Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Den sidste mongolske khan var Ligden Khan i det tidlige 17. århundrede. Han kom i konflikt med manchuerne over plyndring af kinesiske byer, og fremmedgjorde også de fleste mongolske stammer. Han døde i 1634. I 1636 havde de fleste indvendige mongolske stammer underkastet sig manchuerne, der grundlagde Qing-dynastiet. Khalkhaerne underkastede sig til sidst Qing-herredømmet i 1691, og hele det nuværende Mongoliet kom derfor under mandschurernes herredømme. Efter flere Dzungar<unk>Qing krige
Som et resultat af Qing erobring af Dzungaria i 1757-1758 blev Dzungarerne (vestmongolerne eller Oirater) praktisk talt udslettet.