Byen og slottet blev hårdt beskadiget i [[Trediveårskrigen]]. Det blev plyndret af [[Den svenske stormagtstid|svenske tropper]] under kommando af [[Lennart Torstenson|Lennart Torstensson]] i 1643. De fleste bygninger blev brændt ned. Byen blev yderligere beskadiget af en stor brand i 1656. Kroměříž kom sig under biskop [[Karl II af Liechtenstein-Kastelkorn|Karl 2. von Liechtenstein-Kastelkorns]] styre, som havde genopbygget byen og slottet. Slottet blev først repareret og i 1686 fuldstændig genopbygget. Han har også repareret bymure og grundlagt en [[mønt]] og repræsentative haver i 1666-1675. Kroměříž blev igen en vigtig by.<ref>{{Cite web|title=Historie Kroměříže: 4. díl – Zničení Kroměříže a jeho skvělé zbudování v 17. století|url=http://www.mojekromeriz.cz/magazin/clanek/historie-kromerize-4-dil-zniceni-kromerize-a-jeho-skvele-zbudovani-v-17-stoleti|publisher=Moje Kroměříž|language=cs|access-date=13. december 2021}}</ref>
Historie Tidligere_riger,_stater,_protektorater,_kolonier_og_lande