Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I 1953 dømte den kommunistiske regering parret "in absentia" for at "tage ulovlig orlov" i udlandet. I 1956 inviterede regimet ham tilbage "med løfter om frihed til at gøre alt, hvad jeg ville", sagde Kubelík, men han afslog invitationen. I et brev til "The Times" i 1957 sagde Kubelík, at han kun ville overveje at vende tilbage, når alle landets politiske fanger var blevet løsladt, og alle emigranter fik så meget frihed, som han ville have haft. Han blev inviteret tilbage af regimet i 1966, men nægtede igen; i 1968, efter at Prag foråret var blevet afsluttet af den sovjetiske invasion
, organiserede han en international boykot, hvor mange af de store klassiske kunstnere i Vesten deltog.