I den nye NHL blev McDonald hentet af Montreal Wanderers. McDonald var en af 12 spillere, der var medlemmer af Wanderers' trup i 1917/18. Wanderers' hjemmebane blev ødelagt af ild kun 6 kampe ud af de 22 på planen. Denne begivenhed tvang ligaen til at sprede Wanderers spillere via et udkast til 1 af de resterende 3 hold (Toronto, Montreal Canadiens og Ottawa Senators) i National Hockey League. McDonald blev hentet af Montreal Canadiens, som han spillede for indtil 1919.
1919 Stanley Cup Finals, som blev aflyst efter fem kampe (bundet til 2-2, med en bundet spil) på grund af den spanske influenza pandemi. McDonald var en af Canadiens spillere alvorligt syg med influenza, da serien blev aflyst. Hans holdkammerat Joe Hall ville bukke under for sygdommen.