[[Church of Scotland]] oprettede Queen's College i 1841 ved et charter fra [[Dronning Victoria]]. Undervisningen, som skulle forberede de studerende til præstegerningen, begyndte 7. marts 1842 med 13 studerende og 2 lærere.<ref name="pound2005">{{cite book |title='Fitzhenry and Whiteside Book of Canadian Facts and Dates'  |last=Pound |first=Richard W. |publisher=Fitzhenry and Whiteside |year=2005}}</ref> I 1869 var Queen's det første universitet vest for de [[Maritime Provinser]] som optog kvindelige studerende.<ref name=hist/> I 1883 blev der er oprettet en medicinsk skole for kvinder med tilknytning til Queen's University, efter at mandlige ansatte og studerende havde reageret fjendtligt over optagelse af kvinder på medicinstudiet.<ref name=":0">{{Cite web|url=https://www.queensu.ca/encyclopedia/w/women-medical-students-expulsion |title=Women Medical Students, Expulsion of {{!}} Queen's Encyclopedia |website=www.queensu.ca |access-date=2019-10-11}}</ref><ref name=WMC>{{cite book|title=Queen's University: Volume I, 1841-1917: And Not to Yield|last=Neatby|first=Hilda |pages=214–216 |year=1978 |publisher=McGill-Queen's University Press |isbn=0-7735-6074-2}}</ref> Queen's endte sin tilknytning til den [[Presbyterianisme|presbyterianske kirke]] i 1912<ref name=roycha/> og skiftede navn fra '''Queen's College at Kingston''' til sit nuværende navn.<ref name=hist />
Historie Foreninger Organisationer