Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I marts 1991 eskalerede spændingerne mellem kroater og serbere til den kroatiske uafhængighedskrig. Efter en folkeafstemning om uafhængighed, der i vid udstrækning blev boykottet af kroatiske serbere, vedtog det kroatiske parlament officielt uafhængighed den 25. juni. Republikken Serbisk Krajina (RSK) erklærede sin hensigt om at løsrive sig fra Kroatien og slutte sig til Republikken Serbien, mens regeringen for Republikken Kroatien erklærede det for et oprør. Mellem august 1991 og februar 1992 indledte RSK en etnisk udrensningskampagne for at fordrive den kroatiske og ikke-serbiske befolkning fra RSK-kontrollerede område, hvilket til sidst udviste så mange som 250.000 mennesker ifølge Human Rights Watch. Kroatiske styrker var også involveret i etnisk udrensning mod serbere i Øst- og Vest-Slavonien og dele af Krajina i et mere begrænset omfang. Den 4. august 1995 indledte den kroatiske hær Operation Storm.
Den 7. august blev Krajina-regionen genindtaget. Operationen resulterede i en udvandring af ca. 200.000 serbere fra Krajina, mens de serbere, der ikke kunne eller ikke var villige til at forlade deres hjem, primært de ældre, blev udsat for forskellige forbrydelser. ICTY sætter antallet af dræbte serbiske civile på 324.