Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Full-scale krig begyndte igen i Cambodja i december 1978 da den vietnamesiske hær invaderede
at vælte Røde Khmer. Røde Khmer-tropper trak sig tilbage til grænseområderne. I januar angreb vietnameserne angiveligt Khmer Rouge-tropper, der var gemt i templet, men der var ingen rapporter om skader på det. Et stort antal cambodjanske flygtninge kom ind i Thailand efter invasionen. Guerillakrig fortsatte i Cambodja gennem 1980'erne og langt ind i 1990'erne, hvilket hæmmede adgangen til Preah Vihear. Templet åbnede kortvarigt for offentligheden i 1992, kun for at blive genbesat det følgende år af Khmer Rouge-krigere. I december 1998 var templet scenen for forhandlinger, hvorved flere hundrede Khmer Rouge-soldater, der siges at være guerillabevægelsens sidste betydelige styrke, indvilligede i at overgive sig til Phnom Penh-regeringen.