_id
stringlengths 8
8
| text
stringlengths 0
8.63k
| title
stringlengths 0
1.11k
|
|---|---|---|
wtvfow2f
|
Computationele methoden voor het bepalen van de secundaire structuur van RNA-sequenties uit gegeven alignments zijn momenteel gebaseerd op thermodynamische vouwing, compenserende basepaar substituties of beide. Er is echter momenteel geen aanpak die beide informatiebronnen combineert in één optimalisatieprobleem. Hier presenteren we een model dat zowel de energiegebaseerde als de evolutiegebaseerde benaderingen formeel integreert om de vouwing van meervoudig uitgelijnde RNA-sequenties te voorspellen. We hebben een uitgebreide versie van Pfold geïmplementeerd die baseparen identificeert die een hoge waarschijnlijkheid hebben om geconserveerd te zijn en energetisch gunstig te zijn. De consensusstructuur wordt voorspeld met behulp van een maximum verwachte nauwkeurigheidsscoreschema om het effect van onjuist voorspelde baseparen te verzachten. Parameterafstemming onthulde dat de waarschijnlijkheid van baseparing een grotere impact heeft op de RNA-structuurvoorspelling dan de corresponderende waarschijnlijkheid om enkelstrengs te zijn. Verder ontdekten we dat structureel geconserveerde RNA-motieven meestal worden ondersteund door vouwingsenergieën. Andere problemen (bijv. RNA-vouwingskinetiek) kunnen ook profiteren van het toepassen van de principes van het model dat we introduceren. Onze implementatie, PETfold, is getest op een set van 46 goed gecureerde Rfam-families en de prestaties werden gunstig vergeleken met die van Pfold en RNAalifold.
|
Evolutionaire en thermodynamische informatie verenigen voor RNA-vouwing van meervoudige alignments
|
nv228vte
|
Studies naar genfusie in solide tumoren zijn niet zo uitgebreid als in hematologische maligniteiten vanwege verschillende technische en analytische problemen geassocieerd met tumorheterogeniteit. Niettemin is er een groeiende interesse in de rol van fusiegenen in veelvoorkomende epitheliale tumoren na de ontdekking van recidiverende TMPRSS2:ETS fusies in prostaatkanker. Van alle gerapporteerde fusie partners in de ETS genfamilie is TMPRSS2:ERG de meest voorkomende. Hier presenteren we een simpele en gevoelige microarray-gebaseerde assay die gelijktijdig meerdere fusievarianten kan bepalen met een enkele RT-PCR in onzuivere RNA-monsters. De assay detecteerde TMPRSS2:ERG fusie-transcripten met een detectiesensiteit van <10 cellen in de aanwezigheid van meer dan 3000 keer zoveel normaal RNA, en in primaire prostaattumoren met niet >1% kankercellen. Het vermogen om meerdere transcriptvarianten in een enkele assay te detecteren is kritisch afhankelijk van zowel het primer- als het probe-design. De assay zou klinische en fundamentele studies voor fusiegeenscreening in klinische specimens moeten vergemakkelijken, aangezien deze gemakkelijk aangepast kan worden om meerdere genloci op te nemen.
|
Een gevoelige array-gebaseerde assay voor het identificeren van meerdere TMPRSS2:ERG fusiegenvarianten
|
5j496cx0
|
Het herleiden van het splicing-mechanisme door hybridisatie van hoge-affiniteit, RNase H-incompetente oligonucleotide-analogen zoals phosphoramidaat morpholino-oligonucleotiden (PMO) kan leiden tot belangrijke klinische toepassingen. Chemische conjugatie van PMO aan arginine-rijke cel-penetrerende peptiden (CPP) zoals (R-Ahx-R)(4) (waarbij Ahx staat voor 6-aminohexaanzuur) leidt tot sequentie-specifieke splicingcorrectie in afwezigheid van endosomolytische agentia in celkweek, in tegenstelling tot de meeste conventionele CPP's. Belangrijk is dat (R-Ahx-R)(4)–PMO conjugaten effectief zijn in muismodellen van verschillende virale infecties en Duchenne spierdystrofie. Helaas kunnen actieve doses in sommige toepassingen dicht bij cytotoxische doses liggen, wat een uitdaging vormt voor systemische toediening van de conjugaten in die klinische settings. Structuur-activiteitsrelatie studies zijn daarom ondernomen om CPP structurele kenmerken te ontrafelen die belangrijk zijn voor de efficiënte nucleaire afgifte van het geconjugeerde PMO en de beperkende stappen in hun internalisatiepad. Affiniteit voor heparine (genomen als model voor heparaansulfaat), hydrofobiciteit, cellulaire opname, intracellulaire distributie en splicingcorrectie zijn gemonitord. De afstand tussen de ladingen, de hydrofobiciteit van de linker tussen de Arg-groepen en de Arg-stereochemie beïnvloeden de efficiëntie van de splicingcorrectie. Een significante correlatie tussen splicingcorrectie-efficiëntie, affiniteit voor heparine en het vermogen om model synthetische vesikels te destabiliseren is waargenomen, maar er is geen correlatie gevonden met cellulaire opname. De inspanningen zullen zich moeten richten op endosomale ontsnapping, aangezien dit de beperkende factor lijkt te zijn voor de afgifte van deze splice-herleidende ON-analogen.
|
Afgifte van sterisch blokkerende morpholino-oligomeren door (R-X-R)(4) peptiden: structuur-activiteitsstudies
|
6zrv687k
|
Twee belangrijke manifestaties van virale immuniteit zijn efficiënte klaring van acute infectie en het vermogen om te vaccineren tegen secundaire virale blootstelling. Voor norovirussen zijn de bijdragen van T-cellen aan virale klaring en vaccinatie niet opgehelderd. We rapporteren hier dat zowel CD4 als CD8 T-cellen nodig zijn voor efficiënte klaring van primaire murien norovirus (MNV) infectie uit de darm en de darmlinfoklieren. Verder werd langdurige beschermende immuniteit gegenereerd door orale vaccinatie met levend virus. Systemische vaccinatie met het MNV-capsidproteïne beschermde ook effectief tegen mucosale uitdaging, terwijl vaccinatie met het capsidproteïne van het ver verwante humane Lordsdale-virus gedeeltelijke bescherming bood. Volledig effectieve vaccinatie vereiste een brede immuunrespons, inclusief CD4 T-cellen, CD8 T-cellen en B-cellen, maar het belang van specifieke immuunceltypen varieerde tussen de darm en de darmlinfoklieren. Perforine, maar niet interferon gamma, was vereist voor klaring van MNV-infectie door adoptief overgedragen T-lymfocyten van gevaccineerde gastheren. Deze studies bewijzen de haalbaarheid van zowel mucosale als systemische vaccinatie tegen mucosale norovirusinfectie, demonstreren weefselspecificiteit van norovirus-immuuncellen en geven aan dat efficiënte vaccinatiestrategieën krachtige CD4 en CD8 T-celresponsen moeten induceren.
|
Immuunmechanismen verantwoordelijk voor vaccinatie tegen en klaring van mucosale en lymfatische norovirusinfectie
|
sasijnks
|
Antivirale middelen worden beschouwd als veelbelovend voor de behandeling en preventie van opkomende virale ziekten zoals de H5N1-vogelgriep en SARS. Antivirale geneesmiddelen zijn echter niet volledig onschadelijk, en de omstandigheden waaronder individuen bereid zijn deel te nemen aan een grootschalig antiviraal geneesmiddelenbehandelingsprogramma zijn nog onbekend. Wij presenteren een populatiedynamische en speltheoretische analyse van grootschalige profylactische antivirale behandelingsprogramma's. We vergelijken doorlopend de antivirale bestrijdingsstrategie die optimaal is vanuit het oogpunt van de volksgezondheid met de strategie die zich zou ontwikkelen als individuen hun eigen, rationele beslissingen nemen. Daartoe onderzoeken we de omstandigheden waaronder een grootschalig antiviraal bestrijdingsprogramma een epidemie kan voorkomen, en analyseren we op welk punt in een zich ontwikkelende epidemie het infectierisico de kosten van een antivirale behandeling begint te overtreffen. Dit maakt het mogelijk om te onderzoeken hoe de optimale bestrijdingsstrategie wordt gevormd door de werkzaamheid van antivirale geneesmiddelen, het risico op mortaliteit door antivirale profylaxe en de overdraagbaarheid van het pathogeen. Onze analyses tonen aan dat er een sterke prikkel kan zijn voor een individu om minder antivirale middelen te nemen dan optimaal is vanuit het oogpunt van de volksgezondheid. In het bijzonder, wanneer de volksgezondheid vroegtijdige en agressieve bestrijding vraagt om een opkomend pathogeen te voorkomen of te beteugelen, is een antivirale behandeling voor het individu alleen aantrekkelijk wanneer het infectierisico niet langer verwaarloosbaar is. Het is zelfs mogelijk dat vanuit het oogpunt van de volksgezondheid een situatie waarin iedereen antivirale middelen neemt optimaal is, terwijl het proces van individuele keuze leidt tot een situatie waarin niemand bereid is antivirale middelen te nemen.
|
Eigenbelang versus groepsbelang bij antivirale bestrijding
|
slxdonqi
|
Het aviaire influenzavirus (H5N1) kan worden overgedragen op mensen, wat resulteert in een ernstige of fatale ziekte. Het doel van deze studie was om de immuun-kruisreactiviteit tussen humane en aviaire influenza (H5N1) stammen te evalueren bij gezonde donoren die gevaccineerd waren tegen seizoensgebonden influenza A (H1N1)/(H3N2). Een kleine frequentie van CD4 T-cellen specifiek voor subtype H5N1 werd bij verschillende personen bij baseline gedetecteerd, en toediening van het seizoensvaccin verhoogde de frequentie van dergelijke reactieve CD4 T-cellen. We observeerden ook dat seizoensvaccinatie in staat is om neutraliserende immuniteit tegen influenza (H5N1) te verhogen bij een groot aantal donoren. Er werd geen correlatie waargenomen tussen influenza-specifieke CD4 T-cellen en humorale responsen. N1 kan mogelijk een doelwit zijn voor zowel cellulaire als humorale kruis-type immuniteit, maar aanvullende experimenten zijn nodig om dit punt te verduidelijken. Deze bevindingen benadrukken de mogelijkheid om kruis-type cellulaire en humorale immuniteit tegen het hoogpathogene aviaire influenzavirus A subtype H5N1 te versterken door middel van seizoensgebonden influenza-vaccinatie.
|
Kruisbeschermende immuniteit tegen aviaire influenza bij recent tegen influenza gevaccineerde personen
|
uj7lyawj
|
Studies hebben humane bocavirus (HBoV) gerapporteerd bij kinderen met infecties van de luchtwegen (RTIs), maar slechts af en toe bij volwassenen. We zochten naar HBoV DNA in nasofaryngeale aspiraten (NPAs) van volwassenen met exacerbaties van chronische bronchitis of pneumonie, van kinderen die werden opgenomen voor acute RTIs, en van asymptomatische kinderen tijdens de winter van 2002–2003 in Canada. HBoV werd gedetecteerd in NPAs van 1 (0,8%) van de 126 symptomatische volwassenen, 31 (13,8%) van de 225 symptomatische kinderen, en 43 (43%) van de 100 asymptomatische kinderen die een electieve operatie ondergingen. Een ander virus werd gedetecteerd in 22 (71%) van de 31 HBoV-positieve NPAs van symptomatische kinderen. Twee clades van HBoV werden geïdentificeerd. De pathogene rol van HBoV bij RTIs is onzeker omdat het frequent werd gedetecteerd bij symptomatische en asymptomatische kinderen en vaak werd gevonden samen met andere virussen bij symptomatische kinderen.
|
Humane Bocavirusinfecties bij Gehospitaliseerde Kinderen en Volwassenen
|
qww6pe61
|
We hebben onderzocht hoe verschillende sociaaleconomische en raciale/etnische groepen in de Verenigde Staten het zouden kunnen doen tijdens een influenza-pandemie, op basis van sociale factoren die de blootstelling, kwetsbaarheid voor het influenzavirus en de tijdigheid en adequaatheid van de behandeling beïnvloeden. We bespreken beleidsmaatregelen die de kans op ziekte of overlijden bij verschillende sociale groepen differentieel zouden kunnen beïnvloeden. Ons doel is niet om de precieze omvang van de waarschijnlijk optredende ongelijkheden vast te stellen; het is veeleer om de aandacht te vestigen op vermijdbare ongelijkheden die te verwachten zijn bij gebrek aan systematische aandacht voor differentiële sociale risico's in plannen voor de voorbereiding op een pandemie. Beleidsmakers op federaal, staats- en lokaal niveau moeten rekening houden met potentiële bronnen van sociaaleconomische en raciale/etnische ongelijkheden tijdens een pandemie en specifieke plannen formuleren om deze ongelijkheden te minimaliseren.
|
Pandemische Influenza-planning in de Verenigde Staten vanuit het perspectief van gezondheidsverschillen
|
0wx6yoo8
|
Conflict en Nieuwe Infectieziekten
|
|
av0wlbua
|
Wereldwijde surveillance van een nieuw rhinovirusgenotype wees uit dat het geassocieerd is met gemeenschapsuitbraken en pediatrische luchtwegaandoeningen in Afrika, Azië, Australië, Europa en Noord-Amerika. Moleculaire datering wijst erop dat deze virussen al minstens 250 jaar circuleren.
|
Globale verspreiding van een nieuw rhinovirusgenotype
|
iar66keo
|
Uitgebreide projecten voor het in kaart brengen van eiwitinteracties zijn aan de gang voor veel modelsoorten en de mens. Een belangrijke stap in deze projecten is het schatten van de tijd, kosten en personeel die nodig zijn om een accurate en complete kaart te verkrijgen. Hier modelleren we de kosten van het voltooien van een interactiekaart binnen een spectrum van experimentele ontwerpen. We laten zien dat huidige inspanningen tot wel 20 onafhankelijke tests per eiwitpaar kunnen vereisen om de voltooiing te benaderen. We onderzoeken ontwerpen om deze kosten aanzienlijk te verlagen, waaronder prioritering van eiwitparen, probabilistische drempelwaarden en interactievoorspelling. De beste ontwerpen verlagen de kosten over het geheel genomen met een factor vier en >100-voudig in de vroege stadia van het in kaart brengen. We demonstreren de beste strategie in een lopend project in Drosophila, waarin we 450 interacties met een hoog vertrouwen in kaart brengen met behulp van 47 microtiterplaten, tegenover duizenden platen die verwacht werden met behulp van huidige ontwerpen. Deze studie biedt een raamwerk voor het beoordelen van de haalbaarheid van projecten voor het in kaart brengen van interacties en voor toekomstige inspanningen om hun efficiëntie te verhogen.
|
Kosteneffectieve strategieën voor het voltooien van het Interactoom
|
elhp6rx6
|
ACHTERGROND: Influenza pneumonie veroorzaakt elk jaar een hoge mortaliteit, en pandemieën doden miljoenen mensen. Mortaliteit gerelateerd aan influenza is verschillend toegeschreven aan een ineffectieve respons van de gastheer die er niet in slaagt virale replicatie te beperken, een excessieve inflammatoire respons van de gastheer die resulteert in longbeschadiging en verslechtering van de gasuitwisseling, of aan een bacteriële superinfectie. We wilden vaststellen of longontsteking de overleving van de gastheer bevorderde of aantastte bij influenza pneumonie. METHODEN EN RESULTATEN: Om onderscheid te maken tussen deze mogelijke oorzaken van influenza-gerelateerde sterfte, induceerden we een robuuste longontsteking door muizen bloot te stellen aan een geaerosoliseerd bacterieel lysaat voorafgaand aan uitdaging met levend virus. De behandeling induceerde de expressie van de inflammatoire cytokines IL-6 en TNF in bronchoalveolaire lavagevloeistof respectievelijk 8- en 40-voudig groter dan die veroorzaakt door een letale influenza-infectie. Toch was deze versterkte ontsteking geassocieerd met een opvallende resistentie tegen mortaliteit van de gastheer (0% versus 90% overleving, p = 0,0001) en verlaagde virustitels (p = 0,004). Bacteriële superinfectie van met virus geïnfecteerde longen werd niet waargenomen. Toen muizen herhaaldelijk werden blootgesteld aan het bacteriële lysaat, zoals klinisch wenselijk zou zijn tijdens een influenza-epidemie, was er geen tachyfylaxie van de geïnduceerde virale resistentie. Toen het bacteriële lysaat werd toegediend na de virale uitdaging, was er nog steeds een zekere mortaliteitsverbetering, en toen ribavirine werd toegevoegd aan het geaerosoliseerde bacteriële lysaat, werd de overleving van de gastheer synergistisch verbeterd (0% versus 93,3% overleving, p < 0,0001). CONCLUSIES: Samen wijzen deze gegevens erop dat aangeboren immuunresistentie tegen influenza effectief kan worden gestimuleerd, en suggereren dat ineffectieve in plaats van excessieve ontsteking de belangrijkste oorzaak is van mortaliteit bij influenza pneumonie.
|
Versterkte Longontsteking Beschermt tegen Influenza A Pneumonie
|
xu9llz9u
|
Longkanker is wereldwijd de belangrijkste oorzaak van kankergerelateerde sterfte. Het gebrek aan tumorspecificiteit blijft een groot nadeel voor effectieve chemotherapieën en resulteert in dosisbeperkende toxiciteit. Een ligand-gemedieerd geneesmiddelafgiftesysteem zou echter chemotherapie specifieker voor tumorcellen en minder toxisch voor normale weefsels moeten kunnen maken. In deze studie isoleerden we een nieuwe peptideligand uit een phage-displayed peptidebibliotheek die bindt aan longkankercellijnen (NSCLC). De targetende faag bond aan verschillende NSCLC-cellijnen, maar niet aan normale cellen. Zowel de targetende faag als het synthetische peptide herkenden de chirurgische specimens van NSCLC met een positief percentage van 75% (27 van de 36 specimens). In muizen met severe combined immunodeficiency (SCID) met NSCLC-xenograften bond de targetende faag specifiek aan tumormassa's. Het tumor-homing vermogen van de targetende faag werd geremd door het cognate synthetische peptide, maar niet door een controle- of een WTY-gemuteerd peptide. Toen het targetende peptide werd gekoppeld aan liposomen met doxorubicine of vinorelbine, nam de therapeutische index van de chemotherapeutische middelen en de overlevingspercentages van muizen met humane longkankerxenograften aanzienlijk toe. Bovendien verhoogden de targetende liposomen de geneesmiddelaccumulatie in tumorgeweefsel met 5,7 keer in vergelijking met vrije geneesmiddelen en verbeterden ze de apoptose van kankercellen als gevolg van een hogere concentratie biobeschikbare doxorubicine. De huidige studie suggereert dat dit tumorspecifieke peptide kan worden gebruikt om chemotherapieën te creëren die specifiek gericht zijn op tumorcellen bij de behandeling van NSCLC en om gerichte genoverdrachtsvectoren te ontwerpen, of het kan worden gebruikt bij de diagnose van deze kwaadaardige aandoening.
|
Een nieuwe peptide verbetert de therapeutische werkzaamheid van liposomale anti-kankermedicijnen in muismodellen van humane longkanker
|
osioowtp
|
ACHTERGROND: Er is weinig bekend over de immunopathogenese van het Chikungunyavirus. De circulerende niveaus van immuunmediatoren en groeifactoren werden geanalyseerd bij patiënten die tijdens de eerste uitbraak van Chikungunyakoorts in Singapore begin 2008 geïnfecteerd raakten, om biomarkers te identificeren die geassocieerd zijn met infectie en/of de ernst van de ziekte. METHODEN EN RESULTATEN: Volwassen patiënten met een laboratoriumbevestigde Chikungunyakoortsinfectie, die tussen januari en februari 2008 werden verwezen naar het Communicable Disease Centre/Tan Tock Seng Hospital, werden opgenomen in deze retrospectieve studie. Plasmafracties werden geanalyseerd met behulp van een multiplex-microbead immunoassay. De meest voorkomende klinische kenmerken bij de patiënten waren koorts (100%), arthralgie (90%), huiduitslag (50%) en conjunctivitis (40%). Profielen van 30 cytokinen, chemokines en groeifactoren konden de klinische vormen van Chikungunya onderscheiden van gezonde controles, waarbij patiënten werden ingedeeld als niet-ernstige en ernstige ziekte. De niveaus van 8 plasmacytokinen en 4 groeifactoren waren significant verhoogd. Statistische analyse toonde aan dat een toename van IL-1β, IL-6 en een afname van RANTES geassocieerd waren met de ernst van de ziekte. CONCLUSIES: Dit is het eerste uitgebreide rapport over de productie van cytokinen, chemokines en groeifactoren tijdens een acute Chikungunyavirusinfectie. Met behulp van deze biomarkers konden we onderscheid maken tussen milde en ernstigere vormen van Chikungunyakoorts, waardoor de identificatie van patiënten met een slechte prognose en de monitoring van de ziekte mogelijk werd.
