I 1980 læste Wilson en Associated Press udsendelse om de kongreskabler, der beskrev de flygtninge, der flygtede fra det sovjetisk besatte Afghanistan. Den kommunistiske Demokratiske Republik Afghanistan havde overtaget magten under Saur-revolutionen og bad Sovjetunionen om at hjælpe med at undertrykke modstand fra Mujahideen. Ifølge biografen George Crile III kaldte Wilson personalet i United States House Committee on Appropriations, der beskæftiger sig med "sorte bevillinger", og anmodede om en dobbelt bevillingsforhøjelse til Afghanistan. Fordi Wilson netop var blevet udnævnt til House Appropriations Subcommittee on Defense (som er ansvarlig for finansiering af CIA-operationer), gik hans anmodning igennem.
Underudvalg for Forsvaret