Skriv en fortsættelse til dette afsnit - I august 2009 besøgte Ya'alon ruinerne af Homesh, en bosættelse, der blev ødelagt i den israelske afvikling fra Gaza
I 2005 besøgte han de israelske bosættelser på den nordlige del af Vestbredden, der betragtes som uautoriserede udposter. Han sagde, at disse samfund alle er lovlige og ikke bør kaldes "illegale". Derudover deltog han i en konvention af Manhigut Yehudit ("Jødisk Ledelse"), den mere højreorienterede Settlers' segment inden for det højreorienterede Likud-parti, hvor han fordømte løsrivelsesplanen, kaldte Peace Now en "virus" og sagde, at "Vi vænner os til, at arabere får lov til at leve overalt, i Negev, Galilæa, Nablus, Jenin, og [på den anden side] er der områder, hvor jøder ikke må leve. Det er vores skyld". Han erklærede også, at "med hensyn til spørgsmålet om bosættelserne, kan og bør jøder efter min mening leve overalt i Israel. For det første skal enhver aftale godkendes af myndighederne, og det, der sker på stedet, i modstrid med disse beslutninger og så videre, er ikke legitimt. Det er ulovligt".