I 1811 ledte Stamford Raffles en vellykket
Invasionen af Java og Storbritannien tog kolonien i besiddelse indtil 1816. Raffles havde Buitenzorg-paladset som sin bopæl på grund af det tempererede klima i Bogors bakker, mens han ledede det meste af rådsmødet i paladset i Rijswijk i Batavia. Under sit ophold fik han haven i Buitenzorg-paladset omdannet til en engelsk have, som blev en inspiration for den senere botaniske have.