Efter arrestationen af Jules Bastin og hans efterfølgers flugt til Storbritannien, blev Pire chef for den hemmelige hær i januar 1944. I denne rolle ledte han gruppens mobilisering efter landgangen i Normandiet og under befrielsen af Belgien.
Fra juni til september 1944. Han overvågede efterfølgende gruppens demobilisering, før han trak sig tilbage. Han døde den 29. januar 1953.