Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter at Martin var vendt tilbage til Canada, giftede han sig med Ellen Hill, eller "Karakwineh" (som betyder "bevægelig sol"). Han blev også indskrevet på Toronto School of Medicine i 1863. Han tog sin B.M. i 1865 og sin M.D. i 1866. I 1866 tjente han også i dronningens egne rifler under slaget ved Ridgeway, en af de væbnede konflikter i Fenian Raids
fra USA i det år.