|
IL-1β, IL-6 en RANTES als Biomarkers voor de Ernst van Chikungunya
|
ciuhyhb8
|
Aviaire influenza is uitgegroeid tot een van de belangrijkste zorgen voor de volksgezondheid in de 21e eeuw. Het influenzavirus H5N1 kan incidenteel mensen en andere zoogdieren infecteren. Sinds hun heropkomst in 2003 zijn hoogpathogene aviaire influenza A (H5N1)-virussen overgedragen van pluimvee naar mensen (door direct of indirect contact met geïnfecteerde vogels) in verschillende provincies van het vasteland van China, wat heeft geleid tot 22 gevallen van menselijke infectie en gevolgen heeft gehad voor de Chinese economie. Mensen maken zich zorgen of zich in de toekomst een nieuwe pandemie zal voordoen. De uitroeiing van pathogene aviaire influenzavirussen lijkt de meest effectieve manier te zijn om een influenzapandemie te voorkomen. Dit artikel zal de kenmerken van H5N1 onderzoeken, waaronder incidentie, infectie, immuniteit, klinisch management, preventie en controle, en therapie in het vasteland van China.
|
Aviaire Influenza: Moet China Zich Alarmist Opstellen?
|
928pkpv2
|
Rift Valley koortsvirus (RVFV) (genus Phlebovirus, familie Bunyaviridae) is een RNA-virus met een negatieve streng en een driedelig genoom. RVFV wordt overgedragen door muggen en veroorzaakt koorts en ernstige hemorragische ziekte bij mensen, en koorts en hoge abortuspercentages bij vee. Een niet-structureel RVFV NSs-eiwit remt de transcriptie van mRNA's van de gastheer, waaronder interferon-β mRNA, en is een belangrijke virulentiefactor. De huidige studie onderzocht een nieuwe functie van het RVFV NSs-eiwit door de replicatie van RVFV zonder het NSs-gen te testen in de aanwezigheid van actinomycine D (ActD) of α-amanitine, die beide dienden als een surrogaat van de functie van de NSs voor het onderdrukken van de mRNA-synthese van de gastheer. In de aanwezigheid van de transcriptieremmers van de gastheer induceerde de replicatie van RVFV zonder het NSs-eiwit, maar niet die met NSs, door dubbelstrengs RNA-afhankelijk proteïnekinase (PKR) gemedieerde eukaryotische initiatiefactor (eIF)2α-fosforylering, wat leidde tot de onderdrukking van de translatie van eiwitten van de gastheer en het virus. RVFV NSs bevorderde de post-transcriptionele downregulatie van PKR vroeg in het verloop van de infectie en onderdrukte de accumulatie van gefosforyleerd eIF2α. Deze gegevens suggereerden dat een combinatie van RVFV-replicatie en door NSs geïnduceerde onderdrukking van de gastheertranscriptie PKR-gemedieerde eIF2α-fosforylering induceert, terwijl de NSs efficiënte virale translatie vergemakkelijkt door PKR te downreguleren en PKR-gemedieerde eIF2α-fosforylering te remmen. De twee verschillende functies van de NSs, d.w.z. de onderdrukking van de gastheertranscriptie, inclusief die van type I interferon mRNA's, en de downregulatie van PKR, werken samen om de aangeboren antivirale functies van de gastheer te voorkomen, waardoor efficiënte replicatie en overleving van RVFV in geïnfecteerde zoogdiergastheren mogelijk is.
|
Rift Valley koortsvirus NSs-eiwit bevordert post-transcriptionele downregulatie van proteïnekinase PKR en remt eIF2α-fosforylering
|
87yq2317
|
Van juli 2006 tot augustus 2007 werd in centraal Thailand een surveillanceprogramma voor influenza A-virussen (H5N1) uitgevoerd in levende-vogelmarkten en voedselmarkten. Twaalf virussen van het subtype H5N1 werden geïsoleerd. De in de markten circulerende virussen van het subtype H5N1 waren genetisch verwant aan die welke in Thailand circuleerden tijdens 2004–2005.
|
Influenzavirus (H5N1) in levende-vogelmarkten en voedselmarkten, Thailand
|
k2glr4pd
|
ACHTERGROND: Acht medicinale planten werden getest op hun antimicrobiële en antioxidante activiteiten. Verschillende extractiemethoden werden ook getest op hun effecten op de bioactiviteiten van de medicinale planten. METHODEN: Acht planten, namelijk Herba Polygonis Hydropiperis (Laliaocao), Folium Murraya Koenigii (Jialiye), Rhizoma Arachis Hypogea (Huashenggen), Herba Houttuyniae (Yuxingcao), Epipremnum pinnatum (Pashulong), Rhizoma Typhonium Flagelliforme (Laoshuyu), Cortex Magnoliae Officinalis (Houpo) en Rhizoma Imperatae (Baimaogen) werden onderzocht op hun potentiële antimicrobiële en antioxidante eigenschappen. RESULTATEN: Extracten van Cortex Magnoliae Officinalis vertoonden de sterkste activiteiten tegen M. Smegmatis, C. albicans, B. subtilis en S. aureus. Gekookte extracten van Cortex Magnoliae Officinalis, Folium Murraya Koenigii, Herba Polygonis Hydropiperis en Herba Houttuyniae vertoonden grotere antioxidante activiteiten dan andere geteste medicinale planten. CONCLUSIE: Van de acht geteste medicinale planten vertoonde Cortex Magnoliae Officinalis de hoogste antimicrobiële en antioxidante activiteiten. Verschillende extractiemethoden leveren verschillende spectra van bioactiviteiten op.
|
Antimicrobiële en antioxidante activiteiten van Cortex Magnoliae Officinalis en enkele andere medicinale planten die veel worden gebruikt in Zuidoost-Azië
|
jzwcy7dr
|
Achtergrond: Herpesvirussen kunnen ontstekingen in het centrale zenuwstelsel veroorzaken die zich kunnen manifesteren met symptomen die niet te onderscheiden zijn van schizofrenie en zijn daarom interessant voor schizofrenieonderzoek. De meeste bestaande studies naar herpesvirussen hebben kleine populaties en postdiagnostische specimens gebruikt. Als onderdeel van een groter onderzoeksprogramma hebben we een hypothesegenererende case-control studie uitgevoerd naar geselecteerde herpesvirusantilichamen bij individuen die uit het Amerikaanse leger zijn ontslagen met schizofrenie en pre- en postdiagnostische sera. Methoden: Casussen (n = 180) waren militairen die werden opgenomen in een ziekenhuis en ontslagen uit militaire dienst met schizofrenie. Controles, 3:1 gematcht op verschillende factoren, waren leden die niet werden ontslagen. Het leger verzamelt en bewaart routinematig serumspecimens van leden. We gebruikten een microplate enzyme immunoassay om de niveaus van immunoglobuline G (IgG) antilichamen tegen 6 herpesvirussen te meten in pre- en postdiagnostische specimens. Conditionele logistische regressie werd gebruikt, en de maat voor associatie was de hazard ratio (HR). Resultaten: Over het algemeen vonden we een significante associatie tussen het humane herpesvirus type 6 en schizofrenie, met een HR van 1,17 (95% betrouwbaarheidsinterval [BI] = 1,04, 1,32). Vrouwen en zwarten vertoonden significante negatieve associaties met herpes simplex virus type 2 en cytomegalovirus; onder zwarten was er een significante positieve associatie met herpes simplex virus type 1. Onder mannen was er een HHV-6 tijdelijk effect met een HR van 1,41 (95% BI = 1,02, 1,96) voor sera die 6-12 maanden vóór de diagnose werden afgenomen. Discussie: De bevindingen van eerdere studies naar herpesvirussen en schizofrenie zijn inconsistent geweest. Onze studie is gebaseerd op een grotere populatie dan de meeste eerdere studies en gebruikte serumspecimens die werden verzameld vóór het begin van de ziekte. Deze studie voegt toe aan de kennis en levert testbare hypothesen voor vervolgstudies.
|
Resultaten van een hypothesegenererende case-control studie: Herpesvirussen en schizofrenie onder militairen
|
e1sfuv1n
|
SARS-CoV: Lessen voor de mondiale gezondheid
|
|
9mma6rva
|
Autoritatieve overheidsvoorbereiding op een pandemie vereist een op bewijs gebaseerde aanpak. Het wetenschappelijke adviesproces dat de huidige Britse plannen voor de voorbereiding op een pandemie heeft geïnformeerd, wordt beschreven. De definitief goedgekeurde wetenschappelijke publicaties zijn nu openbaar beschikbaar.
|
Wetenschap naar beleid: voorbereiding op een pandemie van influenza
|
e666nvl3
|
Seizoensvariatie in pokkenoverdracht is een van de meest dringende ecologische vragen en is relevant voor de voorbereiding op bioterrorisme. In deze studie werden 7 historische datasets opnieuw geanalyseerd die maandelijkse gevallen of sterfgevallen registreerden. Naast tijdreeksanalyses van gerapporteerde gegevens, werd een schatting en spectrale analyse gemaakt van het effectieve reproductiegetal op kalendertijd t, R(t). Meteorologische variabelen werden geëxtraheerd uit een rapport in India uit 1890–1921 en vergeleken met pokkensterfte en R(t). Jaarlijkse cycli van pokkenoverdracht werden duidelijk aangetoond, niet alleen in maandelijkse rapporten, maar ook in de schattingen van R(t). Zelfs kortetermijn epidemiegegevens vertoonden duidelijk een jaarlijkse piek elke januari. Zowel mortaliteit als R(t) vertoonden een significante negatieve associatie (P < .01) en correlatie (P < .01) respectievelijk met vochtigheid. Deze bevindingen suggereren dat pokkenoverdracht sterk varieert met het seizoen en hoogstwaarschijnlijk wordt versterkt door droog weer.
|
Pokken en Seizoen: Heranalyse van Historische Gegevens
|
akvhi38e
|
Chinese tijdschriften op het gebied van epidemiologie, preventieve geneeskunde en volksgezondheid bevatten veel informatie die van potentieel internationaal belang is. Echter, weinig niet-Chinees sprekers zijn bekend met deze literatuur. Dit artikel geeft daarom een overzicht van de huidige situatie in de Chinese biomedische tijdschriftpublicatie, Chinese bibliografische databases en Chinese tijdschriften op het gebied van epidemiologie, preventieve geneeskunde en volksgezondheid. De uitdaging van de overstap naar Engels als publicatiemedium, de ontwikkeling van het publiceren van bibliometrische gegevens uit Chinese databases, het vooruitzicht van een Open Access publicatiemodel in China, de kwestie van taalbias in literatuuroverzichten en de kwaliteit van Chinese tijdschriften worden besproken. Epidemiologen worden aangemoedigd om de Chinese bibliografische databases te doorzoeken naar artikelen uit Chinese tijdschriften.
|
Chinese tijdschriften: een gids voor epidemiologen
|
ecey1cyz
|
Laribacter hongkongensis is een recent ontdekte Gram-negatieve bacil uit de familie Neisseriaceae, geassocieerd met zoetwater vis-gebonden gastroenteritis en reizigersdiarree. De complete genoomsequentie van L. hongkongensis HLHK9, verkregen van een immuuncompetente patiënt met ernstige gastroenteritis, bestaat uit een 3.169 kb chromosoom met een G+C-gehalte van 62,35%. Genoomanalyse onthult verschillende mechanismen die potentieel belangrijk zijn voor de aanpassing aan diverse habitats van menselijke en zoetwatervisdarmen en zoetwateromgevingen. De geninhoud ondersteunt de fenotypische eigenschappen en suggereert dat aminozuren en vetzuren kunnen worden gebruikt als koolstofbronnen. De uitgebreide variëteit aan transporteiwitten, waaronder multidrug efflux- en zware metalen transporteiwitten, evenals genen betrokken bij chemotaxis, kunnen L. hongkongensis in staat stellen te overleven in verschillende ecologische niches. Genen die urease, galzouten effluxpomp, adhesie, catalase, superoxide dismutase en andere putatieve virulentiefactoren coderen – zoals hemolysinen, RTX-toxinen, patatine-achtige eiwitten, fosfolipase A1 en collagenasen – zijn aanwezig. Proteomen van L. hongkongensis HLHK9 gekweekt bij 37°C (menselijke lichaamstemperatuur) en 20°C (zoetwaterhabitattemperatuur) vertoonden differentiële genexpressie, waaronder twee homologe kopieën van argB, argB-20 en argB-37, die twee isoenzymen van N-acetyl-L-glutamaat kinase (NAGK) coderen – NAGK-20 en NAGK-37 – in het arginine biosynthesepad. NAGK-20 vertoonde een hogere expressie bij 20°C, terwijl NAGK-37 een hogere expressie vertoonde bij 37°C. NAGK-20 had ook een lagere optimale temperatuur voor enzymatische activiteiten en werd geremd door arginine, waarschijnlijk als negatieve terugkoppeling. Vergelijkbare gedupliceerde kopieën van argB worden ook waargenomen in bacteriën uit warme bronnen zoals Thermus thermophilus, Deinococcus geothermalis, Deinococcus radiodurans en Roseiflexus castenholzii, wat suggereert dat vergelijkbare mechanismen voor temperatuuraanpassing door andere bacteriën kunnen worden gebruikt. Genoom- en proteoomanalyse van L. hongkongensis onthulde nieuwe mechanismen voor aanpassing aan overleving bij verschillende temperaturen en habitats.
|
Het complete genoom en proteoom van Laribacter hongkongensis onthullen potentiële mechanismen voor aanpassing aan verschillende temperaturen en habitats
|
cpu38ryy
|
Maligne mesothelioom is een fatale, aan asbest gerelateerde kwaadaardige tumor die ontstaat uit de bekledingscellen (mesothelium) van de pleurale en peritoneale holten, evenals het pericardium en de tunica vaginalis. De exacte prevalentie is onbekend, maar naar schatting vertegenwoordigen mesotheliomen minder dan 1% van alle kankersoorten. De incidentie neemt toe, met een verwachte piek in de komende 10–20 jaar. Pleuraal maligne mesothelioom is de meest voorkomende vorm van mesothelioom. Typische eerste verschijnselen zijn borstpijn en kortademigheid. Kortademigheid door een pleuravocht zonder borstpijn wordt bij ongeveer 30% van de patiënten gemeld. Een borstwandtumor, gewichtsverlies, zweten, buikpijn en ascites (door peritoneale betrokkenheid) komen minder vaak voor. Mesothelioom is direct toe te schrijven aan beroepsmatige blootstelling aan asbest, met een blootstellingsgeschiedenis in meer dan 90% van de gevallen. Er is ook bewijs dat mesothelioom kan voortkomen uit zowel para-beroepsmatige blootstelling als niet-beroepsmatige "omgevings"-blootstelling. Idiopathisch of spontaan mesothelioom kan ook voorkomen zonder enige blootstelling aan asbest, met een spontane frequentie bij mensen van ongeveer één per miljoen. Een combinatie van een nauwkeurige blootstellingsgeschiedenis, samen met beeldvormend onderzoek en pathologie, is essentieel voor het stellen van de diagnose. Het onderscheiden van maligne van benigne pleurale aandoeningen kan een uitdaging zijn. De meest behulpzame CT-bevindingen die wijzen op maligne pleurale aandoeningen zijn 1) een circumferentiële pleurale schil, 2) nodulaire pleurale verdikking, 3) pleurale verdikking van > 1 cm en 4) mediastinale pleurale betrokkenheid. Betrokkenheid van een multidisciplinair team wordt aanbevolen om een snelle en adequate behandeling te garanderen, met behulp van een raamwerk van radiotherapie, chemotherapie, chirurgie en symptoomverlichting met palliatieve zorg aan het einde van het leven. Vergoedingskwesties moeten ook worden overwogen. De levensverwachting bij maligne mesothelioom is slecht, met een mediane overleving van ongeveer één jaar na de diagnose.
|
Maligne mesothelioom
|
87mjdccj
|
ACHTERGROND: De verwachte omvang van het gebruik van antivirale middelen tijdens een influenza-pandemie kan nadelige gevolgen hebben voor de ontwikkeling van resistentie tegen geneesmiddelen en het rantsoeneren van beperkte voorraden. Het strategische gebruik van geneesmiddelen is daarom een belangrijke zorg voor de volksgezondheid bij de planning van effectieve responsen op pandemieën. METHODEN: We gebruikten een wiskundig model dat zowel gevoelige als resistente stammen van een virus met pandemiepotentieel omvat en antivirale geneesmiddelen toepast voor de behandeling van klinische infecties. Met behulp van geschatte parameters in de gepubliceerde literatuur werd het model gesimuleerd voor verschillende voorraadgroottes om het resultaat van verschillende antivirale strategieën te evalueren. RESULTATEN: We hebben aangetoond dat het ontstaan van sterk overdraagbare resistente stammen geen significante impact heeft op het gebruik van beschikbare voorraden als de behandeling op een laag niveau wordt gehandhaafd of het reproductiegetal van de gevoelige stam voldoende hoog is. Matige tot hoge behandelingsniveaus kunnen echter leiden tot een snellere uitputting van de voorraden, wat leidt tot uitputting, door de verspreiding van resistentie tegen geneesmiddelen te bevorderen. We pasten een antivirale strategie toe die het begin van agressieve behandeling vertraagt gedurende een bepaalde tijd na het begin van de uitbraak. Onze resultaten tonen aan dat als te vroeg in de uitbraak hoge behandelingsniveaus worden afgedwongen, een tweede golf van infecties kan optreden met een aanzienlijk grotere omvang. Een tijdige implementatie van grootschalige behandeling kan echter de verspreiding van resistentie in de populatie voorkomen en de uiteindelijke omvang van de pandemie minimaliseren. CONCLUSIE: Onze resultaten onthullen dat conservatieve behandelingsniveaus in de vroege stadia van de uitbraak, gevolgd door een tijdige verhoging van de schaal van medicijngebruik, een effectieve strategie zullen bieden om resistentie tegen geneesmiddelen in de populatie te beheersen en uitputting te voorkomen. Voor een stam zoals die van 1918 suggereren de bevindingen dat pandemieplannen rekening moeten houden met het opslaan van antivirale geneesmiddelen om ten minste 20% van de bevolking te dekken.
|
Antivirale resistentie tijdens een pandemie van influenza: implicaties voor opslag en medicijngebruik
|
yp1s77ez
|
Hondsdolheid is uitgeroeid bij de populaties huishonden in West-Europa en Noord-Amerika, maar doodt nog steeds elk jaar vele duizenden mensen in Afrika en Azië. Een kwantitatief begrip van de transmissiedynamiek in populaties huishonden levert essentiële informatie op om te beoordelen of wereldwijde eliminatie van hondsdolheid bij honden mogelijk is. We rapporteren uitgebreide observaties van individuele rabiësdieren in Tanzania en genereren een uniek gedetailleerde analyse van de transmissie biologie, die belangrijke epidemiologische kenmerken verklaart, inclusief het niveau van variatie in epidemische trajecten. We ontdekten dat het basis reproductiegetal voor hondsdolheid, R(0), zeer laag is in ons onderzoeksgebied in landelijk Afrika (∼1,2) en in zijn historische globale verspreidingsgebied (<2). Deze bevinding levert sterke ondersteuning voor de haalbaarheid van het beheersen van endemische hondsdolheid bij honden door vaccinatie, zelfs in de buurt van natuurgebieden met grote populaties wilde carnivoren. We laten echter zien dat een snelle omzetting van populaties huishonden een grote hindernis is geweest voor succesvolle beheersing in ontwikkelingslanden, dus regelmatige puls vaccinaties zullen nodig zijn om immuniteit op populatieniveau te handhaven tussen campagnes. Niettemin suggereren onze analyses dat met een aanhoudende, internationale inzet, wereldwijde eliminatie van hondsdolheid bij huishonden, de gevaarlijkste vector voor mensen, een realistisch doel is.
|
Transmissiedynamiek en vooruitzichten voor de eliminatie van hondsdolheid bij honden
|
rl7sdzd7
|
ACHTERGROND: De meest voorkomende methode voor GGO-detectie is gebaseerd op de amplificatie van GGO-specifieke DNA-amplicons met behulp van de polymerasekettingreactie (PCR). Hier hebben we de loop-mediated isothermal amplification (LAMP)-methode toegepast om GGO-gerelateerde DNA-sequenties te amplificeren, 'interne' veelgebruikte motieven voor het controleren van transgene expressie en event-specifieke (plant-transgeen) juncties. RESULTATEN: We hebben de specificiteit en gevoeligheid van de techniek voor gebruik in GGO-studies getest. Resultaten tonen aan dat detectie van 0,01% GGO in equivalent achtergrond-DNA mogelijk was en verdunningen van het template suggereren dat detectie vanuit enkele kopieën van het template mogelijk kan zijn met behulp van LAMP. CONCLUSIE: Dit werk toont aan dat GGO-detectie kan worden uitgevoerd met behulp van LAMP voor routinematige screening, evenals voor detectie van specifieke events. Bovendien benadrukt de hier gedemonstreerde gevoeligheid en het vermogen om targets te amplificeren, zelfs met een hoge achtergrond van DNA, de voordelen van deze isotherme amplificatie bij toepassing voor GGO-detectie.
