I august 1940 blev "York" tildelt Middelhavsflåden og sluttede sig til 3. krydsereskadron i Alexandria i slutningen af september efter at have eskorteret en konvoj rundt om Kap det Gode Håb. To dage senere deltog hun i Operation MB.5, hvor Middelhavsflåden eskorterede de lette krydsere, da de transporterede tropper til Malta. I løbet af
Slaget ved Cape Passero, "York" sank den invaliderede og forladte destroyer den 13. oktober efter destroyerens engagement med den lette krydser den foregående aften. En måned senere gennemførte "York" og Middelhavsflåden Operation MB8, en kompleks serie af manøvrer, herunder Operation Judgment, hvor skibet eskorterede hangarskibet, da dens fly angreb den italienske flåde ved Taranto om aftenen den 11.-12. november. Nogle få dage senere transporterede "York" britiske tropper fra Alexandria i Ægypten til Piraeus i Grækenland. Den 26. november dækkede "York" og resten af 3. krydsereskadron en lille konvoj til Malta.