Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Hun besøgte desuden konfliktområderne for at hjælpe med at pleje de sårede, idet hun oplevede to hofte sår i slaget ved Seven Pines
Den 31. maj 1862 efterlod det hende med en permanent haltning. For denne handling blev hun nomineret til, og senere modtog over et århundrede senere, Confederate Medal of Honor. I denne periode fik hun tilnavnet "Florence Nightingale of the South". Samme år fusionerede konføderationen patienterne på de mindre hospitaler med de større andre steder. Wilsons raid i hele Alabama i marts og april 1865 tvang Hopkinses til at flygte fra staten og søge tilflugt i Newman, Georgia.