Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Under borgerkrigen i Mandat Palæstina i 1947-1948
, flygtede indbyggerne i flere etaper. De fleste flygtede i begyndelsen af maj mod al-Tira, og da al-Tira blev affolket, rejste de til Jenin. Nogle vendte tilbage og forblev i al-Sarafand indtil israelske styrker <unk> sammensat af Carmeli og Alexandroni Brigader <unk> angreb landsbyen den 16. juli 1948. På det tidspunkt forsvarede frivillige fra den arabiske befrielsesarmé og lokale milits al-Sarafand. De fleste af indbyggerne flygtede til den sydøstlige linje af Wadi Ara, hvor den irakiske hær var stationeret. Senere krydsede de Jordanfloden, og siden da har størstedelen af al-Sarafands flygtninge boet i Jordan. Kun en tidligere beboer af al-Sarafand forblev i Israel. Husene i landsbyen blev ikke straks revet ned af israelerne og forblev tomme i mange år. Da de til sidst blev ødelagt, var moskeen den eneste bygning, der blev skånet.