På trods af den unikke [[geomorfologi]] og [[Klima|parkens specifikke klima]] bor der mere end 25 arter af [[flagermus]] i parkens [[hule]]r.<ref name="fauna3">{{Cite web|title=Management Plan of Prespa National Park (Albania)|url=https://www.researchgate.net/publication/280610734_Management_Plan_of_Prespa_National_park_Albania|website=researchgate.net|pages=30–35|language=en}}<cite class="citation web cs1" data-ve-ignore="true">[https://www.researchgate.net/publication/280610734_Management_Plan_of_Prespa_National_park_Albania "Management Plan of Prespa National Park (Albania)"]. ''researchgate.net''. pp.&nbsp;30–35.</cite></ref> [[Treni Cave|Hulen i Treni]] er hjemsted for den største og vigtigste population af [[langfingret flagermus]] i [[Europa]].<ref>{{Cite web|last=The park protects some of the largest and most important populations o|title=Status Survey and Conservation Action Plan for the Bats of Prespa|url=http://www.spp.gr/bats%20action%20plan.pdf|website=spp.gr|page=99|language=en|format=PDF|access-date=31. marts 2021|archive-date=29. oktober 2017|archive-url=https://web.archive.org/web/20171029065500/http://www.spp.gr/bats%20action%20plan.pdf|url-status=dead}}</ref> Parken er hjemsted for 23 arter af [[krybdyr]] og 11 arter af [[Padder|amfibier]], herunder [[europæisk sumpskildpadde]], [[græsk landskildpadde]], [[maurisk landskildpadde]], [[ildsalamander]], [[latterfrø]] og [[springfrø]].
Naturbeskyttelse Foreninger Organisationer