Музей расположен в отреставрированном в 1973—1975 и 2003—2005 годах здании Генерального суда Левобережной Украины (дом В. Кочубея) — памятнике архитектуры конца XVII-XIX веков, редком образце архитектуры украинского барокко. Экспозиция посвящена истории самого здания, деятельности Генерального суда Левобережной Украины, истории старшинско-дворянской семьи Кочубеев — владельцев дома и усадьбы. Отдельный раздел экспозиции раскрывает тайны воспетой в искусстве истории любви гетмана Ивана Мазепы и Мотри Кочубей — дочери генерального судьи Василия Кочубея. Расположен в здании Воскресенской церковноприходской школы (1904 года), отреставрированном в 2005—2008 годах. Открыт 22 января 2009 года Президентом Украины Виктором Ющенко. Экспозиция основана на коллекциях археологических находок Батуринской археологической экспедиции, которая исследует Батурин из 1995 года. Представлены вехи истории города с момента появления на его территории человека и до начала XVII века. Здание дворца — центр композиции дворцово-паркового ансамбля, построенного в 1799—1803 годах архитектором Чарльзом Камероном по заказу гетмана Кирилла Разумовского. Практически со времени постройки началась 200-летняя история его разрушения. В ХХ веке было предпринято несколько попыток реставрации. Успешной оказалась последняя реставрация, которая проходила в 2003—2008 годах. 22 августа 2009 дворец гетмана Кирилла Разумовского торжественно открыл Президент Украины Виктор Ющенко. Экспозиционная площадь дворца — 1 065,3 м². Интерьеры второго этажа воссозданы по сохранившимся в Петербурге аналогам работ Чарлза Камерона. Экспозиция посвящена истории самого памятника, истории семьи Разумовских, Кириллу Разумовскому как государственному деятелю, а также истории Гетманщины и её выдающимся деятелям. В залах дворца экспонируется ряд оригинальных предметов, принадлежавших гетману К. Разумовскому и его семье. Архитектурно-мемориальный комплекс, археопарк-скансен. Площадь 1,3 га. Воссоздан в 2008 г. In situ на месте Батуринского замка — резиденции гетманов Демьяна Игнатовича, Ивана Самойловича, Ивана Мазепы. Воспроизведение базировалось на комплексных научных исследованиях, в первую очередь — археологических материалах, исторических источниках и архитектурных аналогиях в области оборонной, культовой и гражданской архитектуры Гетманщины XVII-XVIII веков. Объекты замка — сухой ров, деревянные башни, стены, деревянная Воскресенская церковь, гетманский дом, казна — стоят на своих исторических местах, выявленных и исследованных археологами. На территории Цитадели в 2004 году установлен Памятник жертвам Батуринской трагедии 1708 г. 