Efter sin indskrivning i Maine for borgerkrigens militær tjeneste, Edward P. Tobie, Jr. officielt indkaldt til tjeneste som sergent med Company G af 1. Maine Volunteer Cavalry. Han deltog derefter med sit regiment i en række af Unionshærens vigtigste kampe i krigen, herunder 1862's First Battle of Winchester
(25. maj) og slag ved Cedar Mountain (9. august), Second Bull Run (28. august 30), South Mountain (14. september), Antietam (17. september) og Fredericksburg (11. december 15); 1863's Stoneman's Raid, Battle of Brandy Station (9 juni), hvor han blev taget til fange efter at være såret, og slagene ved Gettysburg (1. juli 3) og Mine Run (7 november til 2. december) og 1864's slag ved Todd's Tavern (7 maj), Haw's Shop (28. maj), Old Church (30 maj), Cold Harbor (31. maj til 12. juni), Trevilian Station (11. juni 12), St. Mary's Church (24. juni), Boyd's Road (27. og 28. august), Ream Plankton Road (27. og 27. august).