Efter Tjekkoslovakiets befrielse blev han indsat i den tjekkoslovakiske hær ved generalstaben og dimitterede fra militærakademiet. Men kort efter kommunisternes overtagelse af magten i 1948 blev han arresteret og i en politisk retssag dømt til 20 års fængsel. Han kom til de værste kommunistiske tvangsarbejdslejre (som Příbram, Jáchymov osv.) og blev amnestieret så sent som i 1960. Men indtil slutningen af det kommunistiske regime
Han blev stadig forfulgt og kun tilladt at udføre fysisk arbejde. Derefter blev han rehabiliteret, og fik tilbage alle sine hædersbevisninger og rangen som hærgeneral. Han blev også valgt som den første formand for Konfederationen af politiske fanger, og efter at hans mandat var udløbet, forblev han æresformand.