Subset (3)

corpus · 171k rows

Split (1)

test · 171k rows

_id stringlengths 8 8	text stringlengths 0 5.05k	title stringlengths 0 900
k2vbgqk7	مطالعات قبلی نشان می‌دهد که بتا-1-گلیکوپروتئین‌های اختصاصی بارداری انسان (PSGs) نقش تعدیل‌کننده ایمنی در دوران بارداری دارند. با این حال، سایر عملکردهای احتمالی PSGها هنوز مورد بررسی قرار نگرفته است. ما مشاهده کرده‌ایم که PSGها فاکتور رشد تبدیل‌کننده بتا 1 (TGFB1) را القا می‌کنند، که در میان دیگر عملکردهای متنوع آن، عملکرد سلول‌های T را مهار می‌کند و دارای خواص پیش‌رگ‌زایی است. مطالعه حاضر نقش بالقوه PSG1، فراوان‌ترین PSG را در سرم مادر، به‌عنوان یک محرک احتمالی فاکتورهای رشد پیش‌آنژیوژنیک که نقش مهمی در استقرار عروق در فصل مشترک مادر و جنین بازی می‌کند، بررسی می‌کند. برای این منظور، ما TGFB1، فاکتورهای رشد اندوتلیال عروقی (VEGFs) A و C، و سطح پروتئین فاکتور رشد جفتی (PGF) را در چندین نوع سلول پس از درمان PSG1 اندازه‌گیری کردیم. علاوه بر این، روش‌های تشکیل لوله و بهبود زخم برای بررسی تعامل مستقیم احتمالی بین PSG1 و سلول‌های اندوتلیال انجام شد. PSG1 باعث افزایش تنظیم TGFB1 و VEGFA در مونوسیت‌های انسانی، ماکروفاژها و دو رده سلولی تروفوبلاست خارج پرز انسانی شد. ما القای VEGFC یا PGF توسط PSG1 را در هیچ یک از سلول های آزمایش شده مشاهده نکردیم. درمان PSG1 منجر به تشکیل لوله اندوتلیال در حضور و عدم حضور VEGFA شد. جهش زایی سایت جهت نقشه برداری از مناطق ضروری در دامنه N PSG1 مورد نیاز برای فعالیت عملکردی انجام شد. ما دریافتیم که اسید آسپارتیک در موقعیت 95، که قبلاً برای اتصال PSGs به سلول ها مورد نیاز است، برای فعالیت PSG1 مورد نیاز نیست، اما اسیدهای آمینه دخیل در تشکیل یک پل نمک در دامنه N برای PSG1 ضروری هستند. تابع	بتا-1-گلیکوپروتئین 1 مخصوص بارداری انسان (PSG1) نقش بالقوه ای در مورفوژنز عروق جفتی دارد
nj23h32n	پروتئین های پوششی همجوشی ویروسی اهداف مهمی برای توسعه مهارکننده های ورود ویروس هستند. ما رویکردی را برای طراحی محاسباتی مهارکننده‌های پپتیدی پروتئین پوششی (E) ویروس دنگی 2 (DENV-2) با استفاده از داده‌های ساختاری با وضوح بالا از فرم دیمری قبل از ورود پروتئین گزارش می‌کنیم. با استفاده از استراتژی‌های پیش‌بینی همراه با بهینه‌سازی محاسباتی «شبه انرژی‌های» اتصال، ما توانستیم توالی‌های پپتیدی متعددی را طراحی کنیم که فعالیت بازدارندگی ورود میکرومولار ویروسی پایینی را نشان می‌دهند. دو فعال‌ترین پپتید، DN57opt و 1OAN1، به‌ترتیب برای جابجایی نواحی در لولای دامنه II و اولین اتصال صفحه بتا دامنه I/دامنه II طراحی شده‌اند و غلظت‌های مهاری 50 درصدی را به ترتیب 8 و 7 میکرومولار در یک فوکوس نشان می‌دهند. سنجش واحد شکل دهی نشان داده شد که پپتیدهای ضد ویروسی با اتصال ویروس به سلول تداخل دارند، به طور مستقیم با پروتئین های E تعامل می کنند و همچنین با استفاده از تداخل سنجی لایه های زیستی و میکروسکوپ کرایو الکترونی باعث تغییراتی در سطح ویروس می شوند. این پپتیدها ممکن است برای توصیف حالت‌های میانی در فرآیند همجوشی غشا، بررسی مولکول‌های گیرنده DENV و به عنوان ترکیبات سرب برای کشف دارو مفید باشند.	بهینه سازی ساختاری و طراحی نوین پپتیدهای بازدارنده ورود ویروس دنگی
e7b1guwq	پس زمینه: تهدید بیماری های همه گیر آنفولانزای مکرر ناشی از سویه های ویروسی جدید و وقوع جهش یافته های فرار، جستجو برای اهداف درمانی قوی را ضروری می کند. وابستگی ویروس ها به عوامل سلولی نقطه ضعفی در استراتژی تکثیر ویروسی و وسیله ای برای تداخل در تکثیر ویروسی ایجاد می کند. نتایج: با استفاده از یک استراتژی جستجوی مبتنی بر موتیف برای اهداف ضد ویروسی، caveolin-1 (Cav-1) را به عنوان شریک متقابل سلولی احتمالی ویروس‌های آنفلوانزای انسانی A، از جمله سویه‌های ویروس آنفلوانزای A همه‌گیر (H1N1) با منشاء خوکی که از بهار در گردش هستند، شناسایی کردیم. 2009 در. تأثیر Cav-1 بر تکثیر ویروس آنفلوانزای انسانی A/PR/8/34 (H1N1) در آزمایش‌های مهار و رقابت تعیین شد. حذف Cav-1 با واسطه RNAi و همچنین ترانسفکشن یک جهش یافته Cav-1 منفی غالب منجر به کاهش تیتر ویروس در سلول‌های کلیه سگ آلوده مدین-داربی (MDCK) می‌شود، یک رده سلولی که معمولاً در تحقیقات پایه آنفولانزا استفاده می‌شود. و همچنین در تولید واکسن ویروس. برای درک اساس مولکولی این پدیده، ما بر روی دامنه اتصال caveolin-1 (CBD) واقع در قسمت مجاور، قسمت کنار غشایی پروتئین ماتریکس M2 تمرکز کردیم که در جستجوی مبتنی بر موتیف شناسایی شده است. آزمایش‌های Pull-down و آزمایش‌های immunoprecipitation نشان داد که caveolin-1 به M2 متصل می‌شود. داده‌ها نشان می‌دهند که Cav-1 تکثیر ویروس آنفولانزا A را احتمالاً بر اساس تعامل M2/Cav-1 تعدیل می‌کند. نتیجه‌گیری: از آنجایی که Cav-1 در چرخه زندگی ویروس آنفولانزای انسانی انسانی نقش دارد، پروتئین چند منظوره و تعامل آن با پروتئین M2 ویروس‌های آنفلوانزای انسانی انسانی نقطه شروع امیدوارکننده‌ای برای جستجوی عوامل ضد ویروسی است.	Caveolin-1 بر تکثیر ویروس آنفلوانزای انسانی A (H1N1) در کشت سلولی تأثیر می گذارد
2lz03oqb	پس زمینه: پلی پروتئین Pr55(gag) (Gag) HIV به عنوان داربستی برای مونتاژ ویریون عمل می کند و بنابراین برای جوانه زدن و بلوغ ویریون نتاج ضروری است. گگ در غشای پلاسمایی (PM) و غشای اندوزوم‌های دیررس موضعی می‌گیرد و اجازه می‌دهد تا ویروس عفونی مستقیماً از غشای سلولی و/یا پس از اگزوسیتوز آزاد شود. عوامل میزبان دخیل در قاچاق Gag به این سایت ها تا حد زیادی ناشناخته هستند. پس از فعال شدن، سلول های CD4+ T، هدف اولیه عفونت HIV، فعال کننده رونویسی کلاس II (CIITA) و در نتیجه ایزوتیپ MHC کلاس II، HLA-DR را بیان می کنند. مشابه Gag، HLA-DR در PM و در غشای اندوزوم‌ها و محفظه‌های تخصصی MHC کلاس II تاولی (MIIC) قرار می‌گیرد. در سلول های تولید کننده HIV، بیان گذرا HLA-DR باعث تجمع Gag درون سلولی شده و انتشار ویروس را مختل می کند. روش‌شناسی/ یافته‌های اصلی: در اینجا نشان می‌دهیم که بیان پایدار و گذرا CIITA در سلول‌های تولیدکننده HIV باعث احتباس درون سلولی Gag مرتبط با HLA-DR نمی‌شود، اما عفونت‌زایی ویریون‌ها را افزایش می‌دهد. با این حال، هیچ یک از این پدیده ها به دلیل خلاصه کردن مسیر ارائه آنتی ژن کلاس II یا فعال سازی رونویسی ژن های ویروس با واسطه CIITA نیست. جالب توجه است، ما نشان می‌دهیم که CIITA، جدای از اثرات رونویسی‌اش، به صورت سیتوپلاسمی برای افزایش سطوح Pr160 (gag-pol) (Gag-Pol) و در نتیجه پردازش پروتئاز ویروسی و Gag عمل می‌کند که عامل افزایش عفونت‌زایی ویریون‌ها از سلول‌های بیان‌کننده CIITA است. . نتیجه‌گیری/ اهمیت: این مطالعه نشان می‌دهد که CIITA پردازش HIV Gag را افزایش می‌دهد و اولین شواهد از یک عملکرد سیتوپلاسمی جدید، پس از رونویسی، برای یک ترانس فعال‌کننده معروف را فراهم می‌کند.	Transactivator کلاس II (CIITA) پردازش سیتوپلاسمی HIV-1 Pr55Gag را افزایش می دهد
ip0fxvhp	اولتراسانتریفیوژ تحلیلی با سرعت رسوب به یک تکنیک بسیار محبوب برای مطالعه توزیع اندازه و برهمکنش ماکرومولکول ها تبدیل شده است. اخیراً، روشی به نام تحلیل طیف دو بعدی (2DSA) برای تعیین توزیع‌های اندازه و شکل توسط Demeler و همکارانش توضیح داده شده است (Eur Biophys J 2009). این بر اساس ایده‌های جدیدی است که برای برازش معادلات انتگرال توزیع اندازه و شکل به داده‌های تجربی، که با یک مثال نشان داده شده است، اما بدون اثبات اصل الگوریتم ارائه شده است. در کار حاضر، ما الگوریتم 2DSA را با مقایسه با چارچوب مرجع ریاضی و مفاهیم عددی ساده و شناخته شده برای حل معادلات انتگرال فردهولم بررسی می‌کنیم و مفروضات کلیدی زیربنای روش 2DSA را در یک برنامه مثال آزمایش می‌کنیم. در حالی که 2DSA از نظر محاسباتی بیش از حد بیهوده به نظر می رسد، عناصر کلیدی نیز با نتایج ریاضی در تضاد هستند. این باعث ایجاد شک و تردید در مورد صحت نتایج تجزیه و تحلیل 2DSA می شود.	در مورد رویکردهای محاسباتی برای توزیع اندازه و شکل از اولتراسانتریفیوژ تحلیلی سرعت رسوب
1r1ueuk2	مکانیسم‌های عامل بیماری‌زایی ویروس‌های آنفولانزا در انسان هنوز به خوبی شناخته نشده است. یک فرضیه غالب این است که ایزوله‌های ویروسی بسیار بیماری‌زا باعث ایجاد سیتوکینمی شدید می‌شوند که سندرم دیسترس تنفسی حاد و سندرم اختلال عملکرد ارگان‌های متعدد را تشدید می‌کند. Cynomolgus macaques (Macaca fascicularis) آلوده به ویروس H5N1 آنفولانزای مرغی انسانی (HPAI) بسیار بیماری‌زا (HPAI) (A/Vietnam/1203/2004) یا ترکیب‌های مجدد ویروس آنفلوانزای انسانی A/Texas/36/91 (H189 حاوی ژن‌های H1N1) ویروس آنفلوانزای همه گیر A (H1N1) طی 24 ساعت پس از عفونت دچار پنومونی شدید شد. با این حال، انتشار ویروس به خارج از ریه‌ها تنها در گروه H5N1 شناسایی شد، و علائم واکنش‌های بافت خارج ریوی، از جمله فعال شدن میکروگلیا و تنظیم مداوم نشانگرهای التهابی، به ویژه فاکتور 1α القاکننده هیپوکسی (HIF-1α) تا حد زیادی محدود بود. به این گروه بنابراین آسیب شناسی خارج ریوی ممکن است به عوارض ناشی از ویروس H5N1 کمک کند.	پاسخ های بافت خارج ریوی در ماکاک های سینومولگوس (Macaca fascicularis) آلوده به ویروس آنفولانزای پرندگان بسیار بیماری زا A (H5N1)
iec4mvh7	در حال حاضر پذیرفته شده است که یک پاسخ التهابی شدید علت مرگ و میر انسان در اثر عفونت آنفلوانزای پرندگان H5N1 است. با در نظر گرفتن این موضوع، ما به دنبال بررسی متون برای مثال‌هایی از داروهای مکمل و جایگزین که التهاب را کاهش می‌دهند، و نتایج این جستجو را در چارچوب کار خودمان در مدل موشی بیماری آنفولانزا، با استفاده از یک عامل دارویی با ضد بیماری، قرار دادیم. -خواص التهابی اخیراً نشان داده شده است که دو گیاه چینی، Angelica sinensis (Dang Gui) و Salvia miltiorrhiza (Danshen) از موش ها در طول سپسیس آزمایشی کشنده از طریق مهار سیتوکین التهابی جدید پروتئین گروه جعبه 1 با تحرک بالا (HMGB1) محافظت می کنند. Biochanin A، لیگاندی از گیرنده های فعال شده با تکثیر پراکسی زوم (PPAR) آلفا و گاما و ایزوفلاون فعال در Trifolium pratense (شبدر قرمز)، دارای خواص ضد التهابی است و بنابراین می تواند به عنوان یک درمان آنفولانزا استفاده شود. این بسیار جالب است زیرا اخیراً نشان داده‌ایم که جمفیبروزیل، دارویی که برای درمان چربی خون در انسان و لیگاند مصنوعی PPAR آلفا استفاده می‌شود، مرگ و میر مرتبط با عفونت‌های آنفولانزا را در موش‌ها کاهش می‌دهد. توانایی‌های تعدیل‌کننده التهاب این عوامل طبیعی باید با توجه به آنچه که اکنون در مورد مکانیسم‌های آنفولانزای کشنده شناخته شده است، در نظر گرفته شود و به‌عنوان کاندیدهای بالقوه برای درمان‌های آنفولانزا به تنهایی یا به عنوان درمان‌های کمکی برای داروهای ضد ویروسی مورد آزمایش قرار گیرد.	استفاده از داروهای مکمل و جایگزین برای هدف قرار دادن پاسخ میزبان در طول آنفولانزای شدید
ntx35a8s	پس‌زمینه: در اواسط ژوئن 2009، به نظر می‌رسد که ایالت ویکتوریا در استرالیا دارای بالاترین نرخ اطلاع رسانی در مورد آنفلوانزای همه‌گیر (H1N1) 2009 در جهان است. ما فرض می کنیم که این به این دلیل است که انتقال جامعه آنفولانزای همه گیر در زمان شروع آزمایش برای ویروس جدید در ویکتوریا به خوبی تثبیت شده بود. در مقابل، این موضوع برای همه‌گیری در سایر نقاط استرالیا، از جمله استرالیای غربی (WA) صادق نبود. روش‌ها: ما از داده‌های پیگیری دقیق مورد بیماران مبتلا به عفونت تایید شده در ویکتوریا و WA برای نشان دادن تفاوت در منحنی همه‌گیری در دو ایالت استرالیا در طرف مقابل قاره استفاده کردیم. ما همه‌گیری را در هر دو ایالت با استفاده از یک مدل حساس-عفونی-حذف شده با حسابداری استنتاج بیزی برای موارد وارداتی مدل‌سازی کردیم. نتایج: انتقال اپیدمی زودتر در ویکتوریا و بعداً در WA رخ داد. تنها 5 درصد از 100 مورد اول ویکتوریا به صورت محلی به دست نیامدند و سه نفر از آنها برادران یک خانواده بودند. در مقابل، 53 درصد از 102 مورد اول در WA مربوط به واردات از ویکتوریا بود. با استفاده از داده‌های ورودی مدل قابل قبول، تخمین تعداد مؤثر تولید مثل برای همه‌گیری ویکتوریا ما را ملزم می‌کرد تا برای توضیح داده‌های مشاهده‌شده، تاریخ زودتر شروع انتقال را فراخوانی کنیم. این در مدل‌سازی اپیدمی در WA مورد نیاز نبود. نتیجه‌گیری: شواهد مستحکم، که با مدل‌سازی پشتیبانی می‌شوند، نشان می‌دهند که انتقال جامعه آنفولانزای همه‌گیر در ویکتوریا به خوبی تثبیت شده است، اما نه در WA، در زمانی که آزمایش برای ویروس جدید در استرالیا آغاز شد. این ویروس به احتمال زیاد وارد ویکتوریا شده و در همان زمان که برای اولین بار در ایالات متحده و مکزیک شناسایی شد، ایجاد شده است.	بیماری همه گیر (H1N1) 2009 انتقال جامعه آنفولانزا در یکی از ایالت های استرالیا ایجاد شد زمانی که ویروس برای اولین بار در آمریکای شمالی شناسایی شد
9fr0m92p	هدف: توصیف جزئیات بالینی و رادیولوژیک عفونت ویروسی آنفلوانزای همه گیر H1N1 2009 در میان مردان جوان سالم در یک محیط نیمه بسته نهادینه شده. مواد و روش‌ها: در مجموع 18 بیمار مبتلا به عفونت ویروس آنفلوانزای همه‌گیر H1N1 2009 از 18 جولای تا 30 جولای 2009 در این مطالعه وارد شدند. هر بیمار برای تعیین مشخصات بالینی و رادیولوژیکی دقیق مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج: همه بیماران با تب بالا (> 38.0 ℃)، با علائم همراه سرفه، رینوره، گلودرد، میالژی و اسهال، و افزایش مقادیر پروتئین واکنشی C (CRP) بدون لکوسیتوز و افزایش میزان رسوب گلبول قرمز (ESR) مراجعه کردند. . همه بیماران، از جمله یک بیمار که به سندرم دیسترس تنفسی حاد پیشرفت کرده بود، با اسلتامیویر فسفات تحت درمان قرار گرفتند و به سرعت از علائم خود بهبود یافتند. رادیوگرافی قفسه سینه تنها در دو مورد از 18 بیمار، ناهنجاری های ندول های کوچک و تثبیت لوبار را نشان داد. با این حال، شش بیمار از 12 بیمار که تحت معاینات CT مقطع نازک قرار گرفتند، علاوه بر ندول‌های با تعریف ضعیف با غلبه لوب فوقانی، یافته‌های غیرطبیعی برای کدورت‌های شیشه‌ای کوچک (GGOs) نشان دادند. نتیجه‌گیری: در جمعیتی از بزرگسالان جوان سالم، افزایش CRP با سطح طبیعی ESR و گلبول‌های سفید همراه با GGO و گره‌ها در سی‌تی اسکن‌های مقطع نازک ممکن است نشانه‌های اولیه عفونت با ویروس آنفولانزای همه‌گیر H1N1 2009 را نشان دهد.	ویژگی های رادیولوژیکی و بالینی شیوع نظامی همه گیری عفونت ویروس آنفلوانزا H1N1 2009
xkmkwsbv	عفونت وابسته به اسید سلول های Hela و Vero توسط BTV-10 از درون اندوزوم های اولیه به دنبال جذب ویروس توسط اندوسیتوز با واسطه کلاترین رخ می دهد (فورزان و همکاران، 2007: J Virol 81: 4819-4827). در اینجا ما گزارش می دهیم که عفونت BTV-1 سلول های BHK نیز به pH اندوزومی پایین وابسته است. با این حال، ورود ویروس و عفونت توسط جهش‌یافته‌های منفی غالب Eps15، AP180 یا نوع پیوندی «aa» دینامین-2، که نشان داده شد آندوسیتوز با واسطه کلاترین را مهار می‌کنند، مهار نشد. علاوه بر این، عفونت با کاهش کلسترول سلولی مهار نشد، که نشان می‌دهد ورود ویروس توسط فرآیند وابسته به لیپید مانند اندوسیتوز با واسطه caveolae انجام نمی‌شود. اگرچه ورود ویروس و عفونت توسط جهش دهنده دینامین-2 غالب منفی مهار نشد، ورود توسط بازدارنده عمومی دینامین، dynasore، مهار شد، که نشان می دهد ورود ویروس وابسته به دینامین است. در حین ورود، BTV-1 با LAMP-1 و نه با ترانسفرین محلی سازی شد، که نشان می دهد ویروس بدون عبور از آندوزوم های اولیه به بخش های انتهایی آندوزوم منتقل می شود. ورود و عفونت BTV-1 توسط EIPA و cytochalasin-D، مهارکننده‌های شناخته شده ماکروپینوسیتوز مهار شد، و در طول ورود ویروس با دکستران، یک نشانگر شناخته‌شده برای جذب ماکروپینوسیتوز/فاز مایع، موضع‌گیری شد. نتایج ما مشاهدات قبلی را با BTV-10 گسترش می‌دهد و نشان می‌دهد که BTV-1 می‌تواند سلول‌های BHK را از طریق مکانیسم ورودی که مستقل از کلاترین و کلسترول است، اما به دینامین نیاز دارد و ویژگی‌های مشترکی با ماکروپینوسیتوز دارد، آلوده کند.	یک مکانیسم ورود مانند ماکروپینوسیتوز مستقل از کلاترین که توسط ویروس زبان آبی-1 در طی عفونت سلول های BHK استفاده می شود
ydzxp0oe	خون خط لوله سیستم ایمنی است. ارزیابی تغییرات فراوانی رونوشت در خون در مقیاس وسیع ژنوم، دید جامعی از وضعیت سیستم ایمنی در سلامت و بیماری ارائه می‌کند. این بررسی خلاصه‌ای از کارهایی است که از این رویکرد برای شناسایی اهداف درمانی و نشانه‌های زیستی در زمینه خودایمنی و بیماری‌های عفونی استفاده کرده است. پیشرفت‌های اخیر فن‌آوری و روش‌شناختی که زمینه تحقیقات رونوشت خون را به جلو می‌برد نیز مورد بحث قرار می‌گیرد.	ارزیابی سیستم ایمنی انسان از طریق رونویسی خون
boto4h8x	عفونت Reovirus منجر به آپوپتوز در سلول های کشت شده و سیستم عصبی مرکزی موش (CNS) می شود. رونویسی مبتنی بر NF-kB ژن‌های سلولی پرواپوپتوز برای فاز مؤثر پاسخ آپوپتوز مورد نیاز است. اگرچه هم مسیرهای سیگنال دهی خارجی گیرنده مرگ و هم مسیرهای ذاتی شامل آسیب میتوکندری در آپوپتوز ناشی از ریوویروس دخیل هستند، مکانیسم هایی که توسط هر یک از این مسیرها فعال می شوند و ارتباط آنها با سیگنال دهی NF-kB به دنبال عفونت ریویروس ناشناخته است. عضو خانواده پرواپوپتوز Bcl-2، Bid، با برش پروتئولیتیک بدنبال عفونت ریویروس فعال می شود. برای درک اینکه چگونه reovirus مدارهای سیگنالینگ میزبان را برای القای آپوپتوز ادغام می کند، سیگنالینگ پرواپوپتوز را به دنبال عفونت سلول های دارای کمبود Bid بررسی کردیم. اگرچه رشد reovirus تحت تأثیر عدم وجود Bid قرار نگرفت، سلول‌های فاقد Bid موفق به آپوپتوز نشدند. علاوه بر این، ما دریافتیم که فعال‌سازی NF-kB برای برش Bid و سیگنال‌دهی پرواپوپتوتیک بعدی مورد نیاز است. برای بررسی اهمیت عملکردی آپوپتوز وابسته به Bid در بیماری reovirus، ما آنسفالیت کشنده ناشی از reovirus را در حضور و عدم حضور Bid بررسی کردیم. بقای موش‌های با کمبود Bid در مقایسه با موش‌های نوع وحشی پس از تلقیح دهانی یا داخل جمجمه‌ای reovirus به طور قابل‌توجهی افزایش یافت. کاهش حدت reovirus در موش Bid-null با کاهش عملکرد ویروس همراه بود. این یافته‌ها نقش برش Bid وابسته به NF-kB را در برنامه مرگ سلولی آغاز شده توسط عفونت ویروسی تعریف می‌کند و Bid را به حدت ویروسی مرتبط می‌کند.	Bid پاتوژنز Reovirus نوروتروپیک را تنظیم می کند
nnhs8k0i	پس‌زمینه: اگرچه میدان‌های الکترومغناطیسی پالسی (PEMFs) برای درمان پیوندهای تاخیری و جوش نخوردن استفاده می‌شوند، مکانیسم عمل آنها کاملاً مشخص نیست. با این حال، PEMF ها بر بیان ژن های خاص تأثیر می گذارند. سؤالات / اهداف: ما پرسیدیم (1) آیا PEMFها بر بیان ژن در سلول های استئوبلاست مانند انسان (MG63) در شرایط آزمایشگاهی تأثیر می گذارد، و (2) آیا و تا چه اندازه تحریک توسط PEMF باعث تکثیر و تمایز سلولی در کشت های MG-63 می شود یا خیر. روش‌ها: ما دو گروه از سلول‌های MG63 را کشت دادیم. یک گروه به مدت 18 ساعت با PEMFs تحت درمان قرار گرفتند در حالی که گروه دوم در همان شرایط کشت بدون PEMFs (شاهد) نگهداری شدند. بیان ژن در سراسر تجزیه و تحلیل ریزآرایه cDNA شامل 19000 ژن که بخش قابل توجهی از ژنوم انسان را در بر می گیرد، مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج: PEMFها باعث ایجاد دگرگونی ژن‌های مهم مربوط به تشکیل استخوان (HOXA10، AKT1)، ژن‌ها در سطح انتقالی (CALM1، P2RX7)، ژن‌های اجزای اسکلت سلولی (FN1، VCL) و کلاژنی (COL1A2) و غیرکلاژنی شدند. اجزای ماتریس با این حال، PEMF باعث کاهش ژن‌های مربوط به تخریب ماتریکس خارج سلولی (MMP-11، DUSP4) شد. نتیجه‌گیری و ارتباط بالینی: به نظر می‌رسد که PEMFs باعث تکثیر و تمایز سلولی می‌شود. علاوه بر این، PEMF ها تولید و کانی سازی ماتریکس خارج سلولی را در حالی که تخریب و جذب ماتریکس را کاهش می دهند، افزایش می دهند. داده‌های ما مکانیسم‌های خاصی از اثر بالینی مشاهده‌شده PEMFs و در نتیجه رویکردهای خاص برای استفاده در پزشکی احیاکننده را نشان می‌دهند.	اثرات میدان های الکترومغناطیسی پالسی بر سلول های استئوبلاست مانند انسان (MG-63): یک مطالعه آزمایشی
wek9wp6u	هدف این مقاله باز کردن جعبه سیاه زندگینامه سه متخصص است که در منطقه مرزی بین علم، سیاست و بحث عمومی کار می کنند. یک رویکرد بیوگرافی-روایی برای تحلیل نقش‌هایی که ویروس‌شناسان آلبرت اوسترهاوس، روئل کوتینیو و یاپ گودسمیت در سیاست‌گذاری و بحث عمومی بازی می‌کنند، استفاده می‌شود. این ارقام در میان معدود ویروس شناسان برجسته بودند که به وضوح در هلند در طول احیای بیماری های عفونی در دهه 1980 فعال بودند. اوسترهاوس و کوتینیو به طور خاص هنوز هم چهره های کلیدی امروز هستند، همانطور که در طول شیوع آنفولانزای جدید A (H1N1) نشان داده شد. این مقاله به بررسی چالش‌ها و معضلات سیاسی و ارتباطی مختلفی می‌پردازد که این سه ویروس‌شناس با آن‌ها مواجه شده‌اند و نحوه برخورد استراتژیک آنها با این چالش‌ها و معضلات را در مراحل مختلف تاریخ اخیر این رشته مورد بحث قرار می‌دهد. از این نظر مهم، پیگیری آنها برای نقشی عمومی است که هم مؤثر و هم معتبر باشد. ما با تأملی در مورد همه‌گیری H1N1، و روابط تاریخی و بیوگرافی بین ترتیبات حاکمیتی نوظهور و کارشناسان درگیر در توسعه چنین ترتیباتی به پایان خواهیم رسید.	کارشناسان ویروس شناسی در منطقه مرزی بین علم، سیاست و عموم مردم: یک تحلیل بیوگرافی
782iew86	گونه جدیدی از پاروویروس که به طور آزمایشی بوکاویروس انسانی 4 (HBoV4) نامیده می شود، از نظر ژنتیکی مشخص شد. در میان 641 نمونه مدفوع از کودکان و بزرگسالان، شایع ترین گونه های بوکاویروس شناسایی شده HBoV2>HBoV3>HBoV4>HBoV1 با شیوع HBoV2 21% و 26% در کودکان نیجریه و تونس بود. گونه های HBoV3 و HBoV4 ترکیبی در 12/192 مورد فلج شل حاد غیر فلج اطفال (AFP) از تونس و نیجریه و 0/96 افراد سالم تونسی یافت شد (01/0=p). شواهدی از نوترکیبی گسترده در مرز ژن NP1 و VP1 بین و درون گونه‌ها پیدا شد. گونه های متعدد و درجه بالایی از تنوع ژنتیکی که در بین بوکاویروس های انسانی یافت شده در مدفوع نسبت به HBoV1 بسیار همگن مشاهده می شود، نشان می دهد که این پاتوژن تنفسی پراکنده در سراسر جهان ممکن است اخیراً از یک بوکاویروس روده ای تکامل یافته باشد، شاید پس از به دست آوردن یک تروپیسم گسترده به نفع دستگاه تنفسی. مسیر روشن کردن نقش احتمالی بوکاویروس های روده ای تازه شناسایی شده در بیماری های انسانی از جمله AFP و اسهال به مطالعات اپیدمیولوژیک بیشتری نیاز دارد.	بوکاویروس‌های انسانی بسیار متنوع، پراکنده، مستعد نوترکیبی و عفونت‌های روده‌ای شایع هستند.
