Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Akelaitis blev født i nærheden af Marijampolė til en familie af bønder. Hans far deltog i oprøret i 1831 og blev dømt til eksil i Sibirien, hvor han døde. Akelaitis' stedfar kæmpede i Slaget ved Maciejowice under Kościuszko Opstanden, mens hans bedstefars bror tjente i de polske legioner i Italien og kæmpede i Slaget ved Somosierra
i Spanien under Napoleonskrigene. Den forældreløse Akelaitis voksede op med sine bedsteforældre og fortællinger om disse felttog. Hans mor fik et husholdningsjob i Marijampolė, hvor Akelaitis tog privatundervisning hos en lokal præst og en organist i Sasnava. Han blev derefter indskrevet på en grundskole i Marijampolė, som han dimitterede som 17-årig. Han fortsatte sine studier på den fireårige gymnasium i Marijampolė, hvor han løbende blev rangeret som en af de bedste elever, men stoppede uden at blive uddannet omkring 1850. Han fortsatte med at studere selv og lærte flere sprog. Ud over sit modersmål, litauisk, lærte han polsk, russisk, tysk, fransk, latin, noget græsk, sanskrit og hebraisk.