I det 17. århundrede var der langsom fremgang i handel og befolkningstilvækst. Kampene om kontrollen med byen blev udkæmpet under den engelske borgerkrig, herunder en atten-dages belejring i 1644. I 1699 blev Liverpool gjort til et sogn ved lov fra parlamentet, samme år sejlede dets første slavefartøj, Liverpool Merchant, til Afrika. Siden romertiden havde den nærliggende by Chester på floden Dee været regionens vigtigste havn på Det irske Hav. Men da Dee begyndte at slamme op, blev den maritime handel fra Chester stadig vanskeligere og skiftede mod Liverpool på den nærliggende flod Mersey.
1644