Fuentes vendte tilbage til Giants i 1969 og tilbragte de næste to sæsoner som en nytte infielder før genvinde sin startplads på anden base i 1971. Han optrådte i postseason i løbet af 1971 sæsonen som hans Giants vandt NL West titel; hans to-run home run i Game 1 af
1971 NLCS hjalp San Francisco med at tage en tidlig serie føring mod Pittsburgh Pirates, men det ville vise sig at være Giants eneste sejr i den bedste af fem serier. Fuentes fortsatte med at være Giants' anden baseman i yderligere tre sæsoner. I 1973 satte han en National League rekord ved at indspille en.993 fielding procentdel, den højeste for enhver almindelig anden baseman i ligaen historie. Ironisk nok havde Fuentes ført alle National League anden basemen i fejl i løbet af de foregående to sæsoner før at sætte den nye rekord for ekspertise. Hans rekord stod i 13 sæsoner før Ryne Sandberg registrerede en.994 procent på andenpladsen i 1986.