patruljere de vestlige indgange til både Storbritannien og Frankrig. Han var især bekymret over udsigten til en fransk invasion af de britiske øer, hvilket fik ham til at holde en stor styrke i Den Engelske Kanal. I 1756 blev han kritiseret for ikke at sende nok skibe med admiral Byng til
Han ville beskytte Storbritannien fra en truende invasion, men så at Byng ikke kunne redde Minorca, mens ingen invasion forsøg materialiseret. Han forlod Admiralitetet, da Newcastle-ministeriet faldt i november 1756 og tjente derefter igen som First Lord, da Pitt-Newcastle-ministeriet blev oprettet i juni 1757.