Genindførelsen af denne værnepligtsordning førte til en betydelig stigning i antallet af CMF, men dens ledelse og administration krævede tildeling af et stort antal ressourcer og personale fra den regulære hær på et tidspunkt, hvor hæren allerede var stærkt engageret i Korea og Malaya.
og derfor blev ordningen suspenderet i 1959. Dette var et betydeligt slag mod CMF, og dets styrke faldt med mere end halvdelen i det år til 20.000 mænd. Yderligere ændringer kom med indførelsen af pentropisk division (fem kampgrupper) i den australske hær i 1960. Dette viste sig at være en katastrofe for CMF, da der blev foretaget store ændringer og enheder fjernet fra kampordningen. Syv artilleri regimenter blev opløst fra en oprindelig total på 17, mens 31 infanteribataljoner blev reduceret til 17. Dette udelukkede University Regiments og Papua New Guinea Volunteer Rifles, som forblev uændrede. De resterende bataljoner blev senere slået sammen til kun ni bataljoner. I mellemtiden var CMF's pansrede enheder allerede blevet rationaliseret i 1957, og som følge heraf resulterede ændringen til den pentropiske struktur for det meste i en ændring i kun rollen, såsom 4th/19th Prince of Wales's Light Horse, som ændrede sig fra en pansret enhed til et rekognosceringsregiment. De to CMF pansrede brigade hovedkvarterer blev også opløst.