|
Detectie van genetisch gemodificeerde organismen (GGO's) met behulp van isotherme amplificatie van doel-DNA-sequenties
|
tfcerilc
|
ACHTERGROND: Aanhoudende uitbraken van hoogpathogene aviaire influenza (HPAI) H5N1 bij vogelsoorten verhogen het risico op reassortment en aanpassing aan de mens. De mogelijkheid om de verspreiding ervan bij kippen in te dammen, zou deze dreiging verminderen en helpen het vermogen tot op eieren gebaseerde vaccinproductie te behouden. Hoewel vaccins de mogelijkheid bieden om aviaire ziekten te beheersen, is een belangrijke zorg bij huidige vaccins hun potentie en onvermogen om te beschermen tegen evoluerende aviaire influenzavirussen. METHODOLOGIE/BELANGRIJKSTE RESULTATEN: Het vermogen van DNA-vaccins die hemagglutinine (HA)-eiwitten coderen van verschillende HPAI H5N1-serotypen werd geëvalueerd op hun vermogen om neutraliserende antilichamen op te wekken en te beschermen tegen homologe en heterologe HPAI H5N1-stamuitdaging bij muizen en kippen na DNA-immunisatie met naald en spuit of met een druk-injectieapparaat. Deze vaccins riepen antilichamen op die meerdere stammen van HPAI H5N1 neutraliseerden wanneer ze werden toegediend in combinaties met maximaal 10 HA's. De respons was dosisafhankelijk, en de breedte werd bepaald door de keuze van het influenzavirus HA in het vaccin. Monovalente en trivalente HA-vaccins werden eerst bij muizen getest en verleenden bescherming tegen dodelijke H5N1 A/Vietnam/1203/2004-uitdaging 68 weken na vaccinatie. Bij kippen werd bescherming waargenomen tegen heterologe stammen van HPAI H5N1 na vaccinatie met een trivalent H5-serotype DNA-vaccin met doses zo laag als 5 µg DNA, tweemaal toegediend, hetzij door intramusculaire naaldinjectie, hetzij met een naaldloos apparaat. CONCLUSIES/SIGNIFICANTIE: DNA-vaccins bieden een generieke aanpak voor influenzavirus-immunisatie die van toepassing is op meerdere diersoorten. Bovendien maakt het vermogen om plasmiden te vervangen die verschillende stammen coderen een snelle aanpassing van het vaccin aan nieuw evoluerende veldisolaten mogelijk.
|
Multivalent HA DNA-vaccinatie beschermt tegen hoogpathogene H5N1-vogelgriepinfectie bij kippen en muizen
|
ftjnw3an
|
Een komkommergroenmozaïekvirus (CGMMV) werd gebruikt om een getrunceerd denguevirus type 2 envelop (E) eiwitbindingsgebied van aminozuren 379 tot 423 (EB4) te presenteren. Het EB4-gen werd ingebracht aan het terminale uiteinde van het open leesframe (ORF) van het CGMMV-coatproteïne (CP). Read-through sequenties van TMV of CGMMV, CAA-UAG-CAA-UUA, of AAA-UAG-CAA-UUA werden respectievelijk ingebracht tussen de CP- en de EB4-genen. De chimere klonen, pRT, pRG, en pCG+FSRTRE, werden getranscribeerd in full-length gecapte recombinante CGMMV-transcripten. Alleen constructen met de wild-type CGMMV read-through sequentie leverden infectieuze virussen op na infectie van de waardplant, muskmelon (Cucumis melo) bladeren. De verhouding van gemodificeerd tot ongemodificeerd CP voor de ontwikkelde read-through expressiekloon bleek ook ongeveer 1:1 te zijn, hoger dan eerder gerapporteerd. Er werd ook waargenomen dat de infectiviteit niet werd beïnvloed door verschillen in pI tussen de chimera en zijn wilde tegenhanger. Analyse van recombinante virussen na 21 dagen post-inoculatie (dpi) toonde aan dat deleties optraden die resulteerden in gedeeltelijke reversies van de virale populatie naar bijna wild type en suggereerden dat dit de beperkende oogstperiode zou zijn voor het verkrijgen van recombinanten die trouw zijn aan het type met dit construct.
|
Virusspecifieke read-through codon-preferentie beïnvloedt de infectiviteit van chimere komkommergroenmozaïekvirussen die een denguevirus-epitoop vertonen
|
t7004uw2
|
Controle van norovirusuitbraken is afhankelijk van versterkte hygiënemaatregelen, zoals handhygiëne, oppervlakte-reiniging, het gebruik van papieren handdoekjes en het gebruik van aparte toiletten voor zieke en gezonde personen. Er is echter weinig bekend over de effectiviteit ervan bij het beperken van verdere verspreiding van norovirusinfecties. We analyseerden norovirusuitbraken in 7 kampen op een internationale scouting jamboree in Nederland in 2004. De implementatie van hygiënemaatregelen viel samen met een reductie van 84,8% (95% voorspellend interval 81,2%–86,6%) in het reproductiegetal. Deze reductie was onverwacht groot, maar nog steeds lager dan de reductie die nodig is om een norovirusuitbraak te beteugelen. Nog strengere controlemaatregelen zijn nodig om de overdrachtsketen van norovirus te doorbreken.
|
Versterkte Hygiënemaatregelen en Norovirusoverdracht tijdens een Uitbraak
|
3tt99oax
|
De polyomavirussen KI (KIPyV) en WU (WUPyV) zijn recent geïdentificeerd, voornamelijk in ademhalingsmonsters van kinderen. Onder 200 patiënten met ademhalingsaandoeningen die werden opgenomen in het Hôpital Saint-Louis, Parijs, Frankrijk, werd KIPyV bij 8% en WUPyV bij 1% gedetecteerd. KIPyV kwam significant vaker voor bij patiënten met een humane stamceltransplantatie (17,8% versus 5,1%; p = 0,01).
|
Polyomavirussen KI en WU bij immuungecompromitteerde patiënten met ademhalingsaandoeningen
|
niii78fr
|
Surfactant Proteïne-A (SP-A) is het meest prominente van de vier eiwitten in het pulmonaire surfactant-systeem. SP-A wordt geëxprimeerd door alveolaire epitheelcellen type II, evenals door een deel van niet-kleincellige longcarcinomen (NSCLC). De expressie van SP-A wordt complex gereguleerd op transcriptioneel en chromosomaal niveau. SP-A is een belangrijke speler in het pulmonaire cytokine-netwerk en is bovendien beschreven als een factor in de pulmonaire afweer. Aan de hand van celkweek of diermodellen zijn de functionele eigenschappen herhaaldelijk in vele aspecten aangetoond, vaak met verrassende eigenschappen die sterk wijzen op het fysiologisch belang van SP-A. Tot op heden wordt SP-A erkend als een essentiële molecule voor de pulmonaire ontwikkeling, structuur en functie. Een groeiend aantal rapporten behandelt de rol van SP-A bij pulmonaire pathologie. Dit artikel geeft een overzicht van de huidige kennis over SP-A, gericht op toepassingen bij menselijke pulmonaire aandoeningen, en wijst op het belang van pathologie-georiënteerde onderzoeksbenaderingen met behulp van immunohistochemie of in situ hybridisatie als veelbelovende methoden om de rol van dit molecuul bij longziekten bij volwassenen verder te verduidelijken.
|
Over de betekenis van Surfactant Proteïne-A in de menselijke longen
|
vg57cnqw
|
Fytosulfokines (PSKs) zijn uitgescheiden, gesulfateerde peptidehormonen afgeleid van grotere prepropeptide-precursoren. Proteolytische processing van een van de precursoren, AtPSK4, werd aangetoond door splitsing van een preproAtPSK4–myc transgeen product tot AtPSK4–myc. Splitsing van proAtPSK4 werd geïnduceerd door wortelekplanten in weefselkweek te plaatsen. De processing van proAtPSK4 was afhankelijk van AtSBT1.1, een subtilisine-achtig serine protease, gecodeerd door een van de 56 subtilasegenen in Arabidopsis. Het gen dat codeert voor AtSBT1.1 werd gereguleerd na de overdracht van wortelekplanten naar weefselkweek, wat suggereert dat de activering van het proteolytische mechanisme dat proAtPSK4 splitst afhankelijk is van AtSBT1.1 expressie. We toonden ook aan dat een fluorogene peptide die de putatieve subtilase-herkenningsplaats in proAtPSK4 vertegenwoordigt in vitro wordt gesplitst door affiniteitsgezuiverd AtSBT1.1. Een alanine scan door het herkenningsplaatspeptide gaf aan dat AtSBT1.1 vrij specifiek is voor de AtPSK4-precursor. Dus, deze peptide groeifactor, die callusvorming in kweek bevordert, wordt proteolytisch gesplitst van zijn precursor door een specifieke planten-subtilase gecodeerd door een gen dat wordt gereguleerd tijdens het proces van overdracht van wortelekplanten naar weefselkweek.
|
Proteolytische processing van een precursorproteïne voor een groeifactorpeptide door een subtilisine serine protease in Arabidopsis
|
qrnhp1ek
|
Een van de belangrijke gebieden waarop computationele tools voor de voorspelling van domeingrenzen worden toegepast is de structuurbiologie. Ze kunnen worden gebruikt om eiwitconstructies te ontwerpen die stabiel en functioneel tot expressie moeten komen en diffractiekwaliteit kristallen moeten produceren. De voorspelling van proteïne domeingrenzen op basis van aminozuursequenties is echter nog steeds zeer problematisch. In deze studie wordt de prestatie van verschillende computationele benaderingen vergeleken. Er wordt geobserveerd dat de statistische significantie van de meeste voorspellingen nogal gering is. Niettemin, wanneer het juiste aantal domeinen correct wordt voorspeld, worden domeingrenzen binnen zeer weinig residuen van hun werkelijke locatie voorspeld. Er kan worden geconcludeerd dat voorspellingsmethoden nog niet als routinetools in de structuurbiologie kunnen worden gebruikt, hoewel sommige ervan veelbelovend zijn.
|
Voorspelling van Proteïne Domeingrenzen: Een Structuurbiologisch Perspectief
|
50wqhp04
|
Internationale Cursus over Nieuwe Virussen in het Amazonegebied
|
|
5hwqdnx1
|
BioSense is een nationaal Amerikaans systeem dat gegevens uit gezondheidsinformatiesystemen gebruikt voor geautomatiseerde ziektebewaking. We hebben vier modificaties van tijdreeksalgoritmes bestudeerd die zijn ontworpen om de gevoeligheid voor het detecteren van kunstmatig toegevoegde gegevens te verbeteren. Om deze gemodificeerde algoritmes te testen, hebben we gebruik gemaakt van rapporten van dagelijkse syndroombezoeken van 308 faciliteiten van het Department of Defense (DoD) en 340 spoedeisende hulpafdelingen (SEH) van ziekenhuizen. Bij een constante waarschuwingsfrequentie van 1% werd de gevoeligheid voor beide datasets verbeterd door gebruik te maken van een minimale standaarddeviatie (SD) van 1,0, een basislijn duur van 14–28 dagen voor het berekenen van het gemiddelde en de SD, en een aanpassing voor het totale aantal kliniekbezoeken als een surrogaatnoemer. Het stratificeren van basislijndagen in werkdagen versus weekends om rekening te houden met effecten van de dag van de week verhoogde de gevoeligheid voor de DoD-gegevens, maar niet voor de SEH-gegevens. Deze verbeterde methoden kunnen de gevoeligheid verhogen zonder de waarschuwingsfrequentie te verhogen en kunnen het vermogen om uitbraken te detecteren verbeteren door gebruik te maken van gegevens van geautomatiseerde bewakingssystemen.
|
Verbetering van Tijdreeksdetectiealgoritmes voor Geautomatiseerde Biosurveillance
|
4tvrhpss
|
Het vermogen van pathogenen om aan de immuunrespons van de gastheer te ontsnappen is cruciaal voor het tot stand komen van persistente infecties en kan de virulentie beïnvloeden. Recombinatie is waargenomen als een bijdrage aan dit proces door het genereren van nieuwe genetische varianten. Hoewel onderscheidende recombinatiepatronen in veel virale pathogenen zijn beschreven, is er weinig bekend over de invloed van biases in het recombinatieproces zelf ten opzichte van selectieve krachten die inwerken op nieuw gevormde recombinanten. Het begrijpen van deze invloeden is belangrijk om te bepalen hoe recombinatie bijdraagt aan de evolutie van het pathogeengenom en -proteoom. Het meeste eerdere onderzoek naar recombinatiegedreven proteinevolutie heeft zich gericht op relatief eenvoudige eiwitten, meestal in de context van gerichte evolutie-experimenten. Hier bestuderen we recombinatie in het envelope-gen van HIV-1 tussen primaire isolaten behorend tot subtypes die van nature recombineren in de HIV/AIDS-pandemie. Door de vroege stappen in de generatie van recombinanten te karakteriseren, bieden we nieuwe inzichten in de evolutionaire krachten die recombinatiepatronen binnen virale populaties vormgeven. Specifiek laten we zien dat de gecombineerde effecten van mechanistische processen die de locaties van recombinatie-breukpunten over het HIV-1 envelope-gen bepalen, en zuiverende selectie die inwerkt tegen disfunctionele recombinanten, bijna de gehele verdeling van breukpunten kunnen verklaren die in dit gen in de natuur worden aangetroffen. Deze beperkingen verklaren de verrassende schaarste aan recombinatie-breukpunten die bij geïnfecteerde individuen binnen dit zeer variabele gen worden gevonden. De schijnbare willekeur van HIV-evolutie via recombinatie kan dus in feite relatief voorspelbaarder zijn dan verwacht. Bovendien definieert de dominantie van zuiverende selectie in gelokaliseerde gebieden van het HIV-genoom regio's waar functionele beperkingen op recombinanten bijzonder sterk lijken, wat wijst op kwetsbare aspecten van de HIV-biologie.
|
Moleculaire Mechanismen van Recombinatierestrictie in het Envelope-Gen van het Humaan Immunodeficiëntievirus
|
i55gwn3s
|
Overdracht van aviaire influenzavirussen van vogel naar mens is een zeldzame gebeurtenis, ondanks het feit dat aviaire influenzavirussen in vitro en ex vivo het gecilieerde epitheel van de humane luchtwegen infecteren. Met behulp van een in vitro model van humaan gecilieerd luchtweg-epitheel (HAE) tonen we aan dat hoewel humane en aviaire influenzavirussen efficiënt infecteren bij temperaturen van de humane distale luchtwegen (37°C), aviaire, maar niet humane, influenzavirussen beperkt zijn in infectie bij de koelere temperaturen van de humane proximale luchtwegen (32°C). Deze gegevens ondersteunen de hypothese dat aviaire influenzavirussen, gewoonlijk aangepast aan de temperatuur van het aviaire enterale kanaal (40°C), zelden mensen infecteren, gedeeltelijk vanwege verschillen in regionale temperaturen van de gastheerluchtwegen. Eerder werd een kritiek residu op positie 627 in de polymerase-subeenheid PB2 van het aviaire influenzavirus geïdentificeerd als het verlenen van temperatuur-afhankelijkheid in zoogdiercellen. Hier gebruiken we reverse genetics om te laten zien dat avianisering van residu 627 een humaan virus verzwakt, maar niet verantwoordelijk is voor de verschillende infectie tussen 32°C en 37°C. Om het mechanisme van temperatuurbeperking van aviaire influenzavirussen in HAE bij 32°C te bepalen, genereerden we recombinante humane influenzavirussen in de genetische achtergrond van A/Victoria/3/75 (H3N2) of A/PR/8/34 (H1N1) die aviaire of aviair-achtige glycoproteïnen bevatten. Twee van deze virussen, A/Victoria/3/75 met L226Q en S228G mutaties in hemagglutinine (HA) en neuraminidase (NA) van A/Chick/Italy/1347/99 en A/PR/8/34 met de H7 en N1 van A/Chick/Italy/1347/99, vertoonden temperatuurbeperking die benaderde die van volledig aviaire influenzavirussen. Deze gegevens suggereren dat influenzavirussen met aviaire of aviair-achtige oppervlakteglycoproteïnen een verminderd vermogen hebben om een productieve infectie tot stand te brengen bij de temperatuur van de humane proximale luchtwegen. Deze temperatuurbeperking kan zoönotische overdracht van aviaire influenzavirussen beperken en suggereert dat aanpassing van aviaire influenzavirussen aan efficiënte infectie bij 32°C een kritische evolutionaire stap kan vertegenwoordigen die humane-tot-humane overdracht mogelijk maakt.
|
Glycoproteïnen van het aviaire influenzavirus beperken virusreplicatie en -verspreiding door het humane luchtweg-epitheel bij temperaturen van de proximale luchtwegen
|
05ppugs7
|
ACHTERGROND: Momenteel hebben we zeer beperkte mogelijkheden om publieke gezondheidsactiviteiten tussen jurisdicties en landen te vergelijken, of zelfs om verschillen te constateren in wat wordt beschouwd als een publieke gezondheidsactiviteit. Bestaande gestandaardiseerde gezondheidsclassificaties vatten belangrijke dimensies van de publieke gezondheid niet, waaronder de functies ervan, de methoden en interventies die worden gebruikt om deze te bereiken, de gezondheidsproblemen en determinanten van gezondheid die publieke gezondheidsactiviteiten aanpakken, de middelen en infrastructuur die ze gebruiken, en de settings waarin ze plaatsvinden. Een classificatie die deze dimensies beschrijft, zal consistentie bevorderen bij het verzamelen en rapporteren van informatie over publieke gezondheidsprogramma's, uitgaven, personeelsbestand en prestaties. Dit artikel beschrijft de ontwikkeling van een eerste versie van een dergelijke classificatie. METHODEN: We gebruikten open-source Protégé-software en gepubliceerde procedures om een ontologie van de publieke gezondheid te construeren, die de basis vormt van de classificatie. We hebben bestaande definities van publieke gezondheid, beschrijvingen van publieke gezondheidsfuncties en classificaties beoordeeld om het bereik, domein en de multidimensionale klassenstructuur van de ontologie te ontwikkelen. Deze werden vervolgens verfijnd via een reeks consultaties met experts in de publieke gezondheid uit heel Australië, wat resulteerde in een eerste classificatiekader. RESULTATEN: De classificatie van de publieke gezondheid bestaat uit zes topniveauklassen: publieke gezondheids'Functies'; 'Gezondheidsproblemen'; 'Determinanten van Gezondheid'; 'Settings'; 'Methoden' van interventie; en 'Middelen en Infrastructuur'. Bestaande classificaties (zoals de internationale classificaties van ziekten, invaliditeit en functioneren en externe oorzaken van letsel) kunnen worden gebruikt om grote delen van de klassen 'Gezondheidsproblemen', 'Settings' en 'Middelen en Infrastructuur' verder te classificeren, terwijl nieuwe subklassenstructuren worden voorgesteld voor de klassen van publieke gezondheids'Functies', 'Determinanten van Gezondheid' en 'Interventies'. CONCLUSIE: De classificatie van de publieke gezondheid omvat de belangrijke dimensies van publieke gezondheidsactiviteiten. Het zal de organisatie van informatie vergemakkelijken, zodat deze kan worden gebruikt om vragen te beantwoorden met betrekking tot een van deze dimensies, afzonderlijk of in combinatie. De auteurs moedigen lezers aan om de classificatie te gebruiken en verbeteringen voor te stellen.
|
Een multidimensionale classificatie van publieke gezondheidsactiviteiten in Australië
|
tex6bgab
|
RNA-interferentie (RNAi) biedt een krachtig nieuw middel om virale infectie specifiek te remmen. De selectie van siRNA-resistente virussen is echter een belangrijke zorg bij het gebruik van RNAi als antivirale therapie. In deze studie hebben we een lentivirale vector met een H1-short hairpin RNA (shRNA) expressiecassette gebruikt om kleine interfererende RNA's (siRNA's) in zoogdiercellen te brengen. Met behulp van deze vector, die ook enhanced green fluorescence protein (EGFP) als surrogaatmarker tot expressie brengt, werden succesvol stabiele shRNA-expressie cellijnen gevestigd en werden de remmingsefficiënties van rationeel ontworpen siRNA's gericht op geconserveerde regio's van het influenza A virusgenoom beoordeeld. De resultaten toonden aan dat een siRNA gericht op het influenza M2-gen (siM2) de virusreplicatie krachtig remde. De siM2 was niet alleen effectief voor het H1N1-virus, maar ook voor het hoogpathogene aviaire influenza virus H5N1. Naast de M2-remming remde de siM2 ook de accumulatie van NP mRNA en de expressie van het eiwit. Een langdurig remmingseffect van de siM2 werd aangetoond en het ontstaan van siRNA-resistente mutanten in influenza-quasispecies werd niet waargenomen. Samengevat suggereert onze studie dat het M2-gen een optimaal RNAi-doelwit voor antivirale therapie zou kunnen zijn. Deze bevindingen leveren nuttige informatie op voor de ontwikkeling van op RNAi gebaseerde profylaxe en therapie voor humane influenza virusinfectie.
