Den primære funktion af pinealkirtlen er at producere melatonin. Melatonin har forskellige funktioner i det centrale nervesystem, hvoraf den vigtigste er at hjælpe med at modulere søvnmønstre. Melatoninproduktionen stimuleres af mørke og hæmmes af lys. Lysfølsomme nerveceller i nethinden opdager lys og sender dette signal til den suprachiasmatiske kerne (SCN), der synkroniserer SCN til dag-nat cyklus. Nervefibre videregiver derefter dagslysinformationen fra SCN til paraventrikulære kerner (PVN), derefter til rygsøjlen og via sympatisk system til overordnede cervikal ganglier (GSC), og derfra ind i pinealkirtlen.
pinealkirtel