Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Som træner begyndte Deschamps sin karriere med Monaco, og hjalp klubben med at vinde Coupe de la Ligue i 2003, og nåede frem til UEFA Champions League-finalen i 2004, hvor han blev udnævnt til Ligue 1 Manager of the Year i 2004. I løbet af sæsonen 2006/07 hjalp han sin tidligere klub Juventus med at vinde Serie B-titlen og vende tilbage til Serie A efter deres nedrykning på grund af deres involvering i Calciopoli-skandalen i 2006 den foregående sæson. Han har efterfølgende været manager for en anden af sine tidligere klubber, Marseille, hvor han vandt Ligue 1-titlen i sæsonen 2009/10, samt tre på hinanden følgende Coupe de la Ligue-titler mellem 2010 og 2012 og på hinanden følgende Trophée des Champions-titler i 2010.
og 2011.