Morgause og Morgana vender tilbage i tredje sæson, nu sammen for at dræbe Uther. Da Morgana forsøger at gøre Uther vanvittig med en [[alrune]]-forbandelsen, som får han til at opleve forskellige personers død, for hvilke han er skyldig, bliver hendes forræderi opdaget af Merlin. Merlin ender dog med at blive fanget og forhørt af Morgause. Fordi Morgause ikke er i stand til at få nogle brugbare informationer ud af Merlin, bortset fra hans tro på et fremtidigt Camelot med Arthur som konge, binder hun med fortryllede kæder og lader ham at dø i en skov. Merlin undslipper med nød og næppe, med hjælp fra Den Store Drage. Under det midlertidige overtag af Camelot, stoler Morgause på Morganas evner til at genoplive døde, også inden for slottets mure, og bliver rystet, da planen mislykkes. Hun forbliver dog loyal overfor sin søster og i afsnittet "The Crystal Cave", sender hun en besked til Morgana om at mødes med hende. Et par dage senere kommer hun til Camelot, for at finde ud af, hvorfor Morgana ikke mødte op og finder ud af, at Uther er Morganas far. Hun beder til at Morgana ikke skal gøre noget dumdristigt, men Morgana ignorerer hendes bøn og prøver at dræbe Uther alligevel. Efter denne opdagelse, handler Morgauses forsøg nu mere om at dræbe Arthur, sådan at Morgana bliver den næste til tronen, men hun afslører også Arthurs forhold til Gwen og planter et livsdrænende armbånd i Arthurs varetægt, da han skal ud på en farlig rejse. Hun er dog uvidende om Merlins rolle på rejsen, hvor han formår at redde Arthurs liv. Morgause formår på et tidspunkt at overtage Camelot ved at skabe en hær af udødelige soldater, hvor hun smider Uther af tronen og tvinger Geoffrey til at krone Morgana til dronning.
Overtagelsen bliver dog hurtigt afbrudt, da Arthur leder en mindre gruppe af loyale riddere ind til Camelot for at generobre byen. Under generobringen kaster Merlin Morgause ind i en pille, da hun forsøger at angribe Gaius (efter Gaius havde distraheret hende fra at skade Merlin yderligere). Morganas reagerer voldsomt, da hun ser sin døde halvsøsters lig, men Merlin og Gaius diskuterer senere, om Morgause måske kun var alvorlig skadet og ikke død, ligesom det var sket med Morgang i slutningen af anden sæson. <br /> Det er senere blevet bekræftet, at Emilia Fox har annonceret at hun medvirker i endnu en omgang af serien ''Merlin''.
Fiktive_personer Lister_over_personer