Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Han blev genindsat med rang af oberst og tjente som chefstabschef for brigadegeneral T. I. Weeratunga, da han vendte tilbage til Jaffna i juni 1981 som kommandør for sikkerhedsstyrkerne - Jaffna for at underlægge de tamilske militante grupper, der opererede der. I 1983 overtog Balthazar som kommanderende for sikkerhedsstyrkerne - Jaffna med rang af brigadegeneral. Som kommandant for sikkerhedsstyrkerne i Jaffna havde han hærens Task Force 4 Northern og alle væbnede styrker i provinsen under sin kommando. Han indledte militære operationer for at underkaste Tamil militancy tager form i Jaffna i 1983. Det lykkedes ham at dræbe den tamilske militante leder Charles Lucas Anthony aka Seelan den 15. juli 1983. Han forsøgte at overfalde den tamilske militante leder Sellakilis skjulested den 24. juli 1983. Imidlertid overfaldt Sellakili en af Balthazars rutinemæssige patruljer Four Four Bravo dræbte tretten soldater. Denne hændelse udløste De Sorte Juli-oprør
og anses for at være starten på Sri Lankas borgerkrig. Han blev efterfulgt af brigadegeneral Nalin Seneviratne. Han tjente som stabschef for hæren under general Seneviratne under Vadamarachchi-operationen.