Den store depression ramte San Francisco Bay-området hårdt i 1930'erne, hvilket førte til høje arbejdsløshedsniveauer og en destabilisering af den politiske orden. Warren tog en hård holdning mod arbejderne i opbyggelsen til San Francisco General Strejke
- Hvad? I "Whitney v. California" (1927) retsforfulgte Warren en kvinde under California Criminal Syndicalism Act for at have deltaget i et kommunistisk møde i Oakland. I 1936 stod Warren over for en af de mest kontroversielle sager i sin karriere efter at George W. Alberts, en fragtfartøjs chefingeniør, blev fundet død. Warren troede, at Alberts blev myrdet i en sammensværgelse, der blev orkestreret af radikale venstreorienterede fagforeningsmedlemmer, og han vandt overbevisningen af fagforeningsembedsmænd George Wallace, Earl King, Ernest Ramsay og Frank Conner. Mange fagforeningsmedlemmer hævdede, at de tiltalte var blevet narret af Warrens kontor, og de organiserede protester mod retssagen.