Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Selv om Portugal var neutral under Anden Verdenskrig, blev portugisisk Timor i december 1941 besat af en lille britisk, australsk og hollandsk styrke for at forhindre en japansk invasion. Men japanerne invaderede i slaget om Timor.
I februar 1942. Under den japanske besættelse blev de hollandske og portugisiske grænser overset, og øen Timor blev gjort til en enkelt administrationszone for den kejserlige japanske hær (IJA). 400 australske og hollandske kommandosoldater, der var fanget på øen af den japanske invasion, førte en guerilla-kampagne, der bandt japanske tropper og påførte over 1.000 tab. Timoreserne og portugiserne hjalp guerillaerne, men efter de allieredes evt. evakuering var japansk gengældelse fra deres soldater og timoresiske militser, der blev rejst i Vesttimor, alvorlig. Ved krigens slutning var anslået 40 <unk>60.000 timoresere døde, økonomien var i ruiner, og hungersnød var udbredt. (se Slaget om Timor).