Den 1. november 1937 udnævnte Mustafa Kemal Atatürk Bayar som premierminister i den 9. regering i Tyrkiet efter İsmet İnönü forlod regeringen. Han fortsatte med at tjene som premierminister, da Atatürk døde, og İnönü blev præsident i 1938 (Tyrkiets 10. regering). Forskelle i meninger med Inönü førte ham til at træde tilbage fra stillingen den 25. januar 1939.
Forskelle med Inönü