Under den tyske invasion af Polen, der startede Anden Verdenskrig, kom "Einsatzgruppe I" ind i Bielsko-Biała i første halvdel af september 1939 for at torturere, plyndre og myrde jøder. Under krigen blev Bielsko-Biała annekteret og besat.
af Nazityskland. I 1939 arresterede tyskerne adskillige polske lærere og skoleledere, som derefter blev deporteret til nazistiske koncentrationslejre og myrdet der. Tyskerne havde et fængsel for polakker i Bielsko-Biała. Mange af byens jødiske indbyggere blev myrdet i den nærliggende udryddelseslejr Auschwitz. Mindre end 1000 af Bielsko-Bialas jødiske samfund på næsten 8000 overlevede krigen. Efter Nazi-Tysklands nederlag i 1945 flygtede den resterende tyske befolkning mod vest eller blev fordrevet. Byen blev poloniseret og gradvist befolket af polske bosættere.