I begyndelsen af det 13. århundrede, de migrerede til bassinerne af Mellem Lena, Aldan og Vilyuy floder under pres fra de stigende mongolerne. De nordlige Yakutter var i vid udstrækning jægere, fiskere og rensdyr hyrder, mens de sydlige Yakutter opdrættet kvæg og heste. I 1620'erne Tsardom af Muscovy alene begyndte at flytte ind i deres territorium og annekteret eller bosatte sig på det, pålagt en yderligere skat og formået at undertrykke flere tsaristiske oprør mellem 1634 og 1642.
Den transsibiriske jernbane