Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Majoriteten af den armenske befolkning i Shusha blev massakreret eller udvist
I marts 1920. Katedralen blev beskadiget og gik gradvist i forfald. Efter at regionen kom under sovjetisk kontrol, på grund af statens ateistiske politik, blev det til sidst lukket i 1930 og blev omdannet til en kornmagasin i 1940'erne. Dens kuppel og en del af væggene omkring den blev ødelagt i 1950'erne. Den blev derefter plyndret, og dens sten blev brugt til at bygge flere luksuriøse huse i den aserbajdsjanske del af byen. I 1970'erne "så det ud som om katedralen havde overlevet et voldsomt bombardement". Efter offentligt pres gav sovjetiske og aserbajdsjanske myndigheder tilladelse til lanceringen af et restaureringsprojekt af katedralen i 1980'erne. Restaureringerne begyndte i 1981 og fortsatte indtil 1988 og blev overvåget af Volodya Babayan. I 1987 var der kun to af de fire stenstatuer af engle på klokketårnet tilbage.