rb45gk2w	برای ایجاد عفونت، ویروس ها باید سیستم دفاعی بدن میزبان را سرکوب کنند یا از آن فرار کنند. تحقیقات اخیر ایمونولوژیک بر ایمنی ذاتی به عنوان اولین خط دفاع میزبان متمرکز شده است، به ویژه مولکول های تشخیص الگو مانند گیرنده های Toll مانند (TLRs)، گیرنده های RIG-I مانند (RLRs)، و گیرنده های NOD مانند (NLRs). اجزای مختلف میکروبی توسط اشکال مولکولی مبهم و رایج خود به نام الگوهای مولکولی مرتبط با پاتوژن (PAMP) شناخته می شوند. PAMP ها واکنش های التهابی را به واسطه فعال شدن فاکتور رونویسی NF-kB و اینترفرون ها ایجاد می کنند که منجر به پاسخ ایمنی ضد ویروسی می شود. ویروس ها توانایی سرکوب یا فرار از این واکنش ضد میکروبی با واسطه مولکول های شناسایی الگو را به روش های مختلف دارند. در این مقاله، ما استراتژی‌های مختلف مورد استفاده توسط ویروس‌ها را برای تعدیل پاسخ ایمنی ذاتی با واسطه مولکول‌های شناسایی الگو بررسی می‌کنیم.	نبرد بین ویروس و میزبان: مدولاسیون مسیرهای سیگنالینگ گیرنده تلفن همراه با عفونت ویروسی
mticfoic	پس زمینه: ذات الریه یک قاتل بیماری های عفونی پیشرو در سراسر جهان است، اما بار در چین به خوبی درک نشده است زیرا بسیاری از داده ها در ادبیات غیر انگلیسی منتشر شده است. روش‌شناسی/ یافته‌های اصلی: ما به‌طور سیستماتیک ادبیات چینی و انگلیسی زبان را برای مطالعات با داده‌های اولیه در مورد بروز پنومونی و مرگ‌ومیر در سرزمین اصلی چین مرور کردیم. بین سال‌های 1985 و 2008، 37 مطالعه معیارهای ورود را داشتند. کیفیت مطالعات بسیار متغیر بود. برای کودکان کمتر از 5 سال، میزان بروز از 0.06-0.27 قسمت در هر سال و میزان مرگ و میر بین 184-1223 مرگ در هر 100000 نفر متغیر بود. بروز کلی و مرگ و میر در طول دوره مورد مطالعه ثابت یا کاهش یافته و در روستاها نسبت به مناطق شهری بیشتر بود. نتیجه‌گیری/ اهمیت: ذات‌الریه همچنان یک چالش عمده بهداشت عمومی در کودکان خردسال در چین است و تخمین‌ها از بروز و مرگ و میر پنومونی بسیار متفاوت است. داده‌های نظارتی قابل اعتماد و تلاش‌های پیشگیرانه جدید ممکن است برای دستیابی و مستندسازی کاهش بیشتر، به‌ویژه در مناطقی با بروز و مرگ‌ومیر بالاتر مانند محیط‌های روستایی مورد نیاز باشد.	بروز پنومونی و مرگ و میر در سرزمین اصلی چین: بررسی سیستماتیک ادبیات چینی و انگلیسی، 1985-2008
om92cx5q	استحکام ظرفیت یک سیستم بیولوژیکی را برای کانالیزه ماندن علیرغم اغتشاش توصیف می کند. استحکام ژنتیکی علیرغم ورودی جهشی، فنوتیپ را حفظ می کند، که لزوماً نقش اپیستازی را شامل می شود. استحکام محیطی پایداری فنوتیپی در مواجهه با تغییرات محیطی است، جایی که اپیستاز ممکن است دخیل نباشد. در اینجا استحکام ژنتیکی و محیطی را از نقطه نظر تکامل بیماری‌های عفونی مورد بحث قرار می‌دهیم و پیشنهاد می‌کنیم که استحکام ممکن است یک اصل وحدت‌بخش برای درک چگونگی تکامل عوامل مختلف بیماری باشد. ما به‌ویژه بر روی ویروس‌های دارای ژنوم RNA به دلیل اهمیت آنها در تکامل بیماری‌های نوظهور و به‌عنوان سیستم‌های مدل برای آزمایش نظریه استحکام تمرکز می‌کنیم. ما داده‌های جدیدی را در مورد محدودیت‌های تطبیقی برای یک ویروس RNA مدل ارائه می‌کنیم که در پاسخ به تابش UV تکامل می‌یابد. ما همچنین توجه را به سایر سیستم‌های بیماری‌های عفونی جلب می‌کنیم که در آن‌ها نظریه استحکام ممکن است برای پل زدن زیست‌شناسی تکاملی و زیست‌پزشکی، به ویژه تکامل مقاومت آنتی‌بیوتیکی در باکتری‌ها، فرار ایمنی توسط آنفولانزا، و عفونت‌های انگل مالاریا مفید باشد.	در مورد نقش احتمالی استحکام در تکامل بیماری های عفونی
c8uvemh0	پس زمینه: میکروذرات (MPs) وزیکول های غشایی هستند که در طی فعال شدن سلول و آپوپتوز آزاد می شوند. MPs بسته به سلولی که از آنها منشا گرفته اند، اثرات بیولوژیکی متفاوتی دارند. بیماری ریه سیستیک فیبروزیس (CF) با هجوم گسترده گرانولوسیت های نوتروفیل در راه های هوایی، فعال شدن آنها و در نهایت آپوپتوز مشخص می شود. ما در مورد حضور و فنوتیپ MPs در خلط، یک منبع غیر تهاجمی غنی از بیومارکرهای التهاب، بیماران بالغ CF حاد و پایدار را بررسی کردیم. MethodsThe خلط خود به خود، به دست آمده از 21 بیمار CF (10 حاد و 11 پایدار) و 7 بیمار مبتلا به دیسکینزی مژگانی اولیه (PCD)، با اسپوتازول مایع شد. MPs شمارش شد، با میکروسکوپ الکترونی مشاهده شد، و در سوپرناتانت خلط تیمار شده با سیتوفلوریمتری و نشان‌بندی ایمنی برای آنتی‌ژن‌های لکوسیت (CD11a)، گرانولوسیت (CD66b)، و مونوسیت-ماکروفاژ (CD11b) شناسایی شدند. نتایج: میکروسکوپ الکترونی نشان داد که MPs خلط در محدوده 100-500 نانومتر بوده و حاوی باکتری نیست و آزمایش‌های میکروبیولوژیکی را تأیید می‌کند. خلط CF حاوی تعداد MPs بیشتری در مقایسه با خلط PCD بود. سطوح CD11a (+) - و CD66b (+) -، اما نه CD11b (+) -MPs در CF به طور قابل توجهی بالاتر از PCD بود، بدون تفاوت بین بیماران حاد و پایدار. نتیجه‌گیری: به طور خلاصه، MPs در خلط به‌دست‌آمده از بیماران CF قابل تشخیص هستند و عمدتاً منشأ گرانولوسیتی دارند. این روش جدید جداسازی MPs از خلط فرصت جدیدی را برای مطالعه پاتولوژی ریه در CF باز می کند.	جداسازی و شناسایی ریز ذرات موجود در خلط بیماران سیستیک فیبروزیس
m4sp9sjn	ناقل‌های آدنوویروسی (Ad) برای کاربردهای مختلف واکسن از جمله سرطان و بیماری‌های عفونی استفاده شده‌اند. به طور سنتی، واکسن های مبتنی بر Ad برای بیان آنتی ژن ها از طریق بیان تراریخته یک آنتی ژن معین طراحی می شوند. با این حال، در برخی موارد، این واکسن‌های مبتنی بر Ad معمولی نتایج بالینی کمتر از حد مطلوبی داشته‌اند. این نتایج زیر بهینه تا حدی به ایمنی از قبل موجود در سروتیپ Ad 5 (Ad5) نسبت داده می شود. به منظور دور زدن نیاز به بیان آنتی ژن از طریق ادغام ترانس ژن، استراتژی انتقال کپسید آنتی ژن توسعه یافته و برای توسعه واکسن مبتنی بر آگهی در زمینه چند بیماری استفاده شده است. این استراتژی شامل ترکیب پپتیدهای آنتی ژنی در ساختار کپسید ناقل های ویروسی است. هگزون اصلی پروتئین کپسید به دلیل نقش طبیعی هگزون در تولید پاسخ ایمنی ضد Ad و نمایش عددی آن در Ad virion برای این استراتژی‌های ترکیب کپسید استفاده شده است. با استفاده از این استراتژی، ما ابزاری را برای ترکیب اپی توپ های پپتید هترولوگ به طور خاص در حوزه های اصلی هگزون پروتئین کپسید Ad ایجاد کرده ایم. مطالعه ما در اینجا بر تولید ناقل‌های واکسن چند ظرفیتی که آنتی‌ژن‌های HIV را در هگزون پروتئین کپسید Ad ارائه می‌کنند، و همچنین بیان یک آنتی ژن HIV به عنوان یک ترانس ژن متمرکز است. این ناقل های جدید از HVR2 به عنوان یک سایت ادغام برای یک ناحیه بیست و چهار اسید آمینه از ناحیه اکتودومین پروگزیمال غشای HIV (MPER)، مشتق شده از گلیکوپروتئین HIV gp41 (gp41) استفاده می کنند. مطالعه ما در اینجا نشان می‌دهد که ناقل‌های چند ظرفیتی ضد اچ‌آی‌وی ما پاسخ سلولی ضد HIV را ایجاد می‌کنند. علاوه بر این، واکسیناسیون با این ناقل ها، که آنتی ژن های HIV را در HVR2 ارائه می کنند، یک پاسخ ایمنی هومورال خاص اپی توپ HIV را ایجاد می کند.	ترکیب آنتی ژن HIV در آدنوویروس Hexon Hypervariable 2 برای یک رویکرد جدید واکسن HIV
0bwxcij3	مقدمه: تاثیر مدل امتیاز بیماری مرحله پایانی کبدی (MELD) بر عوارض و مرگ و میر پس از عمل هنوز مبهم است، به خصوص برای MELD بالا. گزارش‌هایی از نتیجه ضعیف‌تر بیمار در کاندیدهای پیوند با نمره MELD بالا وجود دارد، اگرچه دیگران هیچ تأثیری از نمره MELD بر نتیجه و بقا گزارش نمی‌دهند. روش‌ها: ما به صورت گذشته‌نگر داده‌های 144 گیرنده پیوند کبد را طی یک دوره 72 ماهه در واحد پیوند خود، از ژانویه 2003 تا دسامبر 2008، تجزیه و تحلیل کردیم و تجزیه و تحلیل تک متغیره و چند متغیره را برای عوارض و مرگ‌ومیر انجام دادیم، به‌ویژه برای تعریف تأثیر MELD بر روی این پارامترها نتایج: این مطالعه امتیاز MELD را بیشتر از 23 به عنوان یک عامل خطر مستقل عوارض ناشی از ماندن در بخش مراقبت های ویژه (ICU) بیش از 10 روز (نسبت شانس 7.0) شناسایی کرد، اما در مقابل هیچ تاثیر منفی بر مرگ و میر نداشت. علاوه بر این، ما انتقال بیش از 7 واحد گلبول قرمز را به عنوان عامل خطر مستقل برای مرگ و میر (نسبت خطر 7.6) و برای اقامت طولانی مدت در ICU (نسبت شانس [OR] 7.8) همراه با تزریق بیش از 10 واحد پلاسمای تازه منجمد شناسایی کردیم. (OR 11.6). نارسایی کلیه پس از عمل یک پیش بینی کننده قوی برای عوارض است (OR 7.9) و درمان جایگزینی کلیه پس از عمل بسیار با افزایش مرگ و میر (نسبت خطر 6.8) همراه بود، همانطور که سندرم کلیه کبدی قبل از پیوند (نسبت خطر 13.2) بود. نتیجه‌گیری: این مطالعه نمره MELD بالاتر از 23 را به عنوان یک عامل خطر مستقل عوارض ناشی از ماندن در ICU بیش از 10 روز شناسایی کرد، اما در مقابل تأثیر منفی بر مرگ و میر نداشت. این یافته از پیوند بیماران با نمره MELD بالا اما تنها با آگاهی از افزایش عوارض حمایت می کند.	امتیاز مدل مرحله پایانی بیماری کبدی (MELD) بیشتر از 23 طول مدت اقامت در ICU را پیش‌بینی می‌کند اما مرگ و میر را در گیرندگان پیوند کبد پیش‌بینی نمی‌کند.
t7rxmzvi	به طور سنتی در تنظیم فشار خون مهم است، سیستم رنین-آنژیوتانسین - و به طور خاص آنزیم مبدل آنژیوتانسین (ACE) - آنژیوتانسین (Ang) II-AT(1) محور گیرنده - ممکن است نقش برجسته ای در ترویج التهاب و فیبروز ACE2، یک جزء جدید از سیستم رنین-آنژیوتانسین، به عنوان یک آنزیم کلیدی ظاهر شده است که به طور انتخابی Ang II را تجزیه می کند و Ang-(1-7)، یک پپتید زیست فعال با اثرات ضد التهابی و ضد فیبروتیک تولید می کند. تاکاهاشی و همکارانش تیترهای گردشی اتوآنتی بادی های مهاری علیه ACE2 را در بیماران مبتلا به اسکلروز سیستمیک نشان دادند. مطالعه حاضر مکانیسم بالقوه جدیدی را برای کاهش فعالیت کاتالیزوری ACE2 نشان می‌دهد، در نتیجه اقدامات Ang II را ارتقا می‌دهد.	اتوآنتی بادی های آنزیم مبدل آنژیوتانسین 2: شواهد بیشتر برای نقش سیستم رنین-آنژیوتانسین در التهاب
1gad01re		نقش کموکاین ها در عفونت ویروسی CNS
wrru98zg	سابقه و هدف: آنفولانزا یکی از شایع ترین بیماری های قابل پیشگیری با واکسن در مسافران است. با انجام دو پرسشنامه مقطعی در زمستان 2009 و زمستان 2010 در بین مسافران اروپایی به مقاصد با منابع محدود، هدف ما بررسی دانش، نگرش و عملکرد (KAP) در مورد واکسیناسیون آنفولانزای فصلی بود. روش‌ها: پرسشنامه‌ها در اتاق انتظار برای بازدیدکنندگان مرکز بهداشت سفر دانشگاه زوریخ (CTH) در ژانویه و فوریه 2009 و ژانویه 2010 قبل از مشاوره سلامت سفر (CTH09 و CTH10) توزیع شد. سوالات شامل داده های دموگرافیک، ویژگی های مربوط به سفر و KAP در مورد واکسیناسیون آنفولانزا بود. داده ها با استفاده از SPSS نسخه 14.0 برای ویندوز تجزیه و تحلیل شد. تفاوت در نسبت ها با استفاده از آزمون Chi-square مقایسه شد و سطح معنی داری 05/0 ≤ p تعیین شد. پیش‌بینی‌کننده‌های واکسیناسیون آنفولانزای فصلی و همه‌گیر با تحلیل‌های رگرسیون لجستیک چندگانه تعیین شدند. نتایج: با نرخ پاسخ 96.6٪، 906 نفر ثبت نام کردند و 868 (92.5٪) داده های کامل را ارائه کردند. پوشش واکسیناسیون آنفولانزای فصلی 13.7٪ (119 نفر) بود. تنها 43 شرکت کننده (14.2%) در برابر آنفولانزای همه گیر A/H1N1 واکسینه شدند که اکثراً هر دو واکسن فصلی و همه گیر را به طور همزمان دریافت کرده بودند. اهداف مرتبط با شغل (44، 37 درصد)، سن > 64 سال (25، 21 درصد) و توصیه های پزشک خانواده (27، 22.7 درصد) بیشترین دلایل گزارش شده برای واکسینه شدن بودند. در تجزیه و تحلیل رگرسیون لجستیک چندگانه داده‌های تلفیقی افزایش سن (OR = 1.03، 95% فاصله اطمینان (CI): 1.01 - 1.04)، یک سفر کاری (OR = 0.39، 95% فاصله اطمینان (CI): 0.17 - 0.92) و واکسیناسیون آنفولانزای فصلی در فصول زمستان قبلی ( OR = 12.91، 95% فاصله اطمینان (CI): 8.09 - 20.58) پیش بینی کننده مستقل برای واکسیناسیون آنفولانزای فصلی در سال 2009 یا 2010 بودند. واکسیناسیون آنفولانزا توصیه شده توسط پزشک خانواده (327، 37.7%)، سفر به مناطق با خطر بالای آنفلوانزا (55،30). ٪، و واکسن آنفولانزا مورد نیاز برای اهداف شغلی (233، 26.8٪) اغلب برای در نظر گرفتن واکسیناسیون آنفولانزا ذکر شده است. نتیجه‌گیری: درک خطر و پوشش واکسیناسیون مربوط به آنفولانزای فصلی و همه‌گیر در بین مسافرانی که به مقصدهای دارای منابع محدود در مقایسه با گروه‌های در معرض خطر سنتی مقایسه می‌شوند، بسیار ضعیف بود. دسترسی قبلی به واکسیناسیون آنفولانزا واکسیناسیون را در سال بعد تسهیل کرد. استراتژی های اطلاعاتی در مورد آنفولانزا باید تشدید شود و متخصصان بهداشت را شامل شود، به عنوان مثال. پزشکان خانواده، پزشکان طب مسافرتی و شرکت های تجاری.	یک نظرسنجی مقطعی برای ارزیابی دانش، نگرش و عملکرد (KAP) در مورد واکسیناسیون آنفولانزای فصلی در بین مسافران اروپایی به مقصدهای با منابع محدود
4458ra21	پس‌زمینه تولید آنتی‌ژن‌های بومی برای تشخیص سرمی عفونت‌های کرمی کار دشواری است و با تغییرات دسته‌به‌بچ با مشکل مواجه می‌شود. برای تشخیص سرمی اکینوکوکوز، به ویژه بیماری کیستیک، اکثر آزمایشات غربالگری به مایع کیست هیداتید خام یا خالص شده اکینوکوکوس گرانولوزوس متکی هستند. برای رفع محدودیت های مرتبط با آنتی ژن های بومی در تست های سرولوژیکی، استفاده از آنتی ژن های استاندارد شده و بسیار خالص تولید شده توسط سنتز شیمیایی مزایای قابل توجهی را ارائه می دهد، مشروط بر اینکه حساسیت و ویژگی تشخیصی مناسب به دست آید. روش‌شناسی/یافته‌های اصلی: با استفاده از مجموعه رو به رشد داده‌های ژنومی و پروتئومی، مجموعه‌ای از معیارهای انتخاب بیوانفورماتیک را برای مجموعه‌ای از توالی‌های پروتئینی شامل داده‌های توالی نوکلئوتیدی ترجمه مفهومی دو کرم نواری مرتبط، Echinococcus multilocularis و granuloscocus، اعمال کردیم. رویکرد ما مارپیچ‌های آلفا-مارپیچ و نواحی ذاتاً بدون ساختار پروتئین‌های انگل را هدف قرار می‌دهد که به طور بالقوه در معرض سیستم ایمنی میزبان قرار دارند. از 6 پروتئین E. multilocularis و 5 پروتئین E. granulosus، 45 پپتید با طول بین 24 تا 30 اسید آمینه طراحی شد. این پپتیدها به صورت شیمیایی سنتز شدند، روی ریزآرایه‌ها مشاهده شدند و از نظر واکنش‌پذیری با سرم‌های انسان‌های آلوده غربالگری شدند. پپتیدهایی که بالاتر از برش واکنش نشان می‌دهند، در سنجش‌های جاذب ایمنی متصل به آنزیم (ELISA) اعتبارسنجی شدند. پپتیدهای شناسایی شده نتوانستند بین عفونت E. multilocularis و E. granulosus تمایز قائل شوند. پپتید با بهترین عملکرد به حساسیت 57 درصد و ویژگی 94 درصد رسید. این نامزد از آنتی ژن B8/1 Echinococcus multilocularis مشتق شده بود و واکنش قوی به سرم بیماران آلوده به E. multilocularis یا E. granulosus نشان داد. نتیجه‌گیری/ اهمیت: این مطالعه اثبات اصل را برای کشف پپتیدهای تشخیصی مرتبط با انتخاب بیوانفورماتیک همراه با غربالگری بر روی یک پلت‌فرم ریزآرایه با توان بالا ارائه می‌کند. داده‌های ما نشان داد که یک پپتید منفرد نمی‌تواند حساسیت تشخیصی کافی را ارائه دهد در حالی که ادغام چندین آنتی ژن پپتیدی حساسیت را بهبود می‌بخشد. بنابراین ترکیب چندین پپتید ممکن است راه را برای آزمایش‌های تشخیصی جدید که جایگزین یا حداقل مکمل تشخیص ایمنی مرسوم اکینوکوکوز می‌شوند، منجر شود. استراتژی ما می تواند برای پیشرفت های تشخیصی در سایر پاتوژن ها مفید باشد.	تشخیص سروصدایی اکینوکوکوس گونه عفونت: انتخاب اکتشافی آنتی ژن های تشخیصی توسط ریزآرایه پپتیدی
mlhd9zbs	ظهور یک سویه جدید آنفلوانزا به دلیل حداقل ایمنی آنتی بادی منجر به گسترش سریع جهانی ویروس می شود. ایمنی سلول های T CD8(+) از قبل که به سمت مناطق ویروسی داخلی حفاظت شده هدایت می شود، می تواند بیماری را تا حد زیادی بهبود بخشد. با این حال، فرار جهشی در اپی توپ های سلول T یک مسئله اساسی برای کنترل ویروس و طراحی واکسن است. اگرچه جهش‌ها می‌توانند منجر به از دست دادن شناخت سلول‌های T شوند، برخی از انواع، پاسخ‌های سلول‌های T متقاطع را ایجاد می‌کنند. در این مطالعه، ما از ژنتیک معکوس برای اصلاح پپتید NP (336-374) آنفولانزا در یک باقیمانده در معرض نیمه حلال (جهش N->A، NPN3A) برای ارزیابی در دسترس بودن، اثربخشی و مکانیسم زمینه‌ای واکنش متقاطع خاص آنفولانزا استفاده کردیم. پاسخ سلول های T ویروس مهندسی شده باعث کاهش پاسخ سلول T CD8 (+) شد و یک مجموعه گیرنده سلول T باریک (TCR) را در دو منطقه Vβ (Vβ8.3 و Vβ9) انتخاب کرد. این را می توان تا حدی با ساختار H-2D(b)NPN3A توضیح داد که از دست دادن چندین تماس بین پپتید NPN3A و H-2D(b) را نشان داد، از جمله تماس با His155، موقعیتی که نقش مهمی در میانجی گری ایفا می کند. تعاملات TCR-pMHC-I. علی‌رغم این تفاوت‌ها، TCR‌های متقاطع واکنشی رایج در هر دو مجموعه TCR ساده و ایمنی NPN3A خاص شناسایی شدند. با این حال، در حالی که اپی توپ NPN3A سلول های T حافظه را که پاسخ یادآوری معادلی به ویروس جهش یافته یا نوع وحشی (wt) می دهند، به طور قابل توجهی کمتر از چالش wt->wt هستند. چنین کاهش پاسخ CD8 (+) پس از چالش هترولوگ استخراج شده منجر به تاخیر در پاکسازی ویروسی از ریه آلوده شد. علاوه بر این، موش هایی که برای اولین بار در معرض ویروس wt قرار گرفتند، پس از عفونت ثانویه با جهش یافته، پاسخ ضعیف و کم علاقه نشان دادند. بنابراین، کارایی محافظتی سلول‌های T متقاطع CD8(+) که اپی توپ‌های ویروسی جهش یافته را تشخیص می‌دهند به تعاملات ساختاری پپتید-MHC-I و علاقه عملکردی بستگی دارد. مطالعه ما از استراتژی‌های واکسنی که شامل ایمن‌سازی در برابر گونه‌های متقاطع واکنش متقاطع با جهش‌هایی در باقیمانده‌های نیمه در معرض حلال هستند که ویژگی‌های قابل مقایسه با NPN3A دارند، پشتیبانی نمی‌کند.	اثر حفاظتی سلول های T متقاطع واکنشی CD8(+) در شناسایی اپی توپ های ویروسی جهش یافته به برهمکنش های ساختاری پپتید-MHC-I و آستانه فعال سازی سلول T بستگی دارد
hgpn8oba	هدف از این مطالعه ایجاد یک سیستم امتیازدهی علائم برای استفاده در مطالعات بالینی بود که کودکان مبتلا به علائم سرماخوردگی را که علت ویروسی قابل شناسایی برای عفونت دستگاه تنفسی فوقانی خود (URI) دارند از کسانی که هیچ ویروسی در آنها شناسایی نشده است، متمایز می‌کند. سواب بینی برای آزمایش PCR برای شناسایی ویروس های تنفسی در کودکان 2 تا 11 ساله در ابتدا و زمانی که والدین فکر می کردند کودکشان در حال ابتلا به سرماخوردگی است، به دست آمد. شدت علائم خاص ثبت شده توسط والدین در کودکان با و بدون URI ویروسی مستند مقایسه شد. سواب بینی از 108 کودکی که والدین آنها گزارش داده بودند که فرزندشان در حال ابتلا به سرماخوردگی است، گرفته شد. اتیولوژی ویروسی در 62 مورد از 108 نمونه (57.4%) شناسایی شد. علائمی که به بهترین وجه کودکان با علت ویروسی را از کودکان فاقد آن متمایز می‌کرد، آبریزش چشم و سرفه قابل توجه در روزهای 1 تا 4 بیماری بود. امتیاز علائم URI بر اساس این علائم با حساسیت 81.4٪، ویژگی 61.9٪ و دقت 73.3٪ ایجاد شد. برداشت والدین تنها یک پیش‌بینی‌کننده نسبتاً دقیق URI ویروسی در کودکان است. امتیاز علائم URI ما روش دقیق تری برای شناسایی کودکان مبتلا به URI ویروسی برای مطالعات بالینی ارائه کرد.	ایجاد یک امتیاز علائم برای مطالعات بالینی برای شناسایی کودکان مبتلا به عفونت ویروسی مستند دستگاه تنفسی فوقانی
