Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Bakteriers evne til at nedbryde en række organiske forbindelser er bemærkelsesværdig og er blevet brugt i affaldsbehandling og bioremediering. Bakterier der kan fordøje kulbrinterne i olie, bruges ofte til at rydde op efter olieudslip. Gødning blev lagt på nogle af strandene i Prince William Sound i et forsøg på at fremme væksten af disse naturligt forekommende bakterier efter olieudslippet ved "Exxon Valdez" i 1989
- Hvad? Disse bestræbelser var effektive på strande der ikke var for tykt dækket af olie. Bakterier anvendes også til bioremediering af industrielt giftigt affald. I den kemiske industri er bakterier af største betydning i produktionen af enantiomerisk rene kemikalier til brug som lægemidler eller agrokemikalier.