Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Ronaldo missede Madrids første tre kampe i 2016/17 sæsonen, herunder UEFA Super Cup 2016
mod Sevilla, da han fortsatte med at rehabilitere knæskaden, han led mod Frankrig i Euro 2016-finalen. Den 15. september fejrede han ikke sin sene frispark-udligning mod Sporting CP i Champions League, hvor Ronaldo udtalte post-kamp, at "de gjorde mig til den, jeg er". Den 7. november blev hans kontrakt opdateret for anden gang og forlænget med tre år til 2021. Den 19. november scorede han et hat-trick i en 3-0 sejr mod Atlético, hvilket gjorde ham til den bedste målmand i Madrid derby med 18 mål. Den 15. december scorede Ronaldo sit 500. mål i klubkarrieren i 2-0-sejr over Club América i semifinalen af FIFA Club World Cup 2016. Han scorede derefter et hat-trick i 4-2 sejren over den japanske klub Kashima Antlers i finalen. Ronaldo sluttede turneringen som topscorer med fire mål og blev også udnævnt til turneringens spiller. Han vandt 2016 Ballon d'Or, hans fjerde, og den indledende 2016 The Best FIFA Mænds Player, en genoplivning af den tidligere FIFA World Player of the Year, i høj grad på grund af hans succes med Portugal i at vinde Euro 2016.