zueoyesj	پس زمینه: این یک باور پذیرفته شده است که سلول های سرطانی حالت رونویسی خود را در طول پیشرفت بیماری تغییر می دهند. ما پیشنهاد می‌کنیم که پیشرفت سلول‌های سرطانی به سمت فنوتیپ‌های بدخیم را می‌توان با استفاده از فن‌آوری‌های با توان بالا که تغییرات تدریجی مشاهده‌شده در پروفایل‌های بیان ژن را با استفاده از نظریه ریاضی ارتباط شانون دنبال می‌کنند، ردیابی کرد. سپس روش‌های مبتنی بر تئوری اطلاعات می‌توانند واگرایی پروفایل‌های رونویسی سلول‌های سرطانی را از پروفایل‌های سلول‌های ظاهر شده طبیعی بافت‌های منشا کمیت کنند. ارتباط روش‌های پیشنهادی را می‌توان با استفاده از مجموعه داده‌های ریزآرایه‌ای موجود در حوزه عمومی ارزیابی کرد، اما این روش در اصل برای سایر روش‌های بازده بالا قابل اجرا است. روش‌شناسی/ یافته‌های اصلی: با استفاده از مجموعه داده‌های سرطان پروستات و ملانوما نشان می‌دهیم که چگونه می‌توان از آنتروپی شانون و واگرایی جنسن-شانون برای ردیابی پیشرفت تغییرات رونویسی بیماری استفاده کرد. ما مشخص می کنیم که چگونه تغییرات این دو معیار با نشانگرهای زیستی تعیین شده پیشرفت سرطان ارتباط دارد. معیارهای تئوری اطلاعات به ما امکان می‌دهند که نشانگرهای زیستی جدیدی را برای تغییرات رونویسی پیشرونده و نسبتاً ناگهانی که منجر به فنوتیپ‌های بدخیم می‌شوند شناسایی کنیم. در همان زمان، این روش توانست تعداد زیادی از ژن ها و فرآیندهایی را که به نظر می رسد در پیشرفت ملانوم و سرطان پروستات دخیل هستند، تأیید کند. نتیجه‌گیری/ اهمیت: بنابراین ما یک قانون راهنمای کمی ارائه می‌کنیم، یک نشانه بارز یکپارچه‌کننده جدید سرطان: تغییرات رونوشت سلول سرطانی منجر به انتقال مشاهده‌شده قابل اندازه‌گیری مقادیر آنتروپی شانون عادی شده (همانطور که توسط فناوری‌های توان عملیاتی بالا اندازه‌گیری می‌شود) می‌شود. در همان زمان، سلول‌های تومور با ایجاد حالت‌هایی که ممکن است مستقیماً آن‌ها را اندازه‌گیری نکنیم، انحراف خود را از پروفایل بافت طبیعی افزایش می‌دهند. این علامت یکسان کننده، از طریق واگرایی جنسن-شانون، امکان شناسایی فلش زمان فرآیندها از پروفایل های بیان ژن را فراهم می کند و به ترسیم علائم فنوتیپی و مولکولی زیرگروه های خاص سرطان کمک می کند. مبنای ریاضی عمیق این رویکرد به ما اجازه می‌دهد تا پیشنهاد کنیم که این اصل، امیدواریم، برای سایر بیماری‌ها کاربرد کلی داشته باشد.	کشف نشانگر زیستی سرطان: علامت مشخصه آنتروپیک
hkc4vbmj	اولین نشست علمی شبکه جدید SYSGENET اروپایی در مرکز تحقیقات عفونت هلمهولتز (HZI) در براونشوایگ، 7 تا 9 آوریل 2010 برگزار شد. حدود 50 محقق در زمینه ژنتیک سیستم ها با استفاده از جمعیت های مرجع ژنتیکی موش (GRP) کار می کنند. ) در جلسه شرکت کردند و نتایج، رویکردهای فنوتیپ و ابزارهای تجزیه و تحلیل داده ها برای مطالعه ژنتیک سیستم ها را تبادل کردند. علاوه بر این، آینده منابع GRP و فنوتیپ در اروپا مورد بحث قرار گرفت.	SYSGENET: گزارش جلسه ای از یک شبکه اروپایی جدید برای ژنتیک سیستم ها
yc8rjjyf	جوامع بشری در شبکه های پیچیده ای سازماندهی شده اند که دائماً توسط یک پویایی اجتماعی که تحت تأثیر اطلاعاتی که افراد در مورد دیگران دارند، تغییر شکل می دهند. به طور مشابه، انتشار اپیدمی ممکن است تحت تأثیر اطلاعات محلی قرار گیرد که افراد را از وضعیت سلامتی روابط اجتماعی خود آگاه می کند و به آنها امکان می دهد از تماس با افراد آلوده خودداری کنند و با افراد سالم در ارتباط باقی بمانند. در اینجا ما پویایی بیماری را در جمعیت‌های محدودی مطالعه می‌کنیم که در آن عفونت در امتداد پیوندهای یک شبکه تماس پویا رخ می‌دهد که تغییر شکل آن ممکن است بر اساس وضعیت سلامتی هر فرد مغرضانه باشد. ما برخی از پرکاربردترین مدل‌های اپیدمیولوژیک را اتخاذ می‌کنیم و تأثیر تغییر شکل شبکه تماس را بر پویایی بیماری بررسی می‌کنیم. ما نتایج تحلیلی را در محدوده‌ای به دست می‌آوریم که در آن تغییر شکل شبکه بسیار سریع‌تر از گسترش بیماری اتفاق می‌افتد و به صورت عددی نشان می‌دهیم که این محدودیت در مقیاس‌های زمانی بسیار گسترده‌تر از آنچه که ممکن است پیش‌بینی شود گسترش می‌یابد. به طور خاص، ما نشان می‌دهیم که از یک توصیف در سطح جمعیت، انتشار بیماری در یک شبکه سریع تطبیق‌پذیر را می‌توان به‌طور معادل گسترش بیماری در یک جمعیت کاملاً مخلوط اما با عفونی‌سازی مجدد فرمول‌بندی کرد. ما متوجه شدیم که برای همه مدل‌های مورد مطالعه در اینجا - SI، SIS و SIR - مسری بودن مؤثر یک بیماری به اندازه جمعیت، تعداد مبتلایان در جمعیت، و ظرفیت افراد سالم برای قطع تماس با افراد آلوده بستگی دارد. نکته مهم، ما نشان می‌دهیم که چگونه استفاده از اطلاعات موجود مانع از پیشرفت بیماری می‌شود، یا با کاهش میانگین زمان لازم برای ریشه‌کن کردن یک بیماری (در صورت امکان بهبودی)، یا با افزایش میانگین زمان لازم برای گسترش یک بیماری به کل جمعیت ( در صورتی که بهبودی یا مصونیت غیرممکن باشد).	شبکه های تماس تطبیقی، عفونی و پویایی مؤثر بیماری را تغییر می دهند
yjwm84ub	تأثیر متقابل بین ژن های حساسیت و عوامل محیطی نقش مهمی در پیدایش مولتیپل اسکلروزیس (MS) در نظر گرفته می شود. در میان عوامل محیطی، نقش یک پاتوژن عفونی برای مدت طولانی در فرآیند بیماری نقش اساسی در نظر گرفته شده است. این نظر هم از داده‌های اپیدمیولوژیک و هم از یافته‌های ناهنجاری‌های ایمونولوژیک در مایع نخاعی پشتیبانی می‌کند که منعکس‌کننده پاسخ ایمنی به یک آنتی ژن هنوز مشخص نشده، احتمالاً یک پاتوژن، در مایع مغزی نخاعی است. بررسی ما درک کنونی از نقش عفونت در ایجاد و پیشرفت ام اس را تشریح خواهد کرد. ما داده‌هایی را که به علت عفونی ام‌اس اشاره می‌کنند، مرور می‌کنیم و عوامل خاص کلامیدوفیلا (کلامیدیا) پنومونیه، ویروس هرپس انسانی 6 و ویروس اپشتین بار را که در ایجاد یا پیشرفت ام‌اس دخیل هستند، در نظر می‌گیریم.	نقش عفونت ها در پاتوژنز و سیر مولتیپل اسکلروزیس
iejfgkst	Ca(2+) نقش اساسی در فیزیولوژی و بیوشیمی موجودات پروکاریوتی و پستانداران ایفا می کند. ویروس ها همچنین از سیگنال جهانی Ca(2+) برای ایجاد یک محیط سلولی خاص برای دستیابی به همزیستی با میزبان و انتشار استفاده می کنند. در این مقاله ابتدا توسعه خود را از یک رویکرد پیوند برای درک خواص اتصال Ca(2+) اختصاصی سایت پروتئین های EF-hand با موتیف اتصال مارپیچ-حلقه-مارپیچ Ca(2+) توصیف می کنیم، سپس پیش بینی و شناسایی خود را خلاصه می کنیم. از محل‌های اتصال EF-hand Ca(2+) در مقیاس وسیع ژنومی در باکتری‌ها و ویروس‌ها، و گزارش بعدی کاربرد روش پیوند برای بررسی قابلیت اتصال فلزی موتیف‌های EF-دست پیش‌بینی‌شده در گیرنده هموپروتئین استرپتوکوک (Shr) استرپتوکوک پیروژنز و پروتئین غیر ساختاری 1 (nsP1) ویروس Sindbis. هنگامی که روش‌هایی مانند رویکرد پیوند در ارتباط با الگوریتم‌های پیش‌بینی توسعه می‌یابند، بهتر می‌توانیم مکان‌های پیوسته Ca(2+) را که قبلاً به دلیل محدودیت روش‌شناسی مرسوم کمتر معرفی شده‌اند، بررسی کنیم.	کلسیومیکس: پیش‌بینی و تجزیه و تحلیل پروتئین‌های متصل شونده به کلسیم EF توسط مهندسی پروتئین
bujydnde	سابقه و هدف: بر اساس نمایش بالینی علائم بیماری، بیماران مبتلا به ام اس (MScl) را می توان به دو زیر گروه عمده تقسیم کرد. عود کننده (RR) MScl (85-90%) و پیشرونده اولیه (PP) MScl (10-15%). آنالیز پروتئومیکس مایع مغزی نخاعی (CSF) تعدادی از پروتئین‌ها را شناسایی کرده است که در بیماران MScl افزایش یافته است. در اینجا ما به طور خاص با مقایسه پروتئین‌های CSF قصد داریم بین زیرگروه‌های PP و RR MScl تمایز قائل شویم. روش‌شناسی/یافته‌های اصلی: نمونه‌های CSF (31=n) طبق همان پروتکل برای اندازه‌گیری‌های طیف‌سنجی جرمی کمی که قبلاً گزارش کردیم، استفاده شدند. در مقایسه PP MScl در مقابل RR MScl، تعدادی از پروتئین‌های فراوان متفاوت، مانند پروتئین دندانه دار-1 و پروتئین اتصال دهنده ویتامین D را مشاهده کردیم. پروتئین jagged-1 در PP MScl در مقایسه با RR MScl بیش از سه برابر کمتر بود. پروتئین متصل شونده به ویتامین D تنها در نمونه های RR MScl شناسایی شد. این دو پروتئین با تکنیک‌های مستقل (Western blot و ELISA) به‌عنوان فراوانی متفاوت در مقایسه بین هر دو نوع MScl تأیید شدند. نتیجه گیری/ اهمیت: یافته اصلی این مطالعه مقایسه ای مشاهده این است که پروفایل های پروتئوم CSF در بیماران PP و RR MScl تا حد زیادی با هم همپوشانی دارند. با این حال، تعدادی از تفاوت ها را می توان مشاهده کرد. Protein jagged-1 یک لیگاند برای چندین گیرنده Notch است و در میانجیگری سیگنالینگ Notch نقش دارد. در ادبیات پیشنهاد شده است که مسیر Notch در بازسازی مجدد ضایعات MScl نقش دارد. انحراف هموستاز طبیعی ویتامین D، که تقریباً 90٪ آن به پروتئین متصل به ویتامین D متصل است، چند سالی است که به طور گسترده در MScl نقش دارد. ویتامین D به طور مستقیم و غیرمستقیم تمایز، فعال‌سازی لنفوسیت‌های T CD4+ را تنظیم می‌کند و می‌تواند از توسعه فرآیندهای خودایمنی جلوگیری کند و بنابراین ممکن است در عناصر محافظت کننده عصبی در MScl نقش داشته باشد.	مقایسه پروتئومیکس مایع مغزی نخاعی عود کننده و مولتیپل اسکلروز اولیه پیشرونده
bufbjdmw	بیماری بینابینی ریه (ILD) در نوزادان و کودکان شامل طیف وسیعی از اختلالات تنفسی نادر است که عمدتاً مزمن بوده و با عوارض و مرگ و میر بالا همراه است. این اختلالات با تغییرات التهابی و فیبروتیک مشخص می شوند که بر دیواره آلوئول تأثیر می گذارد. ویژگی‌های معمول ILD شامل تنگی نفس، انفیلترات منتشر در رادیوگرافی قفسه سینه، و تست‌های عملکرد غیرطبیعی ریوی با نقص تهویه محدود و/یا اختلال در تبادل گاز است. بسیاری از موقعیت‌های پاتولوژیک می‌توانند تبادل گاز را مختل کنند و بنابراین ممکن است به آسیب پیشرونده ریه و ILD کمک کنند. در نتیجه، رویکرد تشخیص باید با یک ارزیابی بالینی که مستلزم داشتن تاریخچه دقیق با توجه به مواجهه ها و بیماری های سیستمیک است، ساختار یابد. چندین طبقه بندی برای ILD پیشنهاد شده است اما هیچ کدام کاملاً رضایت بخش نیست به خصوص در کودکان. مقاله حاضر به بررسی مفاهیم کنونی مکانیسم های پاتوفیزیولوژیک، علت شناسی و رویکردهای تشخیصی و همچنین راهبردهای درمانی می پردازد. گروه بندی تشخیصی زیر برای بحث در مورد علل مختلف ILD کودکان استفاده می شود: 1) ILD مرتبط با مواجهه. 2) ILD مرتبط با بیماری سیستمیک. 3) ILD مرتبط با اختلال ساختار آلوئولی. و 4) ILD مخصوص دوران نوزادی. گزینه های درمانی عمدتاً شامل داروهای ضد التهابی، سرکوب کننده سیستم ایمنی و/یا ضد فیبروتیک هستند. نتیجه بسیار متغیر با نرخ مرگ و میر در حدود 15٪ است. پاسخ مطلوب کلی به درمان با کورتیکواستروئید در حدود 50٪ موارد مشاهده می شود که اغلب با عواقبی مانند تحمل محدود ورزش یا نیاز به اکسیژن درمانی طولانی مدت همراه است.	بیماری های بینابینی ریه در کودکان
73nlxqgk	پیش‌زمینه: کنترل شیوع همه‌گیری بیماری‌های تازه در حال ظهور مستلزم تخصیص سریع و هدفمند منابع محدود در بین کشورها است. در صورتی که بتوان عوامل خطر کلیدی را که به طور دقیق گسترش اولیه بیماری را بلافاصله پس از ظهور پیش بینی می کنند، شناسایی کرد، مراحل کنترل اولیه و حیاتی به میزان زیادی افزایش می یابد. روش‌شناسی/ یافته‌های اصلی: در اینجا، نقش سفر، تجارت و منابع ملی مراقبت‌های بهداشتی را در پیش‌بینی ظهور و شیوع اولیه آنفولانزای A/H1N1 در سال 2009 بررسی می‌کنیم. ما دریافتیم که گنجاندن داده‌های منابع ملی مراقبت‌های بهداشتی در تجزیه و تحلیل‌های ما، ظرفیت بسیار بیشتری برای پیش‌بینی شیوع بین‌المللی این ویروس فراهم می‌کند. در کشورهایی که منابع مراقبت های بهداشتی کمتری دارند، گزارش موارد A/H1N1 در سال 2009 به طور قابل توجهی به تعویق افتاد که احتمالاً نشان دهنده ظرفیت پایین برای آزمایش و گزارش دهی، و همچنین سایر مسائل سیاسی-اجتماعی است. ما همچنین تجارت بین‌المللی قابل توجهی در خوک و طیور زنده در دهه قبل از همه‌گیری را گزارش می‌کنیم که ممکن است در پیدایش و ترکیب ژنوتیپ این سویه همه‌گیر نقش داشته باشد. با این حال، عدم آگاهی از تکامل اخیر هر بخش ژن ویروسی H1N1، استفاده از این رویکرد را برای تعیین منشاء ویروسی منع می‌کند. نتیجه‌گیری/ اهمیت: ما نتیجه می‌گیریم که استراتژی‌های جلوگیری از ظهور و گسترش ویروس آنفلوآنزای همه‌گیر در آینده باید شامل موارد زیر باشد: 1) نظارت افزایش یافته برای سویه‌های ناشی از دسته‌بندی مجدد در دام‌های تجاری. 2) استقرار سریع اقدامات کنترلی در مرحله انتشار اولیه به کشورهایی که داده‌های سفر پیش‌بینی می‌کنند پاتوژن به آنها برسد و به کشورهایی که منابع کمتر مراقبت‌های بهداشتی احتمالاً باعث تأخیر در گزارش‌دهی می‌شود. نتایج ما مزایایی را برای همه طرف‌ها نشان می‌دهد، زمانی که کشورهای با درآمد بالاتر منابع مراقبت‌های بهداشتی اضافی را برای کشورهای کم‌درآمد، به‌ویژه آن‌هایی که حجم ترافیک هوایی بالایی دارند، فراهم می‌کنند. به ویژه، مقامات بین المللی باید کمک به فقیرترین کشورهایی را که خطر ابتلا به بیماری های عفونی در حال ظهور و حجم ترافیک هوایی در آنها بالاتر است، در اولویت قرار دهند. این استراتژی منجر به تشخیص زودهنگام پاتوژن ها و کاهش تأثیر همه گیری های آینده خواهد شد.	قدرت پیش‌بینی سفر هوایی و داده‌های اجتماعی-اقتصادی برای شیوع زودهنگام همه‌گیری
q3r327z7	سابقه و هدف: تئوری اپیدمیولوژیک استاندارد ادعا می کند که در جمعیت های ساختاریافته رقابت بین سویه های پاتوژن متعدد یک فرآیند قطعی است که با واسطه تعداد بازتولید پایه ([تصویر: متن را ببینید]) سویه های منفرد انجام می شود. یک نظریه جدید مبتنی بر تجزیه و تحلیل، شبیه سازی و مطالعه تجربی این پیش بینی کننده موفقیت را به چالش می کشد. یافته‌های اصلی: نشان می‌دهیم که کمیت [تصویر: متن را ببینید] یک پیش‌بینی‌کننده معتبر در جمعیت‌های ساخت‌یافته تنها زمانی است که اندازه بی‌نهایت باشد. در این مقاله نشان می‌دهیم که وقتی اندازه جمعیت محدود است، دینامیک عفونت توسط پاتوژن‌های چند سویه یک فرآیند تصادفی است که نتیجه آن را می‌توان با آنتروپی تکاملی، S، یک معیار نظری اطلاعاتی که عدم قطعیت در سن عفونی یک فرد آلوده را توصیف می‌کند، پیش‌بینی کرد. والدین یک عفونت جدید به طور تصادفی انتخاب شده است. آنتروپی تکاملی ثبات جمعیتی یا استحکام جمعیت عفونی را مشخص می کند. این پارامتر آماری مدت زمان عفونت را تعیین می کند و بنابراین یک شاخص کمی از بیماری زایی یک سویه را ارائه می دهد. نظریه اپیدمیولوژیک استاندارد مبتنی بر [تصویر: متن را ببینید] به عنوان معیاری از مزیت انتخابی، حد است زیرا اندازه جمعیت به بی نهایت نظریه انتخاب آنتروپیک تمایل دارد. مدل استاندارد تقریبی به نظریه انتخاب آنتروپیک است که اعتبار آن با اندازه جمعیت افزایش می یابد. نتیجه‌گیری: تجزیه و تحلیل اپیدمیولوژیک مبتنی بر آنتروپی برای توضیح مشاهدات تجربی در مورد ظهور سویه‌های بیماری‌زای کمتر آنفولانزای انسانی در طول فاز رانش آنتی ژنی نشان داده شده است. علاوه بر این، ما از دیدگاه آنتروپی برای بحث در مورد الگوهای اپیدمیولوژیک خاصی از شیوع فعلی آنفولانزای خوکی H1N1 استفاده می‌کنیم.	آنتروپی تکاملی موفقیت تهاجم را در اپیدمی های اضطراری تعیین می کند
ampip7od	پروتئوم‌هایی که مجموعه‌ای از پروتئین‌ها را در موجودات معاصر تشکیل می‌دهند از طریق نوترکیب و تکثیر مجموعه محدودی از دامنه‌ها تکامل یافته‌اند. این حوزه‌های پروتئینی اساساً اجزای اصلی پروتئین‌های کروی هستند و اصلی‌ترین سطحی هستند که عملکرد پروتئین و تعاملات پروتئین را می‌توان درک کرد. یکی از جنبه های مهم تکامل دامنه، ساختار اتمی و عملکرد بیوشیمیایی آنها است که هر دو با اطلاعات موجود در توالی اسید آمینه مشخص می شوند. تغییرات در این اطلاعات ممکن است چین‌ها، عملکردها و معماری‌های پروتئینی جدیدی ایجاد کند. با وجود توالی‌ها و داده‌های حاشیه‌نویسی که توسط ژنومیک به دست می‌آیند و همچنان در حال افزایش است، روابط تکاملی جدیدی به طور مداوم آشکار می‌شود، ساختارهای ناشناخته مدل‌سازی می‌شوند و فیلوژنی استنباط می‌شود. چنین تحقیقاتی نه تنها به پیش‌بینی عملکرد پروتئین‌های تازه کشف‌شده کمک می‌کند، بلکه به نقشه‌برداری مسیرهای پیش‌بینی‌نشده تکامل کمک می‌کند و فعل و انفعالات بین مولکولی و درون مولکولی را آشکار می‌کند. این به نوبه خود به ما کمک می‌کند توضیح دهیم که چگونه حوزه‌های پروتئینی شبکه‌های تعامل سلولی را شکل می‌دهند و پویایی تنظیم آنها در سلول. علاوه بر این، از این مطالعات می توان برای طراحی دامنه های پروتئینی جدید و بهینه برای درمان استفاده کرد. در این بررسی، هدف ما توصیف مفاهیم اساسی تکامل دامنه پروتئین و نشان دادن پیشرفت‌های اخیر در تکامل مولکولی است که بینش‌های جدید ارزشمندی را در زمینه ژنومیک مقایسه‌ای و شبکه‌های برهمکنش پروتئین ارائه کرده است.	ماهیت تکامل دامنه پروتئین: شکل دادن به شبکه تعامل
9uswwyxm	پس زمینه: بورتزومیب بازدارنده پروتئازوم یک پیشرفت مهم در درمان مولتیپل میلوما (MM) است. بورتزومیب فعالیت پروتئازوم 26S را مهار می کند و باعث مرگ سلولی در انواع سلول های تومور می شود. با این حال، مکانیسم سمیت سلولی به خوبی شناخته نشده است. روش‌شناسی/ یافته‌های اصلی: ما فسفوپروتئوم دیفرانسیل را بر مهار پروتئازوم با استفاده از برچسب‌گذاری ایزوتوپ پایدار توسط اسیدهای آمینه در کشت سلولی (SILAC) در ترکیب با غنی‌سازی فسفوپروتئین و آنالیز LC-MS/MS بررسی کردیم. در مجموع 233 فسفوپروتئین شناسایی شد و 72 فسفوپروتئین تغییر 1.5 برابری یا بیشتر را با درمان بورتزومیب نشان دادند. فسفوپروتئین‌ها با تغییرات بیانی، تمام کلاس‌های پروتئینی اصلی، از جمله تعداد زیادی پروتئین‌های اتصال‌دهنده به اسید نوکلئیک را در بر می‌گیرند. کمی سازی فسفوپپتید اختصاصی سایت نشان داد که فسفوریلاسیون Ser38 روی استاتمین با درمان بورتزومیب افزایش یافته است، که مکانیسم های جدیدی را در ارتباط با آپوپتوز ناشی از بورتزومیب در سلول های MM نشان می دهد. مطالعات بیشتر نشان داد که نمایه فسفوریلاسیون استاتمین در پاسخ به درمان با بورتزومیب اصلاح شد و تنظیم استاتمین توسط فسفوریلاسیون در باقیمانده‌های خاص Ser/Thr در پاسخ سلولی ناشی از بورتزومیب شرکت کرد. نتیجه‌گیری/ اهمیت: پروفایل سیستماتیک ما از تغییرات فسفوریلاسیون در پاسخ به درمان با بورتزومیب نه تنها درک مکانیکی جهانی از عملکرد بورتزومیب روی سلول‌های میلوما را ارتقا داد، بلکه پروتئین‌های سیگنال‌دهنده قبلاً مشخص نشده در سلول‌های میلوما را نیز شناسایی کرد.	فسفوپروتئومیکس کمی مهار پروتئازوم در سلول های مولتیپل میلوما
3n05cb49	بسیاری از بیماری‌های عفونی جدید و مشترک بین انسان‌ها به صورت عفونت‌های پراکنده با شیوع‌های محدود مکانی و زمانی ظاهر می‌شوند، همانطور که در آنفولانزای A(H5N1) دیده می‌شود. سازگاری اغلب یک عامل کلیدی برای برقراری موفقیت آمیز انتقال پایدار از انسان به انسان است. در اینجا ما از مدل‌های ریاضی ساده برای توصیف سناریوهای سازگاری مختلف با اشاره خاص به ناهمگونی فضایی در جمعیت انسانی استفاده می‌کنیم. ما عبارات تحلیلی را برای احتمال ظهور در هر مقدمه و همچنین زمان انتظار برای یک رویداد ظهور موفق ارائه می‌کنیم. علاوه بر این، ما نتایج تحلیلی کلی را برای ویژگی‌های آماری رویدادهای ظهور، از جمله توزیع احتمال اندازه‌های شیوع، استخراج می‌کنیم. ما نتایج تحلیلی خود را با یک مدل تصادفی مقایسه می کنیم که قبلاً به صورت محاسباتی مورد مطالعه قرار گرفته است. نتایج ما نشان می‌دهد که برای نقاط قوت اتصال معمولی بین جوامع، ناهمگونی فضایی تنها تأثیر ضعیفی بر توزیع اندازه شیوع و خطر ظهور در هر مقدمه دارد. به عنوان مثال، اگر [تصویر: متن را ببینید] یا بزرگتر، هر روستایی که فقط با ده مسافر در روز به یک شهر بزرگ متصل می شود، با در نظر گرفتن احتمال ظهور و توزیع اندازه شیوع، عملاً فقط بخشی از شهر است. ما داده‌های تجربی در مورد الگوهای رفت و آمد ارائه می‌کنیم و نشان می‌دهیم که اکثریت قریب به اتفاق جوامعی که چنین داده‌هایی برای آنها در دسترس است، حداقل به خوبی به هم مرتبط هستند. برای محدوده پارامترهای قابل قبول، اثرات ناهمگونی فضایی احتمالاً تحت سلطه زیست‌شناسی تکاملی سازگاری میزبان است. ما با بحث در مورد مفاهیم برای نظارت و کنترل عفونت های در حال ظهور نتیجه گیری می کنیم.	بینش در مورد تکامل و ظهور یک بیماری عفونی جدید
