Bonino blev udvalgt af San Jose Sharks i sjette runde, 173.
2007 NHL Entry Draft. Hans rettigheder blev senere handlet til Anaheim Ducks med målmand Timo Pielmeier i bytte for Travis Moen og Kent Huskins den 4. marts 2009. Den 21. marts 2010 underskrev Bonino en toårig kontrakt med Ducks. Efter at have underskrevet med Anaheim, sluttede han sig straks til holdet og gjorde sin NHL-debut den 26. marts 2010 i en kamp mod Edmonton Oilers. Han scorede sit første NHL-mål i Anaheim's næste kamp, tre nætter senere, mod Dallas Stars; målet blev assisteret af Teemu Selänne. Han sluttede året med at spille i ni kampe og registrere et mål og en assist med seks straffe i minutter.