For at generobre byen, indledte det russiske tsarrige i 1632 den såkaldte "Smolensk-krig" mod Samveldet. Efter et nederlag i hænderne på kong Wladislaw IV forblev byen i polsk-litauiske hænder. I 1632 byggede den uniatiske biskop Lew Kreuza sine lejligheder i Smolensk; de blev senere omdannet til den ortodokse kirke St. Barbara. Fjendtlighederne genoptog i 1654, da Samfundet blev påvirket af Khmelnytsky Opstanden og
Svensk oversvømmelse. Efter endnu en belejring blev Smolensk den 23. september 1654 generobret af Rusland. I Andrusovo-våbenhvilen i 1667 opgav den polsk-litauiske stat sine krav på Smolensk.