Angribefragtfartøjet forlod San Francisco den 4. januar 1945 for at vende tilbage til det vestlige Stillehav. Hun stoppede i Pearl Harbor fra 10. til 28. januar, før hun fortsatte sin rejse mod vest. Undervejs besøgte "Virgo" også Eniwetok, før den ankom til Ulithi den 13. februar, hvor den meldte sig til tjeneste med Service Squadron (ServRon) 10. Hendes tjeneste med ServRon 10 ændrede skibets mission. Hun tjente ikke længere som et angrebsfragtfartøj, der var involveret i amfibieoperationer. Fra det tidspunkt tjente angrebet fragtfartøj som et direkte fragtfartøj. I den rolle støttede hun Iwo Jima-operationen i februar ved at genopfylde krigsskibe til søs. I april og maj udførte "Virgo" lignende tjenester til støtte for Okinawa-kampagnen. I maj påbegyndte hun en returrejse til USA og forlod Okinawa den 15. maj. Undervejs gjorde hun stop ved Ulithi og Pearl Harbor før hun ankom til San Francisco den 20. juni. Efter en måned i overhaling på Moore's Shipyard, gik "Virgo" tilbage til det vestlige Stillehav den 3. august. Men hun genoptog ikke sine krigshandlinger, fordi fjendtlighederne ophørte.
Den 15. august, fire dage før hun ankom til lagunen ved Ulithi. Den næste dag vendte hun tilbage til havet med Task Group (TG) 30.8 for at forsyner skibene i den 3. flåde i japanske farvande. Efter at have afsluttet denne mission i begyndelsen af september ankom "Virgo" til Tokyobugten den 9. september, en uge efter den formelle overgivelse. Hun tjente som station lager skib på Yokosuka for besættelsesstyrkerne indtil 10. april 1946, hvorefter hun gik tilbage til USA. Skibet ankom til San Francisco den 14. maj og begyndte overhaling på San Francisco Naval Shipyard.