Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Ved magten var YSP omringet af interne splittelser. I 1980 blev Ismail erstattet som præsident for Sydjemen af Ali Nasir Muhammad, der var en mere moderat og forsonende leder sammenlignet med Ismail's pro-sovjetiske venstrefløj. Han søgte at forbedre forbindelserne med Sydjemens arabiske naboer og Vesten. Konflikten mellem de to fraktioner førte til borgerkrigen i det sydlige Yemen.
I 1986 blev Abdul Fattah Ismail dræbt, men hans allierede Ali Salem al Beidh overtog partiet, mens den mere moderate Haidar Abu Bakr al-Attas blev præsident. Al-Beidh og al-Attas besatte stillinger i regeringen i et genforenet Yemen indtil borgerkrigen i 1994. Der blev afholdt parlamentsvalg i oktober 1986, og selv om YSP forblev det eneste lovlige parti, fik uafhængige kandidater lov til at stille op til valget og vandt 40 af de 111 pladser, mens YSP vandt de øvrige 71.