Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1899 blev Isthmian Canal Commission oprettet for at afgøre, hvilket sted der ville være bedst for kanalen (Nicaragua eller Panama), og derefter at føre tilsyn med byggeriet af kanalen. Efter at Nicaragua var udelukket, var Panama det indlysende valg. Der var dog opstået nogle problemer. Efter at USA havde fastholdt sine interesser i Panama (som dengang var en lille del af Colombia), hævede både Colombia og det franske firma, der skulle levere byggematerialer, priserne. Da USA nægtede at betale de højere end forventede gebyrer, "oprettede de en revolution" i Colombia. Den 3. november 1903 gjorde Panama (med støtte fra den amerikanske flåde) oprør mod Colombia. Panama blev en ny republik og modtog 10 millioner dollars alene fra USA. Panama fik også en årlig betaling på 250.000 dollars og garantier for uafhængighed. USA fik rettighederne til kanalen.
"i al evighed". Roosevelt sagde senere at han "tog kanalen og lod kongressen debattere". Efter at Colombia havde mistet Panama, forsøgte de at appellere til USA ved at genoverveje traktater og endda at navngive Panama City som Colombias hovedstad.