|
Klein interfererend RNA gericht op het M2-gen induceert effectieve en langdurige remming van Influenza A virusreplicatie
|
q75spbgv
|
ACHTERGROND: Er zijn steeds meer meldingen van ernstige klinische gevallen die uitsluitend geassocieerd zijn met Plasmodium vivax infecties. Met name is deze ernst onlangs in verband gebracht met chloroquineresistentie. PATIENTEN: Twee verschillende patiënten presenteerden zich op de Hospital Clinic in Barcelona met P. vivax malaria-episodes. Een patiënt had ernstige symptomen en de ander milde symptomen. Beide patiënten reisden in 2007 door het Braziliaanse Amazonegebied (Manaus). Voor beide patiënten was de huidige diagnose malaria de eerste. Twee andere patiënten met milde symptomen presenteerden zich in 2000 bij het "Centro de Pesquisa em Medicina Tropical", eveneens in het Braziliaanse Amazonegebied (Rondônia). METHODEN: Om de mogelijkheid uit te sluiten dat de ernstige symptomen van de patiënt te wijten waren aan Plasmodium falciparum, werd een geneste PCR uitgevoerd. Een magnetische methode werd gebruikt om P. vivax te zuiveren van humane leukocyten. Kwantitatieve real-time PCR werd uitgevoerd om de transcriptieniveaus van twee belangrijke transporteiwitten te vergelijken die waarschijnlijk betrokken zijn bij chloroquineresistentie in P. vivax, namelijk de P. vivax chloroquineresistentie transporter, pvcrt-o, en de P. vivax multidrug resistentie transporter, pvmdr 1. RESULTATEN: De resultaten toonden aan dat de ernstige klinische symptomen uitsluitend te wijten waren aan P. vivax. De patiënt presenteerde acute respiratoire aandoeningen die opname op de intensive care vereisten. De magnetische methode toonde sterk gezuiverde geïnfecteerde reticulocyten met volwassen stadia. Bovendien werd vastgesteld dat parasieten verkregen van de ernstig zieke patiënt een tot 2,9-voudige toename van pvmdr1-niveaus en een tot 21,9-voudige toename van pvcrt-o-niveaus vertoonden in vergelijking met de expressieniveaus van parasieten van de andere patiënten met milde symptomen. CONCLUSIE: Dit is het eerste klinische geval van een ernstige ziekte die uitsluitend geassocieerd is met vivax malaria in Spanje. Bovendien suggereren deze bevindingen dat de klinische ernst geassocieerd kan zijn met verhoogde expressieniveaus van parasitegenen die waarschijnlijk betrokken zijn bij chloroquineresistentie. Het is noodzakelijk om het potentieel van pvmdr1 en met name pvcrt-o expressieniveaus verder te onderzoeken als moleculaire markers van ernstige ziekte bij P. vivax.
|
Verhoogde expressieniveaus van de pvcrt-o en pvmdr1 genen bij een patiënt met ernstige Plasmodium vivax malaria
|
6c3zb3g4
|
ACHTERGROND: Preventie van moeder-op-kind-overdracht (PMTCT) wordt beschouwd als geen eenvoudige interventie, maar als een uitgebreide reeks interventies die bekwame zorgverleners vereisen. Het uitgebreide zorgsysteem van Vietnam reikt tot op dorpsniveau, maar HIV-geïnfecteerde moeders en kinderen ontvangen nog steeds ontoereikende gezondheidszorgdiensten voor PMTCT. We rapporteren hier de percepties van zorgverleners over factoren die leiden tot hun falen om hoogwaardige PMTCT-diensten te leveren. METHODEN: Er werden semigestructureerde interviews afgenomen met 53 zorgverleners en ongestructureerde observaties uitgevoerd in negen zorginstellingen in Hanoi. De selectie van respondenten was gebaseerd op hun functie, positie en ervaring in de ontwikkeling of implementatie van PMTCT-beleid/programma's. RESULTATEN: Factoren die leiden tot het falen van zorgverleners om hoogwaardige diensten voor PMTCT te leveren, zijn onder meer hun eigen angst voor HIV-infectie; gebrek aan kennis over HIV en counselingsvaardigheden; of een hoge werkdruk en personeelsgebrek; de onbeschikbaarheid van HIV-testen op commune-niveau; tekort aan antiretrovirale geneesmiddelen; en gebrek aan operationele richtlijnen. Een negatieve houding tijdens counseling en zorgverlening, behandelen in een aparte ruimte en het helemaal vermijden van dienstverlening werden door zorgverleners gezien als het gevolg van angst voor infectie, evenals wantrouwen jegens bijna alle HIV-geïnfecteerde patiënten vanwege de heersende associatie met antisociaal gedrag. Bovendien is de fragmentatie van het zorgsysteem in gespecialiseerde verticale pijlers, waaronder een verticaal programma voor HIV/AIDS, een belangrijke hindernis voor het leveren van een continuüm van zorg. CONCLUSIE: Veel ziekenhuispersoneel was niet in staat of zelfs niet bereid om passende zorg te verlenen aan HIV-positieve zwangere vrouwen. De studie suggereert dat de kwaliteit van de PMTCT-dienst kan worden verbeterd door de communicatie- en andere vaardigheden van zorgverleners te verbeteren, hen meer ondersteuning te bieden en hun motivatie te vergroten. Verminderen van de werkdruk zou ook belangrijk zijn. De ontwikkeling van een praktische strategie is nodig om het verwijzingssysteem te versterken en aan te passen aan de behoeften van patiënten.
|
Visies van zorgverleners op de kwaliteit van de preventie van moeder-op-kind-overdracht en postnatale zorg voor HIV-geïnfecteerde vrouwen en hun kinderen
|
wk9oxl4n
|
ACHTERGROND: Proteolytische processing van de Lassa-virus envelop glycoproteïne precursor GP-C door de gastheer proproteïne convertase site 1 protease (S1P) is een vereiste voor de incorporatie van de subeenheden GP-1 en GP-2 in virale deeltjes en daarom essentieel voor infectiviteit en virus verspreiding. Daarom hebben we in deze studie het concept getest om S1P te gebruiken als doelwit om efficiënte virusreplicatie te blokkeren. METHODOLOGIE/BELANGRIJKSTE RESULTATEN: We laten zien dat stabiele cellijnen die induceerbaar S1P-aangepaste α(1)-antitrypsine varianten tot expressie brengen de proteolytische maturatie van GP-C remmen. Introductie van de S1P-herkenningsmotieven RRIL en RRLL in de reactieve center loop van α(1)-antitrypsine resulteerde in de afschaffing van GP-C processing door endogeen S1P tot een vergelijkbaar niveau dat werd waargenomen in S1P-deficiënte cellen. Bovendien remden S1P-specifieke α(1)-antitrypsinen significant de replicatie en verspreiding van een replicatie-competent recombinant vesiculair stomatitis virus dat het Lassa-virus glycoproteïne GP tot expressie bracht, evenals authentiek Lassa-virus. Remming van virale replicatie correleerde met het vermogen van de verschillende α(1)-antitrypsine varianten om de processing van de Lassa-virus glycoproteïne precursor te remmen. CONCLUSIES/SIGNIFICANTIE: Onze gegevens suggereren dat glycoproteïne splitsing door S1P een veelbelovend doelwit is voor de ontwikkeling van nieuwe anti-arenavirale strategieën.
|
Inhibitie van Lassa-virus glycoproteïne splitsing en multicyclus replicatie door site 1 protease-aangepaste α(1)-antitrypsine varianten
|
x5lbstyr
|
Door virale agentia veroorzaakte infectieziekten doden jaarlijks miljoenen mensen. De verbetering van de preventie en behandeling van virale infecties en de daarmee gepaard gaande ziekten blijft een van de belangrijkste uitdagingen op het gebied van de volksgezondheid. Om dit doel te bereiken, opent het ontrafelen van virus-gastheer moleculaire interacties nieuwe perspectieven om de biologie van infectie te begrijpen en voor het ontwerpen van nieuwe antivirale strategieën. Inderdaad, modellering van een infectienetwerk tussen virale en cellulaire eiwitten zal een conceptueel en analytisch kader bieden om efficiënt nieuwe biologische hypothesen op proteoom schaal te formuleren en de ontwikkeling van geneesmiddelen te rationaliseren. Daarom presenteren wij de eerste release van VirHostNet (Virus-Host Network), een openbare kennisbank gespecialiseerd in het beheer en de analyse van geïntegreerde virus-virus, virus-gastheer en gastheer-gastheer interactienetwerken gekoppeld aan hun functionele annotaties. VirHostNet integreert een uitgebreide en originele, uit de literatuur afkomstige dataset van virus-virus en virus-gastheer interacties (2671 niet-redundante interacties) die meer dan 180 verschillende virale soorten vertegenwoordigen en een van de grootste humane interactomen (10 672 eiwitten en 68 252 niet-redundante interacties) gereconstrueerd uit openbaar beschikbare gegevens. De VirHostNet webinterface biedt geschikte tools die efficiënt zoeken en visualisatie van dit geïnfecteerde cellulaire netwerk mogelijk maken. Openbare toegang tot het VirHostNet kennisgebaseerde systeem is beschikbaar op http://pbildb1.univ-lyon1.fr/virhostnet.
|
VirHostNet: een kennisbank voor het beheer en de analyse van proteoombrede virus-gastheer-interactienetwerken
|
wj7yonjw
|
Rfam is een verzameling RNA-sequentiefamilies, weergegeven door multiple sequence alignments en covariantiemodellen (CM's). Het primaire doel van Rfam is het annoteren van nieuwe leden van bekende RNA-families op nucleotidese-sequenties, met name complete genomen, met behulp van gevoelige BLAST-filters in combinatie met CM's. Een minderheid van de families met een zeer breed taxonomisch bereik (bijv. tRNA en rRNA) levert het grootste deel van de sequentieannotaties, terwijl de meerderheid van de Rfam-families (bijv. snoRNA's en miRNA's) een beperkt taxonomisch bereik heeft en een beperkt aantal annotaties levert. Recente verbeteringen aan de website, methodologieën en gegevens die door Rfam worden gebruikt, worden besproken. Rfam is gratis beschikbaar op het web via http://rfam.sanger.ac.uk/ en http://rfam.janelia.org/.
|
Rfam: updates van de RNA families database
|
pebc17zw
|
Rhinovirussen en enterovirussen zijn belangrijke oorzaken van luchtweginfecties. Om de genotype diversiteit te evalueren en de krachten te identificeren die de evolutie van picornavirussen vormgeven, hebben we personen met luchtwegaandoeningen gescreend met behulp van rhinovirus-specifieke of generieke real-time PCR assays. Vervolgens hebben we het 5′ untranslated region, het capside-eiwit VP1, en de protease precursor 3CD regio's van virus-positieve samples gesequenced. Subsequente fylogenetische analyse identificeerde de grote genotype diversiteit van rhinovirussen die in mensen circuleren. We identificeerden en completeerden de genoomsequentie van een nieuw enterovirus genotype geassocieerd met respiratoire symptomen en acute otitis media, waarmee de nauwe relatie tussen rhinovirussen en enterovirussen en de noodzaak om beide virussen in respiratoire specimens te detecteren, wordt bevestigd. Ten slotte identificeerden we recombinanten onder circulerende rhinovirussen en brachten we hun recombinatieplaatsen in kaart, waarmee we aantoonden dat rhinovirussen in hun natuurlijke gastheer kunnen recombineren. Deze studie verduidelijkt de diversiteit en verklaart de redenen voor de evolutie van deze virussen.
|
Nieuwe Respiratoire Enterovirussen en Recombinante Rhinovirussen onder Circulerende Picornavirussen
|
10j9cp9c
|
ACHTERGROND: Snelle en kosteneffectieve methoden voor HIV-1 diagnose en monitoring van de virale load zouden het klinisch management van HIV-1 geïnfecteerde volwassenen en kinderen in omgevingen met beperkte middelen aanzienlijk verbeteren. Recente aanbevelingen om perinataal geïnfecteerde zuigelingen binnen het eerste levensjaar te behandelen zijn alleen haalbaar als vroege diagnose routinematig beschikbaar is. Gedroogde bloedvlekken (GBV) op filterpapier zijn een eenvoudige en handige manier om bloedmonsters te verzamelen en te transporteren. Een snelle en kosteneffectieve methode om HIV-1 te diagnosticeren en te kwantificeren vanuit GBV is dringend nodig om vroege diagnose van HIV-1 infectie en monitoring van antiretrovirale therapie te vergemakkelijken. METHODEN EN RESULTATEN: We hebben een real-time LightCycler (rtLC) PCR-assay ontwikkeld om HIV-1 te detecteren en te kwantificeren vanuit GBV. HIV-1 RNA geëxtraheerd uit GBV werd geamplificeerd in een one-step, single-tube systeem met behulp van primers specifiek voor long-terminal repeat sequenties die geconserveerd zijn in alle HIV-1 clades. SYBR Green kleurstof werd gebruikt om PCR-amplicons te kwantificeren en HIV-1 RNA kopiegetallen werden bepaald aan de hand van een standaardcurve gegenereerd met serieel verdunde bekende kopieën van HIV-1 RNA. Deze assay detecteerde monsters over verschillende clades, heeft een dynamisch bereik van 5 log(10), en %CV <8% tot 4 log(10) verdunning. Plasma HIV-1 RNA kopiegetallen verkregen met deze methode correleerden goed met de Roche Ultrasensitive (r = 0.91) en branched DNA (r = 0.89) assays. De onderste detectielimiet (95%) werd geschat op 136 kopieën. De rtLC GBV assay was 2,5 keer sneller en 40 keer goedkoper in vergelijking met commerciële assays. Aanpassing van de assay in andere real-time systemen toonde vergelijkbare prestaties. CONCLUSIES: De nauwkeurigheid, betrouwbaarheid, genotype-inclusiviteit en betaalbaarheid, samen met de kleine hoeveelheden bloed die nodig zijn voor de assay, suggereren dat de rtLC GBV assay nuttig zal zijn voor vroege diagnose en monitoring van pediatrische HIV-1 infectie in omgevingen met beperkte middelen.
|
Goedkope HIV-1 Diagnostiek en Kwantificering in Gedroogde Bloedvlekken met Real-Time PCR
|
fa7s7xj5
|
ACHTERGROND: Epidemiologische interventies zijn gericht op het beheersen van de verspreiding van infectieziekten via verschillende mechanismen, elk met verschillende bijbehorende kosten. METHODOLOGIE: We beschrijven een flexibel statistisch kader voor het genereren van optimale epidemiologische interventies die zijn ontworpen om de totale verwachte kosten van een opkomende epidemie te minimaliseren, terwijl tegelijkertijd onzekerheid met betrekking tot de onderliggende parameters van het ziektemodel wordt doorgegeven aan het besluitvormingsproces. De strategieën die via dit kader worden geproduceerd zijn adaptief: vaccinatieschema's worden iteratief aangepast om de verwachte traject van de epidemie weer te geven, gegeven de huidige populatietoestand en bijgewerkte parameterschattingen. CONCLUSIES: Aan de hand van simulatiestudies gebaseerd op een klassieke influenza-uitbraak, demonstreren we de voordelen van adaptieve interventies ten opzichte van niet-adaptieve interventies, in termen van kosten- en resource-efficiëntie, en robuustheid tegen modelspecificatiefouten.
|
Een Statistisch Kader voor Adaptief Beheer van Epidemiologische Interventies
|
2ygb80sc
|
Multi-orgaan disfunctiesyndroom (MODS) treedt op als reactie op ernstige beschadigingen zoals sepsis, ernstige bloedingen, trauma, grote operaties en pancreatitis. Het mortaliteitscijfer is hoog ondanks intensieve ondersteunende zorg. Het pathofysiologische mechanisme dat ten grondslag ligt aan MODS is niet volledig duidelijk, hoewel er verschillende zijn voorgesteld. Overweldigende ontsteking, immunoparese, occulte zuurstofschuld en andere mechanismen zijn onderzocht, en – ondanks vele onbeantwoorde vragen – zijn therapieën gericht op deze mechanismen ontwikkeld. Helaas lijken slechts enkele interventies, meestal die gericht zijn op meerdere mechanismen tegelijkertijd, voordelig te zijn. We moeten de mechanismen die ten grondslag liggen aan MODS duidelijk beter begrijpen. Het endotheel speelt zeker een actieve rol bij MODS. Het functioneert op het snijvlak van verschillende systemen, waaronder ontsteking, coagulatie, hemodynamiek, vocht- en elektrolytenbalans en celmigratie. Een belangrijke regulator van deze systemen is het angiopoëtine/Tie2-signaleringsysteem. In deze review beschrijven we dit signaleringsysteem, met speciale aandacht voor wat er bekend is over dit systeem bij kritiek zieke patiënten en het potentieel ervan als doelwit voor therapie.
|
Bench-to-bedside review: Angiopoëtine signalering bij kritieke ziekte – een toekomstig doelwit?
|
zkudc8ww
|
In dit werk bestuderen we de gevolgen van sequentievariaties van het neuraminidase van de "2009 H1N1" (varken- of Mexicaanse griep) influenza A virusstam voor geneesmiddelbehandeling en vaccinatie. We constateren dat het fylogenetisch nauwer verwant is aan Europese H1N1 varkensgriep en H5N1 vogelgriep dan aan de H1N1 tegenhangers in Amerika. Homologie-gebaseerde 3D-structuurmodellering onthult dat de nieuwe mutaties bij voorkeur op het eiwitoppervlak liggen en de actieve site niet verstoren. Deze laatste is de bindingsholte voor 3 momenteel gebruikte neuraminidase-remmers: oseltamivir (Tamiflu(®)), zanamivir (Relenza(®)) en peramivir; de geneesmiddelen zouden dus effectief moeten blijven voor behandeling. De antigene gebieden van het neuraminidase die relevant zijn voor vaccinontwikkeling, serologische typering en passieve antilichaambehandeling kunnen echter verschillen van die van eerdere stammen en variëren al tussen patiënten. Dit artikel werd beoordeeld door Sandor Pongor en L. Aravind.
|
Mapping van de sequentiemutaties van het 2009 H1N1 influenza A virus neuraminidase ten opzichte van de bindingslocaties van geneesmiddelen en antilichamen
|
qfb7074e
|
ACHTERGROND: Anatiden herpesvirus 1 (AHV-1) is een alphaherpesvirus geassocieerd met latente infectie en mortaliteit bij eenden en ganzen en heeft momenteel een ernstige impact op de wereldwijde watervogelproductie. Hier beschrijven we een fluorescerende kwantitatieve real-time PCR (FQ-PCR) methode ontwikkeld voor snelle meting van AHV-1 DNA gebaseerd op TaqMan MGB technologie. RESULTATEN: De detectielimiet van de assay was 1 × 10(1) standaard DNA kopieën, met een gevoeligheid van 2 logs hoger dan die van de conventionele gel-gebaseerde PCR assay gericht op hetzelfde gen. De real-time PCR was reproduceerbaar, zoals aangetoond door bevredigende lage intra-assay en inter-assay variatiecoëfficiënten. CONCLUSIE: De hoge gevoeligheid, specificiteit, eenvoud en reproduceerbaarheid van de AHV-1 fluorogene PCR assay, gecombineerd met het brede dynamische bereik en de hoge doorvoer, maken deze methode geschikt voor een breed spectrum van AHV-1 etiologisch gerelateerde toepassingen.
|
Ontwikkeling van een TaqMan(® )MGB fluorescerende real-time PCR assay voor de detectie van anatiden herpesvirus 1
|
g4puurhk
|
Het huidige sterftecijfer van patiënten die lijden aan acuut respiratoir distress syndroom (ARDS) ligt tussen 45% en 92%, waarbij de meeste binnen de eerste twee weken na het begin van de ziekte overlijden. In een poging om zo'n alarmerend hoog sterftecijfer te bestrijden, zijn verschillende behandelingsmethoden zoals strategieën met lage tidal volumes bij beademing, corticosteroïdtherapie en het gebruik van stikstofmonoxide (NO) geprobeerd bij de behandeling van patiënten met ARDS. Drie patiënten die werden opgenomen op de intensive care en bij wie ARDS werd vastgesteld, konden niet worden gespeend van beademingsondersteuning, en er werd een behandeling met stikstofmonoxide gestart. Dit verbeterde de zuurstofvoorziening van de patiënten gedurende korte perioden, maar had geen invloed op de mortaliteit. De patiënten konden niet van de beademing worden afgewend en overleden.
