锥虫（Trypanosome）是一种具有广泛宿主寄生性的单细胞人兽共患寄生原虫，主要流行于亚非拉各大洲。在我国，锥虫病以伊氏锥虫引起的苏拉病为主，可导致家畜日益消瘦甚至死亡，造成严重的经济损失，是世界卫生组织致力要控制和消灭的重要人兽共患病。伊氏锥虫被认为是布氏锥虫的一个突变体，这两种锥虫在基因组上非常相似，形态和生活史却截然不同，全面阐述蛋白质组和翻译后修饰（PTMs）组的动态变化，有望为探寻锥虫发育机制和防治策略提供潜在方向。2020年4月，沈阳农业大学陈启军教授课题组在Cell出版社新子刊iScience上发表题为LandscapesofProteinPosttranslationalModificationsofAfricanTrypanosomaParasites的论文。研究者对两种不同表型具有明显进化差异的锥虫（布氏锥虫和伊氏锥虫），进行了10种蛋白质翻译后修饰组学的分析，共鉴定到约40000个修饰位点和150个组蛋白修饰位点，并系统的揭示了驱动锥虫发育差异的分子机制。该研究是目前锥虫蛋白质翻译后修饰最为全面的研究，为研究具有明显进化差异的真核生物提供了有价值的模型。景杰生物作为共同作者提供了蛋白质修饰组学检测。一、布氏锥虫和伊氏锥虫的蛋白质组学差异研究者首先通过非标记定量蛋白质组学（质谱策略）的方法对布氏锥虫和伊氏锥虫的蛋白组进行分析，分别在布氏锥虫和
链霉菌以生成具有多种化学结构和生物活性的天然产物而闻名。短链酰基辅酶A，如乙酰辅酶A、丙二酰辅酶A和琥珀酰辅酶A，是初级代谢的分解代谢产物，同时也是初级代谢过程中大分子生物合成和次级代谢过程中天然产物的共同前体。人们已经充分认识到，精确控制链霉菌的初级/次级代谢发展及其转换对天然产物的正常生产至关重要。蛋白质翻译后修饰(PTM)在代谢调控中扮演至关重要的角色，但PTMs如何在更广的范围内调节链霉菌的代谢尚未被阐明。2020年4月24日，浙江大学医学院第一附属医院李永泉、毛旭明团队在Nature旗下子刊CommunicationsBiology上发表论文。文章以玫瑰孢链霉菌为模型，通过修饰蛋白组学揭示了巴豆酰化修饰作为一种重要的翻译后修饰，在链霉菌代谢调控中发挥重要作用。研究发现各种代谢途径中的关键酶上存在广泛的巴豆酰化修饰，并进一步鉴定到链霉菌中巴豆酰化修饰调控酶、和关键修饰底物，以此深入揭示了巴豆酰化修饰在链霉菌代谢中的调控作用。景杰生物为本文的巴豆酰化修饰组学分析提供了技术支持。1、巴豆酰化修饰在链霉菌中广泛存在链霉菌之前就发现存在乙酰化修饰，但是其余的酰化修饰是否广泛存在犹未可知。研究人员首先通过巴豆酰化修饰泛抗体对发酵过程中的链霉菌做了免疫印迹实验，发现链霉菌存在显着的巴豆酰化修饰。随后，研究人员构建了ΔprcB/A突变菌株（蛋白酶体缺失突变，从而减少蛋白酶体介导的蛋白降
所有打喷嚏和咳嗽，流鼻涕和红眼都可能导致过敏发作，但是令人惊讶的是，这些症状并不是由入侵的过敏原驱动的，而是由人体自身的免疫细胞——肥大细胞（Mastcells，MCs）驱动。肥大细胞是一种粒细胞，与许多过敏症密切相关。除此之外，肥大细胞还是免疫系统的关键部分，提供宿主对细菌和寄生虫的天然免疫，并参与调节炎症、伤口愈合、凝血、适应性免疫和急性过敏反应的其他功能。但是当前对于肥大细胞的生理或病理功能及其参与过敏反应的机制并不十分清楚。今天介绍的这篇关于肥大细胞的蛋白质组学研究文章，于近日发表于在国际免疫学专业期刊Immunity（IF=21.522）上。作者是前不久荣获2019年度德国科研最高奖项——莱布尼茨奖（GottfriedWilhelmLeibnizPrize，在德国学界地位仅次于诺贝尔奖，迄今共有七位“莱布尼茨奖”获得者日后获得诺贝尔奖。）