Skriv en fortsættelse til dette afsnit - For 2011/12 sæsonen
Perrotta blev normalt brugt som en central midtbanespiller sammen med Daniele De Rossi og Miralem Pjanić. Den 20. februar 2012 underskrev Perrotta en ny etårig forlængelse af sin kontrakt med Roma, der vil holde ham i klubben indtil 2013. Perrottas faste bruttoafgift for den aktuelle sæson blev forhøjet til €2,6 millioner plus præstationsbonusser. Han spillede 20 kampe i 2011-12 sæsonen, uden at score et mål.