Air Commodore John Emilius "Johnny" Fauquier, (født 19. marts 1909, død 3. april 1981) var en canadisk flyver og leder af Bomber Command i Anden Verdenskrig. Han kommanderede No. 405 Squadron RCAF og senere No. 617 Squadron RAF (Dambusters) i løbet af krigen. En bush pilot før krigen, han sluttede sig til Royal Canadian Air Force som flyveinstruktør i 1939. Han sluttede sig derefter til 405 Squadron i 1941 og ville flyve operationelt for resten af krigen, idet han faldt i rang ved en lejlighed for at vende tilbage til aktiv kommando. Under sine tre operationer deltog han i Operation "Hydra"
og dusinvis af andre udflugter over Europa.