Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Nystrom etablerede en hårdtarbejdende stil svarende til sin fars, hvilket hjalp ham med at tjene en invitation til at spille med US National Development Program (USDP). Han spillede 55 kampe for USDP i North American Hockey League i 1999-2000 og scorede syv mål og 23 point. Han delte 2000-01 sæsonen med det nationale under-18-program og juniorholdet i United States Hockey League, der også repræsenterede USA ved 2001 IIHF World U18 Championships. Han repræsenterede senere USA ved 2002
og 2003 World Junior Ice Hockey Championships.