På trods af denne opdagelse, internationale forskningsindsatser for at identificere virus, oprindeligt kaldet non-A, non-B hepatitis (NANBH), mislykkedes i det næste årti. I 1987, Michael Houghton, Qui-Lim Choo, og George Kuo på Chiron Corporation, i samarbejde med Daniel W. Bradley på Centers for Disease Control and Prevention, brugte en ny molekylær kloning tilgang til at identificere den ukendte organisme og en diagnostisk test. I 1970 bekræftede Alter virusets tilstedeværelse ved at verificere dets tilstedeværelse i et panel af NANBH-transfusionsmedicin. I april 1989 blev opdagelsen af HCV offentliggjort af Alter og hans forskergruppe. I 1998 faldt den internationale forskningsindsats for at identificere viruset, oprindeligt kaldet non-A, non-B hepatitis (NANBH), til trods for denne opdagelse. I 1998 blev Bradley og Bradley henvist til CDC for at udvikle en undersøgelse, der resulterede i en betydelig forbedring af risikoen for at udvikle hepatitis A.
1987 og