Doria studerede filosofi og teologi i Spanien og blev forfremmet til kardinal ved kong Felipe II af Spanien. Da kong Filip II døde, blev han udnævnt til kardinaldiakon i konsistoriet den 9. juni 1604 i en alder af 31 år. Doria fik tilladelse til at modtage de hellige ordrer uden for Ember-dagene, den 9. december 1604. Han deltog i både den pavelige konklave i marts-april 1605
, som valgte pave Leo XI, og i det pavelige konklave i maj 1605, som valgte pave Paul V.