I den intrinsiske regulering er den metaboliske vej selvregulerende for at reagere på ændringer i niveauet af substrater eller produkter, der er involveret; for eksempel kan et fald i mængden af produkt øge strømmen gennem vejen for at kompensere. Denne type regulering indebærer ofte allosterisk regulering af aktiviteterne af flere enzymer i vejen. Ekstrinsisk kontrol indebærer en celle i en flercellet organisme, der ændrer sin metabolisme som reaktion på signaler fra andre celler. Disse signaler er normalt i form af opløselige budbringere som hormoner og vækstfaktorer og opdages af specifikke receptorer på overfladen. Disse signaler sendes derefter inde i cellen af den anden budbringende, der er involveret i fosfatisering af proteiner.
allosterisk regulering af aktiviteten af flere enzymer i vejen