Borobudur er bygget som en enkelt stor stupa, og når den ses ovenfra, tager den form af en gigantisk tantrisk buddhistisk mandala, der samtidig repræsenterer den buddhistiske kosmologi og sindets natur. Det oprindelige fundament er et firkantet, cirka 118 meter på hver side. Det har ni platforme, hvoraf de nederste seks er firkantede og de øverste tre er cirkulære. Den øverste platform har halvfjerds to små stupaer, der omgiver en stor central stupa. Hver stupa er klokkeformet og gennemboret af talrige dekorative åbninger. Buddha-statuer sidder inde i de gennemborede indhegninger.
ni