Ud fra ytringer i breve og det videre levnedsløb formodes det, at Ludwigs interesse for det andet køn var begrænset. Ludwigs hemmelige dagbog, som i [[1925]] blev udgivet af minister [[Johann von Lutz]]s stedsøn, giver antydninger, som peger i retning af, at kongen var [[homoseksuel]]. Den indeholder vidnesbyrd om kongens samvittighedskvaler og for hans forsøg på at undertrykke sit begær.<ref>Bernd-Ulrich Hergemöller, ''Mann für Mann'', S. 478.</ref> [[Psykiater]]en og [[neurolog]]en Heinz Häfner fra [[Heidelberg]] hævder i sin bog om eventyrkongen, at han ikke blot var homoseksuel, men at han endog i forfølgelse af sin tilbøjelighed skal have misbrugt undergivne ryttersoldater seksuelt.<ref>Heinz Häfner, ''Ein König wird beseitigt: Ludwig II. von Bayern.</ref> Den østrigske forfatter [[Leopold von Sacher-Masoch]] skal Ludwig have betragtet som åndsbeslægtet.<ref>Edir Grein, ''Tagebuch-Aufzeichnungen von Ludwig II.'', Schaan (Liechtenstein): Quaderer-Verlag, 1925.</ref>
Religion