Tilbage på Guam, begyndte 3. bataljon at træne til en landing på Miyako Jima, en ø lige syd for Okinawa. Disse ordrer blev til sidst annulleret, men bataljonen deltog stadig i mindre kampe i 1945 og deltog i to operationer på Guam, der var designet til at fange japanske soldater, der stadig holdt ud i bakkerne. Disse udredninger fandt sted i april og december 1945. 3. bataljon begyndte også at forberede sig på Operation Olympic, hvor den som en del af V Amphibious Corps, ville have landet i Kushikino, Kagoshima, på Kyūshū. Efter atombomberne i august 1945 og
Efter Japans kapitulation blev 3. bataljon løsrevet fra 3. marinedivision i november 1945 og deaktiveret den følgende måned den 20. december 1945. Kort før den blev deaktiveret, led 3. bataljon dog den tvivlsomme ære at have den sidste amerikaner dræbt i Anden Verdenskrig, da PFC W.C. Patrick Bates fra Kilo Company blev skudt af en japansk snigskytte den 14. december under en oprydningsaktion på Guam (tre måneder efter den formelle ende af fjendtlighederne).