Udfyld følgende sætning: Prkačin var medlem af det kroatiske U22-landshold. Hans debut på en stor turnering med det senior kroatiske landshold kom på EuroBasket i 1997. Derefter spillede han med Kroatien ved følgende store FIBA-turneringer: EuroBasket 1999, EuroBasket 2001, EuroBasket 2003, EuroBasket 2005 og EuroBasket 2007.
Sommer-OL 2008 og EuroBasket 2009. Prkačin var Kroatiens holdkaptajn to gange.