Nationalforsamlingen blev i første omgang ikke indviet, da præsident Yahya Khan og PPP-formanden Zulfikar Ali Bhutto ikke ønskede et parti fra Østpakistan i den føderale regering. I stedet udnævnte Yahya den veteran bengali politiker Nurul Amin som premierminister og bad ham om at nå frem til et kompromis mellem PPP og Awami League. Men dette skridt mislykkedes, da forsinkelsen i indvielsen allerede havde forårsaget betydelige uroligheder i Østpakistan. Situationen eskalerede til en borgerkrig.
Det førte til dannelsen af den uafhængige stat Bangladesh. Forsamlingen blev til sidst indviet i 1972, efter at Yahya trådte tilbage og overgav magten til Zulfikar Ali Bhutto. Bhutto blev premierminister i 1973, efter at posten blev genskabt ved en ny forfatning.