في وقت داروين لم يكن هناك نموذج متفق عليه بالوراثة ؛ وفي الفصل الاول اعترف داروين, القوانين التي تحكم الميراث غير معروفة تماما. وقد قبل نسخة من الميراث من الخصائص المكتسبة (والتي بعد وفاة داروين تسمى lamarckism), ويبحث الفصل الخامس ما اطلق عليه اثار الاستخدام وال الاستعمال ؛ وكتب انه يعتقد انه لا يمكن ان يكون هناك شك يذكر في استخدام هذه الصفات. الحيوانات المنزلية تعزز و يوسع اجزاء معينة, و يقللها, وتقلل منها ؛ وان مثل هذه التعديلات ورثت, وان هذا ينطبق ايضا في الطبيعة. وذكر داروين ان بعض التغييرات التي عادة ما كانت عادة ما تكون قد تكون في الاستخدام وال الاستعمال, مثل فقدان الاجنحة الوظيفية في بعض الحشرات التي تعيش في الجزيرة, قد تنتج عن طريق الاختيار الطبيعي. وفي طبعات اخرى من الاصل, توسع داروين الدور عزا الى الميراث من الخصائص المكتسبة. وقد اعترف داروين ايضا بالجهل بمصدر الاختلافات تورث, ولكن توقع انها قد تنتج عن طريق العوامل البيئية. ومع ذلك, كان هناك شيء واحد واضح: ايا كانت الطبيعة الدقيقة واسباب الاختلافات الجديدة, علم داروين من الملاحظة والتجربة ان مربي كانوا قادرين على اختيار مثل هذه الاختلافات وتنتج اختلافات كبيرة في العديد من الاجيال من الاختيار. ملاحظة ان الاختيار يعمل في الحيوانات المحلية لا تدمر بسبب عدم فهم الالية الوراثية الاساسية.
ماذا تعلم داروين عن الاختلافات من خلال مراقبة مربي?
مربي كانوا قادرين على اختيار مثل هذه الاختلافات وتنتج اختلافات كبيرة في العديد من الاجيال من الاختيار