Men disse oplysningsreformer viste sig at være kontraproduktive, eller måske for sent, til at undertrykke koloniernes krav. Hele Vicekongedømmets historie var præget af voksende uroligheder og politisk ustabilitet. Mellem 1780 og 1782, oprøret af Túpac Amaru II
inspirerede en voldelig Aymara-ledet oprør i det øvre Perus højland, der demonstrerede den store vrede mod de koloniale myndigheder af både mestizo og indfødte befolkninger. Femogtyve år senere forsvarede criollos, indfødte folk af spansk afstamning, sig med held mod to på hinanden følgende britiske forsøg på at erobre Buenos Aires og Montevideo. Dette øgede deres følelse af selvstændighed og magt på et tidspunkt, hvor spanske tropper ikke var i stand til at hjælpe.