Skipper har boet på [[Vesterbro]].<ref>{{Cite news
 | author = [[Jan Hedegaard]]
 | title = Spidskandidaten
 | publisher = [[Berlingske]]
 | date = 10. juli 2014
 | url = http://www.b.dk/foedselsdag/spidskandidaten
}}</ref>
Siden 2013 har hun været kæreste med DR's USA-[[Korrespondent (journalist)|korrespondent]] [[Oliver Routhe Skov]].<ref>{{Cite news
 | author = Kristian Dam Nygaard
 | title = Pernille Skipper kysser med DR-journalist
 | publisher = [[metroxpress]]
 | date = 7. november 2013
 | url = http://www.mx.dk/underholdning/kendte/story/21765654
 | access-date = 27. februar 2014
 | archive-date = 10. november 2013
 | archive-url = https://web.archive.org/web/20131110003946/http://www.mx.dk/underholdning/kendte/story/21765654
 |url-status=dead
 }}</ref>
Parret blev gift i 2015,<ref>{{Cite news
 | url = http://www.bt.dk/politik/pernille-skipper-hemmeligt-gift-her-er-hendes-nye-mand
 | author =  Sanne Fahnøe
 | title = Pernille Skipper hemmeligt gift: Her er hendes nye mand
 | date = 19. april 2016
 | publisher = [[BT]]
}}</ref>
Levende_personer Litteratur Ledere