Efter Anden Verdenskrig faldt Genovas evne til at ende i de øverste rækker i Serie A betydeligt; i resten af 1940'erne var klubben mellem-tabellen. Sæsonen 1948/49
Genoa slog Inter 4-1, den berømte "Grande Torino" side 3-0 og Padova 7-1. 1950'erne begyndte dårligt for klubben, de havde købt argentineren Mario Boyé fra Boca Juniors, men han blev kun en sæson, og klubben blev forvist efter at have afsluttet bunden af tabellen, men efter to sæsoner opnåede de deres comeback efter at have vundet Serie B, foran Legnano. Ragnar Nikolay Larsen var en bemærkelsesværdig spiller for klubben i denne periode, og de opretholdt midterstabellen for resten af årtiet.