Under felttoget i 1813 deltog Eugène i slaget ved Lützen.
- Hvad? Napoleon sendte ham derefter tilbage til Italien, hvor han organiserede forsvaret mod østrigerne og holdt ud på Mincio indtil abdikationen i 1814. Efter Napoleons fald i 1814 trak Eugène sig tilbage til München og på foranledning af sin svigerfar, kong Maximilian I Josef af Bayern. Han vendte snart tilbage til Paris efter sin mors død, hvor han blev hilst velkommen af Ludvig XVIII og Alexander I af Rusland, og han opgav straks sin politiske aktivitet og vendte tilbage til sin kones familie i Bayern. Derfor forblev han neutral under Napoleons tilbagevenden til magten i De Hundrede Dage.