的德国癌症研究中心免疫学家Hans-ReimerRodewald教授。Rodewald教授在血细胞生成（haematopoiesis）领域做出了许多开创性的贡献【1】。之前的研究工作中他分析了免疫系统细胞的发育，特别是在胸腺中发育并对细胞免疫反应起关键作用的T细胞，以及与许多过敏症有关的肥大细胞【2】。Prof.Dr.Hans-ReimerRodewald在这篇文章中，为了解肥大细胞主要功能及结构基础，研究人员运用系统的
糖基化是最重要和最普遍的蛋白质翻译后修饰之一。异常的蛋白质糖基化修饰通常与许多疾病的病理进展有关，包括癌症、神经退行性疾病、肺部疾病、血液疾病和遗传病等。大多数糖蛋白质是潜在的药物作用靶标和疾病诊断生物标志物，这些特征使糖蛋白成为临床和生物学研究中一类重要目标。不过蛋白质糖基化异常复杂，存在宏观不均一性和微观不均一性，因此使得糖蛋白组学研究具有挑战性。国内的科学家在这一领域也是颇有建树，做出了许多开拓性的研究成果。如之前报道，2019年12月，来自国家蛋白质科学中心（北京）、中国军事科学院军事医学研究院生命组学研究所钱小红团队、秦伟捷团队合作，在专业学术期刊AnalyticalChemistry上发表了一种大规模尿液样本的O-糖基化组学分析新策略[1]，可快速识别、高深度和可重现的无标记的人类尿液O-糖基化定量蛋白质。这种策略将数据库搜索速度提高了20倍，并使单个样品中完整O-糖肽定量提高了30％-40％，重现性明显提高（点击查看详细解读）。近日，糖基化蛋白组学研究再获新进展，来自复旦大学的杨芃原、曹纬倩团队、与中国科学院杨福全、付岩团队分别发表了关于O-糖基化组学与N-糖基化组学研究新成果。其中，杨芃原、曹纬倩研究团队成功构建了一个名为OGP的O-糖蛋白质组资源库，也是迄今为止最大规模的O-糖蛋白质数据库，并在数据库基础上，开发了O-糖基化位点预测工具，极大地促进O-糖基化研
针对肺癌驱动基因之一的KRAS基因突变研究，一直以来是学术界关注热点之一。KRAS是人类癌症（例如胰腺癌、结直肠癌和肺癌）中最常见的突变，大约占突变总比例的30%左右，在具有“癌症之王”之称的胰腺癌里，这一数字甚至高达90%。鉴于KRAS在肿瘤中的关键作用和普遍性，特异性地抑制KRAS有巨大的医学前景。由于在结构上缺乏让小分子或药物结合的靶点，KRAS因此一度被行业认为“不可成药”。幸运的是，经过了几十年持续不断的研究，KRASG12C癌蛋白的共价抑制剂近些年已经被陆续开发出来，并在临床试验进行了评估，让KRAS突变不再“无药可治”【1】。但众所周知，靶向疗法的耐药性很常见，可能会限制住KRAS抑制剂（KRASi）的长期疗效，全面表征KRASi的抗性机制之重要性不言而喻。近日，美国达纳·法伯（Dana-Farber）癌症研究中心的JosephMancias教授团队在国际知名期刊CellReports发文，研究人员运用TMT定量蛋白质组学，对目前正在接受临床试验评估的新开发KRASG12C抑制剂的耐药机制展开了深入研究。研究比较了不同肿瘤细胞系（胰腺癌，肺癌）、不同细胞培养条件（2D,3D）以及不同的KARS抑制剂（ARS-1620,compound4）所造成的蛋白质组差异，全面表征了KRASG12C突变肿瘤细胞对KARSi的适应性机制。本研究共定量到10805种蛋
