Fuldfør følgende sætning: Som skoledreng på latinskolen i sin hjemby led Kerner, der var fysisk lille og svag, både af sin fars strenghed og af mobning fra skolekammerater. Hans modstandsånd forblev imidlertid ubrudt, selv efter at hans far i 1779 havde sikret ham adgang til den elitære Karlsschule (militær- og generalakademi) i Stuttgart, der ifølge en kilde var "hertugens prestigefyldte skole, der skulle uddanne loyale regeringsembedsmænd, halvt internat, halvt universitet". Andre elever var blandt andet Friedrich Schiller. På trods af at Kerner gik på militærakademiet, levede han aldrig intellektuelt op til, hvad der blev forventet af ham. I en tale på navndagen for akademiets grundlægger, Württembergs aldrende hersker, hertug Karl Eugen, opfordrede Kerner til oprettelse af et system med statslig velfærd for de fattige. Schiller forlod akademiet til fordel for en karriere i teatret i 1782, men Kerner var stadig studerende i 1789. Han etablerede en politisk klub inden for akademiet dedikeret til støtte for den franske revolution. Andre medlemmer omfattede Christian Heinrich Pfaff og Joseph Anton Koch. Den 14. juli 1790 afholdt de en hemmelig fejring for at markere den første årsdag for
Stormen på Bastillen. Disse og lignende handlinger fra Kerner og hans venner udløste en negativ reaktion i det konservative Württemberg blandt borgerne og de aristokratiske franske emigranter, som de tog til deres hjerter. Med hjælp fra venner skrev Kerner en afhandling, der afsluttede hans studier og gav ham kvalifikationen som læge på påsken i 1791. Nu, ledsaget af sit livs første store kærlighed, flyttede han til Strasbourg under påskud af at ønske at forbedre sin lægevidenskab på universitetet.