Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Under den svenske invasion
Kirken faldt i ruiner og blev efterfølgende nedbrændt, men dommerens beslutning fra 1664 sikrede, at hospitalet havde en indkomst. I 1665, til ære for forsvaret af Warszawa, lovede magistraten præsterne i den paulinske orden et nyt tempel til tilbedelse.