Vanskelighederne i de militære kampagner tog en stor fysisk vejafgift på Cornwallis, og han søgte at vende tilbage til England. John Shore, hans afløser, ankom først i marts 1793, og Cornwallis blev indtil august for at hjælpe med overgangen. Han overvågede også erobringen af den franske forpost i Pondicherry efter at nyheden om, at krigen var brudt ud igen, var kommet.
i Europa. Den 14. august 1793 sejlede han stille fra Calcutta til Madras, og den 10. oktober sejlede han endelig til England om bord på "Swallow".