Uganda debuterede ved de paralympiske sommerlege i 1972 i Heidelberg, Vesttyskland. Efter at have deltaget i Paralympics i Toronto i 1976, var de fraværende fra Sommer-Paralympics indtil Atlanta-spilene i 1996.
, og har siden deltaget i alle paralympiske sommerlege. Disse OL i Rio de Janeiro var landets ottende optræden ved en sommerparalympiade. Uganda havde ikke vundet sin første paralympiske medalje før udgaven af Rio de Janeiro. Sommerparalympics 2016 blev afholdt fra 7. til 18. september 2016 med i alt 4.328 atleter, der repræsenterede 159 nationale paralympiske komiteer, der deltog. Atletikløberen David Emong var den eneste deltager for Uganda i Rio de Janeiro. Tre andre atleter, Christine Akullo, Emmanuel Vukoja og Bashir Bwanga, nåede ikke at komme på holdet på grund af, at de gik glip af deres sidste kvalificerende møder. Emong blev udvalgt som flagbæreren for nationernes parade under åbningsceremonien.