kfkumsux	سابقه و هدف: تعداد غیرمعمول بالایی از موارد ذات الریه شدید با مرگ و میر قابل توجهی با عفونت های ویروسی همه گیر H1N1 2009 در سطح جهان مشاهده می شود. در هند، همه موارد خفیف و بدحال در مرحله اولیه همه‌گیری در بیمارستان‌های دولتی بستری و تحت درمان قرار گرفتند. مطالعه حاضر در این مرحله اولیه از همه گیری انجام شد. روش: نقش بار ویروسی و عوامل میزبان در پاتوژنز با بررسی 26 بیمار خفیف (MP)، 15 بیمار بدحال (CIP) و 20 کنترل سالم از پونا، هند بررسی شد. نمونه های خون و ریه متوالی از CIP جمع آوری شد. بار ویروسی و سطوح سیتوکین/کموکاین از آسپیراسیون پلاسما و ریه بیماران تعیین شد. سطوح TLR با رنگ آمیزی و تجزیه و تحلیل FACS تعیین شد. پروفایل ژن برای هر دو سلول در آسپیره های ریه و PBMC با استفاده از آرایه های کم چگالی TaqMan انجام شد. تیتر آنتی بادی و ایزوتایپ با استفاده از ELISA مبتنی بر پروتئین HA انجام شد. یافته های اصلی: 15/13 بیماران بدحال منقضی شده اند. تمام نمونه های پلاسما برای ویروس بدون در نظر گرفتن دسته بندی بیمار منفی بود. نمونه‌های ریه متوالی از CIP بارهای ویروسی کمتری را نشان دادند که ارتباط تکثیر ویروس با شدت را زیر سوال برد. تیترهای Anti-rpH1N1-09-HA-IgG در بیماران بدحال به طور قابل توجهی بالاتر بود و هر دو دسته منحصراً ایزوتیپ IgG1 در گردش بودند. بیماران بدخیم افزایش در TLR-3، 4، 7 و کاهش در بیان TLR-2 به نمایش گذاشته. شدت بیماری با افزایش سطوح پلاسمایی IL1RA، IL2، IL6، CCL3، CCL4 و IL10 مرتبط بود. اکثر ژن‌های عملکرد ایمنی در PBMC‌ها کاهش یافتند و در سلول‌های آسپیراسیون ریه بیماران بدحال تنظیم شدند. هنگامی که نمونه های متوالی برای پارامترهای مختلف مورد بررسی قرار گرفتند، هیچ الگوی متمایز افتراق بیماران کشنده و زنده مشاهده نشد. نتیجه گیری: شدت بیماری با اختلال مشخص در پاسخ ایمنی میزبان همراه بود.	نقش پاسخ ایمنی میزبان و بار ویروسی در پیامد متفاوت عفونت ویروس آنفلوانزای همه‌گیر H1N1 (2009) در بیماران هندی
ip32y0j5	پس‌زمینه انتقال غیرفعال آنتی‌بادی‌ها نه تنها محافظت کوتاه‌مدت فوری در برابر بیماری را فراهم می‌کند، بلکه می‌تواند به عنوان یک ابزار درمانی نیز مورد استفاده قرار گیرد. با این حال، «انسانی کردن» آنتی‌بادی‌های مونوکلونال موش (mAbs) فرآیندی زمان‌بر و پرهزینه است که دارای اشکال ذاتی تغییر بالقوه ویژگی و/یا میل آنتی ژنی است. جاودانه سازی سلول های B انسانی جایگزینی برای به دست آوردن mAbs انسانی است، اما به در دسترس بودن نمونه های بیولوژیکی از افراد واکسینه شده یا بیماران در حال نقاهت متکی است. در این کار ما یک رویکرد جدید برای تولید mAbs کاملاً انسانی با ترکیب یک مدل موش انسانی با یک تکنیک جدید جاودانگی سلول B را توصیف می‌کنیم. روش‌شناسی/یافته‌های اصلی: پس از پیوند با سلول‌های پیش‌ساز خون‌ساز CD34(+)CD38(-)، موش‌های BALB/c Rag2(-/-)IL-2Rγc(-/-) سیستم ایمنی بدن انسان را به دست می‌آورند و سلول‌های B را با یک رپرتوار متنوع IgM موش های «سیستم ایمنی انسان» سپس با دو آنتی ژن تجاری واکسن، سم کزاز و آنتی ژن سطحی هپاتیت B ایمن شدند. سلول‌های B CD19(+)CD27(+) به صورت رتروویروسی با ژن‌های لنفوم سلول B (BCL)-6 و BCL-XL انتقال داده شدند و متعاقباً در حضور CD40-ligand و IL-21 کشت داده شدند. این روش اجازه می دهد تا سلول های B گیرنده مثبت سلول B پایدار تولید کند که ایمونوگلوبولین ها ترشح می کنند. ما کلون های سلول B پایداری را که به ترتیب IgM اختصاصی برای سم کزاز و آنتی ژن سطحی هپاتیت B تولید می کردند، بازیابی کردیم. نتیجه‌گیری/ اهمیت: این کار اثبات مفهومی را برای سودمندی این روش جدید مبتنی بر ایمن‌سازی موش‌های انسانی شده برای تولید سریع mAbs انسانی در برابر طیف وسیعی از آنتی‌ژن‌ها ارائه می‌کند.	تولید آنتی بادی های مونوکلونال IgM اختصاصی آنتی ژن انسانی با استفاده از موش های واکسینه شده «سیستم ایمنی انسان»
4owsb0bg	گابریل لئونگ و آنگوس نیکول بازتاب‌های خود را در مورد واکنش بین‌المللی به همه‌گیری آنفلوانزای H1N1 در سال 2009 ارائه می‌کنند، از جمله اینکه چه چیزی خوب پیش رفت و چه تغییراتی باید در پیش‌بینی همه‌گیری‌های آنفولانزای آینده انجام شود.	تأملاتی در مورد همه گیری (H1N1) 2009 و واکنش بین المللی
ujf6v8x0	ارتباط نزدیک فیلوژنتیکی بین انسان و پستانداران غیر انسانی، نخستی‌های غیر انسانی را به مدلی بی‌بدیل برای مطالعه بیماری‌های عفونی انسان تبدیل می‌کند. در این مطالعه، ما توسعه یک محفظه جداسازی چند منظوره خودکار در مقیاس بزرگ را برای استفاده با حیوانات آزمایشگاهی با اندازه متوسط حامل بیماری‌های عفونی توصیف می‌کنیم. محفظه جداسازی شامل زنجیره انتقال، زنجیره ضدعفونی، سیستم جداسازی فشار منفی هوا، سیستم رفاه حیوانات و سیستم خودکار، به گونه ای طراحی شده است که تمام استانداردهای ایمنی بیولوژیکی را رعایت کند. برای ایجاد یک محیط محفظه داخلی که کاملاً از بیرون جدا شده است، از دمنده‌های درایو فرکانس متغیر در سیستم ورودی هوا و خروجی هوا استفاده می‌شود که دقیقاً جریان هوای فیلتر شده را کنترل می‌کند و یک محافظت در برابر هوا ایجاد می‌کند. یک درگاه انتقال دو درب برای انتقال مواد بین فضای داخلی محفظه جداسازی و بیرون استفاده می شود. استریل کننده اسید پراستیک و خط لوله مربوط به آن امکان ضدعفونی کامل محفظه جداسازی را فراهم می کند. تمام پارامترهای محفظه ایزوله را می توان به طور خودکار توسط یک منوی کامپیوتری قابل برنامه ریزی کنترل کرد که امکان کار با حیوانات مختلف را در قفس های با اندازه های مختلف بسته به پروژه تحقیقاتی فراهم می کند. محفظه ایزوله چند منظوره در مقیاس بزرگ، یک سیستم مفید و ایمن برای کار با حیوانات آزمایشگاهی با اندازه متوسط عفونی در آزمایشگاه‌های ایمنی زیستی سطح بالا فراهم می‌کند.	توسعه یک سیستم محفظه ایزوله در مقیاس بزرگ برای مراقبت ایمن و انسانی از حیوانات آزمایشگاهی سایز متوسط حامل بیماری های عفونی
o80duxhs	پروتئومیکس مطالعه ای در مقیاس بزرگ در مورد ساختار و عملکرد پروتئین ها در نمونه های پیچیده بیولوژیکی است. چنین رویکردی ارزش بالقوه ای برای درک ماهیت پیچیده ارگانیسم دارد. ابزارهای پروتئومی کنونی امکان تجزیه و تحلیل در مقیاس بزرگ و با توان بالا را برای تشخیص، شناسایی و بررسی عملکردی پروتئوم فراهم می کنند. پیشرفت‌ها در تکنیک‌های تقسیم‌بندی پروتئین و برچسب‌گذاری، شناسایی پروتئین را بهبود بخشیده است تا حاوی پروتئین‌های کم‌تر باشد. علاوه بر این، پروتئومیکس با تجزیه و تحلیل اصلاحات و تکنیک های پس از ترجمه برای مقایسه کمی پروتئوم های مختلف تکمیل شده است. با این حال، محدودیت اصلی تحقیقات پروتئومی، پیچیدگی ساختارهای بیولوژیکی و فرآیندهای فیزیولوژیکی است که مسیر اکتشاف را با مشکلات و دام های مختلف هموار می کند. مقدار داده‌هایی که با تکنیک‌های جدید به‌دست می‌آیند، چالش‌های جدیدی را در پردازش و تحلیل داده‌ها ایجاد می‌کند. این مقاله مروری کوتاه بر تکنیک‌های پروتئومیک موجود در حال حاضر و کاربردهای آن‌ها را ارائه می‌کند و به دنبال آن، مزایا و چالش‌های فنی را به تفصیل شرح می‌دهد. چند راه حل برای دور زدن مشکلات فنی پیشنهاد شده است.	پروتئومیکس: چالش ها، تکنیک ها و امکانات برای غلبه بر پیچیدگی نمونه های بیولوژیکی
llilwq1u	مطالعات کالبد شکافی نشان داده است که ویروس آنفولانزای پرندگان بسیار بیماری زا انسانی (H5N1) می تواند چندین اندام انسان را به غیر از ریه ها آلوده کند و علل احتمالی آسیب اندام یا تکثیر ویروسی و/یا اختلال در تنظیم سیتوکین ها و کموکاین ها است. عدم قطعیت هنوز وجود دارد، تا حدی به دلیل تعداد محدودی از موارد مورد تجزیه و تحلیل. در این مطالعه، کالبد شکافی کامل شامل 5 سیستم اندام بر روی یک مورد تایید شده مرگبار انسانی H5N1 (مرد، 42 ساله) طی 18 ساعت پس از مرگ انجام شد. علاوه بر سیستم تنفسی (ریه‌ها، برونش و نای)، ویروس از قشر مغز، ماده مدولاری مغز، مخچه، ساقه مغز، هیپوکامپ ایلئوم، کولون، رکتوم، حالب، عروق آئورت ریوی و غدد لنفاوی جدا شد. شواهد واقعی RT-PCR نشان داد که ژن‌های ماتریکس و هماگلوتینین علاوه بر بافت‌های مثبت با جداسازی ویروس، در کبد و طحال نیز مثبت بودند. ایمونوهیستوشیمی و لکه های هیبریداسیون درجا شواهدی از عفونت ویروسی با RT-PCR زمان واقعی به جز برونش نشان داد. RT-PCR کمی نشان داد که بار ویروسی بالا با افزایش پاسخ میزبان همراه است، اگرچه بار ویروسی در اندام های مختلف به طور قابل توجهی متفاوت بود. سلول های سیستم ایمنی نیز می توانند هدف عفونت ویروسی باشند. به طور کلی، پاتوژنز ویروس HPAI H5N1 هم با تکثیر ویروس و هم با ضایعات ایمونوپاتولوژیک مرتبط بود. علاوه بر این، سلول های ایمنی را نمی توان از ایفای نقش در انتشار ویروس در داخل بدن مستثنی کرد.	مطالعه پاتولوژی مولکولی سیستماتیک یک مورد انسانی H5N1 تایید شده آزمایشگاهی
xwfptmmv	سابقه و هدف: اینکه آیا منابع اطلاعاتی بر رفتارهای حفاظتی سلامت در طول همه گیری آنفولانزا یا سایر اپیدمی های بیماری های عفونی نوظهور تأثیر می گذارد نامشخص است. روش: داده‌های حاصل از مصاحبه‌های تلفنی مقطعی 1001 بزرگسال هنگ‌کنگ در ژوئن 2009 در برابر تئوری و فرضیه‌های حاصل از داده‌ها بین اعتماد به اطلاعات (رسمی/غیررسمی)، درک، خودکارآمدی، حساسیت و نگرانی درک شده و بهداشت دست و فاصله گذاری اجتماعی با استفاده از مدل سازی معادلات ساختاری با مقایسه چند گروهی یافته های اصلی: اعتماد به اطلاعات رسمی (دولت/رسانه) در مورد آنفلوانزا با درک بیشتر گزارش شده از علت A/H1N1 (β = 0.36) و خودکارآمدی پیشگیری از A/H1N1 (β = 0.25) مرتبط بود، که به نوبه خود با بهداشت دست بیشتر (به ترتیب β = 0.19 و β = 0.23). اعتماد به اطلاعات غیررسمی (بین فردی) با حساسیت فردی A/H1N1 (21/0-=β) ارتباط منفی داشت، که با خودکارآمدی درک شده (42/0-=β) ارتباط منفی داشت، اما با نگرانی از آنفولانزا (44/0=β) همراه بود. . اعتماد به اطلاعات غیررسمی به طور مثبت با نگرانی آنفولانزا (β = 0.16) همراه بود که به نوبه خود با فاصله اجتماعی بیشتر (β = 0.36) همراه بود. مقایسه‌های چند گروهی تفاوت‌های جنسیتی را در رابطه با مسیرهای اعتماد به اطلاعات رسمی تا درک علت A/H1N1، اعتماد به اطلاعات غیررسمی تا درک علت A/H1N1، و درک علت A/H1N1 تا خودکارآمدی درک‌شده نشان داد. نتیجه‌گیری/ اهمیت: اعتماد به اطلاعات دولتی/رسانه‌ای قوی‌تر با خودکارآمدی بیشتر و شستشوی دست‌ها مرتبط بود، در حالی که اعتماد به اطلاعات غیررسمی قویاً با تهدید سلامت درک شده و رفتار اجتنابی مرتبط بود. ارتباط ریسک باید تأثیر تفاوت های جنسیتی را در نظر بگیرد.	آگاهی موقعیتی و پاسخ های محافظتی بهداشتی به آنفولانزای همه گیر A (H1N1) در هنگ کنگ: یک مطالعه مقطعی
xroo7z7g	Yersinia pestis عامل ایجاد کننده طاعون است که در طول تاریخ ثبت شده بشریت بیش از 200 میلیون نفر را کشته است. آنتی‌بیوتیک‌ها ممکن است تسکین فوری کمی برای بیمارانی که باکتریمی بالایی دارند یا بیمارانی که با گونه‌های طاعون مقاوم به آنتی‌بیوتیک آلوده هستند، فراهم کند. دو عامل بیماریزای Y. pestis عبارتند از پروتئین کپسید F1 و پروتئین V با پاسخ کم کلسیم (Lcr) یا آنتی ژن V که ثابت شده است که اهداف ایمن سازی فعال و غیرفعال هستند. آنتی بادی های مونوکلونال موش (mAbs) علیه آنتی ژن های F1- و V وجود دارد که می توانند به طور غیر فعال از موش ها در مدل موشی طاعون محافظت کنند. با این حال، هیچ آنتی بادی مونوکلونال ضد Yersinia pestis برای درمان پیشگیرانه یا درمانی در انسان وجود ندارد. ما یک mAb انسانی ضد F1 خاص (m252) و دو mAb انسانی ضد V خاص (m253، m254) را با بررسی یک کتابخانه Fab ساده نمایش داده شده توسط فاژ در برابر آنتی ژن های F1 و V شناسایی کردیم. Fabs به IgG1 تبدیل شد و فعالیت های اتصال و حفاظتی آنها مورد ارزیابی قرار گرفت. M252 ضعیف به پپتیدهای واقع در انتهای N F1 متصل می شود که در آن یک mAb ضد F1 محافظ موش نیز متصل می شود. M253 به شدت به پپتید V-آنتی ژن متصل می شود که نشان دهنده یک اپی توپ خطی است. m254 به هیچ پپتیدی از پانل 53 پپتید متصل نشد که نشان می دهد اپی توپ آن ممکن است ساختاری باشد. M252 محافظت بهتری نسبت به m253 و m254 در برابر چالش Y، pestis در مدل موش طاعون نشان داد. هنگامی که سه آنتی بادی با هم ترکیب شدند، یک اثر هم افزایی مشاهده شد. حفاظت ناقص تا کامل زمانی حاصل شد که m252 در زمان‌های مختلف پس از چالش داده شد. این آنتی بادی ها را می توان بیشتر مورد مطالعه قرار داد تا پتانسیل آنها به عنوان درمان یا پیشگیری کننده در عفونت Y. pestis در انسان تعیین شود.	آنتی بادی های مونوکلونال ضد طاعون انسانی از موش ها در برابر یرسینیا پستیس در مدل طاعون بوبونیک محافظت می کند.
480d3yfv	سابقه و هدف: تشخیص افتراقی بیماران مبتلا به ارتشاح ریه همچنان یک چالش است. گیرنده محرک بیان شده بر روی سلول های میلوئیدی (TREM) -1 یک گیرنده نوتروفیل و مونوسیت است که در طول عفونت تنظیم می شود. هدف از این مطالعه ارزیابی دقت تشخیصی TREM-1 و پروتئین واکنشی C (CRP) از بیماران مبتلا به ارتشاح ریه برای تشخیص عفونت‌های ریوی اکتسابی جامعه بود. مواد و روشها: 68 بیمار بستری در بخش پزشکی با بیماری حاد تنفسی در این مطالعه وارد شدند. بیان نوتروفیل و مونوسیت TREM-1 با فلوسیتومتری، sTREM-1 با روش ایمونواسی آنزیمی و پروتئین واکنش‌گر C با نفلومتری اندازه‌گیری شد. نمره عفونت ریوی بالینی ثبت شد. نتایج: 34 بیمار مبتلا به پنومونی اکتسابی از جامعه باکتریایی (گروه A) و 34 بیمار با بیماری ریوی غیر باکتریایی (گروه B) تشخیص داده شدند. میانگین غلظت سرمی TREM-1 در گروه A 102.09 pg/ml و کمتر از 15.10 pg/ml (0.0001>p) در گروه B بود. میانگین ±SE نوتروفیل TREM-1 در گروه A 0.53 ± 4.67 MFI و 0.2 ± 2.64 بود. MFI (0.001 = p) در گروه B. بیان مونوسیت TREM-1 در گروه A 4.2 ± 0.42 MFI و 2.64 ± 0.35 MFI (0.007 = p) در گروه B و میانگین ± SE CRP در گروه 18.03 ± 2 میلی گرم در میلی لیتر بود. A و mg/ml 1.54 ± 7.1 (p <0.001) در گروه B. برش 19.53 pg/ml sTREM-1 با حساسیت 82.6 درصد و ویژگی 63 درصد برای تمایز بین ارتشاح ریوی عفونی و غیر عفونی پیدا شد. . sTREM-1 در پذیرش بیشتر از 180 pg/ml با پیامد نامطلوب همراه بود. نتیجه گیری: بیان میلوئید TREM-1 و sTREM-1 نشانگرهای قابل اعتماد عفونت باکتریایی در بین بیماران مبتلا به ارتشاح ریوی هستند. sTREM-1 پیش بینی کننده نتیجه نهایی است.	ارزش تشخیصی گیرنده محرک بیان شده بر روی سلول های میلوئیدی-1 و پروتئین واکنشی C برای بیماران مبتلا به ارتشاح ریه: یک مطالعه مشاهده ای
v4jochbe	ظهور مداوم عفونت‌های انسانی که از حیات وحش منشا می‌گیرند، نیاز به دانش بهتر جامعه میکروبی در گونه‌های حیات وحش را که رویکردهای تشخیصی سنتی محدود هستند، برجسته می‌کند. در اینجا ما زیست‌های میکروبی را در گوزن قاطر سالم (Odocoileus hemionus) با تجزیه و تحلیل متا رونوشت‌های غدد لنفاوی ارزیابی می‌کنیم. کتابخانه‌های cDNA از پنج فرد و دو مجموعه از نمونه‌ها از RNA غدد لنفاوی خلف حلقی غنی‌شده برای RNA پلی‌آدنیله تهیه و با استفاده از فناوری Roche-454 Life Sciences تعیین توالی شدند. توالی‌های کدکننده پروتئین و RNA ریبوزومی 16S (rRNA) از نظر طبقه‌بندی با استفاده از پایگاه‌های اطلاعاتی خاص پروتئین و rRNA مشخص شدند. نمایندگان تمام فیلاهای باکتریایی در هفت کتابخانه بر اساس رونوشت های کد کننده پروتئین که نشان می دهد میکروبیوتای زنده در غدد لنفاوی وجود دارد، شناسایی شدند. ساکنان پوست و شکمبه، و آنهایی که در همه جا در زیستگاه گوزن قاطر وجود دارند، بر گونه های باکتریایی قابل طبقه بندی غالب بودند. بر اساس تشخیص هر دو rRNA و رونوشت کد کننده پروتئین، ما دو گونه پروتئوباکتریایی جدید را شناسایی کردیم. یک هلیکوباکتر نزدیک به هلیکوباکتر ستوروم در مجموعه هلیکوباکتر پیلوری/هلیکوباکتر آسینونیچیس و یک اسینتوباکتر مربوط به اسینتوباکتر شیندلری. در میان ویروس ها، یک رتروویروس جدید گاما و سایر اعضای Poxviridae و Retroviridae شناسایی شدند. ما علاوه بر این تنوع باکتریایی را با آمپلیکون توالی‌بندی ناحیه V6 هیپرمتغیر 16S rRNA ارزیابی کردیم و نشان دادیم که تنوع طبقه‌بندی کلی با رویکرد متا رونویسی بالاتر است. این داده ها کامل ترین تصویر تا به امروز را از تنوع میکروبی در یک میزبان حیات وحش ارائه می دهد. تحقیقات ما استفاده از متا رونویسی را برای مطالعه میکروبیوتا در بافت‌های حیات وحش، که تشخیص ارگانیسم‌های جدید با پتانسیل بیماری‌زایی برای انسان و حیوانات را تسهیل می‌کند، افزایش می‌دهد.	نودئومیکس: تشخیص پاتوژن در غدد لنفاوی مهره داران با استفاده از متا ترانس کریپتومیکس
m5ho3ccj	فلاوی ویروس ها به شبکه آندوپلاسمی جوانه می زنند و از طریق مسیر ترشحی منتقل می شوند، جایی که محیط اسیدی خفیف باعث بازآرایی ذرات می شود و به پردازش فورین پروتئین prM به pr و M اجازه می دهد. پپتید pr محیطی در pH پایین به ویروس متصل می شود و ویروس را مهار می کند. تعامل غشایی پس از اگزوسیتوز، انتشار pr در pH خنثی بلوغ ویروس را به یک ذره عفونی کامل می کند. این شواهد با هم نشان می دهد که pr ممکن است از پروتئین فیوژن فلاوی ویروس E در برابر محیط pH پایین مسیر اگزوسیتی محافظت کند. در اینجا ما یک سیستم آزمایشگاهی برای بازسازی تعامل ویروس دنگی (DENV) pr با پروتئین‌های E محلول ایجاد کردیم. در pH پایین، PR نوترکیب به هر دو شکل مونومر و دایمر E متصل می شود و ورود غشاء آنها را مسدود می کند. PR اگزوژن با DENV عفونی بالغ تعامل داشت و به طور خاص از همجوشی و عفونت ویروس جلوگیری کرد. جایگزینی آلانین E H244، یک باقیمانده هیستیدین بسیار حفاظت شده در رابط pr-E، تعامل pr-E را مسدود کرد و انتشار ذرات شبه ویروس DENV را کاهش داد. تا کردن، درج غشا و trimerization از H244A جهش پروتئین E حفظ شد، و انتشار ذرات را می توان تا حدی با خنثی کردن pH پایین مسیر ترشحی نجات داد. بنابراین، pr برای خاموش کردن فعالیت همجوشی فلاوی ویروس در طول ترشح ویروس عمل می کند، و این عملکرد را می توان از فعالیت چاپرون prM جدا کرد. حفظ توالی باقی مانده‌های کلیدی درگیر در تعامل pr-E فلاوی ویروس نشان می‌دهد که این رابط پروتئین-پروتئین ممکن است یک هدف مفید برای مهارکننده‌های طیف وسیع باشد.	مطالعات In Vitro و In Vivo ویژگی‌های مهم تداخلات پروتئینی pr-E ویروس دنگی را شناسایی می‌کنند.
812uc4w7	CD200، یک گلیکوپروتئین غشایی نوع I، نقش مهمی در پیشگیری از اختلالات التهابی، رد پیوند، بیماری های خود ایمنی و از دست دادن خود به خود جنین ایفا می کند. همچنین ایمنی تومور را تنظیم می کند. یک CD200 کوتاه (CD200 (tr)) که از پیوند جایگزین به‌عنوان یک آنتاگونیست عملکردی برای CD200 تمام قد شناسایی و مشخص شده است. بنابراین، مهم است که مکانیسم(های) کنترل اتصال جایگزین CD200 را بررسی کنیم. در این مطالعه، ما یک تقویت کننده پیرایش اگزونیک (ESE) واقع در اگزون 2 را شناسایی کردیم که یک محل اتصال احتمالی برای پروتئین تنظیم کننده SF2/ASF است. حذف یا جهش سایت ESE بیان CD200 تمام قد را کاهش داد. اتصال مستقیم SF2/ASF به سایت ESE با روش تغییر حرکت الکتروفورتیک RNA (EMSA) تایید شد. کاهش بیان SF2/ASF منجر به همان الگوی پیرایشی شد که پس از حذف یا جهش ESE مشاهده شد، در حالی که بیان بیش از حد SF2/ASF بیان CD200 تمام قد را افزایش داد. مطالعات in vivo نشان داد که عفونت ویروسی الگوی پیوند جایگزین CD200 را با افزایش بیان SF2/ASF و CD200 تمام قد معکوس کرد. روی هم رفته، داده‌های ما برای اولین بار نشان می‌دهد که SF2/ASF عملکرد CD200 را با کنترل اتصال جایگزین CD200، از طریق اتصال مستقیم به ESE واقع در اگزون 2 CD200، تنظیم می‌کند.	پیوند جایگزین CD200 توسط یک تقویت کننده اتصال خارجی و SF2/ASF تنظیم می شود.
