Med skiftet i verdensøkonomien og handelsruter til den nye verden og væk fra Middelhavet, begyndte Genovas politiske og økonomiske magt at falde. Dens militære magt kollapsede under angrebet på Genova i 1793 og slaget ved Genova
i 1795, hvor Genova kæmpede den franske flåde og den engelske. I 1797, under pres fra Napoleon, blev Republikken Genova et fransk protektorat kaldet den Liguriske Republik, som blev annekteret af Frankrig i 1805. Denne kendsgerning nævnes i den første sætning i Tolstojs "Krig og fred":