Under invasionen af Polen med rang af kaptajn deltog han i slaget ved Modlin
- Hvad? Han organiserede et kapitel af Służba Zwycięstwu Polski (senere omdannet til Związek Walki Zbrojnej og derefter til Armia Krajowa) i Pomorze. Han var medvirkende til at koordinere aktiviteterne i forskellige polske modstandsorganisationer i Pomorze-regionen, indtil de fleste af dem blev fusioneret i Armia Krajowa. Efter Józef Ratajczaks død i maj 1940 var han den uofficielle leder af den polske modstand i Pomorze. Fra 1943 var han stabschef for Komenda Okręgu Armii Krajowej Pomorze under Komendant Okręgu Jan Pałubicki (kodenavn "Janusz"). I den tid boede han for det meste i Toruń, selv om han hvert par måneder rejste til Warszawa for at mødes med kommandanter for AK (Stefan Rowecki og Tadeusz Komorowski).