Thiago startede 2011-12 sæsonen med den første etape af den spanske Supercup kamp mod rivalerne Real Madrid, blev udskiftet for Xavi efter 58 minutter, og var en ubrugt erstatning, da de besejrede FC Porto for 2011 UEFA Super Cup
- Hvad? Han scorede derefter i Barcelonas første La Liga-kamp i sæsonen i en 5 til 0 hjemme sejr mod Villarreal CF. Den 18. december startede han, da Barcelona vandt 4 til 0 i Club World Cup-finalen på International Stadium Yokohama. Thiago nettede også Barcelonas femte i en 7-0 sejr mod Rayo Vallecano den 29. april fra en tæt afstand header.