Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Keramiske fund tyder på, at Kolonai var beboet i forhistorisk tid, men det er ukendt, om der var nogen kontinuitet mellem disse perioder af dens bosættelse og den græske periode. Græsk keramisk materiale vises på stedet fra det 7. århundrede f.Kr., hvilket markerer dets grundlæggelse som en græsk bosættelse. I den periode, hvor Daës af Kolonai skrev (sandsynligvis det 4. århundrede f.Kr.), troede indbyggerne i Kolonai, at de var blevet grundlagt af eoliske grækere. I betragtning af at Lesbos også var etnisk eolisk og Kolonai var en af de såkaldte akteaniske byer, som Athen tog fra Mytilene efter afslutningen af mytilæernes oprør
I 427 f.Kr., er det sandsynligt, at Mytilene grundlagde Kolonai og efterfølgende kontrollerede det. En korrupt passage af geografen Strabo antyder i stedet, at Kolonai tilhørte peraia af Tenedos, men der er nu enighed blandt konsensus om, at manuskripterne skal henvise til, at det tilhører peraia af Lesbos.