Efter Tysklands kapitulation i maj 1945 og afslutningen af krigen i Europa
, Fortsatte Wartime League's struktur for en sæson mere fra 1945-1946 med kun League North og League South. Denne sæson markerede dog pensioneringen af Football League War Cup og tilbagevenden af FA Cup med en ny struktur; at se hjem og væk ben bånd for første gang i sin historie med resultater, der afgøres på samlede mål og ekstra tid, efterfulgt af en genspilning.