Efter overgivelsen af den konfødererede bastion den 4. juli 1863, blev 106. overført til Helena, Arkansas, under kommando af generalmajor Frederick Steele. Her deltog det i fremrykningen på Little Rock og
Slaget ved Bayou Fourche den 10. september 1863, som sikrede Little Rock og det meste af Arkansas for Unionen. I resten af krigen blev 106. tildelt vagter i hele Arkansas, der holdt freden og vogtede mod mulige konfødererede modangreb i den region. Rapporten fra Illinois Adjutant General opsummerer 106th Illinois' tjeneste kortfattet: "Med undtagelse af belejringen af Vicksburg deltog regimentet ikke i nogen af de mest kendte slag, men det udførte alligevel godt sin del i at slå et oprør ned, og det led mange fattigdom og vanskeligheder, marchede gennem sumpe og bayous, bevogtede jernbaner, statens ejendom, kæmpede og søgte efter føde, som det er bevist af dets lange liste over tab".