Cheptai begyndte at gøre en indvirkning på seniorniveau i 2013 sæsonen, der starter med en runner-up finish på Cross Internacional de Itálica og tredjeplads på Cross Internacional Juan Muguerza. Andenpladsen til Margaret Muriuki ved Kenya Cross Country Championships bragte hendes udvælgelse til det senior nationale hold, og sluttede tiende ved 2013 IAAF World Cross Country Championships
(selvom det kun var det femte bedste blandt det vindende kenyanske hold). Hun konkurrerede på IAAF Diamond League sporet kredsløb for første gang det år og formåede personlige bests på 8:56.20 minutter og 14:50.99 minutter for 3000 m og 5000 m.