Ma blev overført sammen med sin bror Ma Fuxiang og flere fætre til at tjene som officerer under general Dong Fuxiang til Beijing i 1898. Under hundrede dages reform i 1898 blev Dong Fuxiang, Ma Anliang og Ma Haiyan kaldt til Beijing og hjalp med at sætte en stopper for reformbevægelsen sammen med Ma Fulu og Ma Fuxiang. Under bokseroprøret blev de muslimske tropper kendt som "Kansu Braves" og kæmpede mod otte nationers alliance. Ma Fulu og Ma Fuxiang deltog begge i baghold og kørsel tilbage af Alliancens styrker i Slaget ved Langfang under Seymour-ekspeditionen, hvor han ledte en styrke af Hui, Dongxiang og Baoan-muslimer til at drive Alliancen tilbage til Tianjin og personligt førte en kavaleribelastning og nedskærede fjendtlige tropper med sit sværd. Ma Fulu og fire af hans fætre blev dræbt i kamp under slaget mod udlændinge i Beijing i 1900 under slaget om Peking (1900)
under et blodigt slag ved Zhengyang Gate. Hans fætre Ma Fugui 馬福貴, Ma Fuquan 馬福全 og hans faderlige nevøer Ma Yaotu 馬耀圖 og Ma Zhaotu 馬兆圖 døde i slaget. 100 af hans kolleger Hui og Dongxiang soldater fra hans hjemby blev dræbt i aktion ved Zhengyang Gate i belejringen af Peking. Han havde ledet en brigade, hans bror Ma Fuxiang overtog hans position efter hans død. Ma Fuxiang arvede Ma Fulus hær.