Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Humbert blev kort tid efter hjemsendt i en fangeudveksling og udnævnt i rækkefølge til hæren i Mainz, Donau og Helvetia, hvor han deltog i det andet slag ved Zürich
- Hvad? Han tog derefter på en ekspedition til Saint-Domingue, som var midt i et slaveoprør, for at genoprette fransk kontrol over kolonien og genoprette slaveriet. Humbert blev anklaget for plyndring i Saint-Domingue af Jean Baptiste Brunet, og det blev også rygtet, at han havde en affære med Pauline Bonaparte, hustru til hans kommanderende officer Charles Leclerc. Han blev sendt tilbage til Frankrig på ordre af Leclerc i oktober 1802 for "forhastelser og forbindelsesforhold med organisatorer af indbyggerne og med ledere af banditter". En engageret republikaner, hans utilfredshed med Napoleons kejserlige krav førte til, at han blev afskediget i 1803 og han trak sig tilbage til Morbihan, Bretagne.