Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Cambodja blev uafhængigt i 1953, og de to stater har siden da haft et splittet forhold. En tvist opstod i slutningen af 1950'erne om ejerskabet af Preah Vihear-templet, som ligger ved grænsen i Dângrêk-bjergene. I 1962 blev sagen henvist til Den Internationale Domstol, som besluttede til fordel for Cambodja, men Thailand udtrykte forbehold med hensyn til resultatet. I midten af 1960'erne var der også en tvist om ejerskabet af Ko Kut-øen. Disse tvister forsvandt, da Cambodja blev opslugt af en række konflikter i de følgende årtier og den katastrofale Khmer Rouge-herredømme, med tusindvis af flygtninge, der krydsede grænsen. I 1981 boede over 250.000 kambodsjanske og vietnamesiske flygtninge i tyve lejre langs grænsen, støttet af internationale hjælpeorganisationer og FN's Border Relief Operation. Sporadiske kampe brød ud langs grænsen efter Vietnams invasion.
I 1979 blev der oprettet et militærkontor i Cambodja, som fortsatte gennem hele 1980'erne, indtil Vietnam trak sig ud af landet i 1989. I et forsøg på at stoppe Khmer Rouge infiltration fra Thailand, Cambodja bygget en stor befæstet hegn langs grænsen i anden halvdel af 1980'erne. Siden freden i Cambodja i begyndelsen af 1990'erne har forbindelserne med Thailand endnu en gang forværret sig på grund af spørgsmålet om Preah Vihear og i mindre grad øen Ko Kut. Der blev i 1995 oprettet en grænse-kommission i et forsøg på at løse problemerne fredeligt, men der er kun sket få fremskridt, og en fuldstændig afgrænsning af grænsen, der er tilfredsstillende for begge parter, er endnu ikke afsluttet.