Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Under den japanske besættelse af det hollandske Ostindien blev der afholdt en rekruttering af officerer fra den kejserlige japanske flåde (IJN) i Medan. Nasution sluttede sig til rekrutteringsprogrammet, og gennemgik flådeuddannelser i Bandung og Kyoto. Han fik endelig rang af løjtnant og blev styrmand på Haraokamaru skibet i 1944. Han deltog i Stillehavskampen og kæmpede mod de amerikanske styrker i Salomonøernes kampagne.
og i Filippinerne kampagne. Under et søslag på Filippinerne blev hans skib ramt og fik ild. Nasution blev såret og døde næsten.