Efter sin løsladelse organiserede Bohne en gruppe kommunistiske atleter fra 1939 og sluttede sig til Bästlein-Jacob-Abshagen-gruppen, en anti-nazistisk modstandsgruppe, i 1941. Han blev arresteret og fængslet igen i 1942, men formåede at flygte efter bombningen af Hamburg.
I juli 1943. Den 5. januar 1944 forsøgte tre Gestapo-officerer at arrestere Bohne i Hamburg; da han forsøgte at forsvare sig, blev han skudt til døde.