Efter at have trukket sig tilbage som University of Florida præsident emeritus i 1984, Marston vendte tilbage til Virginia Military Institute som en fremtrædende forsker, og senere tjente på VMI's styrende bestyrelse af besøgende under kontroversen over retten beordrede optagelse af kvinder. I 1985 vendte han tilbage til University of Florida-fakultetet og udførte forskning og præsenterede papirer for universitetets Institut for Fiskeri og Akvatiske Videnskaber og dets Medicinske Fakultet, medredigerede "The Medical Implications of Nuclear War" på vegne af National Academy of Sciences og fungerede som formand for Sikkerhedsrådgivende Udvalg for Rensning af
Tre Mile Island. Han accepterede også formandskabet for Florida Marine Fishery Commission, der har til opgave at styre statens saltvandsfiskeri og værgemål af dens ressourcer.