19sejitq	پس زمینه: تصور می شود که مهارکننده های نورآمینیداز در کاهش زمان کاهش علائم در بیماران سرپایی مبتلا به آنفولانزای فصلی موثر هستند. هدف از این مطالعه مقایسه اثر ویروسی کوتاه مدت ترکیب اسلتامیویر-زانامیویر در مقابل هر تک درمانی به همراه دارونما بود. روش‌ها و یافته‌ها: ما یک کارآزمایی تصادفی‌سازی شده با دارونما را با 145 پزشک عمومی در سراسر فرانسه در طول اپیدمی آنفولانزای فصلی 2008-2009 انجام دادیم. بیماران، پزشکان عمومی و ارزیاب‌های پیامد همگی نسبت به تکلیف درمان کور بودند. بیماران سرپایی بزرگسالی که بیماری شبه آنفولانزا را برای کمتر از 36 ساعت نشان می دادند و با تشخیص سریع آنفولانزا مثبت بودند، به طور تصادفی به اسلتامیویر 75 میلی گرم خوراکی دو بار در روز به همراه زانامیویر 10 میلی گرم از طریق استنشاق دو بار در روز (OZ)، اوسلتامیویر به همراه دارونما استنشاقی (O) یا زانامیویر به همراه دارونما خوراکی (Z). اثربخشی درمان از نظر ویروس شناسی با توجه به نسبت بیماران مبتلا به رونویسی معکوس آنفولانزای بینی (RT)-PCR زیر 200 نسخه معادل ژنوم (cgeq)/μl در روز 2 (نتیجه اولیه) و از نظر بالینی به زمان کاهش علائم تا روز ارزیابی شد. 14. به طور کلی 541 بیمار (از 900 بیمار برنامه ریزی شده) وارد شدند (OZ، 192 = O، 176 = n، Z، n = 173)، 49٪ مرد، میانگین سنی 39 سال. در تجزیه و تحلیل قصد درمان انجام شده در 447 بیمار مبتلا به آنفولانزای A تایید شده با RT-PCR، 46٪، 59٪ و 34٪ در OZ (n = 157)، O (n = 141)، و Z (n) = 149) بازوها دارای RT-PCR<200 cgeq/μl (-13.0٪، فاصله اطمینان 95٪ [CI] -23.1 تا -2.9، p = 0.025؛ + 12.3٪، 95٪ CI 2.39-22.2، p = 0.028 برای مقایسه OZ/O و OZ/Z). میانگین کاهش بار ویروسی در روز صفر تا روز دوم 2.14، 2.49 و 1.68 log (10) cgeq/μl بود (0.060 = p، 0.016 = p برای OZ/O و OZ/Z). زمان متوسط برای کاهش علائم 4.0، 3.0 و 4.0 روز بود (+1.0، 95% فاصله اطمینان (CI): 0.0-4.0، p = 0.018؛ +0.0، 95% فاصله اطمینان (CI): 3.0- تا 3.0، p = 0.960 برای OZ/O و OZ/ ز). چهار عارضه جانبی شدید مشاهده شد. حالت تهوع و/یا استفراغ در بازوی ترکیبی بیشتر بود (به ترتیب OZ، 13 نفر؛ O، 4 نفر؛ و Z، 5 نفر). نتیجه‌گیری: در بزرگسالان مبتلا به آنفولانزای فصلی A عمدتاً با ویروس H3N2، ترکیب اسلتامیویر-زانامیویر نسبت به تک‌تراپی اوسلتامیویر مؤثرتر به نظر می‌رسد و به طور قابل‌توجهی مؤثرتر از تک‌تراپی با زانامیویر نیست. با وجود پتانسیل نظری برای کاهش ظهور مقاومت ضد ویروسی، اثربخشی کمتر این ترکیب نیاز به احتیاط در استفاده از آن در عمل بالینی دارد. ثبت آزمایشی: www.ClinicalTrials.gov NCT00799760 لطفاً در ادامه مقاله برای خلاصه ویراستاران ببینید	اثربخشی ترکیب Oseltamivir-Zanamivir در مقایسه با هر تک درمانی برای آنفلوانزای فصلی: یک کارآزمایی تصادفی کنترل شده با دارونما
zar4py7o	نوروویروس ها (NoVs) یکی از علل اصلی گاستروانتریت حاد در سراسر جهان هستند. پروتئین NoV GII-4 VP1 در یک سیستم باکولوویروس نوترکیب با استفاده از سلول‌های حشره Sf9 بیان شد. چندین روش برای خالص سازی و غلظت ذرات ویروس مانند (VLPs) مورد ارزیابی قرار گرفت. سنجش اتصال میکروسکوپ الکترونی (EM) و آنتی ژن گروه خونی (HBGA) نشان داد که تصفیه مکرر گرادیان ساکارز به دنبال اولترافیلتراسیون منجر به VLP های دست نخورده با اتصال عالی به آنتی ژن های H نوع 3 شد. VLP ها حداقل به مدت 12 ماه در دمای 4 درجه سانتی گراد و تا 7 روز در دمای محیط پایدار بودند. این یافته‌ها نشان می‌دهد که این روش VLP‌های پایدار و باکیفیت را به همراه داشت.	مقایسه روش‌های خالص‌سازی و غلظت ذرات شبه ویروس کپسید نورویروس GII-4
tycbhz8a	هدف: آرتریت ایدیوپاتیک نوجوانان سیستمیک یک بیماری مزمن کودکان است. تظاهرات بالینی اولیه می تواند سایر شرایط التهابی کودکان را تقلید کند که اغلب منجر به تاخیر قابل توجه در تشخیص و درمان مناسب می شود. توسعه بیومارکر SJIA یک نیاز تشخیصی/پیش‌آگهی برآورده نشده برای جلوگیری از عوارض بیماری است. طراحی آزمایشی: ما پپتیدوم ادرار را برای تجزیه و تحلیل مجموعه‌ای از 102 نمونه ادرار، از بیماران مبتلا به SJIA، بیماری کاوازاکی (KD)، بیماری‌های تب (FI) و افراد سالم بررسی کردیم. مجموعه ای از 91 نمونه پلاسما، از بیماران SJIA شعله ور و ساکن، با استفاده از یک آرایه آنتی بادی سفارشی شده علیه 43 پروتئین شناخته شده در فرآیندهای التهابی و کاتابولیک پروتئین، پروفایل شدند. نتایج: ما یک پانل بیومارکر پپتید 17 ادراری را شناسایی کردیم که می‌تواند به طور موثر بیماران SJIA را در وضعیت‌های بیماری فعال، ساکن و بهبودی و بیماران مبتلا به SJIA فعال را از شرایط مخدوش‌کننده از جمله KD و FI متمایز کند. توالی یابی هدفمند این پپتیدها نشان داد که آنها در چندین خوشه محکم از هفت پروتئین مختلف قرار می گیرند که نشان دهنده فعالیت های پروتئولیتیک خاص بیماری است. پروفایل پلاسمایی آرایه آنتی بادی یک امضای شعله ور شدن پلاسما SJIA را شناسایی کرد که شامل بازدارنده بافتی متالوپروتئیناز-1 (TIMP1)، اینترلوکین (IL)-18، تنظیم شده پس از فعال شدن، بیان و ترشح سلول T طبیعی (RANTES)، P-Selectin، MMP9، و L-Selectin. نتیجه‌گیری و ارتباط بالینی: آنالیزهای پپتیدومیک و پروتئین پلاسما ادرار پتانسیل بهبود مراقبت SJIA را دارند و نشان می‌دهند که نشانگرهای زیستی پپتید ادرار SJIA ممکن است نتیجه اثرات التهاب محور بر مسیرهای کاتابولیک باشد که در مکان‌های مختلف عمل می‌کنند. مواد تکمیلی الکترونیکی: نسخه آنلاین این مقاله (doi:10.1007/s12014-010-9058-8) حاوی مطالب تکمیلی است که در دسترس کاربران مجاز است.	آنالیزهای پپتیدومیک و پروتئین هدفمند پلاسمای ادرار در تشخیص و پایش آرتریت ایدیوپاتیک سیستمیک نوجوانان
7coajgjz	حوزه‌های تشخیص کربوهیدرات (CRDs) در گیرنده‌های اتصال به گلیکان DC-SIGN (مولکول چسبندگی بین سلولی اختصاصی سلول‌های دندریتیک 1-غیر اینتگرین؛ CD209) و DC-SIGNR (گیرنده مرتبط با DC-SIGN، همچنین به عنوان L-SIGN شناخته می‌شود. و CD209L و CD299 با نام های مختلف پیش بینی شده اند از سطح غشاء توسط حوزه های گردنی گسترده حاوی تکرارهای متعدد از یک موتیف توالی 23 آمینو اسیدی تا حد زیادی حفظ شده است. کریستال‌های قطعه‌ای از حوزه گردن DC-SIGNR حاوی تکرارهای متعدد که در آن هر مولکول از طریق سلول‌های واحد چندگانه گسترش می‌یابد، به طوری که واحد نامتقارن کریستالوگرافی مشاهده‌شده نشان‌دهنده یک تکرار با میانگین شش تکرار پروتئین است. تکرارها عمدتاً α-مارپیچ هستند. بر اساس ساختار و آرایش تکرارها در کریستال، ناحیه گردن را می توان به عنوان مجموعه ای از بسته های چهار مارپیچ که توسط پیوندهای کوتاه و غیر مارپیچ متصل شده اند توصیف کرد. ترکیب ساختار ناحیه گردن جدا شده با یک ساختار همپوشانی که قبلاً تعیین شده در انتهای دیستال ناحیه گردن با CRDs متصل شده، مدلی از بخش خارج سلولی تقریباً کامل گیرنده را ارائه می دهد. نتایج با توصیف قبلی ساختار توسعه یافته برای ناحیه گردن جدا شده و حوزه خارج سلولی مطابقت دارد. سازماندهی گردن نشان می‌دهد که چگونه CRDها ممکن است در DC-SIGN در مقایسه با DC-SIGNR و در اشکال مختلف DC-SIGNR که از پلی‌پپتیدهایی با تعداد تکرارهای متفاوت در حوزه گردن جمع‌آوری شده‌اند، به طور متفاوتی دفع شوند.	ساختار مارپیچی بخش‌دار ناحیه گردن گیرنده اتصال گلیکان DC-SIGNR
zpk3gjwo	تکثیر ویروس‌های RNA رشته‌ای به فاکتورهای میزبانی که در کمپلکس‌های replicase ویروسی جذب می‌شوند، بستگی دارد. مطالعات قبلی نشان داد که فاکتور ازدیاد طول ترجمه یوکاریوتی (eEF1A) یکی از پروتئین‌های میزبان ساکن در کمپلکس replicase ویروس تومبوس بسیار خالص شده است. با استفاده از یک کتابخانه تصادفی از جهش‌یافته‌های eEF1A، یک جهش یافته را شناسایی کردیم که کاهش و سه جهش یافت که تکثیر ویروس شیرین‌کاری بوته‌ای گوجه فرنگی (TBSV) را در یک میزبان مدل مخمر افزایش داد. سنجش‌های in vitro اضافی با عصاره‌های سلول کامل تهیه‌شده از سویه‌های مخمری که جهش‌یافته‌های eEF1A را بیان می‌کنند، عملکردهای متعددی را برای eEF1A در همانندسازی TBSV نشان دادند: تسهیل جذب الگوی RNA ویروسی در کمپلکس replicase. مونتاژ مجتمع replicase ویروسی؛ و افزایش سنتز رشته منهای با ارتقاء مرحله شروع. این نقش‌ها برای eEF1A از نقش متعارف آن در ترجمه پروتئین میزبان و ویروسی جدا هستند و بر عملکردهای حیاتی این پروتئین سلولی فراوان در طول تکثیر TBSV تأکید می‌کنند.	ضریب افزایش طول ترجمه 1A مونتاژ Replicase ویروس Tombus را تسهیل می کند و سنتز منهای رشته را تحریک می کند
5z3s5pjl	پس زمینه: اندازه گیری دقیق پیچیدگی فنوتیپی موجودات زنده دشوار است. در اینجا ما روشی را برای محاسبه حداقل مقدار اطلاعات ژنومی مورد نیاز برای ساخت ارگانیسم (اطلاعات مؤثر) به عنوان معیار پیچیدگی ارگانیسم با استفاده از فرمول‌های جایگشت و ترکیب و مفهوم اطلاعات شانون پیشنهاد می‌کنیم. نتایج: نتایج نشان می‌دهد که اطلاعات محاسبه‌شده به خوبی با پیچیدگی فنوتیپی موجود زنده تعریف شده توسط طبقه‌بندی سنتی و نظریه تکاملی ارتباط دارد. از ویروس ها گرفته تا انسان ها، اطلاعات مؤثر به تدریج افزایش می یابد، از هزاران بیت به صدها میلیون بیت. هرچه ارگانیسم ساده تر باشد، اطلاعات کمتری دارد. هرچه ارگانیسم پیچیده تر باشد، اطلاعات بیشتر است. حدود 13 درصد از ژنوم انسان به عنوان اطلاعات مؤثر یا توالی عملکردی تخمین زده می شود. نتیجه‌گیری: اطلاعات مؤثر می‌تواند به‌عنوان معیار کمی پیچیدگی فنوتیپی موجودات زنده و همچنین به‌عنوان تخمینی از کسر عملکردی ژنوم مورد استفاده قرار گیرد. بازبینان: این مقاله توسط دکتر لاوانیا کانان (نامزد شده توسط دکتر آرکادی موشگیان)، دکتر چائو چن، و دکتر ED Rietman (نامزد شده توسط دکتر مارک ویدال) بررسی شده است.	محاسبه پیچیدگی اطلاعات و ارگانیسم
xf0pmog4	هدف. برای ارزیابی اینکه آیا عوامل محیطی خاص به طور موقت با شروع میوپاتی های التهابی ایدیوپاتیک نوجوانان (JIIMs) در ارتباط بین فنوتیپ ها متفاوت است یا خیر. روش ها پزشکان پرسشنامه‌های مربوط به عفونت‌های مستند، داروها، ایمن‌سازی‌ها و یک سؤال باز درباره سایر مواجهه‌های مشخص شده را ظرف 6 ماه قبل از شروع بیماری برای 285 بیمار با JIIM احتمالی یا قطعی تکمیل کردند. سوابق پزشکی 81 درصد از بیماران بررسی شد. فنوتیپ ها با معیارهای استاندارد بالینی و آزمایشگاهی تعریف شدند. نتایج 60 درصد از بیماران JIIM طی 6 ماه قبل از شروع بیماری، در معرض قرار گرفتن گزارش شده بودند. اکثر بیماران (62%) یک بار مواجهه ثبت شده، 26% دو بار و 12% سه تا پنج تماس داشتند. بیماران مسن تر از سن متوسط در هنگام تشخیص، آنهایی که تاخیر بیشتری در تشخیص داشتند و آنهایی که دارای اتوآنتی بادی ذرات تشخیص ضد سیگنال بودند، فرکانس بالاتری از مواجهه مستند داشتند [نسبت شانس (ORs) 95% فاصله اطمینان (CI 3.4, 31]). عفونت ها شایع ترین مواجهه بودند و 44 درصد از تعداد کل مواجهه های گزارش شده را تشکیل می دادند. قرار گرفتن در معرض غیر عفونی شامل داروها (18٪)، ایمن سازی (11٪)، رویدادهای استرس زا زندگی (11٪) و قرار گرفتن در معرض خورشید غیر معمول (7٪) بود. قرار گرفتن در معرض در زمان تشخیص، نژاد، دوره بیماری و وجود آنتی بادی های خاص میوزیت متفاوت بود. نتیجه گیری JIIM ها ممکن است به قرار گرفتن در معرض چندگانه مرتبط باشند و به نظر می رسد که اینها در بین فنوتیپ ها متفاوت است.	عوامل محیطی قبل از شروع بیماری در فنوتیپ های میوپاتی التهابی ایدیوپاتیک نوجوانان متفاوت است.
2zhaknbi	ویروس سنسیشیال تنفسی انسانی (HRSV) یکی از علل اصلی بیماری دستگاه تنفسی تحتانی کودکان است که هیچ واکسن یا استراتژی شیمی درمانی موثری برای آن وجود ندارد. اگرچه سنتز RNA و مونتاژ ویروس در سیتوپلاسم رخ می دهد، HRSV به عنوان القای پاسخ های هسته ای در سلول میزبان شناخته شده است زیرا همانندسازی بیان ژن جهانی را تغییر می دهد. پروتئومیکس کمی برای بررسی بی‌طرفانه تغییرات پروتئین در سلول‌های اپیتلیال پایه آلوئولی انسان آلوده به HRSV استفاده شد. زیربنای آن استفاده از برچسب گذاری ایزوتوپ پایدار با اسیدهای آمینه در کشت سلولی همراه با LC-MS/MS بود که امکان شناسایی و تعیین کمیت پروتئین های سلولی و ویروسی را به طور مستقیم و همزمان فراهم می کرد. برای کاهش پیچیدگی نمونه و افزایش بازگشت داده ها در مورد محلی سازی پروتئین بالقوه، سلول ها به عصاره های هسته ای و سیتوپلاسمی تقسیم شدند. این منجر به شناسایی 1140 پروتئین سلولی و شش پروتئین ویروسی شد. داده‌های پروتئومیکس با استفاده از تجزیه و تحلیل مسیرهای هوشمندی برای شناسایی مسیرهای متعارف تعریف شده و گروه‌بندی‌های عملکردی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. داده‌های انتخاب‌شده با استفاده از وسترن بلات، میکروسکوپ کانفوکال ایمونوفلورسانس مستقیم و غیرمستقیم و سنجش‌های عملکردی تأیید شدند. این مطالعه برای تایید و گسترش برهمکنش های شناخته شده HRSV-سلول میزبان، از جمله آنهایی که با پاسخ ضد ویروسی و تغییرات در ساختارهای زیر هسته ای مانند هسته و ND10 (جسم های لوسمی پرومیلوسیتیک) مرتبط هستند، انجام شد. علاوه بر این، تغییرات جدیدی در پروتئین‌ها و عملکردهای میتوکندری، مولکول‌های تنظیم‌کننده چرخه سلولی، پروتئین‌های پیچیده منافذ هسته‌ای و پروتئین‌های قاچاق نوکلئوسیتوپلاسمی مشاهده شد. این داده‌ها چگونگی تغییر سلول را برای ایجاد شرایط مساعدتر برای عفونت نشان می‌دهند. علاوه بر این، این مطالعه کاربرد و مزیت برچسب‌گذاری ایزوتوپ پایدار با اسیدهای آمینه در کشت سلولی همراه با LC-MS/MS را برای تجزیه و تحلیل فعل و انفعالات ویروس-میزبان نشان می‌دهد.	تجزیه و تحلیل کمی پروتئومی سلول های A549 آلوده به ویروس سنسیتیال تنفسی انسانی
pdjsy9a0	اگرچه واکسن ها بهترین ابزار برای جلوگیری از عفونت آنفولانزا هستند، انتخاب سویه و اجرای بهینه به دلیل رانش آنتی ژنی و عدم درک گسترش جهانی دشوار است. تشخیص حرکت ویروسی با تجزیه و تحلیل توالی با توزیع های جغرافیایی و فصلی منحرف در جدایه های ویروسی پیچیده است. ما یک روش احتمالی را پیشنهاد می‌کنیم که سوگیری نمونه‌گیری را از طریق خوشه‌بندی مکانی-زمانی و مدل‌سازی انتقال منطقه‌ای و فصلی به‌عنوان یک فرآیند دوجمله‌ای محاسبه می‌کند. تجزیه و تحلیل H3N2 نه تنها آسیای شرقی-جنوب شرقی را به عنوان منبع انواع فصلی جدید تأیید کرد، بلکه وضوح انتقال مشاهده شده را به سطح کشور افزایش داد. داده های H1N1 انتشار ویروسی مشابهی را از مناطق استوایی نشان داد. تجزیه و تحلیل شبکه چین و هنگ کنگ را به عنوان منشاء سویه های فصلی جدید H3N2 و ایالات متحده را به عنوان منطقه ای که در آن افزایش واکسیناسیون می تواند گسترش جهانی ویروس را مختل کند، نشان داد. این تکنیک ها یک روش امیدوارکننده برای تجزیه و تحلیل هر ویروس فصلی و همچنین برای نظارت مداوم آنفولانزا ارائه می دهد.	تجزیه و تحلیل شبکه ای از گسترش جهانی آنفلوانزا
zyaj90nh	سابقه و هدف: همه‌گیری عفونت آنفولانزای A (H1N1) در سال 2009 بسیاری از دولت‌ها را برای ایجاد برنامه آمادگی برای کنترل شیوع عفونت آنفلوانزای A (H1N1) آگاه کرده است. واکسیناسیون آنفولانزا یکی از مهمترین اقدامات پیشگیرانه اولیه برای کاهش بار بیماری است. هدف مطالعه ما ارزیابی تمایل پرستارانی است که برای خدمات پرستاری جامعه (CNS) در هنگ کنگ در مورد پذیرش واکسیناسیون آنفولانزای A (H1N1) کار می‌کنند. روش‌ها: 401 پرسشنامه از 24 ژوئن 2009 تا 30 ژوئن 2009 برای پرستاران جامعه با 67 درصد میزان پاسخ ارسال شد. نتایج 267 پاسخ دهنده در مورد تمایل آنها به پذیرش واکسن آنفولانزای A (H1N1) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج: بیست و هفت درصد از پاسخ دهندگان مایل به پذیرش واکسن آنفولانزا در صورت وجود واکسن بودند. واکسینه شدن برای آنفولانزای فصلی در 12 ماه گذشته به طور قابل توجهی به طور مستقل با تمایل آنها به پذیرش واکسیناسیون آنفولانزای A (H1N1) مرتبط بود (OR = 4.03؛ 95% فاصله اطمینان: 2.03-7.98). نتیجه‌گیری: مشابه یافته‌های قبلی انجام‌شده در پرستاران و کارکنان مراقبت‌های بهداشتی بیمارستانی، ما تأیید کردیم که تمایل پرستاران جامعه به پذیرش واکسیناسیون آنفولانزای A (H1N1) کم است. مطالعات آتی که مداخلاتی را برای رسیدگی به نگرانی‌های خاص پرستاران یا مداخلاتی با هدف افزایش آگاهی پرستاران در مورد اهمیت واکسیناسیون آنفولانزای A (H1N1) برای محافظت از جمعیت‌های آسیب‌پذیر بیماران مورد ارزیابی قرار می‌دهند.	تمایل به پذیرش واکسن آنفلوانزای همه گیر H1N1: مطالعه مقطعی پرستاران جامعه هنگ کنگ
dcjwfes7	نوروویروس موشی (MNV) که در سال 2003 شناسایی شد، تنها نورویروسی است که به طور موثر در کشت بافت تکثیر می شود و در نتیجه به طور گسترده به عنوان مدلی برای نوروویروس های انسانی، عامل اصلی گاستروانتریت حاد، استفاده شده است. گزارش حاضر، تولید یک رویکرد جدید برای بازیابی ژنتیکی معکوس MNV تعریف شده ژنتیکی را توصیف می‌کند که بر انتقال RNA سرپوش‌دار رونویسی شده در شرایط آزمایشگاهی مستقیماً به سلول‌ها متکی است. استفاده از سیستم درپوش آنزیمی پس از رونویسی ScriptCap که اخیراً توسعه یافته است، و به دنبال آن الکتروپوراسیون بهینه شده با واسطه نئون سلول های RAW 264.7 بسیار مجاز، منجر به بازیابی سریع و قوی MNV عفونی شد. انتقال سلول‌هایی که قادر به پشتیبانی از تکثیر ویروس هستند اما برای عفونت ویروسی مجاز نیستند، یعنی سلول‌های کلیه انسان یا همستر، همچنین منجر به بازیابی قوی ویروس عفونی بدون تقویت بعدی توسط چندین دور عفونت مجدد شد. این سیستم اخیر ممکن است یک روش تکرارپذیر برای اندازه‌گیری عفونت‌زایی خاص RNA نوروویروس جهش یافته ارائه دهد که امکان تعیین کمیت دقیق اثر جهش‌ها بر تکثیر نوروویروس را فراهم می‌کند.	توسعه یک سیستم ژنتیک معکوس نورویروس موشی مبتنی بر RNA
phepjf55	سابقه و هدف: مدیریت بیماری‌های عفونی نوظهور مانند آنفلوانزای 2009 همه‌گیر A (H1N1) به دلیل اطلاعات محدود در مورد تاریخچه طبیعی بیماری و اپیدمیولوژی، تغییرات تصادفی در سیر اپیدمی‌ها و تغییر، چالش‌های بزرگی را برای مدل‌سازی ریاضی بلادرنگ انتقال بیماری ایجاد می‌کند. تعاریف مورد و شیوه های نظارت یافته ها: مدل ریچاردز و انواع آن برای تناسب منحنی اپیدمی تجمعی برای عفونت های همه گیر H1N1 (pH1N1) آزمایشگاهی تایید شده در کانادا، که توسط آژانس بهداشت عمومی کانادا (PHAC) در دسترس قرار گرفته است، استفاده می شود. این مدل برای به دست آوردن تخمین‌هایی برای نقاط عطف در شیوع اولیه، تعداد پایه تولید مثل (R(0)) و برای اندازه شیوع نهایی مورد انتظار در غیاب مداخلات استفاده می‌شود. داده های مورد تایید شده برای ساخت یک مدل 2 فازی مناسب با سه نقطه عطف استفاده شد. R(0) 1.30 (95% فاصله اطمینان (CI): 1.12-1.47) برای فاز اول (1 آوریل تا 4 می) و 1.35 (95% فاصله اطمینان (CI): 1.16-1.54) برای فاز دوم (4 مه تا 19 ژوئن) برآورد شد. داده‌های بستری شدن در بیمارستان نیز برای برازش یک مدل 1 فازی با R(0)= 1.35 (1.20-1.49) و یک نقطه عطف منفرد در 11 ژوئن استفاده شد. نتیجه‌گیری: استفاده از مدل ریچاردز برای داده‌های pH1N1 کانادا نشان می‌دهد که تشخیص نقاط عطف تحت تأثیر کیفیت داده های موجود در زمان استفاده از داده است. با استفاده از مدل ریچاردز، برآوردهای قوی از R(0) تقریباً یک ماه پس از شیوع اولیه در مورد 2009 A (H1N1) در کانادا به دست آمد.	در مورد مدل‌سازی اپیدمی در زمان واقعی: یک برنامه کاربردی برای شیوع آنفلوانزای جدید A (H1N1) در سال 2009 در کانادا
7s6283y5	سابقه و هدف: آنسفالیت ژاپنی (JE)، ناشی از یک فلاوی ویروس منتقله از پشه، در کل آسیای جنوب شرقی و مناطق مجاور آن بومی است. در حال حاضر هیچ مداخله درمانی برای JE در دسترس نیست، در نتیجه آن را به یکی از مخوف ترین آنسفالیتیدها در جهان تبدیل می کند. یک راه موثر برای مقابله با ویروس، مهار تکثیر ویروس با استفاده از مولکول‌های ضد حسی است که علیه ژنوم ویروسی هدایت می‌شوند. مورفولینو کونژوگه با دندریمر Octaguanidinium (یا Vivo-Morpholino) الیگومرهای ضد حسی بدون بار هستند که می توانند با اندوسیتوز وارد سلول های موجودات زنده شوند و متعاقباً از اندوزوم ها به داخل سیتوزول/ محفظه هسته ای سلول ها فرار کنند. ما فرض می کنیم که Vivo-Morpholinos تولید شده در برابر مناطق خاصی از 3 یا 5' مناطق ترجمه نشده ژنوم JEV، زمانی که در یک مدل تجربی از JE تجویز می شود، اثر ضد ویروسی و محافظت عصبی قابل توجهی خواهد داشت. روش‌شناسی/یافته‌های اصلی: موش‌ها با JEV (سویه GP78) و به دنبال آن تجویز داخل صفاقی Morpholinos (5 میلی‌گرم به ازای هر کیلوگرم وزن بدن) روزانه برای حداکثر پنج درمان آلوده شدند. بقای حیوانات به مدت 15 روز (یا تا زمان مرگ) تحت نظر قرار گرفت و پس از آن آنها قربانی شدند و مغز آنها برای رنگ آمیزی ایمونوهیستوشیمی یا استخراج پروتئین پردازش شد. سنجش پلاک و تجزیه و تحلیل ایمونوبلات انجام شده از هموژنه های مغزی، کاهش بار ویروسی و بیان پروتئین ویروسی را نشان داد که منجر به بقای بیشتر حیوانات آلوده شد. اثر محافظتی عصبی با رنگ آمیزی تیونین مقاطع مغزی مشاهده شد. آرایه مهره‌های سیتوکین کاهش سطح سیتوکین‌های پیش التهابی در مغز را به دنبال درمان مورفولینو نشان داد که پس از عفونت افزایش یافت. این به کاهش فعال سازی میکروگلیال در مغز مربوط می شود. استرس اکسیداتیو کاهش یافت و مشخص شد که مولکول‌های سیگنال دهی مرتبط با استرس به طور مثبت پس از درمان Morpholino تعدیل می‌شوند. مطالعات آزمایشگاهی نیز نشان داد که تولید ذرات ویروسی عفونی به دنبال درمان مورفولینو کاهش یافت. Conclusions/Significance Administration Vivo-Morpholino به طور موثر در افزایش بقای حیوانات و محافظت عصبی در یک مدل موش JE منجر شد. از این رو، این الیگومرها یک عامل ضد ویروسی بالقوه را نشان می دهند که ارزش ارزیابی بیشتر را دارد.	نقش ضد ویروسی و محافظتی عصبی الیگومرهای مورفولینو دندریمر کونژوگه اکتاگوانیدینیم در انسفالیت ژاپنی
00rk8fb5	سابقه و هدف: تاریخچه طبیعی و پیامدهای عفونت شدید آنفلوانزای H1N1 در بیماران سرطانی هنوز به طور کامل مشخص نشده است. ما هشت مورد عفونت H1N1 را در بیماران سرطانی بستری در بخش مراقبت‌های ویژه یک مرکز سرطان ارجاع شرح می‌دهیم. بیماران و روش‌ها: داده‌های بالینی از همه بیماران بستری با نارسایی حاد تنفسی به دلیل عفونت ویروسی جدید H1N1 بررسی شد. بافت ریه برای آنالیزهای ویروسی و باکتریولوژیکی توسط RT-PCR بلادرنگ ارسال شد و کالبد شکافی روی همه بیماران فوت شده انجام شد. یافته‌ها: هشت بیمار در محدوده سنی 55 تا 65 سال بستری شدند. پنج بیمار با تومورهای اندام جامد (5/62 درصد) و سه بیمار با بدخیمی های خونی (5/37 درصد) بودند. پنج بیمار نیاز به تهویه مکانیکی داشتند و همه فوت کردند. چهار بیمار برونکوپنومونی باکتریایی داشتند. همه مرگ‌ها به دلیل نارسایی چند عضوی رخ داده است. نوع خفیف تری از بیماری ریوی در سه موردی که زنده مانده بودند وجود داشت. آنالیز بافت ریه در همه بیماران انجام شد و در اکثر بیماران آسیب آلوئولی منتشر شد. سایر یافته های ریوی، برونشیولیت نکروزان یا خونریزی گسترده بود. نتیجه گیری: عفونت ویروسی H1N1 در بیماران مبتلا به سرطان می تواند باعث بیماری شدید و در نتیجه سندرم دیسترس تنفسی حاد و مرگ شود. برای شناسایی عوامل پیش بینی کننده تکامل نامطلوب در این بیماران به داده های بیشتری نیاز است.	عفونت شدید آنفلوانزای جدید A (H1N1) در بیماران سرطانی