|
De rol van stikstofmonoxide bij de behandeling van acuut respiratoir distress syndroom
|
ke0tkpso
|
Al enkele jaren leven we met de angst voor een dreigende pandemie van aviaire influenza (AI). Ondanks de erkenning in 1996 van de wereldwijde dreiging die het hoogpathogene H5N1-influenzavirus, aangetroffen bij gedomesticeerde ganzen in de provincie Guangdong, China, vormde, blijft de planning voor de verwachte epidemie ernstig ontoereikend; dit geldt met name voor ontwikkelingslanden zoals Saoedi-Arabië. Deze tekortkomingen werden duidelijk in 1997, met de uitbraak van AI op de markten voor levende dieren in Hongkong, die leidde tot de overdracht van de infectie aan 18 mensen met nauw contact met zieke vogels; er werden zes sterfgevallen gemeld.[1] In 2003, met de heropkomst van H5N1 (beschouwd als het meest waarschijnlijke AI-virus) in de Republiek Korea en de daaropvolgende verspreiding naar Thailand, Vietnam, Hongkong en China. Veel landen begonnen agressief voorbereidingen te treffen om de dreiging het hoofd te bieden.[2] De druk op regeringen voor concrete actie is toegenomen. De meeste ontwikkelde landen hebben verzocht om meer financiering voor het zoeken naar een effectiever vaccin, voor het opslaan van mogelijk nuttige antivirale geneesmiddelen en voor het intensiveren van de binnenlandse en wereldwijde surveillance.[3] De meeste landen zijn echter nog steeds ontoereikend voorbereid op een dergelijke epidemie, vooral wat betreft de diergezondheidstoezicht op de veemarkt en het toezicht op trekvogels. Zelfs nu nog beschikken de meeste landen niet over de mogelijkheid om de ziekte bij mensen in de vroege stadia van een uitbraak te detecteren, en voldoen de meeste ziekenhuizen niet aan effectieve infectiepreventiemaatregelen die de verspreiding van het virus in de vroege stadia van een epidemie zouden kunnen beteugelen. In Saoedi-Arabië implementeren we veel van deze maatregelen snel.[4]
|
Aviaire influenza: Het topje van de ijsberg
|
d441jam3
|
Reverse transcriptase (RT) van het humaan immunodeficiëntievirus (HIV)-1 speelt een sleutelrol bij het initiëren van virale replicatie en is een belangrijk doelwit voor de ontwikkeling van anti-HIV-medicijnen. Onze eerdere studie toonde aan dat twee mutaties (Y271A en I274A) in de RT-bocht (Gln(269)-Arg(277)) virale replicatie ophieven, maar dat de replicatiecapaciteit en RT-activiteit discordant waren. In deze studie hebben we verder onderzocht waarom alaninesubstituties op deze twee locaties virale replicatie zouden beïnvloeden. We ontdekten dat zowel de RT-activiteit als het RT-eiwit bijna niet detecteerbaar waren in virale deeltjes van deze twee mutanten, hoewel de Pr160(gag-pol) mutanten correct tot expressie werden gebracht, getransporteerd en geïncorporeerd. Met behulp van een protease-inhibitie-assay demonstreerden we een correlatie tussen de afbraak van de RT-mutanten en de activiteit van viraal protease. Onze native gelanalyse gaf aan dat de mutaties op de 271 en 274 aminozuren conformationele veranderingen kunnen veroorzaken, leidend tot de vorming van hogere-orde oligomeren in plaats van dimeren, resulterend in verhoogde eiwitinstabiliteit en gevoeligheid voor viraal protease. Residuen 271 en 274 zijn dus essentieel voor RT-stabiliteit en resistentie tegen viraal protease. De conservatie van de twee aminozuren onder verschillende stammen van HIV-1 gaf verdere steun aan deze conclusie. De hier verkregen kennis kan nuttig blijken te zijn bij het ontwerpen van medicijnen.
|
De Y271 en I274 aminozuren in reverse transcriptase van het humaan immunodeficiëntievirus-1 zijn essentieel voor eiwitstabiliteit
|
02opdk0m
|
De hier gepresenteerde CVTree webserver (http://tlife.fudan.edu.cn/cvtree) is een nieuwe implementatie van de op het hele genoom gebaseerde, alignment-vrije compositievector (CV) methode voor fylogenetische analyse. Deze is efficiënter en gebruiksvriendelijker dan de eerder gepubliceerde versie in het nummer van Nucleic Acids Research uit 2004 over webservers. De ontwikkeling van de op het hele genoom gebaseerde alignment-vrije CV-methode heeft een onafhankelijke verificatie geleverd van de traditionele fylogenetische analyse op basis van één gen of een paar genen. Deze nieuwe implementatie probeert de uitdaging van de steeds toenemende hoeveelheid genoomgegevens aan te gaan en omvat in zijn database meer dan 850 prokaryotische genomen die maandelijks van NCBI zullen worden bijgewerkt, en meer dan 80 fungale genomen die handmatig zijn verzameld bij verschillende sequencingcentra. Deze nieuwe CVTree webserver biedt een sneller en stabieler onderzoeksplatform. Gebruikers kunnen hun eigen sequenties uploaden om hun fylogenetische positie te vinden tussen genomen die zijn geselecteerd uit de ingebouwde database van de server. Alle sequentiegegevens die in een sessie worden gebruikt, kunnen als gecomprimeerd bestand worden gedownload. Naast standaard fylogenetische bomen kunnen gebruikers er ook voor kiezen om bomen uit te voeren waarvan de monofyletische takken zijn samengevoegd tot verschillende taxonomische niveaus. Deze functie is bijzonder nuttig voor het vergelijken van fylogenie met taxonomie bij het werken met duizenden genomen.
|
CVTree update: een nieuw ontworpen fylogenetisch studieplatform met behulp van compositievectoren en hele genomen
|
533xlisc
|
ACHTERGROND: Glioblastoom is de meest voorkomende en meest maligne primaire hersentumor met een slechte prognose. De vertaling van therapeutische strategieën voor glioblastoom van de experimentele fase naar de kliniek is beperkt gebleven door ontoereikende diermodellen, die belangrijke kenmerken van humane tumoren missen. Lentivirale gentherapie is een aantrekkelijke therapeutische optie voor humane glioblastoom, wat we valideerden in een klinisch relevant diermodel. METHODOLOGIE/BELANGRIJKSTE RESULTATEN: We gebruikten een knaagdier xenograftmodel dat de invasieve en angiogene kenmerken van humane glioblastoom nabootst om het transductiepatroon en de therapeutische werkzaamheid van lentivirale pseudotypische vectoren te analyseren. Zowel lymphocytaire choriomeningitis virus glycoproteïne (LCMV-GP) als vesiculaire stomatitis virus glycoproteïne (VSV-G) pseudotypische lentivirale vectoren transduceerden humane glioblastoomcellen zeer efficiënt in vitro en in vivo. Daarentegen vertoonden pseudotypische gammaretrovirale vectoren, vergelijkbaar met die welke werden geëvalueerd voor klinische therapie van glioblastoom, inefficiënte genoverdracht in vitro en in vivo. Beide pseudotypische lentivirale vectoren transduceerden kankerstamcel-achtige cellen gekarakteriseerd door hun CD133-, nestin- en SOX2-expressie, het vermogen om sferoïden te vormen in neurale stamcelmedium en om astrocytaire en neuronale differentiatiemarkers tot expressie te brengen onder serumcondities. In een therapeutische aanpak met behulp van het suïcidegen herpes simplex virus thymidine kinase (HSV-1-tk) gefuseerd aan eGFP, bemiddelden beide lentivirale vectoren een complete remissie van solide tumoren zoals gezien op MRI, resulterend in een zeer significant overlevingsvoordeel (p<0,001) vergeleken met controlegroepen. In alle recidiverende tumoren werden overlevende eGFP-positieve tumorcellen gevonden, wat pleit voor prodrug-toepassing gedurende meerdere cycli om het therapeutische effect nog te versterken en te verlengen. CONCLUSIES/SIGNIFICANTIE: Concluderend zijn lentivirale pseudotypische vectoren veelbelovende kandidaten voor gentherapie van glioom bij patiënten. De inefficiënte genafgifte door gammaretrovirale vectoren is in overeenstemming met de resultaten verkregen in de klinische therapie voor GBM en bevestigt daarmee de hoge reproduceerbaarheid van het invasieve glioomdiermodel voor translationeel onderzoek.
|
Remissie van invasieve, kankerstamcel-achtige glioblastoom xenograften met behulp van lentivirale vector-gemedieerde suïcidegentherapie
|
7s5b3lpn
|
Een oligonucleotide array (microarray) met 13.000 elementen, representatief voor geselecteerde stammen van hepatitis A virus (HAV), humane coxsackievirussen A en B (CVA en CVB), genogroepen I en II van Norovirus (NV), en humane rotavirus (RV) gensegmenten 3, 4, 10 en 11, werd ontworpen op basis van het principe van tiling. Elk oligonucleotide was 29 basen lang, startend om de vijfde base van elke sequentie, resulterend in een overlap van 24 basen in twee opeenvolgende oligonucleotiden. De toepasbaarheid van de array voor virusidentificatie werd onderzocht met behulp van PCR-versterkte producten van meerdere HAV- en CV-stammen. Met biotine gelabelde PCR-producten werden gehybridiseerd met de array, en het biotine werd gedetecteerd met behulp van een korte reactie met Cy3-gelabeld streptavidine. De array werd vervolgens gescand met een laser, en de hybridisatiegegevens werden uitgezet als fluorescentie-intensiteit tegen elk oligonucleotide in de array. De gecombineerde signaalintensiteiten van alle probes die een bepaalde virusstam representeren werden berekend en uitgezet tegen alle geïdentificeerde virusstammen op een lineaire representatie van de array. Het profiel van de totale signaalintensiteit identificeerde de stam die het meest waarschijnlijk wordt gerepresenteerd in het versterkte cDNA-doelwit. De resultaten verkregen met HAV en CV wezen uit dat het zo gegenereerde hybridisatieprofiel kan worden gebruikt om nauw verwante virale stammen te identificeren. Dit vertegenwoordigt een significante verbetering ten opzichte van huidige methoden voor virusidentificatie met behulp van PCR-amplificatie en amplicon sequencing.
|
Een op Microarrays Gebaseerde Aanpak voor de Identificatie van Veelvoorkomende Voedselborne Virussen
|
d5xv2xdr
|
Multiple sclerose (MS) met begin in de kindertijd biedt een unieke mogelijkheid om de infectieuze achtergrond van deze ziekte te bestuderen, maar de immuunreacties tegen infectieuze agentia bij dergelijke kinderen zijn pas recent onderzocht. Deze en andere epidemiologische studies wijzen sterk op de betrokkenheid van een of meer infectieuze agentia bij de etiologie van MS, waarbij het Epstein-Barr virus (EBV) de belangrijkste kandidaat is. In plaats van de werkelijke oorzaak van MS te zijn, is het waarschijnlijker dat deze agentia betrokken zijn bij de ontwikkeling van immunoregulerende pathways. Deze pathways, indien verstoord door hygiëne-gerelateerde factoren, waaronder een veranderde volgorde van infecties, kunnen een tekort binnen het immunologische netwerk genereren en in stand houden dat specifieke vroege gebeurtenissen in de ontwikkeling van MS faciliteert, jaren of een decennium voorafgaand aan het begin van de MS-ziekte. Er wordt een raamwerk geformuleerd dat kan dienen als leidraad voor verder epidemiologisch, immunologisch en moleculair biologisch onderzoek. Deze aanpak kan licht werpen op de complexe natuurlijke historie van MS en kan leiden tot rationele preventieve en therapeutische strategieën. Het is mogelijk dat MS in de toekomst voorkomen kan worden door vaccinatie tegen EBV in de vroege kindertijd; het raamwerk is relevant voor het ontwerp van een geschikt type vaccin.
|
Hangt het risico op multiple sclerose samen met de ‘biografie’ van het immuunsysteem?
|
jy7j8sh0
|
ACHTERGROND: Humane rhinovirussen (HRVs) zijn een zeer veelvoorkomende oorzaak van acute luchtweginfecties bij kinderen. Ze worden ingedeeld in ten minste drie soorten, HRV-A, HRV-B en HRV-C, die worden gekarakteriseerd door sequencing van het 5′ untranslated region (UTR) of het VP4/VP2 gebied van het genoom. Gezien de toegenomen belangstelling voor de identificatie van nieuwe HRV-stammen en hun wereldwijde verspreiding, hebben we in een tweejarige studie bij kinderen met acute luchtweginfectie die een districtsziekenhuis in Shanghai bezochten, een klinische en moleculaire diagnose van HRV-stammen uitgevoerd. METHODOLOGIE/RESULTATEN: We cloneerden en sequensten een fragment van 924 nt dat een deel van het 5′UTR en de VP4/VP2 capsidegenen omvatte. Onder 827 kinderen met een acute infectie van de onderste luchtwegen werden 64 HRV-geïnfecteerde poliklinische patiënten gediagnosticeerd. Twee monsters waren geco-infecteerd met HRV-A en HRV-B of HRV-C. Door middel van vergelijkende analyse van de VP4/VP2 sequenties van de 66 HRVs, toonden we een hoge diversiteit aan stammen in HRV-A en HRV-B soorten, en een prevalentie van 51,5% van de stammen die behoorden tot de recent geïdentificeerde HRV-C soort. Bij analyse van een fragment van het 5′ UTR karakteriseerden we ten minste twee subsoorten van HRV-C: HRV-Cc, die anders clusterde dan HRV-A en HRV-B, en HRV-Ca, die het resultaat was van eerdere recombinatie in dit gebied met sequenties gerelateerd aan HRV-A. De volledige sequentie van één stam van elk HRV-Ca en HRV-Cc subsoort werd verkregen voor vergelijkende analyse. We bevestigden de nauwe verwantschap van hun structurele eiwitten, maar toonden duidelijke extra recombinatie-evenementen aan in het 2A gen en 3′UTR van de HRV-Ca stam. Dubbele of drievoudige infecties met HRV-C en respiratoir syncytieel virus en/of bocavirus werden gediagnosticeerd bij 33,3% van de HRV-geïnfecteerde patiënten, maar er werd geen correlatie met de ernst van de klinische uitkomst waargenomen. CONCLUSIE: Onze studie toonde een hoge diversiteit aan HRV-stammen die bronchitis en pneumonie bij kinderen veroorzaken. Er werd een overwicht van HRV-C ten opzichte van HRV-A en HRV-B waargenomen, en er werden twee subsoorten van HRV-C geïdentificeerd, waarvan de diversiteit gerelateerd leek te zijn aan recombinatie met vroegere HRV-A stammen. Geen van de HRV-C stammen leek een grotere klinische impact te hebben dan HRV-A of HRV-B op respiratoire compromittering.
|
Bewijs van recombinatie en genetische diversiteit in humane rhinovirussen bij kinderen met acute luchtweginfectie
|
3p81yr4n
|
Postertentoonstelling
|
|
t579ysgl
|
Dit is deel II van een tweeluik over het beoordelen van thoraxfoto's bij kritiek zieke patiënten. Conventionele thoraxradiografie blijft de hoeksteen van de dagelijkse behandeling van kritiek zieke patiënten, af en toe aangevuld met computertomografie of echografie voor specifieke indicaties. In deze tweede review bespreken we radiografische bevindingen van cardiopulmonale aandoeningen die vaak voorkomen bij intensive care patiënten en suggereren we richtlijnen voor interpretatie, gebaseerd niet alleen op beeldvorming, maar ook op de pathofysiologie en klinische gronden.
|
Het beoordelen van thoraxfoto's bij kritiek zieke patiënten (Deel II): Radiografie van longpathologieën die vaak voorkomen bij IC-patiënten
|
9ofqelrm
|
INLEIDING: De precieze rol van cytomegalovirus (CMV)-infectie bij het bijdragen aan de uitkomsten bij kritiek zieke immuuncompetente patiënten is niet volledig gedefinieerd. METHODEN: Studies waarin kritiek zieke immuuncompetente volwassenen werden gemonitord op CMV-infectie op de intensive care unit (ICU) werden beoordeeld. RESULTATEN: CMV-infectie komt voor bij 0 tot 36% van de kritiek zieke patiënten, meestal tussen 4 en 12 dagen na opname op de ICU. Mogelijke risicofactoren voor CMV-infectie zijn sepsis, noodzaak van beademing en transfusie. Verlengde beademing (21 tot 39 dagen versus 13 tot 24 dagen) en duur van het ICU-verblijf (33 tot 69 dagen versus 22 tot 48 dagen) correleerden significant met een hoger risico op CMV-infectie. Mortaliteitscijfers bij patiënten met een CMV-infectie waren in sommige, maar niet alle studies hoger. Of CMV direct een febriele syndroom of orgaanschade veroorzaakt bij deze patiënten is niet bekend. CONCLUSIES: CMV-infectie komt frequent voor bij kritiek zieke immuuncompetente patiënten en kan geassocieerd zijn met slechte uitkomsten. Nader onderzoek is gerechtvaardigd om subgroepen van patiënten te identificeren die waarschijnlijk een CMV-infectie ontwikkelen en om de impact van antivirale middelen op klinisch relevante uitkomsten bij deze patiënten te bepalen.
|
Cytomegalovirusinfectie bij kritiek zieke patiënten: een systematische review
|
bnkbwh3w
|
INLEIDING: Aandoeningen van de onderste luchtwegen door respiratoir syncytieel virus (RSV) worden gekenmerkt door vernauwing van de luchtwegen, resulterend in verhoogde luchtwegweerstand, luchtinsluiting en respiratoire acidose. Deze problemen zouden kunnen worden overwonnen met behulp van een helium-zuurstof gasmengsel. Het effect van beademing met heliox bij deze patiënten is echter onduidelijk. Het doel van deze prospectieve cross-over studie was om de effecten van beademing met heliox 60/40 versus conventioneel gas op de weerstand van het ademhalingssysteem, luchtinsluiting en CO2-eliminatie te bepalen. METHODEN: Mechanisch beademde, gesedeerde en geparalyseerde zuigelingen met bewezen RSV werden binnen 24 uur na opname op de pediatrische intensive care unit (PICU) opgenomen. Bij T = 0 werden de mechanica van het ademhalingssysteem, inclusief de compliantie en weerstand van het ademhalingssysteem, en de piek expiratoire flow gemeten met de AVEA beademingsapparaat. De metingen werden herhaald bij elk interval (na 30 minuten beademing met heliox, na 30 minuten beademing met nitrox en opnieuw na 30 minuten beademing met heliox). Indices van gasuitwisseling (ventilatie- en oxygenatie-index) werden bij elk interval berekend. Luchtinsluiting (gedefinieerd door relatieve verandering in het eind-expiratoire longvolume) werd bepaald door elektrische impedantietomografie (EIT) bij elk interval. RESULTATEN: Dertien zuigelingen werden opgenomen. Bij negen werden EIT-metingen uitgevoerd. Beademing met heliox verlaagde de weerstand van het ademhalingssysteem significant. Dit ging niet gepaard met een verbeterde CO2-eliminatie, verlaagde piek expiratoire flow of verlaagd eind-expiratoir longvolume. Belangrijk is dat de oxygenatie gedurende het hele experimentele protocol ongewijzigd bleef. CONCLUSIES: De weerstand van het ademhalingssysteem wordt significant verlaagd door beademing met heliox (ISCRTN98152468).
|
Heliox vermindert de weerstand van het ademhalingssysteem bij door respiratoir syncytieel virus veroorzaakte ademhalingsinsufficiëntie
|
ucn7t3sg
|
ACHTERGROND: Cyclooxygenase-2 (COX-2) wordt overgeëxprimeerd in colorectale kanker (CRC), waardoor tumorcellen resistent worden tegen apoptose. Selectieve COX-2-inhibitie is effectief in CRC-preventie, hoewel het nadelige cardiovasculaire effecten heeft, waardoor de focus is verschoven naar downstream pathways. METHODEN: Microarray-experimenten identificeerden genen die gereguleerd worden door COX-2 in HCA7 CRC-cellen. De in vitro en in vivo regulatie van DRAK2 (DAP kinase-related apoptosis-inducing kinase 2 of STK17β, een apoptose-inducerende kinase) door COX-2 werd gevalideerd door qRT-PCR. RESULTATEN: Inhibitie van COX-2 induceerde apoptose en verhoogde de DRAK2-expressie in HCA7-cellen (4,4-voudige toename na 4 uur door qRT-PCR, P=0,001), een effect dat werd voorkomen door co-administratie van PGE(2). DRAK2-niveaus werden onderdrukt in een panel van humane colorectale tumoren (n=10) vergeleken met normaal mucosa, en vertoonden een inverse correlatie met COX-2-expressie (R=−0,68, R(2)=0,46, P=0,03). Toediening van de selectieve COX-2-remmer rofecoxib aan patiënten met CRC (n=5) induceerde DRAK2-expressie in tumoren (2,5-voudige toename, P=0,01). In vitro silencing van DRAK2 door RNAi verbeterde de overleving van CRC-cellen na behandeling met een COX-2-remmer. CONCLUSIE: DRAK2 is een serine-threonine kinase betrokken bij de regulatie van apoptose en wordt negatief gereguleerd door COX-2 in vitro en in vivo, wat wijst op een nieuw mechanisme voor het effect van COX-2 op de overleving van kankercellen.
