Nok en reform af linjenettet fulgte 28. maj 1989, hvor den primære linje til Hillerød blev linje A. Linje E blev til gengæld afkortet til Hellerup, idet linjen dog fremdeles fortsatte til Hillerød i myldretiden.<ref name="BYtrafik 2/1989">''S89 - bedre S-tog og bedre busser'', BYtrafik 2/1989, s. 35-41.</ref> Ved samme lejlighed fik linjen også stop på Ishøj, Nordhavn og Svanemøllen,<ref name="BYtrafik 2/1989" /> mens et yderligere stop kom til 29. september 1991, da Lyngby også blev betjent af linje E.<ref name="Køreplan 1991">''DSB Køreplan'', 29.9.91-30.5.92, s. 10-11.</ref> Fra 26. september 1993 kørtes til Hillerød i dagtimerne mandag-lørdag, mens Hellerup stadig var endestation resten af driftstiden.<ref name="Jernbanen 4/1993">''Nyt om S-togsdriften'' af Erik B. Jonsen og Jens Ole Christensen. Jernbanen 4/1993, s. 118.</ref> Udvidelsen af driften skete blandt andet fordi, betjeningen af strækningen Holte-Hillerød var dårlig i forhold til passagertallene mellem myldretiderne. Desuden gav det bedre forbindelser til [[Lille Nord]], [[Gribskovbanen]] og en række buslinjer.<ref>''Nye S-togslinjer'' af Erik B. Jonsen og Jens Ole Christensen. Jernbanen 2/1993, s. 55.</ref> Driften ændredes igen 8. januar 2005, så der fortsattes til Lyngby udenfor dagtimerne på hverdage.<ref name="Ringbanen">[http://myldretid.dk/nyheder/nr/320 ''Ringbanen indviet''] af Thomas de Laine. Myldretid, 25. januar 2005.</ref><ref name="Køreplan 2005">''Tog i Danmark'' 09.01.2005-07.01.2006, s. 92-93.</ref> På Køge Bugt-banen kom der ekstra stop til på Friheden 15. september 2002 for at give forbindelse til [[linje 200S]]<ref name="BF 164">''HT/HUR-linieændringer 15.9.02'' af Jesper Kiby Denborg og Thomas de Laine. Busfronten 164/2002, s. 12.</ref> og på den nye station Ny Ellebjerg 6. januar 2007.<ref name="Færdig">[http://myldretid.dk/nyheder/nr/417 ''Ringbanen er færdig: Ny Ellebjerg taget i brug''] af Thomas de Laine. Myldretid, 5. december 2006.</ref>
Historie Foreninger Organisationer