Thrasybulus var igen i kommando over en eskadrille af den athenske flåde i slaget ved Cyzicus, en fantastisk athensk sejr. I dette slag trækker athenserne imidlertid den spartanske flåde ud for at forfølge en lille styrke ledet af Alcibiades; da spartanerne havde fået en god afstand fra land, dukkede to eskadriller under kommando af Thrasybulus og Theramenes op i deres bageste for at afskære deres tilbagetog. Spartanerne blev tvunget til at flygte til en nærliggende strand, hvor Alcibiades landede sine mænd i et forsøg på at gribe de spartanske skibe. Spartanerne begyndte imidlertid med hjælp fra en persisk hær at drive denne athenske styrke ud i havet; da denne kraft blev set, trækker Thrasybulus ud til lands midlertidigt for at afhjælpe sin egen landflygtning.
Tag spartanernes skibe.