Efter Crossroads-projektet, den 23. august 1946, blev Jennings tildelt pligten som næstkommanderende officer i 509th Bombardment Group med yderligere pligter som vice base commander. Den 509. var Heavy Bomber Air Force med nukleare angrebsmuligheder, der blev fuldt operationelle i februar 1947. Den 8. juli 1947 udsendte oberst William H. Blanchard, 509. basekommanderende, en officiel pressemeddelelse fra hærens luftvåben, hvori det stod, at basens efterretningsbureau havde fundet en såkaldt "flyvende disk" ikke langt fra Roswell, der udløste Roswell-hændelsen.
- Hvad? En lokal ranchmand havde tilsyneladende fundet vraget ugen før, og da general Roger M. Ramey blev informeret, beordrede han at det skulle flyves til Fort Worth Army Air Field. Selv om den daværende oberstløjtnant Jennings aldrig bekræftede sin indblanding i en sådan hændelse, er han gentagne gange blevet identificeret i talrige rapporter og edsvorne erklæringer for at have været personligt involveret, herunder pilotering af B-29, med det genvundne og tvivlsomme vrag, til Ft. Det er Texas værd.