Sæsonen 2020/21 var den 98. sæson i Villarreal CF's eksistens og klubbens ottende sæson i træk i den øverste del af spansk fodbold. Ud over den indenlandske liga
, Villarreal deltog i denne sæsons udgaver af Copa del Rey og UEFA Europa League. Sæsonen omfattede perioden fra den 20. juli 2020 til den 30. juni 2021, med den sene start på grund af COVID-19-pandemien i Spanien.