Elliott blev genindkaldt til en anden tjenesteperiode den 1. januar 1864 i Warrenton, Virginia. Elliot og hans regiment var derefter engageret i Unionens ekspedition til Tyrkiet gennem 4. januar; felttoget fra Rapidan til James (4. maj - 12. juni), som omfattede slaget ved Todd's Tavern (7. maj); generalløjtnant Ulysses S. Grants kampagne over land, som omfattede slaget ved Yellow Tavern (11. maj), Sheridans raid på Richmond gennem 24. maj, og slagene ved
Haw's Shop (28. maj), Totopotomoy Creek (28.-31. maj), Cold Harbor (1-12. juni), Trevilian Station (11-12. juni). Elliott fik derefter et skudsår i lysken og lår under Unionens operationer den 21. juni. Efter helbredelse fra sine sår blev han overført til et artilleribatteri den 9. september. Han deltog med sit nyligt genoprettede regiment i Richmond-Petersburg-kampagnen, og kæmpede derefter i slagene ved Poplar Springs Church (29. september - 2. oktober 1864), Hatcher's Run (5-7. februar 1865) og Dinwiddie Court House (30-31. marts) før han gik ind i Appomattox-kampagnen og slaget ved Five Forks (1. april).