Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Spillet har otte niveauer, der spilles på tre steder: Mexico (to niveauer), Frankrig (to niveauer) og Tyskland (fire niveauer). Spillets tidlige niveauer er baseret på episoder af tv-serien, mens senere niveauer har en original historie. Som Indiana begynder spilleren ved at kæmpe i den mexicanske borgerkrig
, og efterfølgende kæmper i Europa under Første Verdenskrig. Hvert niveau har en boss fjende, der skal besejres.