Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Den 24. juli 1580 proklamerede António sig selv som konge af Portugal i Santarém, efterfulgt af bifald på flere steder i hele landet; hans indenlandske regering varede i 20 dage, indtil han blev besejret i slaget ved Alcântara
af Habsburgernes hære under hertugen af Alba. Efter Lissabons fald forsøgte han at regere landet fra Terceira-øen på Azorerne, hvor han etablerede en eksilregering indtil 1583; António fik endda mønter prægnet - en typisk påstand om suverænitet og kongelighed. Nogle forfattere betragter ham som den sidste monark af Aviz-dynastiet (i stedet for kardinal-kong Henrik) og den 18. konge af Portugal. Hans regering på øen Terceira blev kun anerkendt på Azorerne, mens på fastlandet og på Madeira øerne blev magten udøvet af Filip II, der blev proklameret konge i 1580 som Filip I af Portugal og anerkendt som officiel konge af Cortes of Tomar i 1581. Valget af den nye konge blev gennemført på betingelse af, at kongeriget og dets oversøiske territorier skulle forblive adskilt fra Spanien og holde deres egne love og Cortes.