Den 8. april 2009 angreb fire pirater baseret på FV Win Far 161 skibet. Alle fire pirater var mellem 17 og 19 år gamle, ifølge den amerikanske forsvarsminister Robert Gates. Besætningsmedlemmerne på Maersk Alabama havde modtaget anti-cy-træning fra fagforeningsuddannelsesskoler og havde trænet ombord på skibet en dag tidligere. Deres omfattede brug af håndvåben, anti-terror, sikkerhed, førstehjælp og andre sikkerhedsrelaterede kurser. Da piratlarmen lød tidlig den 8. april bragte chefingeniør Mike Perry 14 medlemmer af hovedbesætningsmedlemmerne ind i et "sikret rum", der havde sikret, at ingeniørerne havde været i rudet af skibet til et sådant formål. Som et svar på det første spørgsmål, som piraterne havde fundet, havde skibsstyret taget kontrollen fra skibet, og de havde taget hele skibet, men skibsstyret blev taget fra skibet.
Perry