Disse kofaktorer tjener mange formål; for eksempel kan metal ioner hjælpe med at stabilisere nukleofilske arter inden for det aktive sted. Organiske kofaktorer kan enten være coenzymer, der frigives fra enzymets aktive sted under reaktionen, eller protetiske grupper, der er tæt bundet til et enzym. Organiske protetiske grupper kan være kovalent bundet (f.eks. i biotin enzymer som carboxylase). Et eksempel på et enzym, der indeholder en ikke-protein cofactor, som er inorganisk (f.eks. metal ioner og jern-sulfur klynger) eller organiske forbindelser (f.eks. flavin og hæme). Disse cofaktorer tjener mange formål; for eksempel kan metal ioner hjælpe med at stabilisere nukleofilske arter inden for det aktive sted. Organiske cofaktorer kan enten være coenzymer, der frigives fra enzymets aktive sted under reaktionen, eller protetiske grupper, der er tæt bundet til et enzym. Organiske protetiske grupper kan være kovalent bundet (f.eks. i biotin enzymer som carboxylase). Et eksempel på
organiske forbindelser