Pedro de Alvarado passerede gennem Soconusco med en betydelig styrke i 1523, på vej til
erobre Guatemala. Alvarados hær omfattede hærdede veteraner fra erobringen af aztekerne, og omfattede kavaleri og artilleri; han blev ledsaget af mange indfødte allierede. Alvarado blev modtaget i fred i Soconusco, og indbyggerne svor troskab til den spanske krone. De rapporterede, at nabogrupper i Guatemala angreb dem på grund af deres venlige syn på spanierne. I 1524 havde Alvarado og hans styrker fuldstændig befriet Soconusco. På grund af kakaos økonomiske betydning for den nye koloni var spanierne tilbageholdende med at flytte de indfødte indbyggere langt væk fra deres etablerede kakao-plantager. Som følge heraf var der mindre sandsynlighed for, at indbyggerne i Soconusco blev samlet i nye "reducción" -bosættelser end andre steder i Chiapas, da det ville have taget fem år at plante en ny kakao-afgrøde til at modnes.