7p3b6tyf	زمینه و هدف: میزان حمله آسم به دنبال عفونت های ویروسی دستگاه تنفسی تحتانی (LRTI) حدود 3 تا 4 برابر بیشتر از جمعیت عمومی است. با این حال، اکثر کودکانی که در دوران نوزادی به LRTI ویروسی مبتلا می شوند، به آسم مبتلا نمی شوند و مشاهده شده است که بروز آسم به طور مداوم با افزایش سن کاهش می یابد. بنابراین، ما نمی‌دانیم که LRTI ویروسی چگونه مستعد ابتلا به آسم در کودکان است یا به‌عنوان نشانگر آن عمل می‌کند. ابتکار تنفسی کودکان تنسی به عنوان یک بررسی آینده نگر طولی در مورد نوزادان و مادران بیولوژیکی آنها ایجاد شده است. اهداف اولیه، بررسی پیامدهای سلامتی حاد و درازمدت ناشی از شدت و اتیولوژی متفاوت عفونت‌های دستگاه تنفسی ویروسی از نظر بالینی در پیامدهای اولیه دوران کودکی است. روش‌ها: در طی چهار فصل ویروسی تنفسی، 2004-2008، نوزادان ترم و بدون وزن تولدی که قبلاً سالم بودند و مادران بیولوژیکی آنها در طول بیماری حاد تنفسی ویروسی نوزاد ثبت‌نام شدند. پیگیری طولی تا سن 6 سالگی ادامه دارد. یافته ها: این گزارش اهداف مطالعه، طراحی و نتایج استخدام بیش از 650 خانواده ثبت نام شده در این بررسی طولی را تشریح می کند. ابتکار تنفسی کودکان تنسی علاوه بر این منحصر به فرد است زیرا به موازات یک گروه تولد گذشته نگر بزرگ از بیش از 95000 زوج مادر-شیرخوار با اهداف مشابه برای بررسی نقش شدت عفونت ویروسی تنفسی و علت شناسی در ایجاد آسم طراحی شده است. نتیجه‌گیری: گزارش‌های آتی از این گروه به روشن شدن رابطه پیچیده بین شدت عفونت ویروسی تنفسی نوزاد، علت شناسی، استعداد آتوپیک و توسعه متعاقب آسم اولیه کودکی و بیماری‌های آتوپیک کمک خواهد کرد.	ابتکار تنفسی کودکان تنسی: اهداف، طراحی و نتایج استخدام یک مطالعه کوهورت آینده‌نگر برای بررسی بیماری‌های تنفسی ویروسی نوزادان و ایجاد آسم و بیماری‌های آلرژیک
3njrml7x	مقدمه: پنومونی لژیونلا می تواند با سطوح مختلف شدت ظاهر شود و اغلب می تواند با عوارضی مانند سندرم زجر تنفسی حاد تظاهر کند. ارائه مورد: ما مورد یک مرد 44 ساله قفقازی مبتلا به پنومونی لژیونلا را با ایجاد متوالی سندرم دیسترس تنفسی حاد گزارش می کنیم. در طول اقامت وی در مراقبت های ویژه، وضعیت بالینی و رادیولوژیک سندرم دیسترس تنفسی حاد مشاهده شده قبلی به طور غیر منتظره به دلیل ارتشاح ائوزینوفیلیک ریوی حاد با منشاء ایتروژنیک بدتر شد. نتیجه گیری: درمان با لووفلوکساسین باعث بروز انفیلترات ائوزینوفیلیک حاد شد. تشخیص برونکوسکوپی با استفاده از برونکواسپیرات و بیوپسی ترانس برونش امکان پذیر بود.	انفیلترات ائوزینوفیلیک در بیمار مبتلا به پنومونی شدید لژیونلا به عنوان یک عارضه مرتبط با لووفلوکساسین: گزارش یک مورد
8crvjzz4	رتروویروس سیمیان نوع 1 از جابجایی فریم ریبوزومی برنامه ریزی شده برای کنترل بیان پلی پروتئین Gag-Pol از همپوشانی gag و pol فریم های خواندن باز استفاده می کند. سیگنال تغییر قاب از یک توالی لغزنده هپتانوکلئوتیدی و یک گره کاذب 12 جفت پایه در پایین دست تشکیل شده است. ساختار حل این شبه گره، که قبلا توسط NMR [Michiels, P.J., Versleijen, A.A., Verlaan, P.W., Pleij, C.W., Hilbers, C.W. و هیوس، اچ. (2001) ساختار حل گره کاذب RNA SRV-1، درگیر در تغییر قاب ریبوزومی. جی. مول. Biol., 310, 1109-1123] دارای یک چین کلاسیک نوع H است و یک مارپیچ سه گانه گسترده را با برهمکنش بین حلقه 2 و شیار کوچک ساقه 1 که شامل تماس های پایه-پایه و پایه-قند است تشکیل می دهد. تجزیه و تحلیل جهشی برای آزمایش اهمیت عملکردی مارپیچ سه‌گانه برای تغییر فریم -1 در شرایط آزمایشگاهی انجام شد. تغییر پایه‌ها در L2 یا جفت‌های پایه در S1 درگیر در یک پایه سه‌گانه منجر به کاهش 2 تا 5 برابری در راندمان تغییر قاب شد. تغییرات در طول L2 اثرات نامطلوبی بر تغییر قاب داشت. اثرات in vitro به خوبی در داخل بدن تکثیر شدند، اگرچه اثر بزرگ‌کردن L2 در داخل بدن چشمگیرتر بود. نقش احتمالی سینتیک تاکردن مجدد گره های کاذب فریمشیفتر مورد بحث قرار گرفته است. به طور کلی، داده ها بر نقش مارپیچ سه گانه در تغییر فریم 1- تأکید دارند.	تجزیه و تحلیل عملکردی گره کاذب تغییر قاب RNA SRV-1
61qdmy15	اگرچه ریبوزوم عمدتاً از rRNA تشکیل شده است و بسیاری از عملکردهای حیاتی آن از طریق فعل و انفعالات RNA-RNA رخ می دهد، حوزه های متمایز پروتئین های ریبوزوم نیز در تغییر ریبوزوم بین حالت های ساختاری/عملکردی مختلف شرکت می کنند. مطالعات قبلی نشان داد که دو دامنه گسترده از پروتئین ریبوزومی L3 یک سوئیچ آلوستریک بین حالت های قبل و بعد از جابجایی تشکیل می دهند. Missing توضیحی برای نحوه ارتباط حرکات این حوزه ها در میان مراکز عملکردی ریبوزوم بود. در اینجا، دامنه سوم L3 به نام شست پایه، که تقریباً عمود بر انگشت W بیرون زده است و در مرکز یک ساختار قفسه مانند که توسط عناصری از سه حوزه مجزا از زیر واحد بزرگ rRNA تشکیل شده است، بررسی می‌شود. جهش‌زایی اسیدهای آمینه باردار پایه به آلانین‌ها و به دنبال آنالیزهای دقیق نشان می‌دهد که به عنوان یک گیره مولکولی عمل می‌کند و نقشی در برقراری ارتباط آلوستریک وضعیت اشغال tRNA ریبوزوم به ناحیه اتصال فاکتور ازدیاد طول و مرکز پپتیدیل ترانسفراز ایفا می‌کند و هماهنگی را تسهیل می‌کند. عملکرد آنها در طول چرخه افزایش طول. مشاهده اینکه این جهش‌ها بر وفاداری ترجمه، انتشار ویروس و رشد سلولی تأثیر می‌گذارند، نشان می‌دهد که چگونه تغییرات ساختاری کوچک در مقیاس اتمی می‌تواند به بیرون منتشر شود و به طور گسترده بر زیست‌شناسی سلول تأثیر بگذارد.	یک گیره مولکولی هماهنگی آلوستریک انتقال پپتیدیل و اتصال لیگاند به محل A ریبوزومی را تضمین می کند.
c8yzoen7	یکی از مشکلات اصلی در تکنیک های مبتنی بر اسید نوکلئیک برای تشخیص عوامل عفونی، مانند ویروس های آنفولانزا، تغییر توالی اسید نوکلئیک است. کاوشگرهای DNA به طول 70 nt، برخی از آنها از جمله نوکلئوتید آنالوگ دئوکسی ریبوز-اینوزین (dInosine)، برای تحمل هیبریداسیون به مقادیر مختلف و توزیع بازهای نامتناسب، به عنوان مثال، تجزیه و تحلیل شدند. جهش های مترادف در DNA هدف کاوشگرهای 70 mer مرتبط با میکروسفر در بافر TMAC 3M برای تجزیه و تحلیل بعدی در یک سیستم Luminex® به DNA تک رشته‌ای (ss) بیوتینیله هیبرید شدند. هنگامی که عدم تطابق، کشش های تطبیق پیوسته 6 nt یا بیشتر را قطع کرد، تأثیر زیادی بر هیبریداسیون داشت. کشش‌های تطبیق پیوسته مهم‌تر از تعداد مشابه نوکلئوتیدهای منطبق هستند که با عدم تطابق در چندین منطقه جدا شده‌اند. dInosine، اما نه 5-nitroindole، تعویض‌ها در موقعیت‌های ناهماهنگ، هیبریداسیون را به‌طور قابل‌توجهی به خوبی تثبیت کردند، که با نوسانات N (4 برابری) در موقعیت‌های مشابه قابل مقایسه بود. برخلاف پروب‌های کوتاه‌تر، پروب‌های 70 nt با جایگزین‌های dInosine و/یا موقعیت‌های تاب خورده به طور قابل ملاحظه‌ای تحمل عدم تطابق داشتند، با ویژگی حفظ شده. یک الگوریتم، NucZip، برای مدل‌سازی فازهای هسته‌زایی و زیپی هیبریداسیون ساخته شد، که مشارکت‌های اتصال محلی و دوردست را ادغام می‌کند. این هیبریداسیون را دقیق‌تر از الگوریتم‌های قبلی پیش‌بینی می‌کرد، و پتانسیل هدایت طراحی پروب‌های مقاوم به تغییرات و در عین حال خاص را دارد.	خواص هیبریداسیون پروب های اسید نوکلئیک بلند برای تشخیص توالی های هدف متغیر و توسعه یک الگوریتم پیش بینی هیبریداسیون
crjwej14	ما تأثیر مهاجرت بین جمعیت‌های جفت شده یا تکه‌ها را بر روی ویژگی‌های پایداری پویایی بیماری چند سویه مطالعه می‌کنیم. مدل اپیدمی مورد استفاده در این کار یک انشعاب Hopf را به نوسانات در یک جمعیت منفرد و کاملاً مخلوط نشان می دهد. به صورت عددی نشان داده شده است که مهاجرت بین دو تکه غیر یکسان حالت پایدار بومی را تثبیت می‌کند، شروع شیوع دامنه وسیع را به تأخیر می‌اندازد و تعداد کل عفونت‌ها را کاهش می‌دهد. این نتیجه با تجزیه و تحلیل انشعاب های Hopf عمومی با فرکانس های مختلف و با جفت انتشار بین آنها ایجاد شده است. تثبیت حالت پایدار دوباره دیده می‌شود، که نشان می‌دهد مشاهدات ما در مدل چند سویه کامل بر اساس ویژگی‌های کیفی دینامیک است تا جزئیات مدل بیماری.	عدم تقارن در حضور مهاجرت، شیوع بیماری چندسویه را تثبیت می کند
zm6a9brd	هدف: سازمان بهداشت جهانی گزارش هایی از 478 مورد تایید شده آزمایشگاهی آنفولانزای A (H5N1) از 15 کشور بین نوامبر 2003 تا فوریه 2010 دریافت کرد. بیش از 50 درصد از این موارد مربوط به بیماران کمتر از 20 سال بود. تعیین ارتباط بین عوامل بالینی در زمان بستری در بیمارستان و پیش آگهی ممکن است برای مشاوره و درمان به موقع و کافی مفید باشد. به‌دست آوردن این عوامل بالینی که با سایر عوامل مخدوش‌کننده مانند سن و جنس تنظیم می‌شوند، دشوار بوده است، زیرا مطالعات منتشر شده در مورد عفونت ویروس H5N1 معمولاً تنها چند مورد را گزارش می‌کنند. بنابراین، ما یک تجزیه و تحلیل تلفیقی از موارد گزارش شده انجام دادیم. روش‌ها: پنج گزارش موردی (36 بیمار کمتر از 18 سال) عفونت H5N1 از چهار کشور که بین سال‌های 2004 و 2009 منتشر شد، بر اساس داده‌های بالینی فردی موجود ارزیابی شد. با استفاده از داده های تلفیقی برای همه بیماران، ما ارتباط بین پیش آگهی بیماران و یافته های آزمایشگاهی موجود، مانند تعداد گلبول های سفید (WBC)، تعداد پلاکت ها (PLT) و سطوح سرمی آسپارتات آمینوترانسفراز (AST) و آلانین آمینوترانسفراز را بررسی کردیم. ALT) با تنظیم سن و/یا جنس. ResultsThe تجزیه و تحلیل رگرسیون خطی نشان داد که مرگ و میر با تعداد WBC و PLT تنظیم شده با سن و جنس رابطه منفی دارد. افزایش log AST تمایل داشت با پیش آگهی ضعیف همراه باشد (0.054 = p)، اما ارتباط معنی داری بین بقا و سطح log ALT وجود نداشت. نتیجه‌گیری: کاهش تعداد WBC و PLT می‌تواند پیش‌بینی‌کننده‌های رایج پیش‌آگهی ضعیف در بیماران آنفولانزای H5N1 کمتر از 18 سال باشد. مطالعات بیشتری برای روشن شدن نیاز است.	عوامل بالینی مرتبط با شدت در کودکان بستری شده در بیمارستان مبتلا به آنفولانزای پرندگان (H5N1)
yci0a6bt	مالاریا پلاسمودیوم فالسیپاروم مرتبط با بارداری (PAM) یکی از علل اصلی عوارض و مرگ و میر در زنان آفریقایی و فرزندان آنها است. PAM با تجمع گلبول های قرمز آلوده (IEs) که به کندرویتین سولفات A (CSA) در فضای بین پرزهای جفت می چسبند مشخص می شود. ما در اینجا نشان می‌دهیم که آنتی‌بادی‌های مونوکلونال IgG انسانی با ویژگی آنتی ژن‌های سطحی مختلف (VSA) که به‌طور خاص توسط IEهای چسبنده به CSA (VSA(PAM)) بیان می‌شوند، می‌توانند در شرایط آزمایشگاهی برای انتخاب انگل‌ها از اهداکنندگان غیرباردار برای بیان VSA (PAM) استفاده شوند و این انتخاب برای بیان VSA (PAM) منجر به رونویسی ترجیحی var2csa می شود. نتایج تلاش‌های فعلی برای توسعه واکسن‌های اختصاصی PAM بر اساس VAR2CSA را تأیید می‌کند.	انتخاب IgG مونوکلونال انسانی پلاسمودیوم فالسیپاروم برای بیان آنتی ژن های سطحی نوع مالاریا ویژه جفت
pc4x5e24	تغییر چارچوب ریبوزومی برنامه ریزی شده یک مکانیسم رمزگذاری مجدد ترجمه ای است که معمولاً توسط ویروس های RNA برای بیان دو یا چند پروتئین از یک mRNA واحد با نسبت ثابت استفاده می شود. یک عنصر ضروری در این فرآیند، وجود یک ساختار ثانویه RNA، مانند گره کاذب یا سنجاق سر است که در پایین دست توالی لغزنده قرار دارد. در اینجا، ما کارایی الیگونوکلئوتیدهای RNA را که در پایین دست توالی لغزنده بازپخت می‌شوند، برای القای تغییر چارچوب در شرایط آزمایشگاهی آزمایش کرده‌ایم. حداکثر تغییر قاب با الیگونوکلئوتیدهای 12-18 NT مشاهده شد. الیگونوکلئوتیدهای آنتی سنس دارای تغییرات اسید نوکلئید قفل شده (LNA) نیز ثابت کردند که در مقایسه با اولیگونوکلئوتیدهای DNA، محرک‌های تغییر چارچوب کارآمد هستند. تعداد، توالی و محل بازهای LNA در یک الیگونوکلئوتید DNA در غیر این صورت باید به دقت دستکاری شود تا سطوح بهینه تغییر قاب به دست آید. داده‌های ما به نفع مدلی هستند که در آن پایداری RNA در ورودی تونل ریبوزومی، به‌جای ساختار سه‌بعدی خاص عنصر RNA تحریک‌کننده، تعیین‌کننده اصلی تحریک لغزش است.	تحریک تغییر قاب ریبوزومی توسط LNA آنتی سنس
2g471tb4	ساختارهای با وضوح بالا نشان می‌دهند که پروتئین ریبوزومی مخمر L11 و همولوگ‌های باکتریایی/آرکائل آن به نام L5 حاوی یک حلقه داخلی کاملاً حفاظت‌شده و اساساً باردار هستند که با حلقه T انتقال‌دهنده پپتیدیل (tRNA) تعامل دارد. ما این را L11 حلقه P-site می نامیم. حفاظت شیمیایی ریبوزوم نوع وحشی نشان می‌دهد که حلقه P-site ذاتاً انعطاف‌پذیر است، یعنی زمانی که توسط tRNA اشغال نشده باشد، به سمت مکان P ریبوزومی گسترش می‌یابد، در حالی که زمانی که به حلقه پایانی 25S rRNA Helix 84 کشیده می‌شود. سایت P اشغال شده است. برای تجزیه و تحلیل بیشتر عملکرد این ساختار، یک سری جهش در حلقه P-site ایجاد و تجزیه و تحلیل شد. جهش‌یافته‌ای که از تعامل حلقه P-site با حلقه پایانی Helix 84 حمایت می‌کند، میل ترکیبی را برای peptidyl-tRNA افزایش می‌دهد، در حالی که دیگری که از گسترش آن در سایت P ریبوزومی حمایت می‌کند، اثر معکوس داشت. دو جهش یافته همچنین اثرات متضادی بر اتصال aa-tRNA به سایت A ریبوزومی داشتند، و اثرات عملکردی پایین دست بر وفاداری ترجمه، مقاومت دارویی/حساسیت بیش از حد، نگهداری ویروس و رشد کلی سلول مشاهده شد. این تجزیه و تحلیل نشان می دهد که حلقه L11 P-site به طور معمول به بهینه سازی عملکرد ریبوزوم با نظارت بر وضعیت اشغال سایت P ریبوزومی کمک می کند.	یک حلقه انعطاف‌پذیر در پروتئین ریبوزومی مخمر L11 اتصال tRNA P-site را هماهنگ می‌کند
ft5wl70x	تا به امروز، حداقل 900 ژن microRNA (miRNA) مختلف در ژنوم انسان کشف شده است. این مولکول‌های کوتاه و تک رشته‌ای RNA از مولکول‌های پیش‌ساز بزرگ‌تری سرچشمه می‌گیرند که برای تولید ساختارهای سنجاق سر تا می‌شوند، که متعاقباً توسط ریبونوکلئازهای Drosha/Pasha و Dicer پردازش می‌شوند تا miRNA‌های بالغ را تشکیل دهند. MiRNA ها در تنظیم پس رونویسی حدود یک سوم ژن های انسانی، عمدتاً از طریق تخریب mRNA های هدف، نقش دارند. در حالی که mRNA های هدف اغلب در تنظیم فرآیندهای فیزیولوژیکی متنوع از زمان رشد تا آپوپتوز نقش دارند، miRNA ها دارای پتانسیل قوی برای تنظیم فرآیندهای بیولوژیکی اساسی در محفظه ریه هستند. با این حال، دانش نقش miRNA ها در شرایط فیزیولوژیکی و پاتولوژیک در ریه هنوز محدود است. بنابراین، این بررسی، دانش فعلی مکانیسم، عملکرد miRNA ها و سهم آنها در رشد ریه و هموستاز را خلاصه می کند. علاوه بر دخالت miRNA ها در شرایط فیزیولوژیکی ریوی، شواهدی وجود دارد که بیان غیر طبیعی miRNA ممکن است منجر به فرآیندهای پاتولوژیک و ایجاد بیماری های مختلف ریوی شود. در مرحله بعد، این بررسی به توصیف وضعیت فعلی پروفایل‌های بیان miRNA در بیماری‌های مرتبط با سیگار از جمله سرطان‌زایی ریه، بیماری‌های ریوی ناشی از سیستم ایمنی و فرآیندهای فیبروتیک در ریه می‌پردازد. از تحقیقات کنونی مشخص است که miRNA ها ممکن است در تنظیم پس از رونویسی ژن های کلیدی در بیماری های ریوی انسان نقش داشته باشند. بنابراین، مطالعات بیشتر برای بررسی پروفایل های بیان miRNA و ارتباط آنها با mRNA های هدف در بیماری های ریوی انسان ضروری است.	دخالت microRNA ها در فرآیندهای فیزیولوژیکی و پاتولوژیک در ریه
m9ni2883	پس زمینه: کلید کنترل آنفولانزای همه گیر، سیستم های نظارتی هستند که به سرعت و با حساسیت هشدار می دهند. علاوه بر این، آنها باید هشدارهای کاذب را در طول فصل عادی آنفولانزا به حداقل برسانند. ما روشی را توسعه می‌دهیم که از داده‌های آنفلوانزای سندرمیک موجود از سیستم نظارتی موجود SERVIS (نظارت بر عفونت ویروس تنفسی پیشرفته اسکاتلندی) برای بیماری شبه آنفلوانزا (ILI) در اسکاتلند استفاده می‌کند. روش‌ها: ما الگوریتمی را بر اساس نسبت موارد هفتگی (WCR) موارد گزارش‌شده ILI ایجاد می‌کنیم تا هشداری برای آنفولانزای همه‌گیر ایجاد کنیم. از داده‌های آنفلوانزای فصلی از 13 هیئت سلامت اسکاتلند، ما توزیع احتمال مشترک WCR در سطح کشور و تعداد تابلوهای بهداشتی را که افزایش همزمان موارد آنفولانزای گزارش‌شده را در هفته گذشته نشان می‌دهند، تخمین می‌زنیم. موارد همه‌گیری با نرخ‌های گزارش‌گیری موارد مختلف از عفونت‌های آنفلوانزای همه‌گیر شبیه‌سازی‌شده نمونه‌برداری می‌شوند و با داده‌های SERVIS فصلی از سال 2001 تا 2007 پوشانده می‌شوند. با استفاده از این سری زمانی ترکیبی، ما روش خود را برای سرعت تشخیص، حساسیت و ویژگی آزمایش می‌کنیم. همچنین، موارد SERVIS ILI 2008-09 برای آزمایش عملکردهای تشخیص سه روش با داده های همه گیر واقعی استفاده می شود. نتایج: ما روش خود را، بر اساس مطالعه شبیه‌سازی خود، با روش‌های میانگین متحرک مجموع تجمعی (Mov-Avg Cusum) و آستانه نرخ ILI مقایسه می‌کنیم و آن را حساس‌تر و سریع‌تر می‌دانیم. برای 1٪ گزارش مورد و ویژگی تشخیص 95٪، روش ما 100٪ حساس است و میانه زمان تشخیص (MDT) 4 هفته است در حالی که روش های Mov-Avg Cusum و ILI به ترتیب، 97٪ و 100٪ حساس هستند. با MDT 5 هفته ای. با ویژگی 99٪، روش ما 100٪ با MDT 5 هفته حساس باقی می ماند. اگرچه روش آستانه حساسیت خود را 100٪ با MDT 5 هفته حفظ می کند، حساسیت Mov-Avg Cusum با افزایش MDT 6 هفته به 92٪ کاهش می یابد. برای کاهش دو برابری نرخ گزارش مورد (0.5٪) و ویژگی 99٪، روش های WCR و آستانه به ترتیب دارای MDT 5 و 6 هفته هستند که هر دو حساسیت نزدیک به 100٪ دارند در حالی که روش Mov-Avg Cusum. فقط می تواند حساسیت 77% را با MDT 6 هفته ای مدیریت کند. با این حال، روش‌های WCR و Mov-Avg Cusum در تشخیص گذشته‌نگر همه‌گیری 2009 در اسکاتلند، 1 هفته از روش آستانه ILI بهتر عمل می‌کنند. نتیجه‌گیری: در حالی که پیاده‌سازی از نظر محاسباتی و آماری ساده است، الگوریتم WCR می‌تواند به سرعت و با حساسیت هشدارهایی را برای همه‌گیری‌های آنفولانزا در برابر پس‌زمینه آنفولانزای فصلی ایجاد کند. اگرچه این الگوریتم با استفاده از داده‌های SERVIS توسعه یافته است، اما این ظرفیت را دارد که در مقیاس‌های جغرافیایی دیگر و برای سیستم‌های بیماری‌های مختلف که خرید زمان اضافی اولیه حیاتی است، استفاده شود.	تشخیص سریع آنفلوانزای همه گیر در حضور آنفولانزای فصلی
f6igj0pd	لپتوسپیروز یک عفونت مشترک بین انسان و دام است که عمدتاً ساکنان مناطق گرمسیری را تحت تأثیر قرار می دهد، اما باعث عفونت در حیوانات و انسان در مناطق معتدل نیز می شود. عوامل لپتوسپیروز شامل چندین عضو از جنس لپتوسپیرا است که شامل گونه های غیر بیماری زا و ساپروفیت نیز می شود. لپتوسپیروز می تواند از نظر شدت از یک بیماری خفیف و غیر اختصاصی تا یک بیماری شدید که شامل نارسایی چند اندام و آسیب گسترده اندوتلیال و خونریزی است متفاوت باشد. برای شروع بررسی چگونگی تأثیر لپتوسپایرهای بیماریزا بر سلولهای اندوتلیال، ما پاسخ دو رده سلولی اندوتلیال را به عفونت توسط لپتوسپیرهای بیماریزا در مقابل غیر بیماریزا مقایسه کردیم. تجزیه و تحلیل‌های ریزآرایه نشان داد که L. interrogans بیماری‌زا و L. biflexa غیر بیماری‌زا باعث تغییراتی در بیان ژن‌هایی می‌شوند که محصولات آن‌ها در معماری سلولی و تعامل با ماتریکس دخیل هستند، اما این تغییرات در جهت مخالف بوده و در درجه اول عفونت توسط L. biflexa وجود دارد. پیش‌بینی می‌شود که یکپارچگی لایه سلولی را افزایش یا حفظ کند، در حالی که L. interrogans عمدتاً منجر به تغییرات پیش‌بینی شده برای برهم زدن یکپارچگی لایه سلولی می‌شود. هیچ یک از سویه های باکتریایی حتی پس از انکوباسیون طولانی مدت باعث نکروز یا آپوپتوز سلول ها نشدند. با این حال، L. اینتروگان های بیماری زا، همانطور که توسط میکروسکوپ و توانایی باکتری ها برای عبور از لایه های سلولی ارزیابی شد، منجر به اختلال قابل توجهی در لایه های سلول های اندوتلیال شد. این اختلال در یکپارچگی لایه اندوتلیال با افزودن داروی محافظ اندوتلیال لیزینوپریل در غلظت های فیزیولوژیکی مرتبط لغو شد. این نتایج نشان می‌دهد که از طریق چسبندگی L. interrogans به سلول‌های اندوتلیال، باکتری‌ها ممکن است عملکرد مانع اندوتلیال را مختل کنند، انتشار باکتری‌ها را ترویج کرده و به تظاهرات شدید بیماری کمک کنند. علاوه بر این، مکمل درمان آنتی بیوتیکی با لیزینوپریل یا مشتقات با فعالیت های محافظتی اندوتلیال ممکن است شدت لپتوسپیروز را کاهش دهد.	پاسخ سلول های اندوتلیال انسان به گونه های بیماری زا و غیر بیماری زا لپتوسپیرا
l3ej1hdk	ناقل‌های آدنوویروس انسانی 5 (AdHu5) پلتفرم‌های واکسن قوی هستند، اما وجود آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده طبیعی ممکن است کارایی ناقل و پتانسیل تجویز مجدد را کاهش دهد. این مطالعه پاسخ‌های ایمنی و حفاظت را پس از واکسیناسیون با وکتور آدنوویروس 3 خوک (PAV3) که قابلیت تکرار ندارد به عنوان واکسن جایگزین AdHu5 با استفاده از مدل بیماری آنفلوانزای پرندگان H5N1 ارزیابی می‌کند. اثربخشی واکسن در موش‌های BALB/c پس از واکسیناسیون با دوزهای مختلف وکتور PAV3 که آنتی‌ژن هماگلوتینین H5N1 A/Hanoi/30408/2005 بهینه‌سازی شده را بیان می‌کند (PAV3-HA) ارزیابی شد و با کنترل AdHu5-HA مقایسه شد. PAV3-HA به سرعت پاسخ های آنتی بادی ایجاد کرد، با تیتر آنتی بادی خنثی کننده قابل توجهی در روز 21، و پاسخ های ایمنی سلولی قوی تر در روز 8، در مقایسه با AdHu5-HA شناسایی شد. واکسن PAV3-HA که 8 روز قبل از چالش تجویز شد، بقای بهبود یافته و بار ویروسی کمتری را نشان داد. ارزیابی اثربخشی طولانی‌مدت واکسن در 12 ماه پس از واکسیناسیون، محافظت بهتری را با PAV3-HA نسبت به واکسن AdHu5-HA نشان داد. نکته مهم، بر خلاف AdHu5، ناقل PAV3 به طور قابل توجهی توسط آنتی بادی های انسانی جمع آوری شده از بیش از 10000 نفر خنثی نشد. به طور کلی، وکتور مبتنی بر PAV3 قادر است پاسخ های ایمنی سریع و قوی را میانجیگری کند و جایگزین امیدوارکننده ای برای AdHu5 ارائه دهد.	یک آدنوویروس خوک با شیوع کم سرمی انسانی یک واکسن جایگزین امیدوارکننده برای آدنوویروس انسانی 5 در مدل بیماری ویروسی H5N1 است.