乳腺癌居全世界女性癌症发病率之首，也是癌症研究的热点。随着基于高通量技术的发展，基因组、蛋白组等组学技术在乳腺癌的研究中发挥着越来越重要的作用。2016年，Nature报道了StevenCarr教授团队运用蛋白组、磷酸化修饰组等技术对乳腺癌进行了癌症组织内部的分子分型研究[1]。2019年，HenrikJ.Johansson等人运用蛋白质组学等技术，实现了对乳腺癌进行多层次系统性检测，包括mRNA表达、基因拷贝数改变，单核苷酸多态性，磷蛋白水平和代谢物丰度等[2]。三阴性乳腺癌（TNBC）是最罕见，也是最具侵略性和最难治疗的乳腺癌类型，它包括一系列具有不同组织学和预后的异质性肿瘤，其中最致命的亚型被称为化生性乳腺癌（MBC），占所有乳腺癌的0.2-5%。MBC具有独特的病理特征，其中的腺性成分可部分或完全被非腺性成分取代，一般具有临床侵袭性高，且化疗效果不佳，预后差等特点。这一重大的临床挑战强调了MBC亚型精准划分的必要性。2020年4月7日，美国密歇根大学安娜堡分校CelinaG.Kleer团队在国际着名期刊NatureCommunications上发表论文，利用定量蛋白质组学技术对27例MBC、TNBC和正常乳腺组织进行分析，系统描绘了MBC和TNBC的蛋白质全景图。相比于TNBC，不同的MBC亚型表现出不同的蛋白质表达差异。进一步比较人的和小鼠的梭形细胞癌亚型的蛋
支链氨基酸(BCAA)是包括亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸在内的重要营养物质，是能量产生的重要来源。最近的研究表明，BCAA代谢功能障碍与心血管疾病发生密切相关。代谢综合征(MS)和2型糖尿病(T2DM)常以肥胖、高脂血症、高血糖和高血压为特征，可增加心血管栓塞病的风险。血小板是动脉粥样硬化血栓形成的主要参与者，是心血管疾病治疗的重要靶细胞。许多研究表明，MS或T2DM患者的血小板通常处于高活性状态。MS患者血浆BCAA水平升高是否与血小板活性升高和血栓形成有关尚不清楚。近日（2020年3月23日），上海交通大学基础医学院刘俊岭团队和孙海鹏团队在着名学术期刊Circulation（IF=23.054）上发表论文。研究人员发现，BCAA代谢可显着增加人血小板的活性，BCAA代谢缺陷显着抑制血小板活化和动脉血栓形成，提示BCAA代谢对血栓形成至关重要。BCAA代谢促进TMOD3丙酰化修饰，可能起着关键作用。此篇研究不仅揭示了BCAA的摄入增加了动脉血栓栓塞的风险，而且为针对BCAA代谢的抗血小板治疗提供了一种新的策略。景杰生物为该研究的丙酰化修饰鉴定提供技术支持。研究人员首先发现BCAA的摄入增加血小板中Val,Leu和Ile的浓度，促进人血小板的聚集和脱颗粒。磷酸酶PP2Cm可对BCAA代谢调控的限速酶BCKD去磷酸化修饰而增强BCAA代谢。PP2Cm缺失会导致BCAA代谢缺陷，抑制
血管的狭窄或堵塞易引起缺血性组织坏死或病变，临床表现为心肌梗死、糖尿病足等疾病。缺血性疾病的治疗策略主要通过功能性血管网络的再生来灌注缺血组织。近年来，基于干细胞疗法的使用在缺血性疾病治疗方法的开发中
专访高友鹤教授：为什么尿液是疾病早期标志物的来源？
甲状腺结节（thyroidnodule），是指在甲状腺内细胞增生后出现的团块。它可由多种因素引起，在当代人群中较为高发，其患病率高达18.6%（2013年统计数据）。与多数结节一样，甲状腺结节有良恶
新冠肺炎已迅速在全球蔓延，对全球公共卫生造成严重威胁并对全球经济造成严重影响。目前针对新冠主要是一些支持性和对症治疗，因此迫切需要开发抑制SARS-CoV-2感染或复制的疗法。尽管SARS-CoV-2
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