Scene 3: En have, Pamina sover:
Monostatos stirrer på hende med henrykkelse. (Arie: "Alles fühlt der Liebe Freuden"). Han skal til at kysse den sovende Pamina, da Nattens Dronning viser sig. Hun giver Pamina en dolk og beordrer hende til at dræbe Sarastro med den og truer med at fornægte hende, hvis hun ikke gør det. (Arie: "Der Hölle Rache kocht i meinem Herzen" / Helvedes hævn koger i mit hjerte). Nattens Dronning forlader scenen. Monostatos forsøger tvinge Pamina til at elske sig ved at true med at afsløre dronningens plan. Sarastro kommer ind og Monostatos flygter og lader os vide, at han nu vil tjene Nattens Dronning. Pamina tigger Sarastro om at tilgive hendes mor, og han beroliger hende og siger, at hævn og grusomhed ingen plads har i hans rige. (Arie: "I diesen heil'gen Hallen").
Musik