Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Patterson ledte sin brigade ved Williamsburg og Seven Pines
Men under det sidste slag måtte han opgive kommandoen på grund af sygdom, tilsyneladende tyfus. Han tog orlov den 7. juni og gik derfor helt glip af De Syv Dagers Slag. I juli var han frisk nok til at påtage sig administrative opgaver i hærens hovedkvarter. Patterson vendte ikke tilbage til feltkommandoen før efterårets måneder, da han genoptog kommandoen over sin gamle brigade, nu i Daniel Sickles' division. Men hans tilbagevendende sygdom plagede ham fortsat.