To forskere, Chris Bennett (1996) og David Peters (2000), har fundet pterosaurer til at være protorosaurer eller tæt beslægtet med dem. Peters brugte en teknik kaldet DGS, som indebærer at anvende de digitale sporing funktioner af foto redigeringssoftware til billeder af pterosaur fossiler. Bennett kun genvundet pterosaurer som nære slægtninge af protorosaurer efter at have fjernet karakteristika af den bageste lem fra sin analyse, i et forsøg på at teste ideen om, at disse tegn er resultatet af konvergent evolution mellem pterosaurer og dinosaurer.
søstergruppe af Scleromochlus eller falder mellem den og Lagosuchus på ornithodiran familietræet