I april 1940 deltog Schultz i Operation Weserubung og
Invasionen af Danmark i spidsen for det nyoprettede 308. infanteriregiment. Senere samme år deltog han i invasionen af Frankrig. Den 1. september 1940 blev han forfremmet til oberst. Fra juni 1941 førte Paul Schultz sit regiment i angrebet på det sydlige Rusland, hvor han den 18. oktober 1941 blev tildelt det tyske kors i guld.