Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Sæsonen 2011/12 oplevede en række ændringer på Connacht. For provinsen som helhed var det den første sæson i Heineken Cup, den øverste europæiske rugby-konkurrence. Connacht kvalificerede sig til 2011-12 Heineken Cup på grund af Leinsters sejr i den foregående sæson, som gav Irland en ekstra plads. I mellemtiden havde holdet mistet en række nøglespillere i løbet af præ-sæsonen gennem overførsler. Blandt spillerne, der forlod provinsen, var førstevalg tighthead prop, Jamie Hagan, der efterlod en position åben på startholdet. Oprindeligt blev denne plads besat af Rodney Ah You. Loughney debuterede i Heineken Cup mod Harlequins den 10. november 2011, hvor han kom ind som erstatning for Wilkinson. Ah You kæmpede dog med sin nye status som førstevalg, og den 10. december 2011 startede Loughney sin første Heineken Cup-kamp nogensinde, hjemme mod Gloucester i Sportsground. Loughney startede yderligere to kampe for holdet i Heineken Cup, herunder hjemme kampen mod Harlequins, Connacht's første sejr i konkurrencen. Hans status som førstevalg blev overført til den indenlandske liga, som var blevet omdøbt til "Pro12", og Loughney spillede i 20 ud af 22 kampe i ligaen sæson
, starter 15 gange. I marts 2012 spillede Loughney sin 100. kamp for provinsen og blev en af de yngste spillere i holdets historie til at nå milepælen.