Fuldfør følgende sætning: I september 2006 holdt pave Benedikt XVI en tale ved universitetet i Regensburg i Tyskland om spørgsmålet om kristendommens "rimelighed". I den
I sin Regensburg-forelæsning talte han om rationalitet i troen og citerede kommentarer fra den byzantinske kejser Manuel II Palaiologos fra det fjortende århundrede, der, som paven udtrykte det, sagde: "vis mig lige hvad Muhammed bragte som var nyt, og der vil du kun finde onde og umenneskelige ting, såsom hans befaling om ved sværdet at udbrede den tro han prædikede". Citatet blev stærkt kritiseret af muslimer over hele verden, herunder Pakistans parlament, som fordømte paven for hans kommentarer og krævede en undskyldning fra ham. Efter talen førte Choudary den 17. september en protest uden for Westminster Cathedral, hvor han fortalte journalister: "Den, der fornærmer Muhammeds budskab, vil blive udsat for dødsstraf". Metropolitan Politiet undersøgte hans kommentarer, men konkluderede, at "ingen væsentlige lovovertrædelser" blev begået under demonstrationen. Den skyggeindretlige indenrigsminister, David Davis, som havde opfordret til at der skulle træffes foranstaltninger mod Choudary, sagde: "Det er ret skammeligt. Det sender et budskab til muslimske ekstremister om, at vi som land ikke har det moralske mod til at stå op imod dem". Der er dog påstande om, at Choudary's britiske retshåndhævende myndigheder ved flere lejligheder havde tilstrækkelige beviser til at foretage en anholdelse. De blev forhindret i at gøre det, da han var central i de undersøgelser, der blev gennemført af de britiske sikkerhedstjenester.