Efter sin karriere som spiller, arbejdede Bernardini som manager og trænede Roma, Vicenza, Fiorentina (vindende italienske mesterskab i 1955-56 Serie A
Lazio (vindende Coppa Italia i sæsonen 1957-1958), Bologna (vindende italiensk mesterskab i Serie A-sæsonen 1963-1964), Sampdoria og Brescia, før han fortsatte med at træne det italienske landshold fra 1974 til 1975.