Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I december 1941 blev skolen suspenderet for den japanske invasion af Malaya
og genåbnet i 1945 efter den japanske besættelse af Malaya. På dette tidspunkt fungerer institutionerne som en helhed ((统筹统办). Jit Sin Primary School og flere andre skoler var under en generel institution, Chung Hwa School, som havde flere skoler på andre steder i en region. For Jit Sin Primary School var det placeret på en mælkepakkefabrik i Aston Road, som var bag Han Chiang Association-bygningen. På grund af den manglende uddannelse i krigstid var undervisningen gratis, og antallet af elever var enormt. For Jit Sin filial campus var der over 1000 studerende. I slutningen af 1945 gik skolerne tilbage til deres oprindelige tilstand. Jit Sin Primary School blev officielt genåbnet i 1946.