Tolv nordlige stater med muslimsk flertal har indarbejdet sharia-domstole i deres retssystemer, hvor disse domstoles magt og jurisdiktion er vokset og faldet i løbet af de sidste to årtier. I nogle af disse stater er sharia-domstole valgfrie voldgiftsdomstole for personlige statusspørgsmål, hvor som i andre har sharia effektivt erstattet det tidligere sekulære statslige retssystem i både civile og strafferetlige sammenhænge. Dette har medført kontrovers på grund af dets diskriminerende praksis over for religiøse og seksuelle minoriteter. Nordlige Nigeria har også været stedet for igangværende islamistiske oprør
som har ført til tusindvis af død og fordrivelse.