Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Efter Jinnahs afvisning af at acceptere det nordlige Arakan i Dominion of Pakistan, grundlagde nogle Rohingya-ældste, der støttede en "jihad"-bevægelse, "Mujahid"-partiet i det nordlige Arakan i 1947. Mujahid-partiets mål var at skabe en selvstændig islamisk stat i Arakan. I 1950'erne begyndte de at bruge udtrykket "Rohingya", som kan være en fortsættelse af udtrykket Rooinga for at etablere en særskilt identitet og identificere sig som indfødte. De var meget mere aktive før 1962 burmesiske statskup
af general Ne Win, en burmesisk general, der begyndte sin militære karriere ved at kæmpe for japanerne i 2. verdenskrig. Ne Win gennemførte militære operationer mod dem over en periode på to årtier. Den fremtrædende var Operation King Dragon, som fandt sted i 1978; som følge heraf flygtede mange muslimer i regionen til nabolandet Bangladesh som flygtninge. Ud over i Bangladesh er et stort antal rohingyaer også flyttet til Karachi i Pakistan. Rohingya mujahideen er stadig aktive i de fjerntliggende områder i Arakan.