Efter Núñez' afgang i 2000, overtog hans vicepræsident gennem 22 år, Joan Gaspart, klubben. Under hans formandskab vandt holdet ingen trofæer, og efter to og et halvt år trådte Gaspart tilbage fra sin stilling den 12. februar 2003, da holdet lå på 15. plads, to point over nedrykning. Enric Reyna blev valgt som midlertidig formand, indtil bestyrelsen trådte tilbage den 5. maj 2003. Herefter blev der oprettet en midlertidig kommission, som stod i spidsen indtil valget. Den 15. juni 2003 trådte Joan Laporta i embedet og var den mest succesrige præsident med hensyn til Champions League-trophæer. Klubben vandt Champions League to gange inden for tre år og fuldførte en "uset sekstupel" ved at vinde 2008-09 La Liga, 2008-09 Copa del Rey, 2009 Supercopa de España, 2008-09 UEFA Champions League,
2009 UEFA Super Cup og 2009 FIFA Club World Cup.