De næste mange Chagatayid-khaner blev udpeget af Kaidu,{{sfn|Biran|1997|p=33}} der beholdt kontrollen over khanatet indtil sin død. Han fandt endelig en passende khan i Baraqs søn [[Duwa]] (1282-1307), der deltog i Kaidus krige med Kublai khan og hans efterfølgere i [[Yuan-dynastiet]].{{sfn|Biran|1997|pp=50–2}} De to herskere var også aktive imod Ilkhanatet. [24] Efter Kaidus død i [[1301]] gav Duwa sin troskab til hans efterfølger. Han indgik også fred med Yuan-dynastiet og betalte [[tribut]] til Yuan-hoffet; på tidspunktet for hans død var chagatai-khanatet en næsten uafhængig stat.{{sfn|Biran|1997|pp=71–8}}
Historie