Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Denne periode med frihed og velstand sluttede i det 16. århundrede, da den spanske vicekonge Philibert van Oranje delvist ødelagde L'Aquila og etablerede spansk feudalisme på landet. Byen, der var blevet skilt fra sine rødder, udviklede sig aldrig igen. De gamle privilegier blev ophævet. L'Aquila blev igen ødelagt af et jordskælv
I 1703. Efterfølgende jordskælv har gentagne gange beskadiget byens store katedral og ødelagt den oprindelige kuppel i San Bernardino-basilikaen, designet i overensstemmelse med kuppel af Santa Maria del Fiore i Firenze. Byen blev også plyndret to gange af franske tropper i 1799.