Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Under Prag-foråret, der tiltrak megen international opmærksomhed i 1968, deltog mange medlemmer af Palacký-akademiske samfund i demokratiseringsindsatserne og forsøgte at flytte det regerende totalitære diktatur mod socialistisk demokrati. Bevægelsen blev knust, og reformerne vendte tilbage, da de kombinerede Warszawapagts hære fra Sovjetunionen, Bulgarien, Østtyskland, Ungarn og Polen
invaderede Tjekkoslovakiet. Sovjetisk militærbesættelse fulgte. På dette tidspunkt blev "Union of University Students of Bohemia and Moravia", en ny studentorganisation, oprettet i Olomouc, og organiserede senere studentstrejk i efteråret 1968. Samtidig blev der gjort forsøg på at genoprette det teologiske fakultet, men de mislykkedes, og det forblev ikke mere end en gren af Charles University Teologiske Fakultet i Litoměřice, og blev tvunget til at lukke igen i 1974.