I 1880, mens han arbejdede på militærhospitalet i Constantine, Algeriet, opdagede han, at årsagen til malaria er en protozoer, efter at have observeret parasitterne i en blodprøve taget fra en patient, der lige var død af malaria. Han fandt, at den forårsagende organisme var en protozoer, som han kaldte Oscillaria malariae, men senere omdøbt til Plasmodium. Dette var første gang, at protozoer blev vist at være en årsag til sygdom af nogen art. Opdagelsen var derfor en validering af bakterieteorien om sygdomme. Laveran arbejdede senere på trypanosomer, især søvnsygdom, og viste endnu en gang, at protozoer var ansvarlige for sygdommen. Spørgsmål: Hvad blev fundet at forårsage malaria?
primat