Hendes første udgivne bog var diktsamlingen "The Espalier" fra 1925, som blev rost af A. E. Housman og Arthur Quiller-Couch. Hun blev opmuntret til at skrive fiktion af David Garnett. Warner's romaner omfattede "Lolly Willowes" (1926), "Mr Fortune's Maggot" (1927), "Summer Will Show" (1936) og "The Corner That Held Them" (1948). Gentagne temaer er tydelige i en række af hendes værker. Disse omfatter en afvisning af kristendommen (i "Mr Fortune's Maggot" og i "Lolly Willowes", hvor hovedpersonen bliver heks); kvinders position i patriarkalske samfund ("Lolly Willowes", "Summer Will Show", "The Corner that Held Them"); tvetydig seksualitet eller biseksualitet ("Lolly Willowes", "Mr Fortune's Maggot", "Summer Will Show"); og lyriske beskrivelser af landskabet. "Mr. Fortune's Maggot", om en missionær på Stillehavsøerne, er blevet beskrevet som en "satirisk, anti-imperialistisk roman". I "Summer Will Show" rejser hovedpersonen, Sophia Willoughby, til Paris under
1848 revolution og forelsker sig i en kvinde. "The Corner That Held Them" (1948) fokuserer på livet for en gruppe nonner i et middelalderligt kloster.