Der var en betydelig indfødte modstand mod det spanske missionsprogram, som fortsatte efter at Mexico blev uafhængigt af Spanien
I 1821. De fleste flygtede indfødte amerikanere flygtede til Central Valley, som var vanskeligt for tungt bevæbnede spanske soldater at krydse på grund af dets sumpige terræn. Omkring november 1828 førte en yokutsmand ved navn Estanislao (døbt efter St. Stanislaus; hans indfødte navn menes at have været "Cucunichi") et oprør i Mission San Jose og flygtede til Laquisimes-flodens land sammen med mange andre indfødte. Der rejste han en hær af yokuter, miwokere og chumashere, som angreb missionerne og de store "ranchos", stjal heste og kvæg og befriede indfødte arbejdere. Den mexicanske hær, ledet af Mariano Vallejo, flyttede for at knuse modstanden, men blev i første omgang besejret af indfødte på Laquisimes-floden, på et sted, der menes at være nær dagens Caswell Memorial State Park.