Strenge kan renses ved denaturering gel elektroforese, hvis det er nødvendigt, og præcise koncentrationer bestemmes via en af flere nukleinsyre kvante metoder ved hjælp af ultraviolet absorptionsspektroskopi. De fuldt ud dannede målstrukturer kan verificeres ved hjælp af native gel elektroforese, som giver størrelse og form information til nukleinsyre komplekser. En elektropetisk mobilitet vurdering af, om en struktur kan inkorporere alle ønskede strenge.
om en struktur indeholder alle de ønskede strenge