Efter Anden Verdenskrig blev Lee udnævnt til en komité, der havde til opgave at genopbygge den malaysiske økonomi, som havde lidt under den japanske besættelse. Da briterne indførte undtagelsestilstand i 1948 som reaktion på det kommunistiske oprør
, blev han udnævnt til det malaysiske fagforenings rådgivende råd, det føderale lovgivende råd og det føderale udøvende råd.