Efter Labour-partiets ledervalg i 2015 vendte Cooper tilbage til bagbænkerne efter næsten sytten år i frontbænken. Udbygning af hendes eksisterende arbejde om den europæiske flygtningekrise
Cooper blev udnævnt til formand for Labour's taskforce for flygtninge, hvor han arbejdede sammen med lokale myndigheder, samfundsgrupper og fagforeninger for at udvikle en bæredygtig og humanitær reaktion på krisen. Hun talte om emnet på Labour's årlige konference i 2016.