Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Navarro blev sandsynligvis født i Garde i den navarresiske dal Roncal. Man ved ikke meget om hans tidlige liv. Han begyndte sin militære karriere i tjeneste for kardinal Juan de Aragon før 1485. Han kæmpede mod barbariske pirater i Italien som Condottiere. Rekrutteret af Gonzalo Fernández de Córdoba i 1499, deltog han i erobringen og belejringen af Cephalonia i 1500. Han opfandt landminen, og hans dygtige brug af miner gjorde det muligt at bryde murene i den tyrkiske fæstning. Han fortsatte i tjeneste hos Gonzalo Fernández de Córdoba og fortsatte til Napoli, og forsvarede Canosa i 1502 og Taranto i 1503 mod franskmændene. Han stod for opførelsen af fæstningsværkerne ved slaget ved Cerignola.
, der gjorde det muligt for Gonzalo Fernández de Córdoba at vinde sin kamp mod Louis d'Armagnac, hertug af Nemours den 28. april. Han spillede en stor rolle i den spanske sejr ved Garigliano-floden den 29. december 1503 og blev skabt greve af Oliveto for sine tjenester. Efter at være vendt tilbage til Spanien i 1507 deltog han i kardinal Cisneros' Nord-Afrika ekspeditioner. Navarro hjalp med at erobre Peñón de Vélez de la Gomera i 1508 ved at bruge et flydende batteri af hans eget design under slaget. Han fortsatte med at kæmpe ved erobringen af Mazalquivir (Mers-el-Kébir) og Oran i 1509. Navarro ledte personligt de spanske styrker under erobringen af Bougie (Béjaïa), Algier, Tunis, Tlemcen og Tripoli i 1510. Han meldte sig i tjeneste hos Ramon de Cardona, vicekonge af Napoli, og vendte tilbage til Italien da han hørte om en ny krig mod Frankrig i 1511. Han konstruerede en række lette vogne monteret med lette artilleri enheder designet til at opløse fjendtlige formationer i 1512.