1995 indrettede museet på [[Sønderborg Slot]] udstillinger i møllen og kornmagasinet.
[[A.P. Møller og Hustru Chastine Mc-Kinney Møllers Fond til almene Formaal]] gav 5,5 millioner kroner til restaurering af den efterhånden forfaldne mølle, og i 2009 blev møllen nypudset og kalket; og vinger og rundgang repareret. I 2019-2020 blev møllen atter renoveret og fik bl.a. nye vinger, samt ny tandkrans.
[[Fil:Dybboel-moelle.jpg|thumb|Dybbøl Mølle]]
[[Fil:Düppel-Album Düppeler Mühle.jpg|thumb|Møllen efter angrebet 18. april 1864]]
[[Fil:Sprængt krudtmagasin på Dybbøl Banke.1.jpg|thumb|Dybbøl Mølle og betonrester af et dansk krudtlager fra 1864]]
Bygninger,_konstruktioner_og_anlæg