Skriv en fortsættelse til dette afsnit - Márquez er den tredje mest indspillede spiller i historien for det mexicanske landshold, hvor han indspillede 147 kampe i hele sin karriere. I 2018 blev han kun den fjerde spiller til at spille for sit landshold i fem på hinanden følgende udgaver af FIFA World Cup, sammen med landsmanden Antonio Carbajal, Lothar Matthäus og Gianluigi Buffon, der optrådte i 2002, 2006, 2010, 2014 og 2018 udgaver af turneringen. Han er også den mexicanske spiller med de fleste VM-kampe spillet med 19. Med landsholdet vandt Márquez 1999 FIFA Confederations Cup, og 2003 og 2011
af CONCACAF Gold Cup.