Sigismunds position blev styrket, da Zamoyski besejrede Maximilian ved
Slaget ved Byczyna og tog ham til fange. På pave Sixtus V's anmodning blev ærkehertugen derefter løsladt og gav igen sit krav på Polen i 1589. Han lykkedes også med at opretholde freden med sin magtfulde sydlige nabo ved at gifte sig med ærkehertuginde Anne af Habsburg i 1592. Samtidig sikrede han sig en alliance med det katolske Østrig mod protestantiske fjender.