2aku9prp	ما قبلاً نشان داده‌ایم که آنتی‌ژن‌هایی که از نظر شیمیایی به سطح لیپوزوم‌های متشکل از اسیدهای چرب غیراشباع جفت شده‌اند، توسط سلول‌های ارائه‌دهنده آنتی‌ژن (APCs) به سلول‌های T CD8(+) ارائه می‌شوند و این فرآیند منجر به القای آنتی‌ژن خاص می‌شود. لنفوسیت های T سیتوتوکسیک در مطالعه حاضر، مکانیسمی که توسط آن آنتی ژن‌های جفت شده با لیپوزوم به سلول‌های T CD8 (+) توسط APCs ارائه شد، مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل میکروسکوپی اسکن لیزر کانفوکال نشان داد که آنتی ژن های جفت شده به سطح لیپوزوم های مبتنی بر اسیدهای چرب غیراشباع پردازش در هر دو بخش MHC کلاس I و کلاس II دریافت می کنند، در حالی که بیشتر آنتی ژن ها به سطح اسید چرب اشباع متصل می شوند. لیپوزوم ها در محفظه کلاس II پردازش شدند. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل فلوسایتومتری نشان داد که آنتی ژن های جفت شده به سطح لیپوزوم های اسید چرب غیر اشباع توسط APCها حتی در یک محیط 4 درجه سانتی گراد گرفته می شوند. این در مورد لیپوزوم های اسید چرب اشباع صادق نبود. هنگامی که دو نوع بازدارنده، دی متیل آمیلوراید (DMA) و سیتوکالاسین B، که به ترتیب پینوسیتوز و فاگوسیتوز توسط APCها را مهار می کنند، به کشت APCها قبل از پالس آنتی ژن اضافه شدند، DMA اما نه سیتوکالاسین B به طور قابل توجهی جذب آنتی ژن لیپوزوم را کاهش داد. . تجزیه و تحلیل بیشتر قاچاق درون سلولی آنتی ژن های لیپوزومی با استفاده از میکروسکوپ اسکن لیزری کانفوکال نشان داد که بخشی از آنتی ژن های جفت شده با لیپوزوم گرفته شده توسط APCها به محفظه لیزوزوم تحویل داده شد. در توافق با کاهش جذب آنتی ژن توسط APCها، ارائه آنتی ژن توسط APCها به طور قابل توجهی توسط DMA مهار شد و منجر به کاهش تولید IFN-γ توسط سلول های T CD8(+) اختصاصی آنتی ژن شد. این نتایج نشان می‌دهد که آنتی‌ژن‌های جفت‌شده به سطح لیپوزوم‌های متشکل از اسیدهای چرب غیراشباع ممکن است توسط APCها پینوسیتوز شوند، بر روی مسیر پردازش MHC کلاس I بارگذاری شوند و به سلول‌های T CD8(+) ارائه شوند. بنابراین، انتظار می رود این آنتی ژن های جفت شده با لیپوزوم برای توسعه واکسن هایی که ایمنی سلولی را القا می کنند، قابل استفاده باشند.	آنتی ژن های همراه با لیپوزوم توسط سلول های ارائه دهنده آنتی ژن از طریق پینوسیتوز درونی شده و به سلول های T CD8(+) ارائه می شوند.
cgx90xnt	درمان توصیه شده هپاتیت B مزمن با آنالوگ های اینترفرون-α و/یا نوکلئوس(t)اید به نتیجه رضایت بخشی منجر نمی شود. القای سلول های T اختصاصی HBV با واکسیناسیون درمانی یا ایمونوتراپی ممکن است یک استراتژی نوآورانه برای غلبه بر ماندگاری ویروس باشد. واکسیناسیون با واکسن‌های تجاری موجود برای HBV در بیماران منجر به کنترل موثر عفونت HBV نمی‌شود، و این نشان می‌دهد که فرمول‌های جدیدی از واکسن‌های درمانی مورد نیاز است. وودچاک (Marmota monax) یک مدل بالینی مفید برای توسعه رویکردهای درمانی جدید در عفونت‌های مزمن هپادناویروسی است. چندین رویکرد نوآورانه ترکیبی از درمان‌های ضد ویروسی با آنالوگ‌های nucleos(t)ide، واکسن‌های DNA و واکسن‌های پروتئینی در مدل وودچاک آزمایش شدند. در این مقاله ما داده‌های موجود در مورد ایمن‌سازی درمانی و ژن‌درمانی را با استفاده از روش‌های ناقل‌های ویروسی نوترکیب در شاخک‌های چوبی خلاصه می‌کنیم که نتایج دلگرم‌کننده‌ای را نشان می‌دهد. علاوه بر این، ما نوآوری‌های بالقوه در استراتژی‌های تعدیل‌کننده ایمنی را برای ارزیابی در این مدل حیوانی ارائه می‌کنیم.	واکسیناسیون درمانی در هپاتیت B مزمن: مطالعات پیش بالینی در وودچک
k2a0q9y8	سابقه و هدف: توکسوپلاسموز باعث از دست دادن زندگی، عملکرد شناختی و حرکتی و بینایی می شود. برای پیشگیری از این بیماری به واکسن بسیار نیاز است. هدف از این مطالعه استفاده از یک رویکرد ایمنی برای ایجاد پایه‌ای برای توسعه واکسن‌هایی برای محافظت از انسان با سوپرتیپ HLA-A03 بود. سه پپتید با نمرات اتصال بالا برای سوپرتایپ‌های HLA-A03 با استفاده از الگوریتم‌های بیوانفورماتیک، میل اتصال اندازه‌گیری شده بالا برای مولکول‌های سوپرتیپ HLA-A03 و توانایی استخراج IFN-γ توسط HLA-A03 سوپرتیپ خون محیطی CD8(+)T شناسایی شدند. سلول های افراد سرم مثبت اما نه سرم منفی. نتایج: در اینجا، هنگامی که این پپتیدها با اپی توپ جهانی سلول CD4(+)T PADRE (AKFVAAWTLKAAA) و به عنوان لیپوپپتید فرموله شدند، یا با GLA-SE به تنهایی یا با Pam(2)Cys تجویز شدند، دریافتیم که موفقیت آمیز بود. آماده‌سازی‌هایی ایجاد کرد که باعث القای IFN-γ و کاهش بار انگل در موش‌های تراریخته HLA-A1101 (یک آلل سوپرتیپ HLA-A03) شد. GLA-SE یک لیگاند مصنوعی TLR4 امولسیون شده جدید است که برای تسهیل توسعه پاسخ های سلول T Helper 1 (TH1) شناخته شده است. سپس، بنابراین، پپتیدهای ما شامل پپتیدهایی می شود که در تاکی زوئیت ها، برادیزوئیت ها و اسپوروزوئیت ها از هر دو انگل نوع I و II بیان می شوند، ما از رویکردهای خود استفاده کردیم که پپتیدهای اولیه را شناسایی کرده بودند. ما پپتیدهای اضافی را با استفاده از بیوانفورماتیک، سنجش میل ترکیبی، و مطالعه پاسخ‌های سلول‌های انسانی HLA-A03 شناسایی کردیم. در نهایت، ما دریافتیم که ایمن سازی موش های تراریخته HLA-A1101 با تمام پپتیدهای ترکیب شده با PADRE، GLA-SE، و Pam(2)Cys یک راه موثر برای استخراج سلول های T طحال CD8(+) تولید کننده IFN-γ است. و حفاظت ایمن سازی شامل پپتیدهای زیر با هم بود: KSFKDILPK (SAG1 (224-232)). AMLTAFFLR (GRA6(164-172))؛ RSFKDLLKK (GRA7(134-142))؛ STFWPCLLR (SAG2C(13-21))؛ SSAYVFSVK((SPA250-258)); و AVVSLLRLLK (SPA(89-98)). این ایمن سازی حفاظت قوی را به همراه داشت که به عنوان کاهش بار انگل با استفاده از یک انگل ترانسفکت شده با لوسیفراز، لوسیفرین، این مدل جدید، مدل موش تراریخته HLA و تصویربرداری با دوربین Xenogen اندازه گیری شد. نتیجه‌گیری: پپتیدهای توکسوپلاسما گوندی باعث ایجاد سلول‌های T CD8 (+) با HLA-A03 محدود شده، تولیدکننده IFN-γ در انسان و موش می‌شوند. این پپتیدهایی که همراه با ادجوانت تجویز می شوند، بار انگل را در موش های تراریخته HLA-A*1101 کاهش می دهند. این کار پایه ای برای واکسن های مبتنی بر ایمنی ایمنی فراهم می کند. همچنین ادجوانت های جدیدی را برای پپتیدهای تازه شناسایی شده برای واکسن ها برای جلوگیری از توکسوپلاسموز در کسانی که آلل های سوپرتیپ HLA-A03 دارند، تعریف می کند.	ایمونوم انسانی، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک با استفاده از ابرموتیف های HLA و ژنوم انگل، سنجش های اتصال، مطالعات پاسخ های سلول های T انسانی، و ایمن سازی موش های تراریخته HLA-A*1101 شامل ادجوانت های جدید، پایه ای برای سلول های CD8(+)T محدود شده HLA-A03 فراهم می کند. واکسن ادجوانت مبتنی بر اپی توپ، محافظ در برابر توکسوپلاسما گوندی
dc7fn26s	ویروس‌های آنفلوانزا A متعلق به بهترین ویروس‌های مورد مطالعه هستند، با این حال هیچ پیشگیری موثری در برابر عفونت آنفولانزا ایجاد نشده است. ظهور گونه های فرار هنوز جدید از ویروس های آنفولانزای A که باعث اپیدمی ها و همه گیری های دوره ای در سراسر جهان می شود، تهدیدی برای جمعیت انسانی است. بنابراین، وظیفه فعلی و داغ تحقیقات ویروس آنفولانزا این است که به دنبال راهی برای نزدیک‌تر کردن ما به یک واکسن جهانی باشد. ترکیبی از آنتی ژن‌های حفاظت‌شده انتخاب‌شده که پاسخ آنتی‌بادی محافظ متقاطع را القا می‌کنند با اپی توپ‌هایی که سلول‌های T سیتوتوکسیک محافظ متقاطع را نیز فعال می‌کنند، یک استراتژی جذاب برای بهبود محافظت در برابر انواع رانش ویروس‌های آنفولانزای فصلی ارائه می‌کند و تأثیر سویه‌های همه‌گیر آینده را کاهش می‌دهد. زیرواحد همجوشی فعال هماگلوتینین (HA2 gp) و اکتودومین پروتئین ماتریکس 2 (eM2) که به صورت آنتی ژنی حفظ شده اند، کاندیدهای امیدوارکننده ای برای تهیه واکسن مبتنی بر HA2 یا eM2 به طور گسترده محافظ هستند که ممکن است به آمادگی برای بیماری همه گیر کمک کند. اثر محافظتی کلی را می توان با مشارکت اپی توپ های شناسایی شده توسط لنفوسیت های T سیتوتوکسیک (CTL) که برای دستیابی به کنترل بسیار گسترده تر عفونت آنفلوانزا مورد مطالعه قرار گرفته اند، به دست آورد. در این بررسی ما به ارائه آخرین هنر در این زمینه می پردازیم. ما مکانیسم‌های ایمنی تطبیقی شناخته شده‌ای را توصیف می‌کنیم که توسط سلول‌های B و T خاص آنفلوانزا درگیر در دفاع ایمنی ضد آنفولانزا همراه با کمک ایمنی ذاتی هستند. ما مکانیسم‌های خنثی‌سازی عفونت آنفولانزا با واسطه آنتی‌بادی‌ها، نقش CTL در حذف ویروسی و رویکردهای جدید برای ایجاد واکسن مبتنی بر اپی‌توپ را مورد بحث قرار می‌دهیم که پاسخ ایمنی اختصاصی ویروس آنفولانزا را القا می‌کند.	اپی توپ های حفاظت شده ویروس آنفولانزای A ایجاد کننده ایمنی محافظتی و چشم انداز آنها برای توسعه واکسن جهانی
svn4e6w6	S-palmitoylation اتصال برگشت پذیر اسیدهای چرب (عمدتا پالمیتات) را بر روی باقی مانده های سیستئین از طریق یک پیوند تیواستر حساس توصیف می کند. این اصلاح پس از ترجمه بر عملکرد پروتئین با تنظیم فعل و انفعالات غشایی، مرتب‌سازی درون سلولی، پایداری و ریزالگوی غشا تأثیر می‌گذارد. چندین یافته اخیر بینش وسوسه انگیزی را در مورد تنظیم و دینامیک مکانی-زمانی پالمیتویلاسیون پروتئین ارائه کرده است. در سلول‌های پستانداران، گلژی به‌عنوان یک مرکز واکنش فوق‌العاده ممکن برای پالمیتویلاسیون پروتئین‌های غشای محیطی پدیدار شده است، در حالی که واکنش‌های پالمیتویلاسیون در بخش‌های پس از گلژی به تنظیم بسترهای خاص کمک می‌کند. علاوه بر آنزیم‌های پالمیتویله‌کننده و پالمیتویله‌کننده، دینامیک پالمیتویلاسیون درون سلولی نیز ممکن است از طریق تعامل با تغییرات متمایز پس از ترجمه، مانند فسفوریلاسیون و نیتروزیلاسیون، کنترل شود.	پویایی درون سلولی پالمیتویلاسیون پروتئین
s4e08yvg	کودکان و بزرگسالان جوان در سنین باروری به‌عنوان گروه‌هایی ظاهر شده‌اند که در برابر همه‌گیری فعلی H1N1 در سال 2009 بسیار آسیب‌پذیر هستند. جنسیت یک فرد یک عامل اساسی است که می تواند بر قرار گرفتن در معرض، حساسیت و پاسخ های ایمنی به آنفولانزا تأثیر بگذارد. در سرتاسر جهان، میزان بروز، بار بیماری، عوارض و میزان مرگ و میر پس از مواجهه با ویروس آنفلوانزای H1N1 2009 بین مردان و زنان متفاوت است و اغلب به سن بستگی دارد. بارداری و تفاوت در ارائه عوامل خطر مختلف منجر به بدتر شدن پیامد عفونت در زنان می شود. اثر واکسیناسیون و درمان ضد ویروسی نیز به روشی وابسته به جنسیت متفاوت است. در نهایت، تفاوت های ژنتیکی و هورمونی مربوط به جنس ممکن است به شدت آنفولانزا و پاکسازی عفونت ویروسی کمک کند. سهم جنسیت و جنسیت در آنفولانزا را فقط می توان با در نظر گرفتن بیشتر این عوامل در مطالعات بالینی و اپیدمیولوژیک و افزایش تحقیقات در زمینه پایه بیولوژیکی زیربنای این تفاوت ها تعیین کرد.	تأثیر جنسیت، جنسیت و بارداری بر بیماری H1N1 2009
b66bb2ri	سازگاری سریع ویروسی و تأثیر این تکامل سریع در ظهور چندین بیماری عفونی جدید، این موضوع را به چالشی بزرگ برای حوزه‌های مختلف تحقیقاتی تبدیل کرده است. در واقع، ویروس‌ها در ایجاد طیف گسترده‌ای از آسیب‌شناسی‌ها نقش دارند و درک چگونگی تعامل ویروس‌ها و سلول‌های میزبان در زمینه سازگاری، یک سوال باز باقی می‌ماند. به منظور ارائه بینش در مورد فعل و انفعالات پیچیده بین ویروس ها و ارگانیسم های میزبان آنها و به عنوان مثال در کسب عملکردهای جدید از طریق تبادل مواد ژنتیکی، ما پایگاه داده PHEVER را توسعه دادیم. هدف این پایگاه داده ارائه اطلاعات دقیق تکاملی و فیلوژنتیکی برای تجزیه و تحلیل ماهیت انتقال ژن جانبی ویروس-ویروس و ویروس-میزبان است. PEVER (http://pbil.univ-lyon1.fr/databases/phever) یک پایگاه داده منحصر به فرد از خانواده های همولوگ است (i) بین توالی های ویروس های مختلف و (ii) بین توالی های ویروسی و توالی های موجودات سلولی. PEVER داده های گسترده ای از ژنوم های به روز کاملا توالی یابی شده (2426 ژنوم ویروسی غیر زائد، 1007 ژنوم پروکاریوتی غیر زائد، 43 ژنوم یوکاریوتی از گیاهان تا مهره داران) را ادغام می کند و مجموعه ای از پروتئین ها را در حداقل یک خانواده همولوگ ارائه می دهد. توالی های ویروسی، و همچنین صف بندی و فیلوژنی برای هر یک از این خانواده ها. دسترسی عمومی به PhEVER از طریق صفحه وب آن و از طریق تمام سیستم های اختصاصی بازیابی ACNUC در دسترس است.	PHEVER: پایگاه داده ای برای اکتشاف جهانی روابط تکاملی ویروس-میزبان
2ad1tu4s	پس‌زمینه پاسخ‌دهی مؤثر به شیوع بیماری‌های عفونی مستلزم یک پاسخ آگاهانه است. روش‌های کمی برای تجزیه و تحلیل داده‌های شیوع و تخمین پارامترهای کلیدی برای توصیف شیوع شیوع، از جمله تعداد تولید مثل و فاصله سریال، اغلب فرض می‌کنند که داده‌های جمع‌آوری‌شده کامل است. در واقعیت، تأخیر در گزارش دهی، موارد شناسایی نشده یا فقدان تست های حساس و اختصاصی برای تشخیص بیماری منجر به گزارش خطا در شمارش موارد می شود. در اینجا ما بینشی در مورد تأثیری که چنین خطاهای گزارشگری ممکن است بر تخمین این پارامترهای کلیدی داشته باشند ارائه می دهیم. نتایج: ما نشان می‌دهیم که وقتی نسبت موارد گزارش‌شده در طول دوره مطالعه در حال تغییر است، برآورد پارامترهای اپیدمیولوژیک کلیدی مغرضانه است. با استفاده از داده‌های شیوع آنفولانزای A/H1N1 در لاگلوریا، مکزیک، تخمین‌هایی از این پارامترها ارائه می‌کنیم و خطاهای احتمالی گزارش‌دهی را در نظر می‌گیریم و نشان می‌دهیم که اگر مشکلات گزارش در نظر گرفته نشود، می‌توانند تا 33 درصد سوگیری داشته باشند. نتیجه‌گیری: عدم در نظر گرفتن داده‌های از دست رفته می‌تواند منجر به تخمین‌های گمراه‌کننده و نادرست پارامترهای اپیدمی شود.	گزارش خطا در شیوع بیماری های عفونی، با استفاده از آنفولانزای همه گیر A/H1N1
iv18eiap	سابقه و هدف: موارد H1N1 و سایر عفونت‌های ریوی به نارسایی حاد تنفسی و مرگ تبدیل می‌شوند که عفونت‌های همزمان یا آسیب ریه بر پاسخ ایمنی غالب باشد، بنابراین نیاز به تشخیص زودهنگام برای بهبود درمان دارد. ObjectiveTo انجام تجزیه و تحلیل هیستوپاتولوژیکی دقیق از نمونه های بیوپسی ریه باز از پنج بیمار مبتلا به ARDS با H1N1 تایید شده. روش‌ها: نمونه‌های ریه تحت آنالیز میکروبیولوژیک و بررسی با میکروسکوپ نوری و الکترونی قرار گرفتند. ایمونوفنوتایپ برای مشخص کردن ماکروفاژها، کشنده طبیعی، سلول های T و B و بیان سیتوکین ها و iNOS استفاده شد. ResultsThe ویژگی های پاتولوژیک مشاهده شده برونشیولیت نکروزان، آسیب آلوئولی منتشر، خونریزی آلوئولی و پاسخ ایمنی غیر طبیعی بود. تجزیه و تحلیل فراساختاری ذرات شبیه ویروس را در همه موارد نشان داد. نتیجه‌گیری: ذرات شبه ویروسی را می‌توان با موفقیت در بافت ریه با بررسی فراساختاری نشان داد، بدون اینکه ویروس توسط RT-PCR در آسپیره‌های نازوفارنکس تایید شود. برونشیول ها و اپیتلیوم، به جای اندوتلیوم، احتمالاً هدف اصلی عفونت هستند و آسیب آلوئولی منتشر که نتیجه اثر انسداد و اختلال عملکرد راه های هوایی بر ایمنی ذاتی است، که نشان می دهد درمان باید بر ترمیم اپیتلیال متمرکز شود.	تجزیه و تحلیل پاتولوژیک و فراساختاری بیوپسی ریه جراحی در بیماران مبتلا به آنفلوانزای خوکی نوع A/H1N1 و نارسایی حاد تنفسی
cxr1ul7q	پس زمینه: از اولین شیوع بیماری تنفسی ناشی از ویروس H1N1 در مکزیک، چندین گزارش نیاز به مراقبت‌های ویژه یا کمک اکسیژن‌رسانی غشای خارج بدنی (ECMO) را در بیماران جوان و اغلب سالم توصیف کرده‌اند. در اینجا ما تجربه خود را در ARDS ناشی از H1N1 با استفاده از استراتژی تهویه و کمک ECMO شرح می دهیم. روش‌ها: پیرو دستورالعمل‌های وزارت بهداشت ایتالیا، یک سرویس اورژانس در بیمارستان آموزشی Careggi (فلورانس، ایتالیا) برای آنفولانزای همه‌گیر جدید ایجاد شد. از 9 سپتامبر تا 10 ژانویه، همه بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه (ICU) بخش اورژانس با ARDS به دلیل عفونت H1N1 مورد مطالعه قرار گرفتند. تمام درمان های ECMO وریدی-وریدی بودند. عفونت H1N1 با روش PCR بر روی سواب حلق، آسپیراسیون ساب گلوت و لاواژ برونش آلوئولار تایید شد. آسیب شناسی ریه روزانه با معاینه اولتراسوند ریه (LUS) ارزیابی شد. نتایج: در مجموع 12 بیمار مورد مطالعه قرار گرفتند: 7 مورد تحت درمان ECMO قرار گرفتند و 5 نفر به تهویه مکانیکی محافظ پاسخ دادند. دو بیمار مبتلا به لژیونلا پنوموفیلا بودند. یک زن باردار بود. در سری ما، PCR از لاواژ برونکوآلوئولار حساسیت 100% در مقایسه با 75% نمونه‌های سواب حلقی داشت. استفاده معمول از LUS تعداد معاینات اشعه ایکس قفسه سینه را محدود کرد و انتقال به رادیولوژی برای سی تی اسکن را کاهش داد، ایمنی بیمار را افزایش داد و از قطع موقت ونتیلاتور جلوگیری کرد. هیچ عارضه عمده ای در طول درمان های ECMO رخ نداد. در سه مورد، خونریزی از محل های دسترسی عروقی به دلیل تزریق هپارین نیاز به تزریق خون داشت. میزان کلی مرگ و میر 8.3٪ بود. نتیجه‌گیری: در تجربه ما، کمک اولیه ECMO با توجه به شرایط تهدیدکننده زندگی در ARDS ناشی از H1N1 ایمن و امکان‌پذیر بود. سونوگرافی ریه وسیله ای موثر برای ارزیابی روزانه بیماران ARDS است.	درمان تهویه و ECMO نارسایی شدید تنفسی ناشی از H1N1: نتایج یک مرکز ارجاع ECMO ایتالیایی
9tivuyh5	همه‌گیری آنفلوانزای همه‌گیر H1N1 در سال 2009، تهدید سلامت جهانی سویه‌های آنفلوانزای جدید را نشان داد. در اینجا، ما یک تجزیه و تحلیل دقیق از پاسخ‌های آنتی‌بادی پلاسمابلاست و مونوکلونال ناشی از عفونت همه‌گیر H1N1 در انسان را گزارش می‌کنیم. برخلاف آنتی‌بادی‌هایی که توسط واکسیناسیون سالانه آنفولانزا ایجاد می‌شوند، اکثر آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده ناشی از عفونت همه‌گیر H1N1 به طور گسترده در برابر اپی توپ‌های موجود در ساقه و ناحیه سر هماگلوتینین (HA) سویه‌های آنفولانزای متعدد واکنش متقابل داشتند. آنتی بادی ها از سلول هایی بودند که تحت بلوغ میل ترکیبی گسترده قرار گرفته بودند. بر اساس این مشاهدات، فرض می‌کنیم که پلاسمبلاست‌هایی که این آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده گسترده را تولید می‌کنند، عمدتاً از سلول‌های حافظه فعال B خاص برای اپی توپ‌های حفظ‌شده در چندین سویه آنفولانزا مشتق شده‌اند. در نتیجه، بیشتر آنتی بادی های خنثی کننده به طور گسترده در برابر سویه های آنفولانزای H1N1 و H5N1 واگرا واکنش نشان دادند. این نشان می دهد که واکسن پان آنفلوانزا ممکن است با توجه به ایمونوژن مناسب امکان پذیر باشد. آنتی‌بادی‌هایی که موش‌ها را به‌شدت محافظت کرده و از چالش کشنده با همه‌گیری H1N1 یا سویه‌های آنفولانزای متمایز از نظر آنتی‌ژنی نجات دادند و آن‌ها را کاندیدای عالی درمانی کردند.	آنتی بادی های واکنش متقاطع گسترده بر پاسخ سلول های B انسانی در برابر عفونت ویروس آنفلوانزای همه گیر H1N1 در سال 2009 غالب می شوند.
