Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Eskadronen opnåede indledende operationel kapacitet i F-16CJ'er i 1996. Squadronens hale kode blev samtidig ændret fra "MJ" til "WW" i anerkendelse af fløjens Wild Weasel arv. Den 8. juli samme år blev eskadrillen den første Pacific Air Forces F-16-enhed, der blev indsat til støtte for Operation Southern Watch, der håndhævede flyveforbudszonen over det sydlige Irak, som følge af en ændring i politikken, der gav alle enheder mulighed for at blive indsat. Under Operation Southern Watch fløj eskadrillen sine første kampmissioner siden Mayaguez-hændelsen i 1975.
- Hvad? Siden 1996 har 13th FS været udstationeret i Afghanistan, Irak og Jordan ti gange, senest i 2014 til Jordan, hvor Panthers åbnede den amerikanske luftkampagne mod Islamisk Stat. Til sidst blev denne indsats kendt som Operation Inherent Resolve (OIR).