En biotop akvarium er en rekreation af et bestemt naturmiljø. Nogle af de mest populære biotoper er ferskvandsmiljøer i Amazon og Rio Negro floder, de afrikanske rift sø miljøer i Lake Malawi og Lake Tanganyika, og saltvand koralrev i Australien, Det Røde Hav og Caribien. Fisk, planter, substrat, klipper, træ, koral, og enhver anden komponent af visningen skal helt matche den lokale naturlige miljø. Det kan være en udfordring at genskabe sådanne miljøer, og de fleste "sande" biotoper vil kun have et par (hvis ikke kun en) arter af fisk og hvirvelløse dyr.
saltvandskoralrev