Efter en tredjeplads i Australiens Grand Prix i 2016, Vettels deltagelse i Bahrain
Endte uden at starte, da hans bil gik i stykker i formationsrunden. Ved F1 kolliderede Vettel med holdkammeraten Räikkönen i første omgang, men begge var i stand til at fortsætte. Han beskyldte Red Bull-køreren Daniil Kvyat for kollisionen, kaldte ham en "galning" og beskrev hans overhalingsmanøvre som "selvmord". Ved Kvyats første runde, stoppede Vettel efter to på hinanden følgende sammenstød med Kvyat. Ved Grand Prix forsøgte Vettel at overhale Red Bull-køreren Max Verstappen, men efter at Verstappen løb af banen og kom tilbage foran ham, angreb Vettel ham og racerdirektør Charlie Whiting verbalt, hvilket han senere undskyldte. Vettel blokerede derefter Red Bulls Ricciardo ved at bevæge sig i bremsezonen, og fik en ti-sekunders straf og to point på hans licens. Selv om han opnåede syv podiumfinaler i løbet af sæsonen, vandt Vettel ikke nogen løb i 2016.