Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I slutningen af 2000, "Bunker Hill" indsat med Battle Group. Hun deltog igen i Operation Southern Watch og gennemførte boardinger og inspektioner af over 40 handelsskibe til støtte for De Forenede Nationers sanktioner mod Irak. "Bunker Hill" eskorterede også Amphibious Ready Group (ARG) under humanitære operationer ud for Østtimor og træningsøvelser i Kuwait. "Bunker Hill" fungerede som luftforsvarschef for ARG, hvor hun designede og implementerede innovative procedurer for CG-integration i en ARG. Efter angrebet
på destroyeren "Bunker Hill", der sejlede fra Bahrain for at yde støtte og beskyttelse til syv amerikanske flådeskibe og amerikanske flådeskibe (hjælpsskibe), der var baseret der, og som efterfølgende forblev til søs i 67 på hinanden følgende dage. "Bunker Hill" vendte tilbage fra udstationering i februar 2001.