Efter Jules Bastins anholdelse og hans efterfølgers flugt til Storbritannien blev Pire chef for den hemmelige hær i januar 1944. I denne rolle ledte han gruppens mobilisering efter landgangen i Normandiet og under
Befrielse af Belgien fra juni til september 1944. Han overvågede efterfølgende gruppens demobilisering, før han trak sig tilbage. Han døde den 29. januar 1953.