Efter shakedown fra San Diego sejlede "General M. B. Stewart" fra San Francisco den 2. april 1945 med mere end 3.000 tropper til Pearl Harbor. Efter at være vendt tilbage til San Francisco den 18. april med 1.500 veteraner ombord, foretog hun en rundrejse ud af San Francisco fra den 26. april til den 19. juni for at transportere tropper til Pearl Harbor; Admiralty Islands; og Leyte, Filippinerne. Hun forlod derefter San Francisco den 26. juni for at operere i Atlanterhavet. Efter at have nået Norfolk den 11. juli sejlede hun til Leghorn, Italien, hvor hun ankom den 5. august for at ombordtage tropper til omfordeling i Stillehavet. Undervejs den 7. august for Panama-kanalen, "General MB Stewart" dampede til østkysten efter
Japansk kapitulation og ankom den 19. august for at lande sine passagerer.