I august 1941 blev 1. kavaleridivision omorganiseret til 10. pansrede division. Clark forblev i kommandoen indtil april 1942 og savnede divisionens aktive tjeneste ved Alam Halfa og det andet slag ved El Alamein. Han blev kommunikator i Tunesien og derefter viceguvernør i Sicilien efter dets erobring i 1943
- Hvad? I slutningen af 1943 blev han kortvarigt generalmajor ved GHQ Middle East i Kairo, før han blev administrerende chef ved de allierede styrkers hovedkvarter (AFHQ), hvor han havde den fungerende rang af generalløjtnant.