Begyndende i midten af 1870'erne blev det britiske koloniale kontor imidlertid interesseret i mere direkte kontrol af Kapen, hovedsageligt med det formål at presse en dårligt rådgivet plan om at annektere de resterende sorte afrikanske lande og pålægge et system af konføderation på de forskellige stater i det sydlige Afrika. Denne involvering udløste konflikter i hele regionen, der kulminerede i den 9. Xhosa-krig.
og den første boerkrig. Brownlee og Cape-regeringen var stærkt imod både den katastrofale konføderationsordning og den britiske politik i grænsekrigen, hvilket førte til en politisk kollision mellem Cape-regeringen og det britiske imperium.