De centrale dele af øen er opdyrket, men ud mod kysten findes en række [[vådområde]]r, hvor der er mange [[fugl]]e, deriblandt mange [[klyde]]r. Derudover er disse arealer rasteplads for en række [[trækfugl]]e. Glænø  er en del af  [[Natura 2000]]-[[Natura 2000-område nr. 162 Skælskør Fjord og havet og kysten mellem Agersø og Glænø|område nr. 162 Skælskør Fjord og havet og kysten mellem Agersø og Glænø]] og er også [[ramsarområde]].<ref>{{Cite web |url=https://mst.dk/media/130845/n162_n2000plan_2016-21.pdf |title=Natura 2000-planen |access-date=20. marts 2021 |archive-date=24. marts 2021 |archive-url=https://web.archive.org/web/20210324075205/https://mst.dk/media/130845/n162_n2000plan_2016-21.pdf |url-status=dead }}</ref> og indgår i [[Holsteinborg Nor]] [[Vildtreservat]].
Naturbeskyttelse