Denne artikel omhandler humant patogene bakterier. Selv om de fleste bakterier er harmløse eller ofte gavnlige, er nogle patogene, med antallet af arter anslået til mindre end hundrede, der ses at forårsage smitsomme sygdomme hos mennesker. Der findes derimod flere tusinde arter i det menneskelige fordøjelsessystem.
Patogene bakterier