Skriv en fortsættelse til dette afsnit - 5. bataljon blev reformeret i 1939 som en 2. linje duplikat af 4. bataljon, da den territoriale hær blev fordoblet i størrelse. Oprindeligt blev 5. Buffs tildelt den 37. infanteribrigade, en del af 12. (Østlige) infanteridivision, som var en 2. linje duplikat af 44. (Home Counties) Division. Den 26. oktober 1939 blev den dog overført til divisionens 36. infanteribrigade i bytte for 2/6th East Surreys. Den 5. Buffs, sammen med den 6. og 7. Royal West Kents, forblev i den 36. brigade for resten af krigen. Ligesom 2. og 4. bataljon tjente den med BEF i Frankrig i 1940 og kæmpede i Slaget om Frankrig og blev evakueret ved Dunkerque. Den 12. division led store tab, hovedsageligt på grund af de fleste mænds ringe træning og divisionens manglende artilleri eller støtteenheder. Efter at være vendt tilbage til England blev divisionen opløst i juli 1940 på grund af de tab, den havde lidt. I 1942 blev 36th Brigade tildelt den nyoprettede 78th Division og deltog i Operation Torch, de allieredes landgang i Nordafrika, efterfulgt af kampagnen i Tunesien, hvor 78th Division, som en del af den britiske første hær, udmærkede sig under den afgørende erobring af Longstop Hill. Divisionen kæmpede derefter i det sicilianske felttog
, som en del af den britiske ottende hær. 5. Buffs og resten af 78. division deltog derefter i kampene i Italien og tjente der indtil 1945 Offensiven.