Udfyld følgende sætning: Under krigen med Rusland i 1654-1667 og under den store nordlige krig (1700-1721) led Merkinė meget af russiske og svenske hære og mistede sin strategiske og økonomiske betydning. Merkinė blev igen brændt af den russiske hær under
1794 Opstand, der forsøgte at befri Det polsk-litauiske Samvelde fra russisk indflydelse. I 1794 blev byens inventar flodhavn ved Nemunas flod nævnt, og også Nemunas og Merkys floder blev vurderet som egnede til navigation. I dokumenter fra det 19. århundrede blev Merkinė nævnt som et flodhandelscenter, hvor flodhandelsskibe blev bygget.