|
Regulatie van de apoptose-inducerende kinase DRAK2 door cyclooxygenase-2 in colorectale kanker
|
1xgjdhkx
|
ACHTERGROND: De familie Picornaviridae bevat een aantal belangrijke pathogene virussen, waaronder de recent herclassificeerde humane parechovirussen (HPeV's). Deze virussen zijn wijdverspreid en kunnen in verschillende types worden ingedeeld. Inzicht in de evolutionaire geschiedenis van HPeV zou vragen kunnen beantwoorden zoals hoe lang de circulerende lineages een gemeenschappelijke voorouder deelden en hoe de evolutie van deze virale soort wordt gevormd door de populatiedynamiek. Met behulp van zowel strikte als ontspannen klok Bayesiaanse fylogenetica onderzochten we 1) de substitutiesnelheden van de structurele P1 en capside VP1 regio's en 2) de evolutionaire tijdschaal van momenteel circulerende HPeV lineages. RESULTATEN: Onze schattingen onthullen dat humane parechovirussen hoge substitutiesnelheden vertonen voor zowel de structurele P1 als de capside VP1 regio's, respectievelijk 2,21 × 10(-3) (0,48 – 4,21 × 10(-3)) en 2,79 × 10(-3) (2,05 – 3,66 × 10(-3)) substituties per site per jaar. Deze liggen binnen het bereik dat geschat is voor andere picornavirussen. Door een constante populatiegrootte coalescente prior te gebruiken, werd de datum van de meest recente gemeenschappelijke voorouder geschat op ongeveer 1600 (1427–1733). Bovendien tonen we, door te kijken naar de frequentie van synonieme en niet-synonieme substituties binnen het VP1-gen, aan dat zuiverende selectie de dominante evolutionaire kracht is die leidt tot sterke aminozuurconservering. CONCLUSIE: Concluderend geven onze schattingen een tijdschaal voor de evolutie van HPeV's en suggereren ze dat de genetische diversiteit van de huidige circulerende HPeV-types ongeveer 400 jaar geleden is ontstaan.
|
De evolutie van humane parechovirussen in de tijd plaatsen
|
wtsyzmo0
|
De eerste HIV-infectie in China werd officieel gemeld in 1985 en tegen het einde van 1996 waren er mogelijk tot 200.000 mensen in het hele land getroffen. In 2001 overschreed dit aantal waarschijnlijk 600.000. Tegen 2003 had het voorspelde aantal HIV-gevallen 1,5 miljoen bereikt. Ten minste 80.000 personen hebben nu volledig ontwikkelde AIDS. China heeft mogelijk binnenkort de grootste HIV-geïnfecteerde bevolking ter wereld, mogelijk 6 miljoen gevallen tegen 2005. Met infectiepercentages die met ongeveer 30% per jaar stijgen, wordt gevreesd dat dit aantal tegen 2010 de 10 miljoen zou kunnen overschrijden. Hoewel de Chinese regering aanvankelijk traag was om het probleem te erkennen, begonnen er eind jaren negentig duidelijke veranderingen plaats te vinden. In 2003 schudde premier Wen Jiabao publiekelijk de hand van een AIDSpatiënt en beloofde zijn regering een reeks gratis HIV-gerelateerde diensten in te voeren. Grote preventieve voorlichtingcampagnes zijn nu aan de gang. Helaas zullen er nog steeds vele obstakels zijn bij het beheersen van de epidemie en het voorkomen van verdere verspreiding van deze ziekte. Zonder twijfel staat China voor een ernstig probleem in het nieuwe millennium, een probleem dat talloze uitdagingen voor de preventieve geneeskunde zal opleveren.
|
HIV/AIDS-preventie in China: Een uitdaging voor het nieuwe millennium
|
dqp4lzqs
|
Het gebruik van dieren als sentinels voor menselijke ziekten draait om het concept van nidality. Dat wil zeggen, een ziekteverwekker bezet een specifieke ecologische niche en veranderingen in die niche zullen de functie van die verwekker veranderen ten opzichte van traditionele gastheer-verwekker-omgevingsrelaties. Nidality is een afleiding van het woord nidus. Nidus wordt gedefinieerd als een nest of broedplaats, met name een plaats waar microben zoals bacteriën, schimmels, virussen, evenals andere organismen en grotere parasieten, zich bevinden en vermenigvuldigen. De toepassing van het concept van nidality en de ontwikkeling van preventiestrategieën zijn het meest geassocieerd met militaire campagnes en de onderbreking van door teken overgedragen infecties. Het moderne gebruik van de term "One Medicine" werd in de Verenigde Staten en Europa gepopulariseerd door Calvin Schwabe en het concept wordt toegeschreven aan Rudolph Virchow. Het wordt vandaag de dag toegepast op de studie van zoönotische ziekten en interventies in rurale agrarische gemeenschappen die nauwe leefomstandigheden delen tussen mensen en hun families, hun pastorale werkomgeving en de dieren waarvoor ze zorgen. Integratie van de twee concepten van One Medicine en nidality biedt een kans om een systeembenadering (d.w.z. algemene systeemtheorie) toe te passen bij het omgaan met opkomende zoönotische ziekten in de huidige mondiale agrarische en industriële omgevingen.
|
Opkomende zoönotische ziekten: Een kans om de concepten van nidality en One Medicine toe te passen
|
1qo1krxv
|
De incidentie en frequentie van epidemische transmissie van zoönotische ziekten, zowel bekende als nieuw ontdekte, is de afgelopen 30 jaar dramatisch toegenomen. Men denkt dat deze dramatische opkomst van ziekten voornamelijk het gevolg is van de sociale, demografische en ecologische transformatie die zich wereldwijd sinds de Tweede Wereldoorlog heeft voorgedaan. De causale verbanden zijn echter niet opgehelderd. Het onderzoeken van opkomende zoönotische pathogenen als een ecologisch fenomeen kan belangrijke inzichten verschaffen in de reden waarom sommige van deze pathogenen van soort zijn gewisseld en grote epidemieën bij mensen hebben veroorzaakt. Een overzicht van concepten en theorieën uit de biologische ecologie en van eerder beschreven causale factoren bij de opkomst van ziekten suggereert een algemeen model van de globale opkomst van zoönotische ziekten. Het model verbindt demografische en maatschappelijke factoren met veranderingen in landgebruik en -bedekking, waarvan de geassocieerde ecologische factoren de opkomst van ziekten helpen verklaren. De schaal en omvang van deze veranderingen zijn significanter dan die geassocieerd met klimaatverandering, waarvan de effecten grotendeels nog niet begrepen zijn. Helaas maakt het complexe karakter en het niet-lineaire gedrag van de mens-natuurlijke systemen waarin gastheer-pathogeen systemen zijn ingebed, specifieke gevallen van ziekte-opkomst of epidemieën inherent moeilijk te voorspellen. Het toepassen van een complexe systemen analytische benadering kan echter laten zien hoe een paar belangrijke ecologische variabelen en systeem eigenschappen, inclusief het adaptief vermogen van instellingen, de opkomst van infectieziekten verklaart en hoe een geïntegreerde, meerlagige aanpak van zoönotische ziektebestrijding het risico kan verminderen.
|
Ziekte-ecologie en de globale opkomst van zoönotische pathogenen
|
0jj9svwj
|
Dit artikel verkent de mogelijkheden voor wereldwijd bestuur om effectief om te gaan met de internationale overdracht van ziekten. Ten eerste vormen zoönotische regulering en controle een speciaal geval voor instanties voor de volksgezondheid, en dit artikel stelt een propositioneel model voor voor een effectieve houding op het gebied van de volksgezondheid. Ten tweede worden de dynamiek van globalisering kort besproken in termen van een opkomende consensus over de noodzaak van wereldwijd bestuur in de volksgezondheid. Ten derde suggereert een kort onderzoek naar modaliteiten van wereldwijd bestuur dat een sterk pleidooi voor wereldwijd bestuur duidelijke beperkingen heeft (ondanks de mogelijke rechtvaardiging); een verkenning van hedendaagse richtingen in wereldwijd bestuur volgt. Ten slotte onderzoekt het artikel het fenomeen van hedendaagse zoönotische controle binnen de voorwaarden van een effectief regelgevingsregime.
|
Globalisering en opkomende besturingsmodaliteiten
|
6d9x0xbj
|
Imidazoline receptoren werden voor het eerst voorgesteld door Bousquet et al., toen zij het antihypertensieve effect van clonidine bestudeerden. Een sterke kandidaat voor I1R, bekend als imidazoline receptor antisera-geselecteerd eiwit (IRAS), is gekloond uit de humane hippocampus. Wij rapporteerden dat IRAS de agmatine-geïnduceerde inhibitie van opioïde afhankelijkheid in morfine-afhankelijke cellen medieerde. Om de functionele en structurele eigenschappen van I1R te verduidelijken, ontwikkelden wij een nieuw monoklonaal antilichaam tegen het N-terminale hIRAS gebied, inclusief het PX domein (10–120aa), door immunisatie van BALB/c muizen met het NusA-IRAS fusie-eiwit dat een IRAS N-terminus (10–120aa) bevat. Stabiele hybrideoma cellijnen werden gevestigd en monoklonale antilichamen herkenden specifiek full-length IRAS eiwitten in hun natuurlijke staat door middel van immunoblotting en immunoprecipitatie. Monoklonale antilichamen kleurde in een overwegend punctate cytoplasmatische patroon bij toepassing op IRAS-getransfecteerde HEK293 cellen door indirecte immunofluorescentie assays en toonden een uitstekende reactiviteit in flow immunocytometrie. Deze monoklonale antilichamen zullen krachtige reagentia leveren voor verder onderzoek naar de functies van hIRAS eiwitten.
|
Generatie en karakterisering van nieuwe humane IRAS monoklonale antilichamen
|
22veehj5
|
30 jaar voordat het pfcrt-gen werd ontdekt, was de veranderde cellulaire drugaccumulatie in drug-resistente malariaparasieten al goed gedocumenteerd. Heme, vrijgemaakt uit gekataboliseerd hemoglobine, werd beschouwd als een belangrijk doelwit voor quinolinegeneesmiddelen, en in enkele laboratoria werden aanvullende modificaties aan de structuur van quinolinegeneesmiddelen aangebracht om de activiteit tegen chloroquineresistente malaria te verbeteren. Echter, parasite celkweekmethoden stonden nog in de kinderschoenen, testen voor drugsgevoeligheid waren niet goed gestandaardiseerd, en de kracht van de malaria genetica lag nog decennia in de toekomst. De afgelopen 10 jaar hebben een explosieve vooruitgang laten zien in de opheldering van de biochemie van chloroquineresistentie. Deze review vat die vooruitgang kort samen en bespreekt waar aanvullend werk nodig is.
|
Moleculaire en fysiologische basis van quinolineresistentie bij Plasmodium falciparum malaria
|
4psg0z3n
|
Omdat de risico's op infectie met het vogelgriepvirus H5N1 geassocieerd zijn met blootstelling aan besmet pluimvee, hebben we een onderzoek uitgevoerd naar kennis, attitudes en praktijken rondom het hanteren van pluimvee onder dorpelingen in het platteland van Cambodja. Ondanks de wijdverbreide kennis van vogelgriep en persoonlijke beschermingsmaatregelen, vertonen de meeste plattelandsbewoners in Cambodja nog steeds een hoog niveau van risicovol pluimveehantering.
|
Interactie tussen Mensen en Pluimvee, Plattelands Cambodja
|
5apikyi7
|
Wilde vogels delen met mensen het vermogen zich snel over grote afstanden te verplaatsen. Tijdens trekbewegingen dragen vogels pathogenen die tussen soorten kunnen worden overgedragen op broed-, overwinterings- en rustplaatsen waar talloze vogels van verschillende soorten geconcentreerd zijn. We beschouwen het gebied van de Camargue (Zuid-Frankrijk) als voorbeeld om te laten zien hoe reeds beschikbare ad hoc informatie over de bewegingen, abundantie en diversiteit van vogels kan helpen bij het beoordelen van het introductie- en transmissierisico voor door vogels overgedragen ziekten in de West-Mediterrane wetlands. Aviaire influenza en Westnijlvirussen worden als voorbeelden gebruikt omdat vogels centraal staan in de epidemiologie van deze virussen.
|
Trekroutes van vogels en risico op verspreiding van pathogenen in West-Mediterrane wetlands
|
vueo83vk
|
INLEIDING: Auto-immuun hemolytische anemie bij kinderen jonger dan 2 jaar wordt meestal gekenmerkt door een ernstig beloop, met een mortaliteitspercentage van ongeveer 10%. De langdurige immunosuppressie na specifieke behandeling kan gepaard gaan met een hoog risico op het ontwikkelen van ernstige infecties. Recent heeft het gebruik van monoklonale antilichamen (rituximab) het mogelijk gemaakt om bij de meerderheid van de pediatrische patiënten met refractaire auto-immuun hemolytische anemie duurzame remissies te verkrijgen. CASUSPRESENTATIE: We beschrijven het geval van een 8 maanden oud blank meisje met een ernstige vorm van auto-immuun hemolytische anemie, die gedurende 16 maanden continue steroïde behandeling nodig had. Daarna kreeg ze 4 wekelijkse doses rituximab (375 mg/m(2)/dosis) in combinatie met steroïdetherapie, die vervolgens gedurende de volgende 2 weken werd afgebouwd. Een maand na de laatste dosis rituximab presenteerde ze zich met recidief van ernstige hemolyse en kreeg ze nog twee doses rituximab. De patiënt bleef 7 maanden in klinische remissie, voordat ze een nieuwe terugval kreeg. Een alternatieve zware immunosuppressieve therapie werd toegediend, bestaande uit cyclofosfamide 10 mg/kg/dag gedurende 10 dagen in combinatie met methylprednisolon 40 mg/kg/dag gedurende 5 dagen, die vervolgens gedurende 3 weken werd afgebouwd. Tijdens de steroïdetherapie ontwikkelde de patiënt een interstitiële pneumonie met acuut respiratoir distress syndroom, wat een onmiddellijke opname op de intensive care vereiste, waar extracorporele membraan oxygenatietherapie gedurende 37 dagen continu werd toegediend. Na 16 maanden follow-up leeft de patiënt en verkeert ze in een goede klinische conditie, zonder orgaan disfunctie, zonder immunosuppressieve behandeling en met een normaal Hb-niveau. CONCLUSIES: Deze casus laat zien dat agressieve gecombineerde immunosuppressieve therapie kan leiden tot een duurzame complete remissie bij kinderen met refractaire auto-immuun hemolytische anemie. De ernstige, levensbedreigende complicatie die zich bij onze patiënt voordeed, wijst er echter op dat strikte klinische monitoring alert moet worden uitgevoerd, dat antimicrobiële profylaxe altijd moet worden overwogen en dat ervaren medisch en verplegend personeel beschikbaar moet zijn om indien nodig zeer gespecialiseerde ondersteunende reddingstherapieën te leveren tijdens intensieve zorgmonitoring.
|
Verlengde extracorporele membraan oxygenatietherapie voor ernstig acuut respiratoir distress syndroom bij een kind met rituximab-resistente auto-immuun hemolytische anemie: een casusbeschrijving
|
3gwm1c2f
|
Het behoud van de functie van het endoplasmatisch reticulum (ER) wordt gedeeltelijk bereikt via Ire1 (inositol-requiring enzyme 1), een transmembraaneiwit dat wordt geactiveerd door eiwitmisvouwing in het ER. Het cytoplasmatische nucleasedomein van Ire1 knipt het messenger RNA (mRNA) dat codeert voor XBP-1 (X-box–bindend eiwit 1), waardoor splicing en productie van deze actieve transcriptiefactor mogelijk worden. We hebben recent aangetoond dat Ire1-activatie onafhankelijk de snelle omzetting induceert van mRNA's die coderen voor membraan- en secretie-eiwitten in Drosophila melanogaster-cellen via een pathway die we gereguleerde Ire1-afhankelijke afbraak (RIDD) noemen. In deze studie tonen we aan dat muisfibroblasten die wild-type Ire1 tot expressie brengen, maar niet een Ire1-variant die geen nuclease-activiteit heeft, ook mRNA's afbreken als reactie op ER-stress. Met behulp van een tweede variant van Ire1 die wordt geactiveerd door een klein adenosine trifosfaatanaloog, tonen we aan dat hoewel XBP-1-splicing kunstmatig kan worden geïnduceerd in afwezigheid van ER-stress, RIDD zowel Ire1-activiteit als ER-stress lijkt te vereisen. Onze gegevens suggereren dat cellen een meerlagig mechanisme gebruiken waarbij verschillende condities in het ER leiden tot verschillende outputs van Ire1.
|
Gereguleerde Ire1-afhankelijke afbraak van messenger RNA's in zoogdiercellen
|
ajz4ef44
|
DNA-sequenties, zoals die in de normale karaktergebaseerde representatie worden weergegeven, lijken een enorme menging van de vier nucleotiden te vertonen zonder enige duidelijke ordening. Nucleotide frequenties en distributies in de sequenties zijn uitgebreid bestudeerd, sinds de eenvoudige regel die bijna een eeuw geleden door Chargaff werd gegeven, die het totale aantal purines gelijk stelt aan de pyrimidines in een duplex DNA-sequentie. Hoewel het moeilijk is om enige relatie tussen de basen te traceren vanuit studies in de karakterrepresentatie van een DNA-sequentie, kunnen grafische representaties een aanwijzing geven. Deze nieuwe representaties van DNA-sequenties zijn nuttig gebleken bij het geven van een overzicht van de basedistributie en -samenstelling van de sequenties en het verschaffen van inzichten in vele verborgen structuren. We rapporteren hier onze observatie, gebaseerd op een grafische representatie, dat de intra-purine en intra-pyrimidine verschillen in sequenties van geconserveerde genen over het algemeen een kwadratische distributierelatie volgen en laten zien dat dit mogelijk is ontstaan uit mutaties in de sequenties over evolutionaire tijdschalen. Vanuit deze tot nu toe onbeschreven relatie voor de in dit rapport beschouwde gensequenties, hypothetiseren we dat dergelijke relaties kenmerkend kunnen zijn voor deze sequenties en daarom een barrière zouden kunnen vormen voor grootschalige sequentie-veranderingen die dergelijke kenmerken tenietdoen, misschien via een ingebouwd monitoringproces in de DNA-sequenties. Een dergelijke relatie roept ook de mogelijkheid op dat intronsequenties een belangrijke rol spelen bij het handhaven van de kenmerken en zou indicatief kunnen zijn voor mogelijke intron-late fenomenen.
|
Empirische Relatie tussen Intra-Purine en Intra-Pyrimidine Verschillen in Geconserveerde Gensequenties
|
utmt5sva
|
Doel De acceptatie van pre-pandemie grieppreventie onder zorgverleners in openbare ziekenhuizen in Hongkong te beoordelen en het effect van escalatie in het waarschuwingsniveau van de Wereldgezondheidsorganisatie voor een grieppandemie. Opzet Herhaalde cross-sectionele studies met behulp van zelf-toegediende, anonieme vragenlijsten. Setting Enquêtes op 31 ziekenhuisafdelingen interne geneeskunde, pediatrie en spoedeisende hulp onder de Hong Kong Hospital Authority van januari tot maart 2009 en in mei 2009. Deelnemers 2255 zorgverleners vulden de vragenlijsten in tijdens de twee studies. Dit waren artsen, verpleegkundigen of paramedici werkzaam in het openbare ziekenhuissysteem. Belangrijkste uitkomstmaten Verklaarde bereidheid om pre-pandemie grieppreventie (influenza A subtypes H5N1 of H1N1) te accepteren en de daarmee geassocieerde factoren. Resultaten De algemene bereidheid om pre-pandemie H5N1-vaccin te accepteren was slechts 28,4% in het eerste onderzoek, uitgevoerd in fase 3 van de WHO-grieppandemie-waarschuwing. Er werden geen significante veranderingen waargenomen in de bereidheid om pre-pandemie H5N1-vaccin te accepteren ondanks de escalatie naar waarschuwingsfase 5. De bereidheid om pre-pandemie H1N1-vaccin te accepteren was 47,9% onder zorgverleners toen het WHO-waarschuwingsniveau in fase 5 was. De meest voorkomende redenen voor de intentie om te accepteren waren "het verlangen beschermd te worden" en "het volgen van het advies van de gezondheidsautoriteiten". De belangrijkste geconstateerde barrières waren angst voor bijwerkingen en twijfels over de werkzaamheid. Meer dan de helft van de respondenten vond dat verpleegkundigen de eerste prioriteitsgroep zouden moeten zijn om de vaccins te ontvangen. De sterkste positief geassocieerde factoren waren een voorgeschiedenis van seizoensgriepvaccinatie en het waargenomen risico om de infectie op te lopen. Conclusies De bereidheid om pre-pandemie grieppreventie te accepteren was laag, en er werd geen significant effect waargenomen bij de verandering in WHO-waarschuwingsniveau. Nader onderzoek is nodig om de hoofdoorzaak van de lage intentie om pre-pandemie vaccinatie te accepteren te achterhalen.
