Øen var [[Fæstningsværk|befæstet]] i perioden [[1801]] til [[1814]], hvor den sammen med tilsvarende [[Kanon (våben)|kanonstillinger]] ved [[Lilleør]] og på [[Besser Rev]] kontrollerede indsejlingen til [[Storebælt]] fra [[nord]]. Kyholm har landets ensomste [[kirkegård]], hvor [[kommandant]] Krügers søn var den næstsidste, som blev begravet.<ref>[http://www.samsoeroots.dk/kyholm/Begravede.htm Begravede]</ref> Kirkegården måler 30 × 30 [[Fod (længdeenhed)|fod]] (9,4 × 9,4 meter) og er [[Naturfredning i Danmark|fredet]].<ref>{{Cite web |url=https://www.samsopastorat.dk/page/119/tranebjerg-kirke |title=Tranebjerg Kirke |access-date= 4. juli 2018 |archive-date= 4. juli 2018 |archive-url=https://web.archive.org/web/20180704124559/https://www.samsopastorat.dk/page/119/tranebjerg-kirke |url-status=dead }}</ref> Den 22. juli [[1932]] blev kirkegården genindviet, men der er ikke foretaget nogle begravelser siden 4. august 1858.<ref>[http://www.samsoeroots.dk/kyholm/genindvielsen.htm Genindvielsen]</ref> Det er tilladt at færdes på Kyholm året rundt.
Naturbeskyttelse