Zhu Di, der var ivrig efter at etablere sin egen legitimitet, annullerede Jianwen-kejsers regeringstid og etablerede en omfattende indsats for at ødelægge eller forfalske optegnelser om hans barndom og oprør. Dette omfattede en massiv udrensning af de konfucianske lærde i Nanjing og tildeling af ekstraordinær ekstralegal myndighed til eunukernes hemmelige politi. En af de foretrukne var Zheng He, der brugte sin autoritet til at foretage store opdagelsesrejser i det sydlige Stillehav og det Indiske Ocean. Vanskelighederne i Nanjing førte også til, at Yongle-kejseren genoprettede Beiping (nutidens Beijing) som den nye kejserlige hovedstad. Han reparerede og genåbnede den store kanal, og mellem 1406 og 1420 stod han for opførelsen af Den Forbudte By. Han var også ansvarlig for Nanjings porcelæntårn, der blev betragtet som et af verdens vidundere, før det blev ødelagt af Taiping-oprørerne.
I 1856. Som en del af sit fortsatte forsøg på at kontrollere de konfucianske lærde-bureaukrater udvidede Yongle-kejseren også det kejserlige eksamenssystem i stedet for sin fars brug af personlig anbefaling og udnævnelse. Disse lærde færdiggjorde den monumentale "Yongle Encyclopedia" under hans regeringstid.