Under forårstræningen i 2008 fik Garciaparra en mikrofraktur i hånden efter et slag. Det tvang ham til at starte 2008 MLB sæsonen på Handicappede listen. Rookie Blake DeWitt spillede tredje base i mellemtiden. Den 16. april startede han sin første kamp mod Pittsburgh Pirates, kun for at lide en spændt venstre kalv muskel ni dage senere, hvilket resulterede i en anden tur til DL. Han vendte tilbage 4. juli, spillede på shortstop for første gang siden 2005 på grund af en skade på Rafael Furcal. Den 1. august blev Garciaparra placeret på DL for at gøre plads til Manny Ramirez, der var blevet erhvervet i en handel. Nomar havde forstuvet sit knæ i en kamp den 27. juli mod Washington Nationals efter at være glidet ind i spikes først på tredje base som Garciaparra havde forsøgt at feltet et kast og tag løberen, Lastings Milledge. Han vendte tilbage den 12. august og fortsatte med at se tid på shortstop gennem slutningen af måneden. Den 13. august slog han et walk-off home run mod Philadelphia Phillies, hvilket gav Dodgers en 7-6 sejr. Garciaparra faktisk så mere tid på shortstop i løbet af 2008 end nogen anden position, for at imødekomme andre spillere på Dodgers. Men i september, var han tilbage til at se tid på første base og tredje base, og bliver brugt som en pinch hitter. På trods af tilbagevenden til stillingen, han nød mest succes i sin karriere, var det en vanskelig sæson for Nomar. Han slog.264 for året, med 8 home runs og 28 RBI, da han optrådte i kun 55 kampe. Dodgers mødte Phillies i 2008 NLCS
Garciaparra slog godt, han var 3-for-7 (.429) med 1 RBI i serien. Han optrådte dog ikke i Game 1, og spillede efterfølgende ikke hele spillet i serien, da han enten blev brugt som erstatning, eller blev erstattet, da spillet fortsatte i Games 2 <unk> 5. Dodgers blev besejret i det femte spil af Phillies, der til sidst gik videre for at vinde World Series 2008.