What is pan genomics?
Pan genomics is a concept introduced in 2005 by Tettelin and Medini which eventually took root in bioinformatics. Pan genome is the complete gene repertoire of a particular taxonomic group: although initially applied to closely related strains of a species, it can be applied to a larger context like genus, phylum, etc. It is divided in two parts- The Core genome: Set of genes common to all the genomes under study (These are often housekeeping genes vital for survival) and The Dispensable/Flexible Genome: Set of genes not present in all but one or some genomes under study. A bioinformatics tool BPGA can be used to characterize the Pan Genome of bacterial species.
O que é a pan-genómica?
A genômica pan é um conceito introduzido em 2005 por Tettelin e Medini que acabou se radicando na bioinformática. O genoma pan é o repertório genético completo de um determinado grupo taxonômico: embora inicialmente aplicado a estirpes estreitamente relacionadas de uma espécie, pode ser aplicado a um contexto maior como gênero, filo, etc. Ele é dividido em duas partes - O genoma central: conjunto de genes comuns a todos os genomas estudados (muitas vezes são genes de limpeza vitais para a sobrevivência) e o genoma dispensável / flexível: conjunto de genes não presentes em todos, mas em um ou alguns genomas estudados.