Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1571, efter lignende initiativer taget ved flere fæstninger langs den portugisiske kyst, beordrede kong Sebastian ombygning af tårnet. På det tidspunkt blev fortet opkaldt til ære for "São Brás" ("Saint Blaise"), skytsmændenes skytshelgen i den portugisiske tradition, og ændret til ære for den unge konge (tabt i slaget ved Alcácer Quibir
) og Sankt Sebastian. Under Afonso Álvares' ansvar omdannede det nye projekt fæstningen til en massiv fæstning, der blev omtalt som "Fæstningen i São Sebastião da Caparica" (). Mellem 1580 og 1640 blev det lokalt omtalt som "Torre dos Castelhanos" ("Tårnet af castilianerne"), hvor det blev ombygget strukturelt for at opfylde kravene fra det filippinske dynasti.