Francken blev udnævnt til statssekretær for asyl og migration i den første Charles Michel-regering i 2014, hvor han blev fremtrædende for sin kontroversielle nul-tolerance-tilgang til ulovlig indvandring midt i den europæiske migrantkrise.
- Hvad? Francken og N-VA var imod Belgiens støtte til Global Compact for Migration, hvilket førte til, at de forlod koalitionsregeringen i december 2018 og dermed udløste dens sammenbrud.