Udfyld følgende sætning:
Krigen sluttede i maj 1945 med, at de vestlige to tredjedele af Tyskland blev opdelt i fire militære besættelseszoner. Bayern var besat af den amerikanske hær. I 1946 stod Johannes Müller over for en form for retssag for den bayerske kommissær for racebaseret, religiøs og politisk forfølgelse. På grund af hans "Eulogising of Hitler in speech and writing" ("Verherrlichung von Hitler in Wort und Schrift") blev Müller, der nu var over 80 år, "dømt" som en alvorlig krigsforbryder ("Hauptschuldiger"). Dommen var kontroversiel, fordi Müller aldrig havde været medlem af nazistpartiet og ikke havde været involveret militært, hvilket tilsyneladende betød, at der ikke var noget retsgrundlag for domfældelse. En beslægtet ansøgning om, at Schloss Elmau skulle konfiskeres, mislykkedes, oprindeligt fordi Elsa, grevinde af Waldersee, som stadig var en del ejer af det, nægtede at sælge sin andel. Müller nægtede at forsvare sig for kommissæren, men den permanente ekspropriering af Schloss Elmau blev ikke gennemført. Müller indrømmede åbent, at han havde taget fejl i sin vurdering af Hitler, og han distancerede sig fra nationalsocialismen, men i andre henseender stod han ved sin "lære".