I betragtning af de forskellige lufthavne i Brno og i Slatina er der ingen tvivl om, at lufthavnen i Brno er en af de vigtigste lufthavne i regionen. I 1967 begyndte man at bygge en ny afgangshal. I løbet af 1980'erne blev lufthavnen overdraget til brug af det tjekkoslovakiske luftvåben, og civile operationer blev reduceret til et minimum. Civile flyvninger blev drevet under udstillinger og messer, der fandt sted på Brno Exhibition Center. I 1986 blev den nye afgangshal og de tilhørende faciliteter færdiggjort. Efter kommunismens fald i 1989
, blev lufthavnen genanvendt til civil brug og blev drevet af den statslige tjekkiske lufthavnsmyndighed.