Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Han kommanderede skruefregatten i den nordatlantiske blokeringsskvadron i 1864-65, og en division af admiral Porters eskadrille i de to slag ved Fort Fisher i december 1864 og januar 1865
- Hvad? Thatcher blev derefter udnævnt til kommandoen over Western Gulf Squadron, og begyndte straks operationer i samarbejde med General Canby, kommandør for Army of West Mississippi, i indtagelsen af Mobile, Alabama. Efter et kortvarigt og kraftigt bombardement blev Spanish Fort og Fort Blakeley erobret af Unionshæren den 9. april 1865. Med byens vigtigste forsvar tabt, evakuerede de konfødererede tropper Mobile den 12. april. En formel overgivelse blev krævet af general Granger og fungerende kontreadmiral Thatcher, og byen blev taget i besiddelse.