Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Gorton var en navnekristen i det mindste i den tidlige del af sit liv, men var ikke kirkegænger. Nogle kilder har identificeret ham som agnostiker eller endda ateist. Han gik på anglikanske skoler og blev påvirket af de kristne socialistiske synspunkter af James Ralph Darling, hans rektor på Geelong Grammar. I en tale i 1948 sagde Gorton at "Kristendommens historie er den mest forbløffende i verdenshistorien". Men i forbindelse med folkeafstemningen i 1999
Han var imod at nævne Gud i præamblen. Ifølge hans biograf Ian Hancock: "Gorton var måske ikke en troende, endsige en praktiserende kristen, og da han talte om'sjælens' religion, havde han ikke en bestemt tro i tankerne. Hans religion var snarere grundlagt på det bud i Femte Mosebog: 'Mennesket lever ikke af brød alene.'"