Skriv en fortsættelse til dette afsnit - To millioner mennesker døde i borgerkrigen
mellem de to områder Sudan og Sydsudan og fire millioner flere forviste, en krig, der blev ført i årtier. Kontrol med Sydsudans olierige reserver var den primære årsag til kampene. En fredsaftale blev underskrevet i 2005, hvilket effektivt bragte krigen til ophør, og Sudan blev et af de første lande til at anerkende Sydsudan. I henhold til bestemmelserne i den omfattende fredsaftale afholdt Sudan en folkeafstemning om uafhængighed. Over 99% af dem, der deltog i afstemningen, stemte for ideen om uafhængighed for Sydsudan.