Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I september 1944 overdrog Cole NWA til Air Commodore Alan Charlesworth. På dette tidspunkt i krigen rykkede de allierede mod nord, og tempoet i Darwin-området var faldet. Gruppen kaptajn Peter Jeffrey ledte No. 1 Wing til Tanimbar øerne og bombede mål i Selaru, men fortalte Caldwell, at han betragtede angrebet som en spildt indsats og kun havde påtaget sig det for at øge sine pilots ånd. Charlesworth gav udtryk for bekymring med hensyn til No. 80 Wing og advarede den højere ledelse om, at dens moral ville falde, hvis den ikke enten fik en mere aktiv rolle i krigen eller blev overført til det sydlige Australien til hvile. I oktober havde fløjen modtaget ordrer om at forlade NWA til Morotai for at slutte sig til den første taktiske luftvåben; dette efterlod NWA med tolv eskadriller til rådighed, herunder en Liberator enhed og tre andre Spitfire eskadriller. I mellemtiden støttede NWA angrebet på Leyte.
med angreb på havne, olieanlæg, og skibsfart i Hollandsk Ostindien ved hjælp af Beaufighters, Mitchells, og Liberators. Disse operationer fortsatte i november og december. No. 31 eskadrille overført fra Coomalie til den første taktiske luftvåben på Morotai i december. På det tidspunkt var NWA's hovedkontor fyldt med 651 ansatte, heraf 156 officerer.