Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter det kommunistiske parti mistede magten i slutningen af 1989
, blev selskabet privatiseret og overdraget til ledelsen. Dårlig forvaltning og beslaglæggelse af aktiver førte til et sammenbrud. Virksomheden blev omstruktureret, og nogle fabrikker lukkede. Med undtagelse af nogle mindre selskaber ved navn Škoda og Škoda Auto blev de tjekkiske Škoda-selskaber efter den kaotiske periode i 1990'erne i 2000 omgrupperet i holdingselskabet "Škoda Holding a.s". I 2010 ændrede holdingselskabet navn til "Škoda Investment, a.s".