种内变异百度百科
种内变异可能涉及生物性状的各个方面，既包括基因型水平的等位基因、
DNA序列
等遗传变异，也包括表型水平的形态、发育、生理、生活史等由遗传和环境因素共同决定的功能性状变异。根据生物性状的数学特征，又可以分为质量性状（qualitative character）和数量性状(quantitative character）两大类。质量性状变异常常表现为不连续的离散值（如
孟德尔豌豆实验
选取的性状：红花VS白花；圆粒VS皱粒；高茎VS矮茎），而数量性状的变异则常常是连续的数值（如叶片面积）。在基因型或基因组层面，大多数性状属于离散性状，种内变异主要包括丰富度（rich-ness)）和均匀度 （evenness)）两个方面。常用的测度指标包括：等位基因多样性（allelic diversity）、等位基因丰富度（allelic richness）、基因型丰富度（geno-typic richness） 、各种多样性指数（如 Simpson 指数、Shannon指数等）、杂合度（heterozygosity）、多态位点百分率（percentage of polymorphic loci ）、突变多样性和有效种群大小（mutational diversity and ef-fective population size）、 核苷酸多态性 （nucleotidediversity）等。在功能性状层面，质量性状变异同样可以利用各种
多样性指数
（例如前面提到的Simp-son 指数等）来估计，而数量性状变异一般采用平均值和方差（或变异系数）等统计参数来进行测度。在数量遗传学中，表型的方差（Vp）常常被分解为遗传方差（Ve）和环境方差（VE)）2部分，其中遗传方差还可以进一步分解为
加性遗传方差
（Va）和显性遗传方差（VD ）等不同的方差成分，在此基础上可以计算遗传力（heritability）。然而这种方差剖分( variance partition）方法一般适用于遗传谱系已知（例如北卡罗来纳设计Ⅰ或Ⅱ)或环境条件已知的实验群体（例如同质园条件下的种群）。在大多数自然种群中，个体间的遗传关系是未知的，环境又表现出明显的异质性，很难进行这种定量剖分。在生态学研究中，度量种内变异和种间变异的相对大小可能更有意义（例如上文提到的T参数）。在遗传学和生态学相对独立的发展过程中，针对不同层面和类型的种内变异提出了不同的测度方法，当前还没有一个单独的指标可以取代其他指标。值得注意的是，不同的测度指标是对种内变异不同方面或特性（例如丰富度和均匀度）的度量，由于不同指标之间的关系是非线性的，利用不同指标测度和比较种内变异可能会得到不同的结果。例如，基于基因型的指标（如基因型丰富度）和基于基因组的指标（如杂合度）之间并不是简单的正比关系，当种群中基因型数量增加时，基因组的杂合度未必会增加，与此相似，对应的功能性状的遗传方差也未必会随之增加。 生态学研究中常常会出现不一致的研究结果，至少一部分可能与采用不同的指标有关，这样的研究结果在某种程度上不能直接比较的。因此，研究者在解释实验结果、推导实验结论、构建理论框架时，要特别注意测度指标的影响。