Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Duterte's præsidentkampagne i 2016 førte til hans valgsejr. Under hans præsidenttid har hans indenrigspolitik fokuseret på bekæmpelse af ulovlig narkotikahandel ved at indlede den kontroversielle krig mod narkotika, bekæmpe kriminalitet og korruption, lancere en massiv infrastrukturplan og et foreslået skift til et føderalt regeringssystem. Han havde også tilsyn med den kontroversielle begravelse af Ferdinand Marcos og ledet regeringen til sejr i slaget ved Marawi i 2017.
Det drejer sig om at skabe en bedre balance mellem de forskellige sektorer. Fra 2020 har han ledet regeringens reaktion på COVID-19-pandemien. Han erklærede sin hensigt om at forfølge en "uafhængig udenrigspolitik" og styrkede forbindelserne med Kina og Rusland. I august 2021 annoncerede han sit kandidatur til vicepræsidentvalget i 2022.