Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Đukanovićs regering sendte tropper for at bekæmpe det løsrivende Kroatien, da han var imod Jugoslaviens nedfald forårsaget af slovensk uafhængighed
og oprør i andre områder. Đukanovićs kabinet deltog aktivt i belejringen af Dubrovnik fra efteråret 1991 til foråret 1992, hvilket resulterede i, at byen led stor strukturel skade. Det omkringliggende område af Konavli led også på grund af plyndringsangreb. I løbet af denne periode var Đukanović en af de mest højlydte høge i den montenegrinske regering. Nogle af hans bemærkelsesværdige udtalelser fra denne periode omfatter en proklamation om "at begynde at hade skak på grund af šahovnica (det kroatiske skakbræt) " og en aggressiv erklæring leveret i en offentlig tale under angrebet på Dubrovnik, at "Vi har allerede udtyndet AVNOJ-grænserne i Montenegro og Hercegovina, det vil sige det østlige Bosnien og Montenegro.