Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I mellemtiden var kong Ferdinand 7. af Spanien blevet genindsat i magten og sendte en stor hær for at undertrykke oprørerne og generobre de tabte kolonier. Den spanske hær, under ledelse af general Pablo Morillo, førte en voldelig og vellykket militær kampagne
som kulminerede i indtagelsen af Santafé den 6. maj 1816. I frygt for Morillos tropper flygtede Torres til den lille by El Pital, nær Neiva. Han forsøgte derefter at flygte fra landet ved at gå om bord på et skib til Argentina i Buenaventuras havn, men han blev taget til fange af Juan Sámanos tropper efter at skibet var afsejlet uden ham og andre i juli 1816. Han blev sendt til Santafé, hvor han blev henrettet af en skudpatrulje for forræderi mod det spanske monarki den 5. oktober 1816.