I 2018 blev han af kirkeminister [[Mette Bock]] valgt til at stå for prædiken i [[Christiansborg Slotskirke]] ved åbningen af [[Folketinget]].
Flere politikere anså valget som kontroversielt med baggrund i Kvists holdninger omkring homoseksuelle, og et citat fra 2008 i [[Politiken]] blev fremdraget, hvor han i en kommentar i forbindelse med godkendelsen af homoseksuelle par som plejefamilier blev citeret for bl.a. at sige "Hvad med de pædofile – har de også rettigheder? De pædofile har et stærkt behov for at være sammen med børn, skal de så have lov til det?".<ref name="Minister får skarp kritik for kontroversielt valg af præst til Folketingsgudstjeneste"/>
I protest valgte [[Socialistisk Folkeparti|SF]]'s folketingsmedlemmer af boykotte Folketingets gudstjeneste.<ref>{{Cite news
 | author = Rikke Gjøl Mansø
 | title = SF boykotter åbningsgudstjeneste i protest mod ministers præstevalg
 | publisher = DR
 | date = 1. oktober 2018
 | url = https://www.dr.dk/nyheder/politik/sf-boykotter-aabningsgudtjeneste-i-protest-mod-ministers-praestevalg
}}</ref>
Åbningsprædikens tema var centreret omkring [[nåde (religion)|nåden]] og Kvist lod [[lignelse]]n om [[den fortabte søn]] eksemplificere begrebet.<ref>{{Cite news
 | author = Morten Kvist
 | title = Vi skal lære at se nåde overalt
 | work = [[Kristeligt Dagblad]]
 | date = 2. oktober 2018
 | url = https://www.kristeligt-dagblad.dk/kirke-tro/praest-i-aabningspraediken-vi-skal-laere-se-naade-overalt
}}</ref> Kvist klagede efterfølgende i en kronik i Kristeligt Dagblad over mediebehandlingen, som han fandt unuanceret,<ref>Morten Kvist: "Morten Kvist: Medier og politikere fastholdt en forkert historie om mig", Kr. D. 13.11.2018, https://www.kristeligt-dagblad.dk/kronik/medier-og-politikere-fastholdt-en-forkert-historie-om-mig</ref> og fik medhold af rektor på Journalisthøjskolen [[Jens Otto Kjær Hansen]] i, at behandlingen i medierne havde været unuanceret og bevidst udeladt citater, som ville stille sagen i et mere nuanceret lys.<ref>Jens Otto Kjær Hansen: "Rektor på Journalisthøjskolen: Vi må diskutere, om journalistikken nærer populismen", Kr. D. 19.11.2018, https://www.kristeligt-dagblad.dk/kronik/vi-maa-diskutere-om-journalistikken-naerer-populismen</ref>
Levende_personer Personbillede_savnes