Den 30. august 2016 blev det offentliggjort, at Kliment blev udlejet til [[Brøndby IF]] for resten af 2016-17-sæsonen.<ref>{{Cite web|url=http://www.vfb.de/en/vfb/latest/newsarchive/2016/329806-jan-kliment-released-on-loan/|title=Jan Kliment released on loan|date=30. august 2016|work=vfb.de|publisher=[[VfB Stuttgart]]|accessdate=15. februar 2017}}</ref> Han fik sin debut i [[Superligaen 2016-17|Superligaen]] den [[11. september]], da han blev skiftet ind i det 56. minut i stedet for [[Teemu Pukki]] i 0-1-sejren ude over [[AaB Fodbold|AaB]].<ref>{{cite web |url=http://www.superstats.dk/kampe/4945 |title=AaB 1-0 Brøndby IF |publisher=superstats.dk}}</ref> Han scorede sit første mål i Superligaen den [[16. oktober]], da han scorede til 1-1 i en kamp imod [[FC Nordsjælland]].<ref>{{cite web  |url=http://www.superstats.dk/kampe/4984 |title=FCN 1-1 Brøndby IF |publisher=superstats.dk}}</ref>
Levende_personer