Johannes, sammen med sin kone, der delte i hans religiøse og velgørende arbejde, er kendt for at have påtaget sig kirkebygning i betydelig skala, herunder opførelse af Kristus Pantokratorklostret (Zeyrekmoskeen) i Konstantinopel. Dette kloster med sine tre kirker er blevet beskrevet som en af de vigtigste og mest indflydelsesrige arkitektoniske konstruktioner i Mellembyzantinsk Konstantinopel. Til klosteret var knyttet et hospital med 5 afdelinger, der var åbent for folk fra alle sociale klasser. Hospitalet var bemandet med uddannede lægmænd i stedet for munke. Klosteret fungerede også som kejserlig grav for Komnenos-dynastiet.<ref>Necipoğlu, p. 133</ref> <ref>Angold (1995), p. 310</ref>
Religion