Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Da den store nordlige krig brød ud efter at prinsen blev kronet som Karl XII, rejste Schlippenbach et regiment af dragoner i Livland, hvoraf han blev oberst. Da Karl brød vinterlejren ved Dorpat (nutidens Tartu) og rejste mod Riga i begyndelsen af 1701, blev Schlippenbach efterladt for at forsvare den livonske grænse. Han vandt slaget ved Rauge den 5. september 1701 og blev efterfølgende forfremmet til generalmajor, men blev derefter besejret af en stor russisk styrke under Boris Sheremetev ved Erastfer
Den 30. december samme år og i Sagnitz og Hummelshof den 19. juli 1702. I 1703 måtte han overføre en stor del af sine styrker for at forstærke Lewenhaupts i Kurland. Dette efterlod ham magtesløs til at forhindre Narva og Dorpat i at falde i russiske hænder i 1704, samme år han blev udnævnt til generalguvernør i Reval (det nuværende Tallinn).