Når Lysander havde fået kommandoen igen, førte han den spartanske flåde mod Hellespont. Den athenske flåde fulgte ham derhen. I 404 f.Kr. samlede athenerne deres resterende skibe ved Aegospotami (nær det thrakiske Chersonese). Den athenske flåde under admiral Conon blev derefter ødelagt af spartanerne under Lysander i
Slaget ved Aegospotami. Conon trak sig tilbage til Cypern.