Efter to på hinanden følgende sæsoner med kollaps, var Huntington og Hurdle fast besluttet på at være aggressive i free agency, tilføje spillere og veteran lederskab, der ville afværge en anden Pittsburgh Pirates kollaps i 2013. I mellemsæsonen blev holdet enige med veteranfangeren Russell Martin om en to-årig, $ 17 millioner aftale. Martin, mens han leverede anstændige offensive tal, blev anset for at være en stor defensiv opgradering i forhold til det foregående års deling af Rod Barajas og Michael McKenry. I 2012 havde Barajas og McKenry kombineret at smide ud 19 af 173 baserunners, for en fanget stjæle procentdel på 11%, mens Russell Martin holdt en karriere fanget stjæle procentdel på 30.25% ind i 2013 sæsonen. Den 26. december 2012 byttede Pirates etableret tættere Joel Hanrahan og infielder Brock Holt til Boston Red Sox for reliever Mark Melancon, og udsigter Jerry Sands, Iván DeJesús Jr. og Stolmy Pimentel. Med dette træk signerede Pirates igen setup manden Jason Grilli til en to-årig aftale til en værdi af $ 4,5 millioner, for at blive den nye Pirates closer. Melancon, der var undervurderet efter en elendig, skade-siddede 2012 sæson, erstattede Grilli som Pirates setup mand. Handlen endte med at læne sig stærkt til fordel for Pirates, da Grilli og Melancon ville forankre den såkaldte "Shark Tank" bullpen som en af de bedste bullpens i MLB samt begge blev udvalgt til
Hanrahan endte med kun at spille i ni kampe for Red Sox, før han fik en skade på sin pitch-arm og skulle opereres, da hans kontrakt var ved at udløbe i slutningen af sæsonen. Hanrahan ville aldrig spille i Major League igen.