Isomerer med forskellige medicinske egenskaber er almindelige; f.eks. placering af metylgrupper. I substituerede xantiner er teobromin, der findes i chokolade, en vasodilator med nogle virkninger til fælles med koffein; men hvis en af de to methylgrupper flyttes til en anden position på den to-ringede kerne, er isomeren teofyllin, som har en række virkninger, herunder bronkodilation og antiinflammatorisk virkning. Et andet eksempel på dette forekommer i de phenythylaminbaserede stimulerende stoffer. Phentermin er en ikke-chiral forbindelse med en svagere effekt end amphetamin. Det bruges som et appetitreducerende lægemiddel og har milde eller ingen stimulerende egenskaber. Men giver et andet atomarrangement til dextromethaminin, som er en stærkere stimulerende effekt end amphetamin, der findes i chokolade. Spørgsmål: Hvad er det, der er almindeligt i chokolade?
Teobromin