Dette førte til det farligste øjeblik i Ferdinands karriere, i 1529, da Suleiman udnyttede denne ungarske støtte til et massivt, men i sidste ende mislykket angreb på Ferdinands hovedstad: Belejringen af Wien
, som sendte Ferdinand til tilflugt i Bøhmen. En yderligere osmannisk invasion blev slået tilbage i 1532 (se Belejringen af Güns). I det år indgik Ferdinand fred med osmannerne og delte Ungarn i en habsburgsk sektor i vest og John Zápolya's domæne i øst, sidstnævnte effektivt en vasalstat af det osmanniske rige.