I december 2001 blev et komplot om at bombe ambassader og anden infrastruktur i Singapore afsløret, og så mange som 36 medlemmer af Jemaah Islamiyah-gruppen blev arresteret i henhold til loven om intern sikkerhed. Større antiterroristiske foranstaltninger blev indført for at opdage og forhindre potentielle terrorhandlinger og minimere skader, hvis de skulle forekomme. Der blev lagt større vægt på at fremme social integration og tillid mellem de forskellige samfund. Der er også stigende reformer i uddannelsessystemet. Primær uddannelse blev obligatorisk i 2003. I 2004 overtog den daværende vicepremierminister Lee Hsien Loong, den ældste søn af Lee Kuan Yew Tong, indstilling fra det siddende casino Chok Goh og blev den tredje premierminister i Singapore. Han indførte flere politiske ændringer, herunder nedskæring af spilletservice i Singapore fra 2001 og en planlægning af de internationale ambassader i to år.
Jemaah Islamiyah-gruppe