Efter reparationer på Eniwetok sejlede "Conner" til søs med en hangarskibs-taskgruppe fra 29. august til 28. september 1944, mens dens hangarskibe lancerede angreb på Palaus, Yap, Ulithi, Mindanao og Visayans, dækkede landgangen på Morotai og vendte tilbage til skærmen for luftangreb på Luzon og Visayans igen. Den 2. oktober sejlede hun fra Manus for at overvåge hangarskibene, da de neutraliserede japanske baser på Okinawa, det nordlige Luzon og Formosa i de sidste forberedelser til den japanske offensiv mod Japan.
Angrebet på Leyte. Den 13. oktober, i et rasende angreb fra japanske fly, blev den torpederet, og "Conner" beskyttede den beskadigede krydser, da hun forlod kampområdet, og sprøjtede flere fjendtlige fly, der forsøgte at afslutte "Canberra". Hun sluttede sig til hangarskibene til angreb på Luzon og Yap, og skærmede dem i slaget ved Surigao-strædet den 25. og 26. oktober, da de lancerede angreb efter japanske skibe, der flygtede fra det episke slag om Leyte-bugten.