I februar 1836 vendte Cos tilbage til San Antonio med Santa Anna og førte en kolonne på 300 soldater i belejringen af Alamo
- Hvad? Hans mænd angreb det nordvestlige hjørne af missionen den 6. marts og overvandt til sidst den nordlige mur. Den 21. april ankom Cos med over 500 forstærkninger til Santa Anna kort før slaget ved San Jacinto. Den eftermiddag besejrede texanske styrker under general Sam Houstons ledelse Santa Annas hær i et slag der kun varede 18 minutter. Både Cos og Santa Anna undslap under slaget; Santa Anna blev taget til fange den næste dag, den 22. april, og Cos blev taget til fange den 24. april. General Santa Anna overgav efterfølgende sin hær og til sidst alle mexicanske krav på Texas, hvilket sluttede Texas Revolution.