Kirkens rester blev bevaret ved indgriben fra Trinity House i 1810, da tårnene længe havde været vigtige som et vartegn for skibsfarten: bevarelse blev opnået gennem den første effektive indsats for at beskytte klippen, hvor kirken dengang stod, mod yderligere erosion. Nogle materialer fra strukturen blev indarbejdet i en erstatning kirke, også dedikeret til St. Mary, bygget på Hillborough i samme sogn. Meget af resten blev brugt til opførelsen af en ny havnevæg ved Margate, kendt som Margate Pier. Andre, overlevende rester omfatter fragmenter af et højt kors af sten, der engang stod inde i kirken, og to stenkolonner fra en tredobbelt bue mellem skibet og kirkegården: kolonnerne var en del af den oprindelige kirke og var stadig på plads, da nedrivning begyndte. Korsfragmenterne og søjlerne er nu opbevaret i Canterbury-katedralen, og de er blandt de elementer der har ført til, at kirken er blevet beskrevet som et eksempel på angelsaksisk kirkearkitektur
og skulptur.