dvh0qrgp		سمپوزیوم سالانه انجمن مطالعه خطاهای ذاتی متابولیسم
ic937w26	سابقه و هدف: وزغ نیشکر، Bufo (Chaunus) marinus، یکی از بدنام ترین آفات مهره داران است که طی 200 سال گذشته به استرالیا معرفی شده است و تاکنون تلاش هایی برای شناسایی یک پاتوژن خاص B. marinus برای استفاده به عنوان یک بیولوژیکی انجام شده است. عامل کنترل ناموفق بوده است. ما یک رویکرد جایگزین را بررسی کردیم که مستلزم اصلاح ژنتیکی یک پاتوژن با ویژگی میزبان گسترده بود، به طوری که دیگر باعث بیماری نمی‌شود، بلکه ژنی را برای مختل کردن چرخه زندگی وزغ نیشکر به شیوه‌ای خاص یک گونه حمل می‌کرد. روش / یافته های اصلی: ژن بتا گلوبین بالغ به عنوان ژن مدل برای اثبات مفهوم خودایمنی به عنوان یک روش کنترل زیستی برای وزغ های نیشکر انتخاب شد. گزارش قبلی نشان داد تزریق بتا گلوبین بالغ قورباغه گاو نر منجر به تغییر در شکل بتا گلوبین بیان شده در دگرگونی و همچنین کاهش بقا شد. در B. marinus ما برای اولین بار ثابت کردیم که تغییر از قورباغه به گلوبین بالغ وجود دارد. سپس تأثیر تزریق پروتئین گلوبین بالغ نوترکیب خالص شده به قورباغه B. marinus با استفاده از رفتاری (سرعت شنا در بچه قورباغه ها و طول پرش در دگرگونی ها)، رشدی (زمان تا دگردیسی، وزن و طول در مراحل مختلف رشد، مشخصات پروتئینی گلوبین بالغ بررسی شد. ) و ژنتیکی (سطح mRNA گلوبین بزرگسالان) اندازه گیری می شود. با این حال، ما قادر به تشخیص هیچ تفاوتی بین حیوانات تحت درمان و کنترل نبودیم. علاوه بر این، تحویل گلوبین با استفاده از Bohle iridovirus، یک جدایه راناویروس استرالیایی متعلق به خانواده Iridovirus، بقای دگرگونی ها را کاهش نداد یا شکل بتا گلوبین بیان شده در دگرگونی ها را تغییر نداد. نتیجه‌گیری/ اهمیت: در حالی که ما توانستیم برای اولین بار نشان دهیم که تغییر از گلوبین قورباغه به گلوبین بالغ در B. marinus رخ می‌دهد، ما قادر به ایجاد خودایمنی و اختلال در دگردیسی نبودیم. زمان کوتاه رشد قورباغه مارینوس ممکن است مانع از این رویکرد شود.	ارزیابی خودایمنی ناقل ویروسی به عنوان یک استراتژی کنترل زیستی برای وزغ های نیشکر
xrsyj1tc	گرانولوسیت های ائوزینوفیل در مخاط تنفسی از جمله ریه ها، در دستگاه گوارش، و در اندام های مرتبط با لنفوسیت، تیموس، غدد لنفاوی و طحال قرار دارند. در عفونت های انگلی، بیماری های آتوپیک مانند درماتیت آتوپیک و آسم، تعداد ائوزینوفیل های در گردش اغلب افزایش می یابد. در شرایطی مانند سندرم هیپرئوزینوفیلیک (HES) سطح ائوزینوفیل در گردش حتی بیشتر افزایش می یابد. اگرچه ائوزینوفیل ها بیش از صد سال پیش شناسایی شدند، نقش آنها در هموستاز و در بیماری هنوز نامشخص است. برجسته ترین ویژگی ائوزینوفیل ها گرانول های ثانویه بزرگ آنها است که هر کدام شامل چهار پروتئین اساسی است که شناخته شده ترین آنها پروتئین کاتیونی ائوزینوفیل (ECP) است. این پروتئین به عنوان یک نشانگر برای بیماری ائوزینوفیلیک ساخته شده است و در مایعات بیولوژیکی از جمله سرم، شستشوی برونش آلوئولار و ترشحات بینی تعیین شده است. افزایش سطح ECP در بیماری های لنفوسیت کمکی T نوع 2 (آتوپیک) مانند آسم آلرژیک و رینیت آلرژیک و همچنین گاهی اوقات در سایر بیماری ها مانند سینوزیت باکتریایی دیده می شود. ECP یک ریبونوکلئاز است که دارای عملکردهای سیتوتوکسیک، نوروتوکسیک، تقویت کننده فیبروز و تنظیم کننده سیستم ایمنی بدن است. ECP سلول های مخاطی و ایمنی را تنظیم می کند و ممکن است مستقیماً علیه عفونت های کرمی، باکتریایی و ویروسی عمل کند. سطوح ECP اندازه گیری شده در بیماری در ترکیب با کاتالوگ عملکردهای شناخته شده پروتئین و پلی مورفیسم های آن که در اینجا ارائه شده است، پایه ای برای گمانه زنی های بیشتر در مورد نقش ECP و در نهایت نقش ائوزینوفیل ایجاد می کند.	تجزیه و تحلیل پروتئین کاتیونی ائوزینوفیل - سرنخی از عملکرد گرانولوسیت ائوزینوفیل
dognow0r	پیش‌زمینه: حدس زده می‌شود که ویروس آنفلوانزای همه‌گیر H1N1 در سال 2009 ممکن است در طول دوره پس از همه‌گیری کنونی با تظاهرات بالینی شدیدتر برای گروه‌های پرخطر شناسایی‌شده در طول همه‌گیری سال 2009 به یک الگوی فصلی تبدیل شود. از این رو میزان نیازهای مازاد احتمالی مراقبت های بهداشتی در این دوره باید به طور کامل در نظر گرفته شود. ما از سابقه تاریخی مراقبت های بهداشتی در تایوان در طول و پس از همه گیری آنفولانزای 1918 استفاده خواهیم کرد تا دامنه بار اضافی بالقوه مراقبت های بهداشتی را در طول دوره پس از همه گیری مشخص کنیم. روش‌ها: برای تعیین نیازهای مراقبت‌های بهداشتی پس از موج اولیه در سال 1918، سوابق سالانه مراقبت‌های بهداشتی ( بستری شدن در بیمارستان، بیماران سرپایی، و غیره) در تایوان طی سال‌های 1918-1920 با داده‌های مربوطه از سال‌های پایه مجاور در سال‌های 1916، 1917 مقایسه شد. 1921 و 1922 برای برآورد بار اضافی مراقبت های بهداشتی در طول شیوع اولیه در سال 1918 و در سال های بلافاصله پس از آن. نتایج: در سال 1918 تعداد بیماران سرپایی بیمارستان های دولتی 20.11٪ از میانگین سالانه سال های پایه (95٪ فاصله اطمینان: 16.43، 25.90) بیشتر شد، و تعداد بستری ها از میانگین سالانه مربوط به سال های پایه 12.20٪ (10.59) بیشتر شد. ، 14.38)، در حالی که تعداد مازاد بیماران تحت درمان توسط پزشکان عمومی 32.21 درصد (28.48، 39.82) بیشتر از میانگین سالانه سال های پایه از نظر آماری معنی دار بود. برای سال 1920، تنها تعداد مازاد بستری شدن در بیمارستان 19.83% (95% فاصله اطمینان: 17.21، 23.38) بیشتر از میانگین سالانه سال‌های پایه از نظر آماری معنی‌دار بود. نتیجه‌گیری: بار اضافی قابل توجهی با تلفات جانی قابل توجه در سال 1918 توسط سیستم پزشکی عمومی و بیمارستان‌های دولتی گزارش شد. در مقایسه، تنها تعداد قابل توجهی از بستری‌های اضافی در بیمارستان‌های دولتی در سال 1920 گزارش شد، که نشان می‌دهد جمعیت نسبتاً برای موج اول در سال 1918 آماده نبودند و به طور کامل از بیمارستان‌های دولتی استفاده نمی‌کردند. علاوه بر این، در طول موج دوم در سال 1920، میزان مرگ و میر نسبتاً پایینی توسط بیمارستان‌های دولتی و پزشکان عمومی گزارش شد، حتی اگر بیماران به میزان قابل توجهی در بیمارستان بستری شدند، که نشان می‌دهد در موج دوم، بیماری‌های کشنده کمتری در بین بیماران بستری شده در بیمارستان وجود داشته است. نتایج ما پارامترهای قابل قبولی را برای ارزیابی نیازهای مراقبت های بهداشتی برای آمادگی پس از همه گیری فراهم می کند.	بار اضافی مراقبت های بهداشتی در طول همه گیری آنفولانزای 1918-1920 در تایوان: پیامدهای آمادگی پس از همه گیری
rq08bhu9	ایمونواسی ابزار مهمی برای تشخیص و شناسایی سریع عوامل بیماری زا، هم از نظر بالینی و هم در آزمایشگاه تحقیقاتی است. یک سنجش ایمنی با پتانسیل برای تشخیص آنفولانزا با استفاده از هماگلوتینین (HA)، یک گلیکوپروتئین که معمولاً مورد مطالعه قرار می‌گیرد، روی سطح ویریون‌های آنفولانزا یافت می‌شود، ایجاد و آزمایش شد. نانوذرات طلا سنتز شدند که اپی توپ‌های پپتیدی متعددی از جمله اپی‌توپ HA را ارائه می‌کنند تا پاسخ گرانشی به‌دست‌آمده با استفاده از حسگر ایمنی QCM برای آنفولانزا را افزایش دهند. به طور خاص، اپی توپ‌های مرتبط با پپتیدهای HA و FLAG توسط یک فاصله‌دهنده PEG شش مرجانی بین اپی توپ و سیستئین انتهایی به نانوذرات طلا چسبانده شدند. نشان داده شد که فاصله‌گذار PEG با افزایش فاصله اپی توپ از سطح طلا، احتمال برهمکنش با آنتی‌بادی‌ها را افزایش می‌دهد. این نانوذرات با استفاده از آنالیز ترموگراویمتری، میکروسکوپ الکترونی عبوری، دفع لیزر به کمک ماتریس/زمان یونیزاسیون پرواز، و آنالیز رزونانس مغناطیسی هسته ای (1)H مشخص شدند. آنتی‌بادی‌های Anti-FLAG و anti-HA به سطح یک QCM چسبانده شدند و پاسخ هر آنتی‌بادی پس از قرار گرفتن در معرض HA، FLAG و نانوذرات دارای عملکرد دوگانه با اتصال نانوذرات Au-tiopronin و پروتئین‌های H5 HA از ویروس آنفولانزا مقایسه شد. (H5N1). نتایج نشان می‌دهد که ایمونواسی قادر به تمایز بین نانوذراتی است که اپی توپ‌های متعامد را در زمان واقعی با حداقل اتصال غیراختصاصی ارائه می‌دهند. تشخیص پروتئین H5 HA گسترش منطقی استفاده از این نانوذرات تقلید را به عنوان یک کنترل مثبت ایمن در تشخیص آنفولانزا نشان می‌دهد و این امر را به گامی حیاتی در بهبود روش‌شناسی تشخیص آنفولانزا تبدیل می‌کند. مواد تکمیلی الکترونیکی: نسخه آنلاین این مقاله (doi:10.1007/s00216-010-4419-8) حاوی مطالب تکمیلی است که در دسترس کاربران مجاز است.	نانوذرات چند منظوره به عنوان شبیه‌ساز برای سنجش ایمنی وزنی
rfwzj1at	زمینه و هدف: کم خونی آپلاستیک (AA) یک اختلال جدی و نادر است که با مغز استخوان هیپوسلولی مشخص می شود. کم خونی آپلاستیک مرتبط با هپاتیت (HAAA) گونه ای از کم خونی آپلاستیک است که در آن کم خونی آپلاستیک به دنبال حمله حاد هپاتیت ایجاد می شود. چندین گزارش ارتباط بین HGV و کم خونی آپلاستیک مرتبط با هپاتیت را در کنار سایر ویروس های عامل هپاتیت ذکر کرده اند. ارائه مورد: یک دختر خانم 11 ساله با سابقه حرکت شل به مدت یک ماه، استفراغ در 15 روز گذشته و دریافت خوراکی ضعیف در چند روز اخیر در اینجا گزارش شده است. معاینه فیزیکی تب، رنگ پریدگی را نشان می‌دهد، در حالی که خونریزی، هپاتومگالی، اسپلنومگالی و کبودی وجود نداشت، سونوگرافی شکم عدم وجود هپاتومگالی، اسپلنومگالی و لنفودنوپاتی را تایید کرد. پارامترهای بررسی آزمایشگاهی عبارت بودند از: هموگلوبین 6.2 گرم در لیتر، تعداد کل لکوسیت ها 1.51، نوتروفیل ها 0.47 درصد، تعداد رتیکولوسیت مطلق 0.5 درصد، مونوسیت ها 0.16 درصد، تعداد گلبول های قرمز 3.2 mil/uL، حجم سلول های Picked (PCV13%، 3 Corpusan، 3) جلد (MCV) 78 fL، میانگین هموگلوبین کورپوسکولار (MCH) 26.3 pg. آنزیم های کبدی آلانین آمینوترانسفراز (ALT) 98 IU/L، آسپارتات آمینوترانسفراز (AST) 114 IU/L بودند. آزمایشات سرولوژیک و مولکولی برای هپاتیت A، B، C، D، E، TTV، B19 منفی بود، در حالی که آزمایش HGV RNA PCR برای ویروس هپاتیت G مثبت بود. آزمایش آسپیراسیون مغز استخوان و بیوپسی ترفین، هیپوسلولی بودن، اریتروپوئیزیس، میلوپوئیز و مگاکاریوپوزیس را نشان داد. نتیجه‌گیری: HAAA یک وضعیت ناشایع اما شدید است که ممکن است به دنبال موارد ایدیوپاتیک هپاتیت حاد رخ دهد. یافته های ما دخالت HGV را در ایجاد کم خونی آپلاستیک نشان می دهد. در بیمارانی که پس از یک دوره هپاتیت حاد با پان سیتوپنی مراجعه می کنند، تشخیص قطعی باید با RT-PCR و در صورت امکان با بیوپسی مغز استخوان در نظر گرفته شود و تایید شود.	کم خونی آپلاستیک مرتبط با ویروس هپاتیت G: مورد اخیر از پاکستان
z4sutqos	گسترش اپیدمی های بیماری های عفونی با واسطه سفر انسان انجام می شود. با این حال الگوهای تحرک انسان به طور قابل توجهی بین کشورها و مناطق متفاوت است. بنابراین، کمی کردن دفعات سفر و طول سفر در جمعیت کاملاً تعریف شده برای پیش‌بینی سرعت و الگوی احتمالی انتشار بیماری‌های عفونی نوظهور، مانند همه‌گیری آنفلوانزای جدید، حیاتی است. در اینجا ما نتایج یک بررسی جمعیتی بزرگی را که در سال 2007 در دو منطقه چین انجام شد ارائه می‌کنیم: شهر شنژن در استان گوانگدونگ و شهر هوانگشان در استان آنهویی. در هر منطقه، 10000 نفر که به طور تصادفی انتخاب شده بودند، مصاحبه شدند و اطلاعات مربوط به سفرهای منظم و گاه به گاه جمع آوری شد. رفتار سفر به عنوان تابعی از سن، جنس، وضعیت اقتصادی و مکان خانه مورد بررسی قرار گرفت. زنان و کودکان معمولاً مسافت های کوتاه تری را نسبت به مردان طی می کردند. نشان داده شده است که الگوهای سفر در منطقه شنژن از نظر اقتصادی توسعه یافته شبیه الگوهای کشورهای توسعه یافته و از نظر اقتصادی پیشرفته با درآمد متوسط است که بخش قابل توجهی از جمعیت در مسافت های بیش از 50 کیلومتر رفت و آمد می کنند. برعکس، در منطقه کمتر توسعه‌یافته روستایی آنهویی، سفر بسیار محلی‌تر بود، با سفرهای بسیار کمی بیش از 30 کیلومتر. الگوهای سفر در هر دو جمعیت با یک مدل گرانشی با یک تابع هسته لگ نرمال به خوبی برازش داده شد. نتایج اولین اطلاعات کمی را در مورد الگوهای سفر انسان در چین مدرن ارائه می‌کند و نشان می‌دهد که یک بیماری همه‌گیر در یک منطقه کمتر توسعه‌یافته روستایی چین ممکن است از نظر جغرافیایی به کندی گسترش یابد تا مهار آن امکان‌پذیر باشد، در حالی که گسترش فضایی در مناطق توسعه‌یافته‌تر اقتصادی ممکن است. انتظار می رود بسیار سریعتر باشد و مهار را دشوارتر کند.	الگوهای سفر در چین
pixbry0c	هنوز درک محدودی از عوامل کلیدی تعیین کننده گسترش فضایی آنفولانزا وجود دارد. همه گیری 1918 فرصتی را برای روشن کردن عوامل تعیین کننده فضایی گسترش در مقیاس بزرگ فراهم می کند. برای توصیف بهتر گسترش موج بزرگ سال 1918، ما طیف وسیعی از مدل‌های انتقال شهر به شهر را به داده‌های مرگ و میر جمع‌آوری‌شده برای 246 مرکز جمعیتی در انگلستان و ولز و 47 شهر در ایالات متحده منطبق کردیم. با استفاده از یک مدل جاذبه برای تماس های شهر به شهر، ما تأثیر اندازه و فاصله جمعیت را بر گسترش بیماری بررسی کردیم و فرضیات مربوط به وابستگی تراکم در اتصال بین شهرها را آزمایش کردیم. ما از روش‌های مونت کارلو زنجیره مارکوف بیزی برای تخمین پارامترهای مدل برای جمعیت، آلودگی، فاصله و وابستگی به تراکم استفاده کردیم. ما محتمل ترین درختان انتقال را برای هر دو کشور استنباط کردیم. برای انگلستان و ولز، مدلی که درجه وابستگی تراکم را در اتصال بین شهرها برآورد می‌کرد، با مقایسه معیار اطلاعات انحراف ترجیح داده شد. در اوایل موج اصلی، فعل و انفعالات عفونی در فواصل طولانی غالب بود، با شیوع گسترده اپیدمی، رویدادهای عفونت محلی بیشتر محتمل بود. برای ایالات متحده، با شهرهای پراکنده کمتر، قدرت آماری برای تخمین وابستگی به اندازه جمعیت یا درجه وابستگی به تراکم وجود نداشت، با مدل ترجیحی فقط به فاصله بستگی دارد. ما دریافتیم که پارامترهای برآورد شده از مجموعه داده انگلستان و ولز را می توان بدون جریمه احتمال به داده های ایالات متحده اعمال کرد.	پویایی فضایی همه گیر آنفولانزای 1918 در انگلستان، ولز و ایالات متحده
wk2u2a9w	تاکردن مجدد پروتئین های همجوشی غشایی کلاس 1 ویروسی از حالت بومی به ساختار تریمر سنجاق سر، ورود ویروس ها به سلول ها را ارتقا می دهد. در اینجا ما ساختار گلیکوپروتئین گذرنده ویروس لوسمی گاوی (TM) را ارائه می‌کنیم و گروهی از باقی‌مانده‌های آسپاراژین را در انتهای غشایی-دیستال تیغه‌های مو که به طرز چشمگیری در بین ویروس‌های واگرا حفظ می‌شوند، شناسایی می‌کنیم. این آسپاراژین ها برای نمایش سطح پاکت پیش ذوب زایی ضروری نیستند. در عوض، جایگزینی این باقیمانده ها به طور چشمگیری همجوشی غشا را مختل می کند. داده‌های ما نشان می‌دهد که از طریق برهمکنش‌های الکترواستاتیکی با یک یون کلرید، باقی‌مانده‌های آسپاراژین به مونتاژ کمک می‌کنند و ساختارهای فعال همجوشی را که برای همجوشی غشایی با واسطه پوشش ویروسی مورد نیاز هستند، عمیقاً تثبیت می‌کنند. علاوه بر این، ساختار BLV TM همچنین یک محفظه آبگریز احاطه‌شده با بار را روی سیم‌پیچ پیچ‌دار مرکزی نشان می‌دهد و فعل و انفعالات با باقیمانده‌های اساسی که در اطراف این جیب جمع می‌شوند برای همجوشی غشاء حیاتی هستند و هدفی برای مهارکننده‌های پپتید عملکرد پوششی تشکیل می‌دهند. جیب های احاطه شده با بار و برهمکنش های الکترواستاتیکی با یون های کوچک در بین پروتئین های همجوشی کلاس 1 رایج است، که نشان می دهد مولکول های کوچکی که به طور خاص چنین نقوشی را هدف قرار می دهند باید از مونتاژ تیغه های مو جلوگیری کنند و به عنوان بازدارنده های درمانی ورود ویروس ارزشمند باشند.	جیب های احاطه شده با شارژ و برهمکنش های الکترواستاتیکی با یون های کوچک، فعالیت پروتئین های همجوشی رتروویروسی را تعدیل می کند.
x7dqe8qa	ما از شیر گرفتن سخت پس از تهویه مکانیکی طولانی مدت در سه کودک تراکئوستومی شده که تحت تأثیر عفونت ویروس تنفسی قرار گرفته اند، توضیح می دهیم. اگرچه آزمایش‌های تنفس خود به خودی موفقیت‌آمیز بود، اما بیماران در تمام لوله‌های بیرونی ناکام ماندند. بنابراین تراکئوستومی انجام شد و طرح از شیر گرفتن شروع شد. استراتژی برای از شیر گرفتن کاهش پشتیبانی تهویه ترکیبی از تهویه کنترل فشار (PCV) با افزایش دوره‌های فشار مثبت مداوم راه هوایی + تهویه پشتیبانی فشار (CPAP + PSV) و سپس CPAP + PSV با افزایش فواصل قطعه T بود. آنها سندرم دیسترس تنفسی حاد را در بستری با نیازهای بالای تهویه مکانیکی (MV) ارائه کردند. عوامل مداخله گر در قابلیت ها و بارهای سیستم تنفسی در نظر گرفته شد و بهینه شد. میانگین زمان MV 69 روز و زمان از شیر گرفتن 31 روز بود. ما نتایج رضایت بخشی را در چارچوب یک پروتکل از شیر گرفتن هدایت شده گزارش می کنیم.	از شیر گرفتن تراکئوستومی و تهویه مکانیکی در کودکان مبتلا به ویروس تنفسی بر اساس یک پروتکل از شیر گرفتن در یک واحد مراقبت‌های ویژه کودکان در آرژانتین: یک کارآزمایی گذشته‌نگر مشاهده‌ای

Subsets and Splits

No community queries yet

The top public SQL queries from the community will appear here once available.