Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 480 f.Kr. ofrede den persiske konge Xerxes 1.000 kvæg ved Athena Ilias helligdom, mens han marcherede gennem Hellespontine-regionen mod Grækenland. Efter det persiske nederlag i 480-479 blev Ilion og dets territorium en del af Mytilenes kontinentale besiddelser og forblev under Mytilenes kontrol indtil det mislykkede mytilenske oprør.
i 428 over 427. Athen befriede de såkaldte akteaniske byer, herunder Ilion, og indskrev disse samfund i Delian League. Athenernes indflydelse i Hellespont aftog efter det oligarkiske kup i 411, og i det år efterlignede den spartanske general Mindaros Xerxes ved også at ofre til Athena Ilias. Fra ca. 410-399 var Ilion inden for indflydelsessfæren for de lokale dynaster ved Lampsacus (Zenis, hans kone Mania og usurpatoren Meidias), der administrerede regionen på vegne af den persiske satrap Pharnabazus.