De nordlige korstog mod hedninger og østlige ortodokse kristne fortsatte med mellemrum fra slutningen af det 12. til begyndelsen af det 16. århundrede. De blev i stigende grad drevet af politiske, snarere end religiøse mål, og blev ledet af den germanske orden. Deres nederlag i april 1242
af en af Ruslands største helte, Alexander Nevsky, stoppede katolsk ekspansion i Østeuropa. To korstog, der havde til formål at standse den osmanniske fremrykning i Sydøsteuropa, endte i katastrofe ved Nikopolis i 1396 og Varna i 1444. Selv om de kulturelle symboler for korstog forblev almindelige i nogen tid efter, dette i det væsentlige sluttede dem som en levedygtig militær mulighed.