Comment le protestantisme institutionnel a-t-il été reconstitué pendant le Désert ?
La répression n'empêcha pas le protestantisme français de se reconstituer. La restauration clandestine des Églises est l’œuvre d’Antoine Court qui, malgré les risques et la clandestinité, rétablit la discipline des Églises réformées, d’abord dans le Midi, puis dans quelques provinces du Nord. On nomme cette période de l'histoire protestante « le Désert » ou bien « l’Église sous la Croix ».


 Échec des visées prosélytes  -  Reconstitution du protestantisme institutionnel 
Le protestantisme institutionnel a été reconstitué par la reconstruction clandestine des Eglises et  la rétablissement de la discipline des Eglises réformées.