Efter kun en kort periode med hvile, 2/1st udstationeret til New Guinea, ankommer der i september 1942 lige som tidevandet af Kokoda Track kampagne
begyndte at vende tilbage til fordel for de allierede. Bataljonen sluttede sig efterfølgende til de allieredes forfølgelse af de tilbagetrækning japanske nord mod deres strandkød omkring Buna<unk>Gona, og under modangrebet var 2/1st Battalion involveret i de store slag ved Eora Creek og derefter ved Gorari, efterfulgt af Sanananda mellem oktober og slutningen af november 1942. Bataljonen led store tab under felttoget, hvor over 60 procent blev dræbt, såret eller evakueret syg. Efter Kokoda-kampagnen vendte 2/1 tilbage til Australien for at genopbygge. På dette tidspunkt modtog de en stor mængde forstærkninger fra 49. bataljon, en militsbataljon, der havde kæmpet omkring Sanananda, før den blev opløst.