Hans mest formidabel personlige anerkendelse kom den 26. januar 2007, da han blev valgt af fans og journalister som FIBA Europe Årets Mændsspiller for 2006, overgået af spillere som Nowitzki, Gasol og Tony Parker. I sommeren 2008 blev Papaloukas kaptajn for Grækenlands landshold for
2008 olympiske lege. Det var også sidste gang han spillede for Grækenlands landshold.