Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Holocaust i Estland refererer til de nazistiske forbrydelser under besættelsen af Estland af Nazityskland. Før krigen var der ca. 4.300 estiske jøder. Efter sovjetisk besættelse i 1940 blev omkring 10% af den jødiske befolkning deporteret
til Sibirien, sammen med andre estere. Omkring 75% af de estiske jøder, der var klar over den skæbne, der ventede dem fra Nazityskland, flygtede til Sovjetunionen; stort set alle dem, der var tilbage (mellem 950 og 1.000 mennesker) blev dræbt af Einsatzgruppe A og lokale samarbejdspartnere inden udgangen af 1941. Også de estiske romer blev myrdet og gjort til slaver af nazisterne og deres kollaboratører. Nazisterne og deres allierede dræbte også omkring 6.000 etniske estere og 1.000 etniske russere, der blev anklaget for at være kommunistiske sympatisører eller slægtninge til kommunistiske sympatisører. Desuden blev omkring 15.000 sovjetiske krigsfanger og jøder fra andre dele af Europa dræbt i Estland under den tyske besættelse.