Den 10. februar 2017 blev Gutoc udnævnt af Rodrigo Duterte-administrationen som medlem af Bangsamoro-overgangskommissionen, der havde til opgave at udarbejde Bangsamoro-grundloven. Men hun trådte tilbage den 29. maj samme år, med henvisning til hendes misbilligelse af regeringens håndtering af Marawi-beslaget.
, erklæringen af undtagelsestilstand, og Duterte's vittighed om, at han ville tage skylden for soldater, der begår voldtægt under undtagelsestilstanden.