Eggen debuterede som forfatter med en roman om general Carl Gustav Fleischers liv og død, den norske øverstkommanderende ved Narvik
1940'erne. Han skrev også et portræt af forfatteren Agnar Mykle, hans svigerfar, og har skrevet romaner med temaer fra middelalderens Norge. I 1993 udgav Eggen "The boy from Gimle" - den selvbiografiske fortælling om en norsk barndom i et nazistisk miljø. Som følge heraf fik de norske krigsbørn to år senere en officiel undskyldning.