|
Bereidheid van zorgverleners in Hongkong om pre-pandemie grieppreventie te accepteren bij verschillende WHO-waarschuwingsniveaus: twee vragenlijstonderzoeken
|
xjspi65a
|
Herpesvirussen vormen een familie van grote DNA-virussen die wijdverspreid zijn in gewervelden en een verscheidenheid aan verschillende ziekten veroorzaken. Ze bezitten dsDNA-genomen variërend van 120 tot 240 kbp die coderen voor 70 tot 170 open leesramen. We rapporteerden eerder de eiwit-interactienetwerken van twee herpesvirussen, varicella-zostervirus (VZV) en Kaposi's sarcoma-geassocieerd herpesvirus (KSHV). In deze studie hebben we systematisch drie extra herpesvirussoorten getest, herpes simplex virus 1 (HSV-1), murien cytomegalovirus en Epstein-Barr virus, op eiwitinteracties om een vergelijkende analyse van alle drie herpesvirus-subfamilies te kunnen uitvoeren. We identificeerden 735 interacties door genome-wide yeast-two-hybrid screens (Y2H), en, samen met de interactomen van VZV en KSHV, werden in totaal 1007 intravirale eiwitinteracties in de analyse opgenomen. Terwijl een groot aantal interacties niet eerder is gerapporteerd, konden we een kernset van sterk geconserveerde eiwitinteracties identificeren, zoals de interactie tussen HSV-1 UL33 met de nucleaire egress-eiwitten UL31/UL34. Interacties waren geconserveerd tussen orthologe eiwitten ondanks over het algemeen lage sequentie-overeenkomst, wat suggereert dat functie meer geconserveerd kan zijn dan sequentie. Door interactomen van verschillende soorten te combineren konden we de lage dekking van het Y2H-systeem systematisch aanpakken en biologisch relevante interacties extraheren die niet evident waren uit enkelvoudige soorten.
|
Evolutionair Geconserveerde Herpesvirus Proteïne-interactienetwerken
|
wup6tig0
|
Polymorfisme van het angiotensine converterend enzym (ACE) gen wordt gerapporteerd geassocieerd te zijn met ischemische hartziekte, hypertrofische cardiomyopathie en idiopathische gedilateerde cardiomyopathie. In deze studie onderzochten we de relatie tussen Kawasaki ziekte en insertie/deletie polymorfisme van het ACE gen. Vijfentachtig Kawasaki ziekte patiënten en 43 gezonde kinderen werden opgenomen. Het ACE genotype werd geëvalueerd van elk van de DNA fragmenten van de proefpersonen via polymerase kettingreactie (PCR). Frequenties van ACE genotypes (DD, ID, II) waren respectievelijk 12,7%, 60,0%, 27,3% in de Kawasaki groep, en 41,9%, 30,2%, 27,9% in de controlegroep, wat wijst op een lage frequentie van DD en een hoge frequentie van het ID genotype onder Kawasaki patiënten (p<0,01). Bij vergelijking van allelische (I, D) frequenties, was het I allel meer prevalent in de Kawasaki groep dan in de controlegroep (57,3% vs. 43,0%, p<0,05). In de Kawasaki groep waren zowel genotype als allelische frequenties niet statistisch significant verschillend tussen degenen met coronaire dilataties en degenen zonder. ACE gen I/D polymorfisme wordt verondersteld geassocieerd te zijn met Kawasaki ziekte, maar niet met de ontwikkeling van coronaire dilataties.
|
Insertie/Deletie Polymorfisme van het Angiotensine Converterend Enzymen Gen bij Kawasaki Ziekte
|
3zh8jmc2
|
Een aantal paramyxovirussen zijn verantwoordelijk voor acute respiratoire infecties bij kinderen, ouderen en immuungecompromitteerde individuen, resulterend in luchtweginflammaties en verergering van chronische ziekten zoals astma. Om de moleculaire pathogenese van deze infecties te begrijpen, hebben we gezocht naar cellulaire targets van het virulentieproteïne C van humaan parainfluenzavirus type 3 (hPIV3-C). We vonden dat hPIV3-C direct via zijn C-terminale domein interageert met STAT1 en GRB2, terwijl C-proteïnen van mazelen of Nipah-virussen dit niet deden. Binding aan STAT1 verklaart de eerder gerapporteerde capaciteit van hPIV3-C om type I interferon signalering te blokkeren, maar de interactie met GRB2 was onverwacht. Dit adaptereiwit verbindt de epidermale groeifactor (EGF) receptor met het MAPK/ERK pathway, een signaalcascade die recent betrokken is gebleken bij de luchtweginflamatoire respons. We rapporteren dat zowel hPIV3-infectie als transiënte expressie van hPIV3-C beide de cellulaire respons op EGF verhogen, zoals beoordeeld door Elk1 transactivatie en fosforyleringsniveaus van ERK1/2, 40S ribosomale subeenheid proteïne S6 en translatie-initiatiefactor 4E (eIF4E). Verder voorkwam inhibitie van het MAPK/ERK pathway met U0126 virale proteinexpression in geïnfecteerde cellen. Al met al leveren onze gegevens een moleculaire basis om de rol van hPIV3-C als virulentiefactor en determinant van pathogenese te verklaren en demonstreren dat Paramyxoviridae een enkele virulentiefactor hebben geëvolueerd om type I interferon signalering te blokkeren en tegelijkertijd de cellulaire respons op groeifactoren te versterken.
|
Differentiële regulatie van type I interferon en epidermale groeifactor pathways door een virulentiefactor van een humaan respiratoir virus
|
3b8b8p61
|
Het aangeboren immuunsysteem reageert op unieke moleculaire handtekeningen die wijdverspreid geconserveerd zijn onder microben, maar die normaal gesproken niet aanwezig zijn in gastheercellen. Verbindingen die aangeboren immuunroutes stimuleren, kunnen waardevol zijn bij het ontwerpen van nieuwe adjuvantia, vaccins en andere immunotherapeutica. Het cyclische dinucleotide cyclisch-di-guanosinemonofosfaat (c-di-GMP) is een recent gewaardeerde secundaire boodschapper die kritische regulerende rollen speelt in vele bacteriesoorten, maar niet wordt geproduceerd door eukaryote cellen. In vivo en in vitro studies hebben eerder gesuggereerd dat c-di-GMP een potente immunostimulerende verbinding is die wordt herkend door muis- en menselijke cellen. Wij leveren bewijs dat c-di-GMP wordt waargenomen in het cytosol van zoogdiercellen via een nieuwe immunosurveillance route. De potentie van de cytosolaire signalering geïnduceerd door c-di-GMP is vergelijkbaar met die geïnduceerd door cytosolaire afgifte van DNA, en beide nucleïnezuren induceren een vergelijkbaar transcriptioneel profiel, inclusief het activeren van type I interferonen en coregulerende genen via inductie van TBK1, IRF3, nucleaire factor κB en MAP-kinasen. Het cytosolaire pad dat c-di-GMP detecteert lijkt echter te verschillen van alle bekende nucleïnezuur-detectieroutes. Onze resultaten suggereren een nieuw mechanisme waardoor gastheercellen een ontstekingsreactie kunnen induceren op een wijdverspreid geproduceerde bacteriële ligand.
|
Een type I interferonrespons van de gastheer wordt geïnduceerd door cytosolaire detectie van de bacteriële secundaire boodschapper cyclisch-di-GMP
|
0p8lk12m
|
ACHTERGROND: Verwerking door γ-secretase van vele type-I membraaneiwitsubstraten triggert signaalcascades door de afgifte van intracellulaire domeinen (ICD's) die, na nucleaire translocatie, de transcriptie van verschillende genen moduleren die een diverse reeks cellulaire en biologische processen reguleren. Omdat de lijst van γ-secretase substraten snel groeit en dit enzym een therapeutisch doelwit is voor kanker en de ziekte van Alzheimer, is het in kaart brengen van de γ-secretase activiteit gevoelige gen transcriptie belangrijk voor het verscherpen van ons beeld van specifieke aangetaste genen, moleculaire functies en biologische pathways. METHODOLOGIE/BELANGRIJKSTE RESULTATEN: Om genen en moleculaire functies te identificeren die transcriptioneel worden beïnvloed door γ-secretase activiteit, werden de cellulaire transcriptomen van Chinese hamster ovary (CHO) cellen met verhoogde en geremde γ-secretase activiteit geanalyseerd en vergeleken met behulp van cDNA microarray. De functionele clustering door FatiGO van de 1981 geïdentificeerde genen onthulde over- en ondervertegenwoordigde groepen met meerdere activiteiten en functies. Enkele genen met de meest uitgesproken transcriptionele gevoeligheid voor γ-secretase activiteit werden geëvalueerd door real-time PCR. Onder de 21 gevalideerde genen ondersteunen de opvallend verminderde transcriptie van PTPRG en AMN1 en de verhoogde transcriptie van UPP1 potentieel gegevens over verstoringen van de celcyclus die relevant zijn voor kanker, stamcel- en neurodegeneratieve ziektenonderzoek. De mapping van interacties van eiwitten gecodeerd door de gevalideerde genen was uitsluitend gebaseerd op evidence-based data en onthulde brede effecten op Wnt pathway leden, waaronder WNT3A en DVL3. Interessant is dat de transcriptie van TERA, een gen met onbekende functie, wordt beïnvloed door γ-secretase activiteit en significant veranderd was in de geanalyseerde menselijke hersenschorsen met de ziekte van Alzheimer. CONCLUSIES/SIGNIFICANTIE: Onderzoek naar de effecten van γ-secretase activiteit op gen transcriptie heeft verschillende aangetaste clusters van moleculaire functies onthuld en, specifieker, 21 genen die een significant potentieel hebben voor een beter begrip van de biologie van γ-secretase en zijn rollen in kanker en de ziekte van Alzheimer pathologie.
|
Genexpressieprofielering in cellen met verhoogde γ-secretase activiteit
|
l0uya9dh
|
Als een belangrijke factor in de dynamiek van endemische en epidemische ziekten, is de geografische verspreiding van virussen vaak geïnterpreteerd in het licht van hun genetische geschiedenis. Helaas was het afleiden van historische verspreidings- of migratiepatronen van virussen voornamelijk beperkt tot modelvrije heuristische benaderingen die weinig inzicht bieden in de temporele setting van de ruimtelijke dynamiek. De introductie van probabilistische evolutiemodellen biedt echter unieke mogelijkheden om aan deze statistische onderneming deel te nemen. Hier introduceren we een Bayesiaans raamwerk voor inferentie, visualisatie en hypothesetesten van fylogeografische geschiedenis. Door karaktermapping te implementeren in Bayesiaanse software die tijdschaal-fylogenieën samplet, stellen we de reconstructie van getimed virale verspreidingspatronen mogelijk, terwijl we rekening houden met fylogenetische onzekerheid. Standaard Markov-modelinferentie wordt uitgebreid met een stochastische zoekvariabele selectieprocedure die de parcimonieuze beschrijvingen van het diffusie proces identificeert. Daarnaast stellen we priors voor die geografische steekproefverdelingen kunnen integreren of alternatieve hypothesen over de ruimtelijke dynamiek kunnen karakteriseren. Om de ruimtelijke en temporele informatie te visualiseren, vatten we inferenties samen met behulp van virtual globe software. We beschrijven hoe Bayesiaanse fylogeografie zich verhoudt tot eerdere parcimonieanalyse bij het onderzoek naar de oorsprong van influenza A H5N1 en de epidemiologische koppeling van H5N1 tussen steekproeflocaties. Analyse van rabiës in West-Afrikaanse hondenpopulaties onthult hoe virusdiffusie endemische instandhouding mogelijk kan maken door continue epidemische cycli. Uit deze analyses concluderen we dat ons fylogeografische raamwerk een belangrijke aanwinst zal zijn in de moleculaire epidemiologie die gemakkelijk kan worden gegeneraliseerd om biogeografie uit genetische gegevens voor veel organismen af te leiden.
|
Bayesiaanse Fylogeografie Vindt Zijn Wortels
|
rlbodumk
|
Het modelrepository (MREP) is een relationeel databasemanagementsysteem (RDBMS) ontwikkeld onder auspiciën van Models of Infectious Disease Agent Study (MIDAS). Het doel van de MREP is om de modellen, resultaten en suggesties voor het gebruik van MIDAS te organiseren en te catalogiseren en deze op te slaan op een manier die gebruikers in staat stelt modellen uit een toegangsgecontroleerde ziekte-MREP te draaien. De MREP bevat bron- en objectcode van ziektemodellen die zijn ontwikkeld door modelleurs van infectieziekten en getest in een productieomgeving. Verschillende versies van modellen die worden gebruikt om verschillende aspecten van dezelfde ziekte te beschrijven, worden in het repository bewaard. Modellen zijn gekoppeld aan hun ontwikkelaars en verschillende versies van de codes zijn gekoppeld aan Subversion, een versiebeheersysteem. Een extra element van de MREP zal zijn om toegang tot een datawarehouse van resultaten van ziektemodellen te huisvesten, te beheren en te controleren, bestaande uit output gegenereerd door de modellen in de MREP. De resultaattafels en -bestanden zijn gekoppeld aan de versie van het model en de invoerparameters die gezamenlijk de resultaten hebben gegenereerd. De resultaattafels worden opgeslagen in een relationele database die het mogelijk maakt ze gemakkelijk te identificeren, categoriseren en te downloaden.
|
Het Modelrepository van de Models of Infectious Disease Agent Study
|
dg10rf2f
|
Een doel van een HIV-vaccin is het opwekken van neutraliserende antilichamen (Nab) die de replicatie van genetisch diverse virussen kunnen beperken en het tot stand komen van een nieuwe infectie kunnen voorkomen. Het identificeren van de sterktes en zwaktes van Nab in de vroege stadia van natuurlijke infectie zou daarom nuttig kunnen zijn bij het bereiken van dit doel. Hier laten we zien dat virale ontsnapping gemakkelijk optrad ondanks de ontwikkeling van autologe Nab met een hoge titer bij twee personen met een acute/vroege subtype C infectie. Om een gedetailleerde weergave van de ontsnappingsroutes te geven, werden Nab-resistente varianten die op meerdere tijdstippen werden geïdentificeerd, gebruikt om een reeks envelop (Env)-glycoproteïne-chimeren en -mutanten te creëren binnen de achtergrond van een overeenkomstige nieuw overgedragen Env. Bij één persoon werd Nab-ontsnapping voornamelijk aangedreven door veranderingen in het gebied van gp120 dat zich uitstrekt van het begin van het V3-domein tot het einde van het V5-domein (V3V5). De Nab-ontsnappingsroutes bij deze persoon oscilleerden echter en vereisten soms samenwerking tussen V1V2 en het gp41-ectodomein. Bij de tweede persoon werd ontsnapping aangedreven door veranderingen in V1V2. Deze V1V2-afhankelijke ontsnappingsroute bleef in de tijd behouden, en het nut ervan werd weerspiegeld in het vermogen van het virus om te ontsnappen aan twee verschillende monoklonale antilichamen (Mab) afkomstig van dezelfde patiënt via de introductie van een enkele potentiële N-gebonden glycosylatiesite in V2. Ruimtelijke representatie van de sequentieveranderingen in gp120 suggereerde dat selectieve druk inwerkte op dezelfde gebieden van Env bij deze twee personen, hoewel de Env-domeinen die ontsnapping veroorzaakten verschillend waren. Samen betogen de bevindingen dat een enkel mutatiepad niet voldoende is om ontsnapping te verlenen bij vroege subtype C HIV-1 infectie, en ondersteunen ze een model waarin meerdere strategieën, waaronder potentiële glycaanverschuivingen, directe verandering van een epitoopsequentie en coöperatieve Env-domein conformationele maskering, worden gebruikt om neutralisatie te ontwijken.
|
Ontsnapping aan autologe neutraliserende antilichamen bij acute/vroege subtype C HIV-1 infectie vereist meerdere pathways
|
cijyfa4j
|
ACHTERGROND: UDP-GlcNAc 2-epimerase/ManNAc 6-kinase, GNE, is een bifunctioneel enzym dat een sleutelrol speelt in de biosynthese van sialic acid. Mutaties in het GNE-eiwit veroorzaken sialurie of autosomaal recessieve inclusion body myopathie/Nonaka myopathie. GNE is het enige humane eiwit dat een kinasedomein bevat dat behoort tot de ROK (repressor, ORF, kinase) familie. BELANGRIJKSTE RESULTATEN: We hebben de structuur van het GNE kinasedomein opgelost in de ligandvrije toestand. Het eiwit bestaat voornamelijk als dimeer in oplossing, met kleine populaties van monomeer en hogere-orde oligomeren in evenwicht met het dimeer. Kristalverpakkingsanalyse onthult het bestaan van een kristallografisch hexameer, en dat het kinasedomein dimeriseert via het C-lobe subdomein. Mapping van ziekte-gerelateerde missense mutaties op de kinase domein structuur onthulde dat de mutatieplaatsen in vier verschillende groepen kunnen worden ingedeeld op basis van de locatie – dimeer interface, interlobaire helices, eiwitoppervlak, of binnen andere secundaire structurele elementen. CONCLUSIES: De kristalstructuur van het kinasedomein van GNE biedt een structurele basis voor het begrijpen van ziekteveroorzakende mutaties en een model van een hexameer wild type full-length enzym. VERBETERDE VERSIE: Dit artikel kan ook worden bekeken als een verbeterde versie waarin de tekst van het artikel is geïntegreerd met interactieve 3D-representaties en geanimeerde overgangen. Houd er rekening mee dat een webplugin vereist is om toegang te krijgen tot deze verbeterde functionaliteit. Instructies voor de installatie en het gebruik van de webplugin zijn beschikbaar in Tekst S1.
|
Kristalstructuur van het N-Acetylmannosamine Kinase Domein van GNE
|
out6zg61
|
Opkomende uitbraken van zoönotische ziekten treffen mensen in een alarmerend tempo. Zolang de ecologische factoren die geassocieerd zijn met zoönosen niet beter worden begrepen, zullen ziekte-uitbraken aanhouden. Voor de ziekte van Lyme is ziekteonderdrukking aangetoond door een verdunnings-effect, waarbij een toename van soortenrijkdom de ziekteprevalentie in gastheerpopulaties verlaagt. Om het verdunnings-effect in een andere ziekte te testen, hebben we 17 ecologische variabelen onderzocht die geassocieerd zijn met de prevalentie van het direct overdraagbare Sin Nombre-virus (genus Hantavirus, etiologische agent van hantavirus pulmonaal syndroom) in zijn wilde gastheer, de witvoetmuis (Peromyscus maniculatus). Alleen soortenrijkdom was statistisch gekoppeld aan infectieprevalentie: naarmate de soortenrijkdom afnam, nam de infectieprevalentie toe. De toename was matig, maar de prevalentie nam exponentieel toe bij lage niveaus van diversiteit, een fenomeen dat wordt beschreven als zoönotische vrijmaking. De resultaten suggereren dat soortenrijkdom van invloed is op de opkomst van ziekten.
|
Verhoogde diversiteit van gastheer-soorten en verlaagde prevalentie van Sin Nombre-virus
|
n4duwd0x
|
Sinds eind 2007 zijn er in Thailand verschillende uitbraken van infecties met het porcine epidemische diarree virus (PEDV) opgetreden. Fylogenetische analyse plaatst alle Thaise PEDV-isolaten tijdens de uitbraken in dezelfde clade als de Chinese stam JS-2004-2. Dit nieuwe genotype PEDV is dominant en veroorzaakt momenteel sporadische uitbraken in Thailand.
