Skriv en fortsættelse til dette afsnit - kl. 08:20 den 30. august 1945 tog "I-400" fart sammen med "I-14" og "Proteus" på vej mod Tokyobugten, hvor de forankrede kl. 14:58 samme dag. USA's flag blev hevet om bord den 31. august 1945 kl. 05:00 og kl. 14:45 begyndte I-400 og Proteus at flytte til en ny forankring i bryggen på ubådsenheden i Yokosuka, hvor Proteus blev forankret kl. 16:50. Tolv ubåde fra U.S. Navy valgt til at repræsentere U.S. Navy Submarine Force ved den japanske overgivelsesceremoni
I Tokyo Bay blev også forankret der, og "I-401" ankom også den 31. august. Under overgivelsesceremonien den 2. september 1945 beordrede kommandøren for ubådstyrken, U.S. Pacific Fleet (COMSUBPAC), viceadmiral Charles A. Lockwood, at hans personlige flag blev hejset om bord på "I-400" og "I-401".