Den [[16. september]] 2001 benægtede Osama bin Laden enhver involvering i angrebene med oplæsningen af en meddelelse på [[Qatar]]s [[Al-Jazeera]] satellit-tv-kanal: "Jeg understreger, at jeg ikke deltog i udførelsen af denne aktion, som lader til at være udført af individer med egne motiver." Denne benægtelse blev offentliggjort på nyhedsstationer i hele verden. Dette var i stærk kontrast til en tidligere fatwa, underskrevet af bin Laden og andre, som refererede til drab på amerikanske statsborgere tilbage i [[1998]].<ref>{{cite web |title=Pakistan to Demand Taliban Give Up Bin Laden as Iran Seals Afghan Border |url=http://www.foxnews.com/story/0,2933,34440,00.html |publisher=[[Fox News Channel]] |date=16. september 2001 |access-date=20. maj 2008}}</ref> I november 2001 fandt amerikanske styrker et videobånd fra et ødelagt hus i [[Jalalabad]], [[Afghanistan]], hvori en mand, som angiveligt er Osama bin Laden, taler med [[Khaled al-Harbi]]. På båndet indrømmer bin Laden at have planlagt angrebene. Båndet blev vist på forskellige tv-stationer den [[13. december]] 2001.<ref>{{cite news| title = Bin Laden on tape: Attacks 'benefited Islam greatly'| publisher = CNN| date = 14. december 2001| url = http://archives.cnn.com/2001/US/12/13/ret.bin.laden.videotape/| access-date = 9. november 2007| quote = Reveling in the details of the fatal attacks, bin Laden brags in Arabic that he knew about them beforehand and says the destruction went beyond his hopes. He says the attacks "benefited Islam greatly".| archive-date = 27. december 2007| archive-url = https://web.archive.org/web/20071227125232/http://archives.cnn.com/2001/US/12/13/ret.bin.laden.videotape/| url-status = dead}}</ref> Den detaljerede tidsplan for bin Laden, der uden forudgående viden blev afsløret i et interview i september 2002 sammen med Khalid Sheikh Mohammed og Ramzi Binalshibh: Beslutningen om at lancere en "martyr-operation indenfor Amerika" blev lavet af al-Qaedas militære komité i begyndelsen af 1999; efter at Atta udvalgte datoen (9/11/01) for angrebene, meddelte Binalshibh den 29. august 2001, at bin Laden var blevet informeret om dette den 6. september 2001.<ref>{{cite news | title= Al-Qaeda 'plotted nuclear attacks' | publisher = BBC News | date = 8. september 2002| url=http://news.bbc.co.uk/2/hi/middle_east/2244146.stm |access-date = januar 2010}}</ref>
Historie