Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Neuner led yderligere tilbageslag ved VM i 2009
i Pyeongchang, hvor hun kæmpede med en forkølelse og et højt antal skudfejl. Hun sluttede som ottende i sprinten, hvor hun styrtede ned ad en nedstigning, og kom på ellevte i forfølgelsesløbet. Hun blev ikke udpeget til det individuelle løb og kunne ikke starte i det blandede stafet på grund af sin forkølelse. Den 21. februar 2009 vandt Neuner sølv som en del af Tysklands kvindelige stafett hold, sammen med Martina Beck, Andrea Henkel og Kati Wilhelm. På den sidste dag af mesterskabet kom hun syvende i massestartløbet.