{{infoboks Natura 2000-område
|navn= Stubbe Sø
|fuldt navn=Natura 2000-område nr. 48<br/>Stubbe Sø
|billede= Stubbe Soe set mod vest.jpg
|billede_størrelse=
|billedtekst= Stubbe Sø set mod vest fra [[fugletårn]]et ved østenden
|region=[[Region Midtjylland]]
|kommuner=[[Syddjurs Kommune]]
|areal=778
|naturtyper=
<small>
* [[Kransnålalge-sø]] (3140)
*[[Næringsrig sø]] (3150)
*[[Vandløb]] (3260)
*[[Surt overdrev]] (6230)*
*[[Tidvis våd eng]] (6410)
*[[Rigkær]] (7230)
*[[Bøg på mor]] (9110)
*[[Ege-blandskov]] (9160)
*[[Stilkege-krat]] (9190)
*[[Elle- og askeskov]] (91E0)*
</small>
|arter= <small>
* [[Damflagermus]] (1318)
* [[Odder (dyr)|Odder]] (1355)
</small>
| landkort           = Midtjylland
| label              =    Stubbe Sø
| korttekst        =Natura 2000-område nr. 48
| coordinates      = {{coord|56|15|21|N|10|42|38|E|type:city_region:DK|display=ti}}
|position   =right  
}}
'''Natura 2000-område nr. 48 Stubbe Sø''' er et [[EU-habitatområde]] (H44) der har et areal på i alt 778 [[hektar]], hvoraf søen udgør ca. halvdelen af området. [[Stubbe Sø]] er den største sø på [[Djursland]] og den tredjestørste i [[Jylland]]. Det er en stor, næringsrig, lavvandet sø på knap 4 km² (376 ha). Søen var oprindeligt enden af en [[fjord]], der gik fra [[Kattegat]] lidt nord for [[Dråby Strand]] og ind i landet. Den ligger i et sø- og moseterræn nordøst for [[Mols Bjerge]], og har afløb via [[Havmølle Å]] til Kattegat. Oprindelig var det en [[hede]]sø, omgivet af [[lyng]]bakker, men beplantning har ændret landskabet, der nu mest består af mørke [[nåleskov]]e med en lysere bræmme af [[Elleslægten|el]] og [[birk]] ned mod søen.
Naturbeskyttelse