Efter Labour-partiets ledervalg i 2015 vendte Cooper tilbage til bagbænkerne efter næsten sytten år i frontbænken. På grundlag af sit eksisterende arbejde med
I forbindelse med den europæiske flygtningekrise blev Cooper udnævnt til formand for Labour-partiets arbejdsgruppe for flygtninge, som arbejder sammen med lokale myndigheder, samfundsgrupper og fagforeninger for at udvikle en bæredygtig og humanitær reaktion på krisen. Hun talte om emnet på Labour's årlige konference i 2016.