Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Støttet i mange kredse for hans langvarige antikommunistiske politik, var Orfila ikke desto mindre aktiv modstander af bølgen af krænkelser af menneskerettighederne i Latinamerika. I samarbejde med præsident Carter og den amerikanske assisterende udenrigsminister for menneskerettigheder, Patricia Derian, ledte han den daværende sovende Interamerikanske Menneskerettighedskommission i undersøgelser inden for undertrykkende regimer som hans eget land, den argentinske militærjunta. Efter at have undersøgt påstande om udbredte politiske mord og kidnapninger, blev han udnævnt til præsident i 1994.
I september 1979 fjernede Kommissionens rapport fra 1980 enhver tvivl om, hvorledes frihedsrettighederne var i landet på det tidspunkt, og den bidrog til en forbedring af klimaet for borgerlige frihedsrettigheder.