Cardinals fortsatte med at vinde efter afgang af La Russa og Pujols. Tidligere Cardinals backstop Mike Matheny blev den nye Cardinals manager for 2012 sæsonen og fremefter. Carlos Beltrán, en anden fri agent, der underskrev for at erstatte Pujols før sæsonen 2012, fik en Player of the Week-pris i maj efter at have slået seks hjemmekunder inden for en uge; han slog til sidst 32 for sæsonen. I slutspillet udnyttede Cardinals deres nyfundne comeback-personlighed mod Washington Nationals i NLDS: i det sidste spil kørte Pete Kozma to løb i niende inning for at vinde serien efter at være nede 6-0. Men efter at have fået en 3 til 1-forspring, faldt de til San Francisco Giants i NLCS
- Hvad? Efter sæsonen fortsatte toppublikationer som ESPN og "Baseball Prospectus" med at mærke Cardinals' farm system som et af de bedste systemer i baseball.