|
Op Chinese lijkende Stam van het Porcine Epidemische Diarree Virus, Thailand
|
xsjdy3yz
|
ACHTERGROND: Er is weinig bekend over hoe optimisme/pessimisme en gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven zich tussen culturen vergelijken. METHODEN: Drie steekproeven van zwangere vrouwen in hun laatste trimester werden gerekruteerd uit China, Ghana en de Verenigde Staten (VS). Deelnemers vulden een vragenlijst in die de Life Orientation Test - Revised (LOT-R, een optimisme/pessimisme-maat), de Short Form 12 (SF-12, een kwaliteit van leven-maat) en vragen over gezondheids- en demografische factoren omvatte. Een drielandenset werd gecreëerd voor analyse door vrouwen te matchen op leeftijd, zwangerschapsduur bij inschrijving en aantal eerdere zwangerschappen. Anovas met post-hoc pairwise vergelijkingen werden gebruikt om de resultaten tussen de cohorten te vergelijken. Multivariate regressieanalyse werd gebruikt om een model te creëren om de variabelen te identificeren die het sterkst geassocieerd zijn met optimisme/pessimisme. RESULTATEN: LOT-R scores varieerden significant tussen culturen in deze steekproeven, waarbij Ghanese zwangere vrouwen het meest optimistisch en minst pessimistisch waren en Chinese zwangere vrouwen het minst optimistisch in het algemeen en het minst pessimistisch in de subscale analyse. Vier belangrijke variabelen voorspelden ongeveer 20% van de variantie in de algemene optimismescores: land van herkomst (p = .006), werken voor geld (p = .05); opleidingsniveau (p = .002), en ooit behandeld zijn voor emotionele problemen met medicatie (p < .001). Kwaliteit van leven scores varieerden ook per land in deze steekproeven, met het meest uitgesproken verschil in de vitaliteitsmaat. Zwangere vrouwen uit de VS rapporteerden veel lagere vitaliteitsscores dan zowel Chinese als Ghanese zwangere vrouwen in onze steekproef. CONCLUSIE: Dit onderzoek werpt belangrijke vragen op met betrekking tot wat het is aan het land van herkomst dat optimisme/pessimisme bij zwangere vrouwen zo sterk beïnvloedt. Verder onderzoek is gerechtvaardigd om de onderliggende conceptualisering van optimisme/pessimisme en gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven tussen landen te onderzoeken.
|
Optimisme/pessimisme en gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven tijdens de zwangerschap in drie continenten: een gematchte cohortstudie in China, Ghana en de Verenigde Staten
|
d0eur1hq
|
De diagnose van rabies is routinematig gebaseerd op klinische en epidemiologische informatie, vooral wanneer blootstellingen worden gemeld in landen waar rabies endemisch is. Diagnostische tests met behulp van conventionele assays die negatief lijken te zijn, zelfs wanneer laat in de ziekte uitgevoerd en ondanks de klinische diagnose, hebben soms de neiging onbetrouwbaar te zijn. Deze tests zijn zelden optimaal en volledig afhankelijk van de aard en kwaliteit van het aangeleverde monster. In de afgelopen drie decennia heeft de toepassing van moleculaire biologie bijgedragen aan de ontwikkeling van tests die resulteren in een snellere detectie van het rabiesvirus. Deze tests maken identificatie van virale stammen uit klinische specimens mogelijk. Momenteel zijn er een aantal moleculaire tests die kunnen worden gebruikt ter aanvulling van conventionele tests bij de diagnose van rabies. De uitdagingen in de 21e eeuw voor de ontwikkeling van rabiesdiagnostiek zijn inderdaad niet van technische aard; deze tests zijn nu beschikbaar. De uitdagingen in de 21e eeuw voor ontwikkelaars van diagnostische tests zijn tweeledig: ten eerste, het bereiken van internationaal geaccepteerde validatie van een test die vervolgens zal leiden tot acceptatie door organisaties wereldwijd. Ten tweede, de gebieden in de wereld waar dergelijke tests nodig zijn, bevinden zich voornamelijk in ontwikkelingslanden waar financiële en logistieke barrières de implementatie ervan belemmeren. Hoewel ontwikkelingslanden met een zwakke gezondheidsinfrastructuur erkennen dat op moleculen gebaseerde diagnostische assays onbetaalbaar zullen zijn voor routinematig gebruik, moet de kosten-batenverhouding nog steeds worden gemeten. De adoptie van snelle en betaalbare rabiesdiagnostische tests voor gebruik in ontwikkelingslanden benadrukt het belang van het delen en overdragen van technologie via laboratoriumtwinning tussen ontwikkelde en ontwikkelingslanden. Belangrijk voor ontwikkelingslanden is het voordeel van moleculaire methoden als hulpmiddel: de mogelijkheid tot differentiële diagnose van menselijke ziekten die zich presenteren met vergelijkbare klinische symptomen. Antemortem testen voor humane rabies is nu mogelijk met behulp van moleculaire technieken. Deze barrières zijn niet onoverkomelijk en het is onze verwachting dat, als dergelijke tests worden geaccepteerd en geïmplementeerd waar ze het meest nodig zijn, ze aanzienlijke verbeteringen zullen opleveren voor rabiesdiagnostiek en -surveillance. De komst van moleculaire biologie en nieuwe technologische initiatieven die vooruitgang in de biologie combineren met andere disciplines, zullen de ontwikkeling van technieken ondersteunen die in staat zijn tot high-throughput testen met een korte doorlooptijd voor rabiesdiagnostiek.
|
Opkomende Technologieën voor de Detectie van Rabiesvirus: Uitdagingen en Hoop in de 21e Eeuw
|
f0vud3gu
|
Abstract Wilde eenden zijn het belangrijkste reservoir van influenza A-virussen die kunnen worden overgedragen op gedomesticeerd pluimvee en zoogdieren, inclusief mensen. Van de 16 hemagglutinine (HA)-subtypen van influenza A-virussen veroorzaken alleen de H5- en H7-subtypen hoogpathogene (HP) influenza bij de natuurlijke gastheren. Verschillende eendensoorten zijn van nature resistent tegen HP Aziatische H5N1-influenzavirussen. Deze eendensoorten kunnen het virus zowel via de luchtwegen als het maagdarmstelsel uitscheiden en verspreiden, terwijl ze weinig of geen ziekteverschijnselen vertonen. Terwijl de HP Aziatische H5N1-virussen 100% dodelijk zijn voor kippen en ander hoenderachtig pluimvee, heeft het ontbreken van ziekteverschijnselen bij sommige eendensoorten geleid tot het concept dat eenden de “Trojaanse paarden” van H5N1 zijn in hun heimelijke verspreiding van het virus. Een belangrijke onopgeloste kwestie is of de HP H5N1-virussen worden gehandhaafd in de wereldwijde populatie wilde eenden. Hier bespreken we de ecologie en pathobiologie van met influenza A-virussen geïnfecteerde eenden en de rol van eenden bij het handhaven en verspreiden van HP H5N1-virussen. We identificeren ook de belangrijkste vragen over de rol van eenden die moeten worden opgelost om de opkomst en beheersing van pandemische influenza te begrijpen. Het wordt algemeen aanvaard dat wilde eendensoorten HP H5N1-virussen kunnen verspreiden, maar er is onvoldoende bewijs om aan te tonen dat eenden deze virussen handhaven en van de ene generatie op de andere overdragen.
|
Eenden: De “Trojaanse paarden” van H5N1-influenza
|
ujgcsx3o
|
Tekenencefalitisvirus (TEEV) veroorzaakt humane epidemieën in Eurazië. Klinische manifestaties variëren van inapparente infecties en koorts tot fatale encefalitis, maar de factoren die de ernst van de ziekte bepalen zijn momenteel niet gedefinieerd. TEEV is kenmerkend een hemagglutinerend (HA) virus; het vermogen om erytrocyten te agglutineren weerspiegelt voorlopig de receptor/fusie-activiteit van het virion. De afgelopen jaren zijn echter veel atypische HA-deficiënte stammen geïsoleerd van patiënten en ook van de natuurlijke Europese gastheer teek, *Ixodes persulcatus*. Door de sequenties van HA-deficiënte stammen te analyseren, hebben we 3 unieke aminozuursubstituties (D67G, E122G of D277A) geïdentificeerd in het envelop-eiwit, die elk de netto lading en hydrofobiciteit van het virion-oppervlak verhogen. Daarom hebben we genetisch gemodificeerde virusmutanten gecreëerd, elk met één van deze 3 substituties; ze vertoonden allemaal HA-deficiëntie. Verrassend genoeg toonde elk genetisch gemodificeerd niet-HA-virus een verhoogde TEEV-reproductie in zich voedende *Ixodes ricinus*, niet de erkende teekgastheer voor deze stammen. Bovendien werd de efficiëntie van virusoverdracht tussen geïnfecteerde en niet-geïnfecteerde teken die gelijktijdig op muizen voedden, ook versterkt door elke substitutie. Retrospectief werd de mutatie D67G geïdentificeerd in virussen geïsoleerd van patiënten met encefalitis. We stellen voor dat het ontstaan van atypische Siberische HA-deficiënte TEEV-stammen in Europa verband houdt met hun moleculaire adaptatie aan lokale teken. Dit proces lijkt te worden aangedreven door de selectie van enkele mutaties die het virion-oppervlak veranderen, waardoor de receptor/fusie-functie wordt verbeterd die essentieel is voor de binnenkomst van TEEV in de onbekende teeksoort. Als gevolg van deze adaptieve mutagenese lijken sommige van deze mutaties ook het vermogen van TEEV te verbeteren om de bloed-hersenbarrière bij de mens te passeren, een waarschijnlijke verklaring voor fatale encefalitis. Toekomstig onderzoek zal uitwijzen of deze opkomende Siberische TEEV-stammen zich blijven verspreiden naar het westen over Europa door adaptatie aan de inheemse teeksoort en of ze geassocieerd zijn met ernstige vormen van TBE.
|
Niet-hemagglutinerende Flavivirussen: Moleculaire mechanismen voor het ontstaan van nieuwe stammen via adaptatie aan Europese teken
|
3qxun84i
|
Symptomen van door medicijnen veroorzaakte interstitiële longziekte (ILD) zijn aspecifiek en kunnen moeilijk te onderscheiden zijn van een aantal ziekten die vaak voorkomen bij patiënten met niet-kleincellige longkanker (NSCLC) onder behandeling. Het identificeren van betrokkenheid van medicijnen en het onderscheid maken van andere ziekten is problematisch, hoewel radiologische manifestaties en klinische tests het mogelijk maken om veel alternatieve oorzaken van symptomen bij gevorderde NSCLC uit te sluiten. Bij longkankerpatiënten is high-resolution computed tomography (HRCT) gevoeliger dan een thoraxfoto bij het evalueren van de ernst en progressie van parenchymateuze longziekte. Het gebruik van HRCT-beeldvorming heeft inderdaad geleid tot de herkenning van vele verschillende patronen van longbetrokkenheid en helpt, samen met klinische tekenen en symptomen, bij het voorspellen van zowel de uitkomst als de respons op de behandeling. Dit manuscript beschrijft de radiologie van door medicijnen veroorzaakte ILD en de differentiële diagnose bij NSCLC. Een algoritme dat klinische tests gebruikt om alternatieve diagnoses uit te sluiten wordt ook beschreven.
|
Diagnose en behandeling van door medicijnen veroorzaakte interstitiële longziekte
|
kxtdv6q9
|
Primair biliaire cirrose (PBC) is een immuungemedieerde chronische cholestatische leverziekte met een langzaam progressief verloop. Zonder behandeling ontwikkelen de meeste patiënten uiteindelijk fibrose en cirrose van de lever en kunnen ze in een laat stadium van de ziekte een levertransplantatie nodig hebben. PBC treft voornamelijk vrouwen (vrouwelijke overweging 9–10:1) met een prevalentie van maximaal 1 op 1.000 vrouwen ouder dan 40 jaar. Veelvoorkomende symptomen van de ziekte zijn vermoeidheid en jeuk, maar de meeste patiënten zijn bij eerste presentatie asymptomatisch. De diagnose is gebaseerd op een aanhoudende verhoging van serummarkers van cholestase, d.w.z. alkalische fosfatase en gamma-glutamyltransferase, en de aanwezigheid van serum-antimitochondriale antilichamen gericht tegen de E2-subeenheid van het pyruvaat dehydrogenasecomplex. Histologisch wordt PBC gekenmerkt door floride galganglaesies met beschadiging van galepitheelcellen, een vaak dicht portaal inflammatoir infiltraat en progressief verlies van kleine intrahepatische galgangen. Hoewel het inzicht in pathogenese aspecten van PBC de afgelopen tien jaar enorm is toegenomen en tal van genetische, omgevings- en infectieuze factoren zijn aangetoond die kunnen bijdragen aan de ontwikkeling van PBC, blijft de precieze pathogenese raadselachtig. Ursodeoxycholzuur (UDCA) is momenteel de enige door de FDA goedgekeurde medische behandeling voor PBC. Wanneer toegediend in adequate doses van 13–15 mg/kg/dag, kunnen tot twee van de drie patiënten met PBC een normale levensverwachting hebben zonder aanvullende therapeutische maatregelen. Het werkingsmechanisme van UDCA is nog steeds onderwerp van discussie, maar stimulatie van een gestoorde hepatocellulaire en cholangiocellulaire secretie, detoxificatie van gal en anti-apoptotische effecten kunnen belangrijke mechanismen vertegenwoordigen. Een op de drie patiënten reageert niet adequaat op UDCA-therapie en kan aanvullende medische therapie en/of een levertransplantatie nodig hebben. Deze review vat de huidige kennis samen over de klinische, diagnostische, pathogenese en therapeutische aspecten van PBC.
|
Primair biliaire cirrose
|
vrd89yk0
|
Het 16S rRNA-gen is een van de meest gebruikte targets voor het oplossen van fylogenetische problemen van soorten in microbiologisch gerelateerde contexten. De identificatie van enkel-nucleotide variaties die een sequentie kunnen onderscheiden binnen een set homologe sequenties kan echter problematisch zijn. Hier presenteren we ORMA (Oligonucleotide Retrieving for Molecular Applications), een set scripts voor het zoeken naar onderscheidende posities en voor het selecteren van hoogwaardige oligonucleotide probes voor gebruik in moleculaire toepassingen. Twee assays gebaseerd op Ligase Detection Reaction (LDR) worden gepresenteerd. Ten eerste werd een nieuwe set probeparen op cyanobacteriële 16S rRNA-sequenties van 18 verschillende soorten vergeleken met die van een eerdere studie. Vervolgens werd een set LDR-probeparen voor de discriminatie van 13 pathogenen die rundermelk contamineren geëvalueerd. De software bepaalde meer dan 100 kandidaat-probeparen per dataset, uit meer dan 300 16S rRNA-sequenties, in minder dan 5 minuten. De resultaten toonden aan hoe ORMA de prestaties van de LDR-assay op cyanobacteriën verbeterde, waarbij 12 van de 14 monsters correct werden geïdentificeerd, en de perfecte discriminatie tussen de 13 melkpathogeen-gerelateerde soorten mogelijk maakte. ORMA vertegenwoordigt een significante verbetering ten opzichte van andere contexten waar enzym-gebaseerde technieken zijn gebruikt op reeds bekende mutaties van een enkele base of op hele subsequenties.
|
ORMA: een tool voor de identificatie van soort-specifieke variaties in het 16S rRNA-gen en het ontwerp van oligonucleotiden
|
0ybn2igj
|
ACHTERGROND: De uitbraak van de pandemie-griep, Influenza A H1N1 (Varkensgriep) begin 2009, vormde een grote uitdaging voor de gezondheidsdiensten wereldwijd. Eerdere pandemieën hebben geleid tot het hamsteren van goederen, de victimisering van bepaalde bevolkingsgroepen en het annuleren van reizen en het boycotten van bepaalde voedingsmiddelen (bijv. varkensvlees). We onderzochten de initiële gedragsmatige en attitudinale reacties op Influenza A, H1N1 ("Varkensgriep") in de zes dagen na het WHO-pandemie-waarschuwingsniveau 5, en regionale verschillen in deze reacties. METHODEN: 328 respondenten vulden een cross-sectionele internet- of papieren vragenlijstonderzoek in Maleisië (N = 180) of Europa (N = 148). De metingen beoordeelden veranderingen in het gebruik van transport, de aankoop van voorbereidende goederen voor een pandemie, waargenomen risicogroepen, indicatoren van angst, geschatte sterftecijfers voor seizoensgriep, de effectiviteit van seizoensgriepvaccinatie en veranderingen in varkensvleesconsumptie. RESULTATEN: 26% van de respondenten was 'zeer bezorgd' over het slachtoffer worden van griep (42% Maleisiërs, 5% Europeanen, p < .001). 36% meldde minder gebruik van openbaar vervoer (48% Maleisië, 22% Europa, p < .001), 39% vluchtannuleringen (56% Maleisië, 17% Europa, p < .001). 8% had voorbereidende materialen gekocht (bijv. mondmaskers: 8% Maleisië, 7% Europa), 41% Maleisië (15% Europa) was van plan dit te doen (p < .001). 63% van de Europeanen, 19% van de Maleisiërs had de pandemie met vrienden besproken (p < .001). Groepen die als 'hoog risico' op infectie werden beschouwd, omvatten de immuungecompromitteerden (genoemd door 87% van de respondenten), varkensboeren (70%), ouderen (57%), prostituees/hoog seksueel actieven (53%) en daklozen (53%). In gegevens die alleen in Europa zijn verzameld, onderschatte 64% de sterftecijfers van seizoensgriep aanzienlijk, 26% geloofde dat seizoensgriepvaccinatie bescherming bood tegen varkensgriep. 7% had minder varkensvlees gegeten/was gestopt met het eten van varkensvlees. 3% had antivirale geneesmiddelen gekocht voor thuisgebruik, terwijl 32% van plan was dit te doen als de pandemie erger zou worden. CONCLUSIE: Initiële reacties op Influenza A tonen grote regionale verschillen in angst, waarbij Maleisiërs angstiger zijn en eerder reizen verminderen en maskers en voedsel kopen. Gesprekken met familie en vrienden kunnen bestaande angstniveaus versterken. Bepaalde groepen (homoseksuelen, prostituees, daklozen) worden als een groter risico gezien, wat kan leiden tot meer vooroordelen tijdens een pandemie. Europeanen onderschatten de sterfte van seizoensgriep en hebben meer informatie nodig over de bescherming die wordt geboden door seizoensgriepinenting.
|
Initiële psychologische reacties op Influenza A, H1N1 ("Varkensgriep")
|
l1khrk52
|
Veel pogingen om complexe adaptieve systemen (CAS) te beheersen zijn mislukt. Hier proberen we te leren van biosystemen om enkele principes voor CAS-management af te leiden. Een toepassing op het beheersen van infecties wordt gegeven.
|
Over het managen van complexe adaptieve systemen, gemotiveerd door bio-systeemtoepassing op infecties
|
duwfxeyt
|
INLEIDING: Humaan herpesvirus 6 (HHV-6) is erkend als een potentieel significante pathogeen bij ontvangers van hematopoëtische stamceltransplantatie (HSCT). Verschillende klinische manifestaties zijn beschreven, waaronder koorts, huiduitslag, beenmergdepressie en encefalitis. MATERIALEN EN METHODEN: Een retrospectieve review werd uitgevoerd van een groep van 26 volwassen ontvangers van allogene HSCT's. Serummonsters afgenomen vóór de transplantatie werden onderzocht op de aanwezigheid van specifieke anti-HHV-6 IgM en IgG antilichamen. Na transplantatie werd kwantitatieve real-time PCR gebruikt om de virale load te bepalen in plasmamonsters van dag 0–80 na transplantatie. RESULTATEN: HHV-6 DNA werd gedetecteerd in plasmamonsters bij 8 (30%) van de 26 ontvangers tussen dag 18 en 40 na transplantatie. Allen ontwikkelden koorts van onbekende oorsprong en meer dan 50% vertoonde kenmerken van graft-versus-host disease. Drie personen uit deze groep overleden tijdens detecteerbare HHV-6 viremie. Nog twee ontvangers vertoonden een enkel positief PCR-resultaat op een later tijdstip. Infectie met HHV-6 werd dus bevestigd bij 10 (38,5%) van de 26 transplantatie-ontvangers. CONCLUSIES: Er is een hoge frequentie van detecteerbare HHV-6 virale load bij stamceltransplantatie-ontvangers in Polen. Verder onderzoek naar het monitoren van HHV-6 reactivatie bij transplantatie-ontvangers zal belangrijk zijn om de uitkomst voor deze patiënten te verbeteren.
|
Prevalentie van antilichamen en DNA van humaan herpesvirus 6 bij allogene stamceltransplantatiepatiënten: tweejarige ervaring in één centrum
|
qs82fva6
|
Hier introduceren we een kweeksysteem voor de isolatie, passage en amplificatie van aviaire tracheale epitheel (ATE) cellen. Het ATE-medium, dat kippenembryo-extract en foetaal runderserum bevat, ondersteunt de groei van trilhaardragende cellen, bekercellen en basale cellen uit kippentrachea op fibronectine- of matrigel-gecoate schaaltjes. Niet-epitheliale cellen maken minder dan 10% van de totale populatie uit. We laten verder zien dat ATE-cellen de replicatie en verspreiding van infectieus bronchitisvirus (IBV) ondersteunen. Interessant is dat immunocytochemische kleuring aantoonde dat basale cellen resistent zijn tegen IBV-infectie. We demonstreren ook dat glycosaminoglycaan geen effect had op de infectie van de cellen door IBV. Samengevat suggereren deze bevindingen dat primaire ATE-cellen een nieuw celkweeksysteem bieden voor de amplificatie van IBV en de in vitro karakterisering van virale cytopathogenese.
|
Infectie van primaire aviaire tracheale epitheelcellen met infectieus bronchitisvirus
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.