I slutningen af 2020 kunne [[AGF Fodbold (kvinder)|AGF]] afsløre, at Pedersen blev ny cheftræner for klubbens kvindehold fra  sommeren 2021.<ref>{{kilde | url = https://kvindesport.dk/agf-ansaetter-katrine-s-pedersen-og-afsloerer-flere-ambitioese-planer-for-klubben/ | titel = AGF ansætter Katrine S. Pedersen og afslører flere ambitiøse planer for klubben | udgiver = kvindesport.dk | dato = {{dato|13-12-2020}} | fornavn = Peter | efternavn = Arndal | hentet = {{dato|13-7-2022}} }}</ref> Det lykkedes ikke for Pedersen og holdet at komme i ligaens slutspil to sæsoner i træk, og klubben valgte derpå ikke at forlænge kontrakten med hende lige inden jul 2022.<ref>{{kilde | url = https://agf.dk/nyheder/2022/december/agf-kvindefodbold-skal-have-ny-cheftraener | titel = AGF kvindefodbold skal have ny cheftræner | udgiver = agf.dk | dato = {{dato|20-12-2022}} | hentet = {{dato|27-12-2022}} }}</ref>
Levende_personer