Ikke længe efter lancerer den amerikanske flåde et modangreb i Doolittle Raid. Efter dette, Yamamoto ordrer
Et massivt søangreb på den amerikanske ø Midway, men de japanske hangarskibe bliver mødt og sænket af de amerikanske hangarskibe. Flere måneder senere, efter kampagnen på Guadalcanal, bliver Yamamoto myrdet, da amerikanske piloter opfanger og skyder hans fly ned. Eiichi vender hjem til Japan og gifter sig med sin forlovede, men bliver snart kaldt tilbage for at deltage i slaget ved Leyte-bugten. Ud for Cape Engaño er "Zuikaku" sunket, og Eiichi er blandt ofrene, da han havde givet sin redningsvest til Shinji, Masatos yngre bror, der var tildelt skibet som navigator. På et andet sted trækker "Yamato", der nu tjener som flagskib for Takeo Kuritas Center Force, sig tilbage fra Leyte uden at have deltaget i kamp.