På klubplan spillede Edu størstedelen af sin karriere i [[Spanien]], hvor han repræsenterede henholdsvis [[Celta Vigo]] og [[Real Betis]].<ref>{{cite news|url=http://www.footballdatabase.eu/football.joueurs..edu.1685.en.html|title=Footballdatabase.eu: Edu|accessdate=2018-05-28}} {{en sprog}}</ref> Hos sidstnævnte var han i 2005 med til at vinde den spanske pokalturnering [[Copa del Rey]]. Han havde også ophold i hjemlandet hos [[São Paulo FC|São Paulo]], [[Sport Club Internacional|Internacional]] og [[Esporte Clube Vitória|Vitória]], inden han sluttede karrieren efter en kort periode i den [[USA|amerikanske]] [[Major League Soccer]] hos [[Colorado Rapids]].
Levende_personer