I Linz var Keplers primære ansvar at færdigøre ''de rudolfinske tavler'' og undervise ved distriktskolen og tilbyde astrologiske og astronomiske tjenester. I hans første år i byen havde han en væsentligt bedre finansiel sikkerhed og religiøs frihed i forhold til i Prag – selv om han ikke kunne deltage i [[nadver]]en på grund af hans teologiske skrupler. Hans første udgivelse i Linz var ''De vero Anno'' (1613), en udvidet afhandling om Jesu fødselsår; han deltog også i overvejelser om [[Pave Gregorius 13.|Pave Gregorius]]' [[Gregorianske kalender|reformerede kalender]] i de protestantiske tyske lande; samme år skrev han også den indflydelsesrige matematiske afhandling ''Nova stereometria doliorum vinariorum'', om hvordan man måler rumfang af beholdere som vintønder (Den udkom først 1615).<ref>Caspar, ''Kepler'', s. 209–220, 227–240</ref>
Walhalla