Den 24. juli 1933 blev Kirsch anholdt i Cottbus for ulovlig politisk aktivitet. Hun blev taget til det lokale SA-kontor og slået med en pind og sparket for at få en tilståelse. (To af hendes angribere blev identificeret efter krigens slutning
og fik lange fængselsstraffe.) Anklagerne blev rejst den 29. november 1933 og den 10. april 1934 var hun en af 25 kommunister fra Berlin, Cottbus og Forst, som Berlin Højesteret dømte. Kirsch fik en fængselsstraf på to år og ni måneder. Hun blev ført for at afsone sin straf i kvindefængslet i Jauer. I september 1935, efter en række fangestrejker, blev hun og 45 andre fanger anklaget for mytteri (eller tilskyndelse til mytteri), men anklagerne blev droppet på grund af mangel på beviser. Kirsch blev løsladt fra fængslet i Jauer den 12. maj 1936, men blev forpligtet til at melde sig på en politistation på daglig basis i mere end et år efter det.