Som med enhver medicinsk behandling, er der et potentiale for vacciner at forårsage alvorlige komplikationer, såsom alvorlige allergiske reaktioner, men i modsætning til de fleste andre medicinske indgreb, vacciner gives til raske mennesker, og så en højere standard for sikkerhed forventes. Mens alvorlige komplikationer fra vaccinationer er mulige, er de ekstremt sjældne og meget mindre almindelige end lignende risici fra de sygdomme, de forebygger. Som succesen af immuniseringsprogrammer øger og forekomsten af sygdom falder, skifter offentlighedens opmærksomhed væk fra risikoen for sygdom til risikoen for vaccination, og det bliver udfordrende for de efterfølgende sundhedsmyndigheder at bevare sikkerheden for vaccinationsprogrammer.
autisme