Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I starten af 2016 sæsonen, Ueda startede sæsonen godt, da han hjalp Kashima Antlers holde to rene lag i de første to liga kampe i sæsonen. Ueda formåede også at genvinde sin første holdplads, hvor han spillede som centerback. Efter kampen i en 3-0 sejr mod Shonan Bellmare den 16. april 2016 var han i tårer i en post-match interview og dedikerer sejren til sin familie og folk, der var i situation ved Kumamoto jordskælv. Ueda hjalp senere siden med at afslutte førstepladsen i den første fase af ligaen. Han blev dog snart placeret på reservbænken for resten af 2016 sæsonen. På trods af dette fortsatte Ueda med at være involveret i Kashima Antlers' første hold og hjalp siden med at ende på toppen af tabellen. Selv om han gjorde en optræden i Championship-fasen, vandt klubben ligaen efter at have spillet begge ben for at slå Urawa Red Diamonds 2<unk>2 på aggregat gennem et udendørs mål. Ueda optrådte tre ud af fire kampe i FIFA Club World Cup
, da han hjalp Kashima Antlers med at nå til finalen, kun for at tabe 4-2 mod Real Madrid. På trods af at have tabt i finalen blev både Ueda og Gen Shojis partnerskab som centerback rost af medierne, både i og uden for Japan. Ueda spillede derefter de næste to kampe ved at slå Sanfrecce Hiroshima og Yokohama F. Marinos for at nå kejserens Cup Final. Han startede derefter i finalen, hvor han startede hele kampen, i en 2 til 1 sejr mod Kawasaki Frontale. I slutningen af 2016 sæsonen, Ueda gik på at gøre tredive en optrædener i alle konkurrencer.