Under Anden Koalitionskrig tjente Hohenzollern igen i Italien. Han kommanderede en brigade under Pál Kray i et slag ved Legnago den 26. marts 1799. Han kæmpede i slaget ved Magnano, hvor han midlertidigt kommanderede en division. Han belejrede citadellet i Milano fra den 30. april og modtog kapitulationen den 24. maj. Den 12. juni forsøgte han med 4.300 soldater at blokere Jacques MacDonalds meget større franske styrke i Slaget ved Modena, men blev besejret med store tab. Han deltog også i slaget ved Trebbia og Novi.
- Hvad? Han vandt forfremmelse til Feldmarschall-Leutnant i oktober 1799.