Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Starting with the Persian Gulf crisis
Pelley har rapporteret om mange krigszoner. I 1991 ledsagede han XVIII Airborne Corps på sin invasion af Irak for at tvinge befrielsen af Kuwait. I 2001 sluttede Pelley og hans team sig til de amerikanske specialstyrker i Afghanistan. I 2003 var Pelley og et "60 Minutes" team de første til at bryde nyheden om den anden invasion af Irak, rapportere fra en forpost, de havde oprettet i DMZ mellem Irak og Kuwait. Holdet valgte at forlade Pentagon's integrerede system og dækkede invasionen af Irak uafhængigt fra det indledende angreb til Bagdads fald. Pelley vendte ofte tilbage til Irak for at rapportere om oprøret. I 2006 og 2007 indgav han rapporter om folkedrab i Darfur-regionen i Sudan. I sin rapport fra 2007 bad Pelley om hjælp fra en oprørsgruppe til at organisere en væbnet rekognoscering i Darfur. Historien afslørede en landsby der var blevet ødelagt af regeringsstyrker i deres folkedrabskampagne. Darfur-rapporten blev hædret med en Emmy Award. I en anmeldelse af historien skrev "Washington Times": "Arven efter (Edward R.) Murrow lever på CBS i de dristige, langtrækkende undersøgelser af Scott Pelley". I Afghanistan har Pelley ledsaget talrige enheder i den amerikanske hær og marinekorps i kampoperationer og har uafhængigt rapporteret om krigens virkninger på civile. I 2011 blev CBS Evening News udsendt fra Afghanistan for en række rapporter om 10-årsdagen for krigen.