Udfyld følgende sætning: I 1365 <unk> 66 og 1384 <unk> 85 fungerede byen som et tilflugtssted for biskoppen af Konstanz, da han blev udvist fra Konstanz. Før 1324 og mellem 1371 og 1386 blev byen pantsat til eksterne ejere som sikkerhed for et lån. Fra 1359 til 1403 var slottet ejet af de lokale. I 1374 blev de fritaget for krigsskatten. Biskopernes herredømme blev svækket ved overgangen af suverænitet fra Habsburg til amtsrådet Baden i 1415. På grund af sin beliggenhed på den religiøse grænse var Kaiserstuhl et vigtigt brohoved for de katolske regioner. I både den første krig ved Villmergen, i 1655/56, og i
Toggenburgkrigen (eller Anden Villmergenkrigen), i 1712, blev landsbyen besat af Zürich. Under de religiøse konflikter blev trafikken til Kaiserstuhl tvunget til i stedet at krydse Rhinen i Zürich-kontrollerede områder. Da byen ikke havde ret til at beskatte skibstrafikken på Rhinen, kostede dette tab af landtrafikken byen det meste af sine toldindtægter. Men byen forblev velstående på grund af vinbrug og husdyrhold, gennem kredit og bankvirksomhed og gennem udenlandstjeneste. Rigdommen afspejles i de storslåede huse der blev bygget i denne tidsalder. (Gasthaus zur Krone i 1550, administrationssalen i klosteret St. Blaise i 1563 og 1612, og "Marschallhaus" i 1764). Bygningerne, der tillod Kaiserstuhl at fungere som et regionalt center, lå på højre bred af Rhinen, og blev tabt i 1798 med oprettelsen af kantonen Baden. Efter franskmændenes ødelæggelse af broen i 1799 ophørte grænsetrafikken gennem Kaiserstuhl i næsten to årtier.