I kamp 6 i National League Championship Series mod Florida Marlins det år, var Alou involveret i
Steve Bartman-hændelsen, hvor Cubs-fanen Steve Bartman afledte en forkert bold, der landede en række ind på tribunen. Bartmans afbøjning forhindrede Alou, der nåede ind på tribunen, i at forsøge at fange bolden til et out, der kunne have været det andet ud af den 8. Inning. Men Marlins fortsatte med at score otte løb i inning, som Cubs havde ført 3 til 0. Cubs, der havde ledet serien 3<unk>2, tabte spillet 8<unk>3 og tabte i sidste ende serien i 7 kampe. Alou indrømmede åbent senere i interviews, at selvom han var frustreret i øjeblikket, kunne han alligevel ikke have taget fangsten. Senere benægtede Alou at have afgivet en sådan udtalelse og sagde, at hvis han havde gjort det, var det kun for at få Bartman til at føle sig bedre.