Carey fik kommandoen over No. 135 Squadron RAF, som fungerende eskadrilleder, i august 1941. I december begyndte eskadrillen at flytte til Indien, med Carey som leder af formationen mod den japanske invasion af Burma. I februar 1942 blev han forfremmet til fløjkommandør og ved udgangen af året havde skudt ni japanske fly ned. Carey blev taget af drift og sendt til RAF Amarda Road i Indien som Air Officer Commanding (AOC) Air Fighting Training Unit 1 i 1943. I november 1944 blev han forfremmet til gruppe kaptajn og forlod Burma til Egypten som AOC på OTU 73. Carey blev nævnt i 1945 New Year Honours liste. I juli 1945 flyttede han til England som Group Captain Tactics ved Central Flying Establishment indtil
Japans kapitulation den 2. september 1945.