De tolv hold, der sluttede på første-, anden- og tredjepladserne i grupperne i den [[Junior-VM i håndbold 2008 (piger)#Indledende runde|indledende runde]], spillede i hovedrunden om placeringerne 1-12. De seks hold fra gruppe A og B blev samlet i gruppe I-M, mens holdene fra gruppe C og D samledes i gruppe II-M. I de to nye grupper spilledes der alle-mod-alle, bortset fra at resultater af indbyrdes opgør mellem hold fra samme indledende gruppe førtes med over til hovedrunden. Vinderne og toerne af de to grupper kvalificerede sig til semifinalerne. De to treere kvalificerede sig til kampen om 5.-pladsen, firerne gik videre til kampen om 7.-pladsen, femmerne spillede om 9.-pladsen, mens sekserne måtte se sig henvist til at spille om 11.-pladsen.
Sport