Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I det 18. århundrede mindskede faldende sølvproduktion og økonomisk diversificering kraftigt den kongelige indkomst. Som svar på dette indførte kronen Bourbon-reformerne, en række edikter, der forhøjede skatterne og delte Vicekongeriget. De nye love udløste Túpac Amarus oprør
Og andre oprør, som alle blev undertrykt. Som et resultat af disse og andre forandringer fik spanierne og deres kreolske efterfølgere monopol på kontrollen med landet og tog beslag på mange af de bedste områder der var blevet forladt på grund af den massive affolkning af indfødte. Men spanierne gjorde ikke modstand mod den portugisiske udbredelse af Brasilien på tværs af meridianen. Tordesillas-traktaten blev gjort meningsløs mellem 1580 og 1640, mens Spanien kontrollerede Portugal. Behovet for at lette kommunikation og handel med Spanien førte til opsplittelsen af vicekongedømmet og oprettelsen af nye vicekongedømmer i New Granada og Rio de la Plata på bekostning af de områder, der dannede Vicekongedømmet Peru; dette reducerede Limas magt, fremtrædende rolle og betydning som vicekongedømmet og skiftede den lukrative andiske handel til Buenos Aires og Bogotá, mens faldet i minedrift og tekstilproduktion accelererede det progressive forfald af Vicekongedømmet Peru.