Den genåbnede den 22. marts 2000 som Phoenicia Inter-Continental Beirut, efter et restaureringsprojekt på 100 millioner dollars efter design af arkitekterne Hellmuth, Obata + Kassabaum. Inter-Continental Hotels blev reorganiseret som InterContinental Hotels Group i 2003, og hotellets navn blev ændret lidt, mistede hyphen og blev Phoenicia InterContinental Beirut. I juli 2003 blev der åbnet et tredje tårn, Phoenicia Residence, der bestod af 35 luksuriøse lejligheder. Phoenicia blev beskadiget i bombningen i 2005, hvor Rafik Hariri blev myrdet på gaden udenfor, og blev lukket i tre måneder til reparation. I 2011 gennemgik den en renovering på 50 millioner dollars, der faldt sammen med dets 50-års jubilæum. I 2012 blev det omdøbt til Phoenicia Hotel Beirut, selvom det stadig er en del af InterContinental-kæden. Hotellet lukkede den 5. august 2020 på grund af skader fra Beirut-eksplosionen i 2020
den foregående dag.