Da Shackleton den 24. februar indså, at de ville blive holdt i isen hele vinteren, og beordrede skibets rutine opgivet. Hundene blev taget af bord og indkvarteret i is-kennels eller "hund", og skibets interiør blev omdannet til egnede vinterkvarterer for de forskellige grupper af officerer, forskere, ingeniører og søfolk. Et trådløst apparat var rigget, men deres afsides beliggenhed var for fjern til at modtage for meget eller signaler. Shackleton var klar over det seneste eksempel af Wilhelm Filchners skib, Deutschland, som var blevet i nærheden af samme område seks måneder tidligere. Efter Shackleton forsøgte at nå en is i hele vinteren, blev skibet fanget ved en is krak på omkring 75° nord for kysten.
6. marts 1912, ca. 320 km ud for Coats Land