Under den russisk-japanske krig hjalp "Akagi" til i belejringen af Port Arthur. Den 2. maj 1904 hjalp hun til med at blokere den kanal, der førte ind i havnen. Senere blev hun sendt til den vestlige kyst af Kwantung-halvøen for at yde ildsupport under Slaget ved Nanshan. Mens hun var på patrulje uden for Port Arthur den 18. maj 1904, kolliderede hun med kanonbåden, som efterfølgende sank. "Akagi" deltog senere i
Invasionen af Sakhalin.