Holt County er et amt i den amerikanske stat Nebraska. I 2010 United States Census, befolkningen var 10.435. Dets amtssæde er O'Neill.Holt County er i Outback området i Nebraska.I Nebraska nummerplade system, Holt County er repræsenteret ved præfix 36 (det havde den 36.-største antal køretøjer registreret i amtet, da nummerplade systemet blev oprettet i 1922).
Nebraska