Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Da krigen var ovre, blev de kommunistiske organisationer legaliseret, og Pekkala blev genvalgt til parlamentet i parlamentsvalget i 1945 som repræsentant for den finske Folkedemokratiske Liga. I 1945-1946 fungerede han som undervisningsminister og 1946-1948 som justitsminister. I 1946-1947 var Pekkala medlem af den særlige domstol for krigsansvarsforsøgene
af de allierede. Pekkala forlod politik i 1948 og drev et advokatfirma i Helsinki indtil sin død i september 1956.