Fuldfør følgende sætning: Carstares blev derefter fængslet i Tower of London; året efter, i 1675, blev han overført til Edinburgh Castle. Han blev antaget at være bekymret for Sir James Stewart i forfatterskabet af en pjece "En beretning om Skotlands klager på grund af D. af Lauderdale's Ministrie, ydmygt tilbudt til hans hellige majestæt" (1674). John Maitland, 1. hertug af Lauderdale fik selv Carstares til at indrømme, at han havde været involveret i trykningen af pamfletten. Lauderdale brugte truslen om tortur af støvlen, som kunne anvendes lovligt i Skotland; men Carstares blev ikke tortureret. I august 1679 blev han løsladt.
Slaget ved Bothwell Bridge. Han kan derfor ikke have været den William Carstares, der var hovedanklager vidnet ved retssagen mod William Staley (den første af de Popish Plot retssager) i november 1678, selv om Carstares var også en skotte, og ligesom hans navnebror siges at have handlet som en efterretningsagent.