Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter fem år i sin rolle med IRFU, Clarke vendte tilbage til Ulster i 2012 som assistent under Mark Anscombe. Clarke fortsatte i denne rolle under Anscombes efterfølgere, Neil Doak og Les Kiss. Under sin anden periode med Ulster Doak fortsatte med at være involveret med den irske opstilling ved lejlighed, hvor han fungerede som cheftræner for Emerging Ireland under deres succesfulde Tbilisi Cup i 2015
kampagne.