Når der er risiko for selv eller andre, normalt tidligt i behandlingen, kan hospitalsindlæggelse være nødvendig. Psykiatrisk rehabilitering, psykoterapi og faglig rehabilitering er meget vigtige for genopretning af højere psykosocial funktion. Som en gruppe har personer med skizoafektiv lidelse, der blev diagnosticeret ved hjælp af DSM-IV og ICD-10-kriterier (som siden er blevet opdateret), et bedre udfald end personer med skizofreni, men har varierende individuelle psykosociale funktionsresultater end personer med humørforstyrrelser.
humørstabiliserende medicin eller antidepressiv medicin, eller begge dele