Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I begyndelsen af 1940 blev skolen stort set upåvirket af krigsudbruddet i Europa, og selv om mange unge jerseymænd havde forladt øen for at deltage i krigsindsatsen, havde flere engelske forældre sendt deres sønner på skole, idet de mente, at Kanaløerne var det sikreste sted på de britiske øer. Udviklingen i krigen i løbet af maj det år og den endelige sammenbrud af den franske modstand
Det betød, at øen var i fare. Kanaløerne blev demilitariseret i den tro, at dette bedst ville beskytte øboernes liv, hvilket betød, at mange frygtede den forestående besættelse af øerne af tyske styrker. Mens mange andre skoler i Jersey overlod evakueringsbeslutninger i forældrenes hænder, besluttede Victoria College at evakuere nogle drenge og deres lærere til Storbritannien, hvor de boede resten af Anden Verdenskrig og deltog i engelske offentlige skoler, herunder Shrewsbury School og Bedford School. Men omkring 130 drenge og flere lærere forblev i Jersey, og skolen fortsatte med at fungere under besættelsen.