I juli 1945 kunne Schreiber vende tilbage til Münster. Den sydlige del af Tyskland, hvor han havde gemt sig i mere end seks måneder, havde været en del af den amerikanske besættelseszone siden maj 1945.
, og hans hjemkomst blev formidlet gennem indgriben af US News Agency på den anden side af den schweiziske grænse i Bern. Hans hjem i Münster var blevet alvorligt beskadiget af anglo-amerikanske luftbombardementer, og han boede for tiden på et seminar på Dompladsen. Det var først da han kom tilbage til Münster, at han opdagede, at han var blevet valgt til universitetsrektor tidligere i måneden, på et møde i en hastigt indkaldt "nødsituation" universitetets senat, der blev afholdt den 16. juli 1945. Senatet havde mødtes under forsæde af den fungerende rektor, professor i patologi, som havde fået tilladelse af de britiske militære myndigheder til at beholde sit embede i den umiddelbare eftervirkning af krigen på trods af hans tætte nationalsocialistiske forbindelser i Hitlers år. De andre medlemmer af nødsenatet var universitetsprofessorer som alle havde besluttet at være "fri" (i den tid anvendte udtryk) fra nazistiske forbindelser. Efter valget af universitetsprofessorer blev Schreibers udnævnelse som rektor bekræftet af Rudolf Amelunxen, der var blevet installeret som første præsident for den nyligt genoprettede provins Westfalen, selv om Amelunxens skriftlige bekræftelse først kom den 26. oktober 1945 efter formel aftale fra de britiske militære administratorer. I mellemtiden havde universitetsmyndighederne allerede i august 1945 genindsat hans professorat.