Efter det japanske angreb på Pearl Harbor og USA's indtræden i Anden Verdenskrig, blev Foster kaldt tilbage til aktiv tjeneste med rangen af kommandør i Naval Reserve og fik direkte besked fra præsident Franklin D. Roosevelt om at udføre særlige marineinspektioner. En af hans første missioner var at foretage en undersøgelse i Panamakanalzonen.
Efter en række klager fra hærens generalløjtnant Daniel Van Voorhis, øverstbefalende for Caribbean Defense Command om samarbejde mellem hæren og flåden.