Skriv en fortsættelse til dette afsnit - På trods af flere respektable præstationer i VM, Fak præstation ved Biathlon World Championships 2009
kom som en stor overraskelse. I åbnings-sprintløbet forbedrede Fak sin karriere bedste præstation med yderligere to pladser ved at afslutte 14. Men han kunne ikke forbedre sin præstation i forfølgelsen og faldt tilbage til 25. plads. Den store overraskelse kom i det 20 kilometer lange individuelle løb, hvor Fak vandt bronzemedaljen. En perfekt score i den sidste række ville have givet Fak en guldmedalje, men efter en miss måtte Fak kæmpe meget hårdt for i det mindste nogle medaljer og til sidst slå Simon Fourcade med mindre end et sekund for at vinde bronze. På den måde vandt Jakov Fak Kroatiens første medalje i biathlon i verdensmesterskabet.