* [[Mucoromycota]] former en søstergruppe til Dikarya og inkluderer mange mikrosvampe, der lever sammen med planter. En inddeling indenfor denne række er [[Glomeromycotina]], der  er mikrosvampe, der danner arbuskulært [[mykorrhiza]]. Kun cirka 169 arter kendes. Denne gruppe var traditionelt en del af formgruppen [[koblingssvampe]] (''Zygomycota'').
* [[Zoopagomycota]] er en gruppe mikrosvampe hvoraf mange lever som parasitter.
* [[Chytridiomyceta]] er et underrige, hvis medlemmer formerer sig med [[zoospore]]r, og inkluderer tre rækker, der totalt rummer mindre end 1000 arter. En række er  [[Piskesvampe]], Chytridiomycota, en gruppe mikrosvampe, der mest lever i vand. En anden række er ''[[Neocallimastigomycota]]'', mikrosvampe, der lever i [[drøvtygger]]es maver. Kun cirka 20 arter.
* [[Blastocladiomycota]] er mikrosvampe der formerer sig med [[zoospore]]r (selvbevægelige, ukønnede sporer med flageller) og alternerer mellem haploide og diploide generationer (de har en såkaldt haplodiplontisk [[livscyklus]]). Kun cirka 179 arter.
* [[Opisthosporidia]] udgør de mest basale svampe og er en muligvis [[parafyletisk gruppe]] (uden fælles stamfader) af endo[[parasit]]ter (indvendige snyltere). En gruppe her er [[Microsporidia]], encellede parasitter i dyr. Over tusind kendte arter.
Naturvidenskab