Den 23. marts 2011 blev Carr byttet til Houston Dynamo i bytte for Dominic Oduro. Han debuterede for Dynamo den 17. august 2011, da han kom ind som erstatning i en 1<unk>1 draw med New England Revolution. Under kampen bar Carr for første gang en beskyttende hjelm, noget han ville gøre i resten af sin karriere. Den 14. september kom han fra bænken og scorede i det 86. minut for at give Houston en 2 til 2 remis med Columbus Crew. Han sluttede den regulære sæson med 1 mål fra 9 optrædener, 4 af dem var starter. I Houstons åbningskamp i slutspillet scorede Carr for at hjælpe Dynamo til en 2 til 1 sejr over Philadelphia Union. Carr ville starte anden etape af Conference Semifinalen, da Houston slog Union 1 <unk> 0 for at komme videre. Han fik også start i Conference Finals, hvor han hjalp Dynamo med at slå Sporting Kansas City 2-0 for at komme videre til MLS Cup 2011.
, hvor Carr og Dynamo ville tabe til Los Angeles Galaxy 1<unk>0.