Der har været flere tilfælde af vold og mord rettet mod homoseksuelle og transseksuelle gennem hele El Salvadors historie. Det blev rapporteret, at under den salvadorianske borgerkrig
, ukendte kræfter kidnappede over et dusin transkønnede sexarbejdere i begyndelsen af 1980'erne. Denne begivenhed mobiliserede den tidlige aktivitet af William Hernández og hans partner Joaquin Cáceres, der dannede den første formelt etablerede LGBT-organisation Entre Amigos.