Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 2016 blev både Fenati og Migno bekræftet, og en tredje cykel blev givet til Nicolò Bulega, men Fenati blev fyret efter ti løb og erstattet af Lorenzo Dalla Porta. Fenati startede 2016 sæsonen med en pole position i Qatar, men han formåede kun 4. i løbet. Han sluttede på 20. plads i Argentina, før hans første sejr i sæsonen i USA. Han var syvende i Jerez, før han endte på andenpladsen i Le Mans, hvor han tabte til Brad Binder med 0,099 sekunder. Fenati kvalificerede sig på pole i Mugello, men formåede ikke at afslutte løbet. Han var fjerde i både Catalunya og Holland
, før en meningsløs 18 position i Tyskland. Fenati blev droppet af Sky Racing VR46 i Østrig som en disciplinær handling for at være uenig med Uccio Salucci. Den 16. august opsagde VR46-holdet deres kontrakt med Romano for sæsonerne 2016 og 2017, idet de anførte adfærdsmæssige problemer i konflikt med holdpolitikken som årsagen til opdelingen.